MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_011205	GCC	2	6	90899	90904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241975
2003	NC_011205	AAC	2	6	90967	90972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241975
2004	NC_011205	TCA	2	6	91000	91005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241975
2005	NC_011205	A	6	6	91019	91024	100 %	0 %	0 %	0 %	198241975
2006	NC_011205	TGG	2	6	91095	91100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241975
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2008	NC_011205	TGG	2	6	91152	91157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241975
2009	NC_011205	GCG	3	9	91253	91261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241975
2010	NC_011205	CGA	2	6	91288	91293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241975
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2012	NC_011205	GTAT	2	8	91359	91366	25 %	50 %	25 %	0 %	198241975
2013	NC_011205	GCTCC	2	10	91461	91470	0 %	20 %	20 %	60 %	198241975
2014	NC_011205	A	7	7	91484	91490	100 %	0 %	0 %	0 %	198241975
2015	NC_011205	GAA	2	6	91504	91509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241975
2016	NC_011205	TCA	2	6	91518	91523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241975
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2249	NC_011205	CGC	2	6	103195	103200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242523
2250	NC_011205	GCT	2	6	103201	103206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242523
2251	NC_011205	CCA	2	6	103240	103245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242523
2252	NC_011205	ATC	2	6	103328	103333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242523
2253	NC_011205	TGA	2	6	103398	103403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242523
2254	NC_011205	GGC	2	6	103426	103431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242523
2255	NC_011205	TGA	2	6	103608	103613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242523
2256	NC_011205	TGG	2	6	103636	103641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242523
2257	NC_011205	AGA	2	6	103644	103649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242523
2258	NC_011205	T	6	6	103661	103666	0 %	100 %	0 %	0 %	198242523
2259	NC_011205	TATT	2	8	103676	103683	25 %	75 %	0 %	0 %	198243047
2260	NC_011205	CAT	2	6	103688	103693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243047
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2263	NC_011205	CTG	2	6	104001	104006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243576
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2265	NC_011205	CCA	2	6	104089	104094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198243576
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2274	NC_011205	GCA	2	6	104501	104506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243576
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2277	NC_011205	TGA	2	6	104602	104607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243576
2278	NC_011205	CAT	2	6	104613	104618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243576
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2280	NC_011205	ATG	2	6	104655	104660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243576
2281	NC_011205	AATG	2	8	104778	104785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_011205	AAGCG	2	10	104796	104805	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2284	NC_011205	GCGG	2	8	105037	105044	0 %	0 %	75 %	25 %	198244685
2285	NC_011205	TAT	2	6	105045	105050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244685
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2289	NC_011205	CCG	2	6	105168	105173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244685
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2291	NC_011205	CG	3	6	105192	105197	0 %	0 %	50 %	50 %	198244685
2292	NC_011205	CGC	2	6	105282	105287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244685
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2301	NC_011205	CTG	2	6	105573	105578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245326
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2304	NC_011205	CG	3	6	105688	105693	0 %	0 %	50 %	50 %	198245326
2305	NC_011205	ATCA	2	8	105696	105703	50 %	25 %	0 %	25 %	198245326
2306	NC_011205	TGC	2	6	105785	105790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245326
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2317	NC_011205	TTC	2	6	106284	106289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245326
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2321	NC_011205	CG	3	6	106485	106490	0 %	0 %	50 %	50 %	198245326
2322	NC_011205	T	6	6	106562	106567	0 %	100 %	0 %	0 %	198245326
2323	NC_011205	GAC	2	6	106619	106624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245326
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2326	NC_011205	TCT	2	6	106747	106752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245326
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2329	NC_011205	TTCGCG	2	12	