MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011205	CCGC	2	8	162242	162249	0 %	0 %	25 %	75 %	198245038
3502	NC_011205	CAC	2	6	162321	162326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245038
3503	NC_011205	CTGG	2	8	162380	162387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_011205	ATCCC	2	10	162408	162417	20 %	20 %	0 %	60 %	198245628
3505	NC_011205	CCA	3	9	162459	162467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245628
3506	NC_011205	TGA	2	6	162489	162494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245628
3507	NC_011205	GCCAGC	2	12	162533	162544	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	198245628
3508	NC_011205	GCA	2	6	162576	162581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245628
3509	NC_011205	T	6	6	162653	162658	0 %	100 %	0 %	0 %	198245628
3510	NC_011205	GAA	2	6	162765	162770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245628
3511	NC_011205	AGA	2	6	162866	162871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245628
3512	NC_011205	CGCTGC	2	12	162872	162883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	198245628
3513	NC_011205	AAT	2	6	162988	162993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245628
3514	NC_011205	CG	3	6	162996	163001	0 %	0 %	50 %	50 %	198245628
3515	NC_011205	AGA	2	6	163004	163009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245628
3516	NC_011205	GGC	2	6	163039	163044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245628
3517	NC_011205	GCA	2	6	163065	163070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245628
3518	NC_011205	GGC	2	6	163087	163092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245628
3519	NC_011205	AAT	2	6	163102	163107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245628
3520	NC_011205	AGCGC	2	10	163116	163125	20 %	0 %	40 %	40 %	198245628
3521	NC_011205	AGC	2	6	163182	163187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245628
3522	NC_011205	ATC	2	6	163223	163228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245628
3523	NC_011205	GCG	2	6	163239	163244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245628
3524	NC_011205	ATGA	2	8	163393	163400	50 %	25 %	25 %	0 %	198245628
3525	NC_011205	TGA	2	6	163412	163417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245628
3526	NC_011205	CTT	2	6	163437	163442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245628
3527	NC_011205	GCG	2	6	163451	163456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245628
3528	NC_011205	TGA	2	6	163509	163514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245628
3529	NC_011205	TGCC	2	8	163838	163845	0 %	25 %	25 %	50 %	198244503
3530	NC_011205	GC	3	6	163855	163860	0 %	0 %	50 %	50 %	198244503
3531	NC_011205	ACC	2	6	163947	163952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244503
3532	NC_011205	ATC	2	6	163971	163976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244503
3533	NC_011205	TGC	2	6	163995	164000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244503
3534	NC_011205	TGG	2	6	164020	164025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244503
3535	NC_011205	GCC	2	6	164067	164072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244503
3536	NC_011205	ATG	3	9	164118	164126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244503
3537	NC_011205	GCA	2	6	164152	164157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244503
3538	NC_011205	GGAT	2	8	164184	164191	25 %	25 %	50 %	0 %	198244503
3539	NC_011205	GC	3	6	164278	164283	0 %	0 %	50 %	50 %	198244503
3540	NC_011205	CAA	2	6	164429	164434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198244503
3541	NC_011205	GAC	2	6	164441	164446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244503
3542	NC_011205	CTT	2	6	164455	164460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244503
3543	NC_011205	CGCC	2	8	164497	164504	0 %	0 %	25 %	75 %	198244503
3544	NC_011205	GAA	2	6	164626	164631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244503
3545	NC_011205	GAT	2	6	164797	164802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244503
3546	NC_011205	CA	3	6	164826	164831	50 %	0 %	0 %	50 %	198244503
3547	NC_011205	ACC	2	6	164895	164900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244503
3548	NC_011205	TGA	2	6	164943	164948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244503
3549	NC_011205	TGAGC	2	10	164965	164974	20 %	20 %	40 %	20 %	198244503
3550	NC_011205	TGT	2	6	165030	165035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245059
3551	NC_011205	CCAG	2	8	165071	165078	25 %	0 %	25 %	50 %	198245059
3552	NC_011205	GGCG	2	8	165101	165108	0 %	0 %	75 %	25 %	198245059
3553	NC_011205	ATG	2	6	165111	165116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245059
3554	NC_011205	TGA	2	6	165154	165159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245059
3555	NC_011205	TGA	2	6	165196	165201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245059
3556	NC_011205	CGCAT	2	10	165227	165236	20 %	20 %	20 %	40 %	198245059
3557	NC_011205	CCA	2	6	165246	165251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245059
3558	NC_011205	GAT	2	6	165374	165379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245059
3559	NC_011205	GTT	2	6	165418	165423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245059
3560	NC_011205	AAT	2	6	165583	165588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_011205	GA	3	6	165668	165673	50 %	0 %	50 %	0 %	198242484
3562	NC_011205	GC	4	8	165678	165685	0 %	0 %	50 %	50 %	198242484
3563	NC_011205	GC	3	6	165699	165704	0 %	0 %	50 %	50 %	198242484
3564	NC_011205	ATG	2	6	165845	165850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242484
3565	NC_011205	CGAAC	2	10	165956	165965	40 %	0 %	20 %	40 %	198242484
3566	NC_011205	GAT	2	6	165973	165978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242484
3567	NC_011205	GAT	2	6	166020	166025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242484
3568	NC_011205	GCC	3	9	166030	166038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242484
3569	NC_011205	GCCA	2	8	166114	166121	25 %	0 %	25 %	50 %	198242484
3570	NC_011205	GCG	2	6	166135	166140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242484
3571	NC_011205	CAA	2	6	166201	166206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242484
3572	NC_011205	GTTCA	2	10	166222	166231	20 %	40 %	20 %	20 %	198242484
3573	NC_011205	TTGG	2	8	166240	166247	0 %	50 %	50 %	0 %	198242484
3574	NC_011205	CAT	2	6	166290	166295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242484
3575	NC_011205	CGCC	2	8	166296	166303	0 %	0 %	25 %	75 %	198242484
3576	NC_011205	CGG	2	6	166467	166472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242484
3577	NC_011205	GTCG	2	8	166512	166519	0 %	25 %	50 %	25 %	198242484
3578	NC_011205	GGC	2	6	166538	166543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242484
3579	NC_011205	AGC	2	6	166598	166603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_011205	CAC	2	6	166610	166615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_011205	TAG	2	6	166655	166660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242926
3582	NC_011205	TGG	2	6	166724	166729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242926
3583	NC_011205	ATA	2	6	166733	166738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242926
3584	NC_011205	C	6	6	166747	166752	0 %	0 %	0 %	100 %	198242926
3585	NC_011205	ATT	2	6	166782	166787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242926
3586	NC_011205	T	7	7	166818	166824	0 %	100 %	0 %	0 %	198242926
3587	NC_011205	TCG	2	6	166866	166871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242926
3588	NC_011205	GCGT	2	8	166908	166915	0 %	25 %	50 %	25 %	198242926
3589	NC_011205	CAG	2	6	167023	167028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242926
3590	NC_011205	GCC	2	6	167032	167037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242926
3591	NC_011205	TCG	2	6	167173	167178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242926
3592	NC_011205	ATGAC	2	10	167188	167197	40 %	20 %	20 %	20 %	198242926
3593	NC_011205	ATC	2	6	167266	167271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241957
3594	NC_011205	TGG	2	6	167344	167349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241957
3595	NC_011205	GCT	2	6	167381	167386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241957
3596	NC_011205	TGG	2	6	167404	167409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241957
3597	NC_011205	GCG	2	6	167481	167486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241957
3598	NC_011205	GCC	2	6	167549	167554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241957
3599	NC_011205	GTT	2	6	167597	167602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198241957
3600	NC_011205	TGG	2	6	167677	167682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241957
3601	NC_011205	TGGC	2	8	167712	167719	0 %	25 %	50 %	25 %	198241957
3602	NC_011205	GC	3	6	167718	167723	0 %	0 %	50 %	50 %	198241957
3603	NC_011205	CGC	2	6	167731	167736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241957
3604	NC_011205	TTC	2	6	167767	167772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241957
3605	NC_011205	CTGGA	2	10	167778	167787	20 %	20 %	40 %	20 %	198241957
3606	NC_011205	GGCG	2	8	167801	167808	0 %	0 %	75 %	25 %	198241957
3607	NC_011205	GC	3	6	167925	167930	0 %	0 %	50 %	50 %	198241957
3608	NC_011205	GCG	2	6	167964	167969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241957
3609	NC_011205	GAA	2	6	167981	167986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241957
3610	NC_011205	TGG	3	9	167998	168006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241957
3611	NC_011205	ATT	2	6	168009	168014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241957
3612	NC_011205	TGC	2	6	168074	168079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_011205	GGC	2	6	168155	168160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245039
3614	NC_011205	TGG	2	6	168348	168353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245039
3615	NC_011205	CG	3	6	168393	168398	0 %	0 %	50 %	50 %	198245039
3616	NC_011205	TCG	2	6	168401	168406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245039
3617	NC_011205	AGT	2	6	168435	168440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245039
3618	NC_011205	CAC	2	6	168490	168495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245039
3619	NC_011205	TGA	2	6	168671	168676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245039
3620	NC_011205	GTG	2	6	168683	168688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245039
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3622	NC_011205	CGG	2	6	168939	168944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245039
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3988	NC_011205	TCT	2	6	183981	183986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241769
3989	NC_011205	GC	3	6	184008	184013	0 %	0 %	50 %	50 %	198241769
3990	NC_011205	CGA	2	6	184147	184152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3991	NC_011205	GTGC	2	8	184154	184161	0 %	25 %	50 %	25 %	198241769
3992	NC_011205	TGG	2	6	184162	184167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241769
3993	NC_011205	ACC	2	6	184199	184204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241769
3994	NC_011205	AGC	2	6	184271	184276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241769
3995	NC_011205	GGTC	2	8	184303	184310	0 %	25 %	50 %	25 %	198241769
3996	NC_011205	GCG	2	6	184317	184322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241769
3997	NC_011205	TAC	2	6	184384	184389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241769
3998	NC_011205	CCG	2	6	184440	184445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241769
3999	NC_011205	CAC	2	6	184501	184506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241769
4000	NC_011205	CAC	2	6	184508	184513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241769

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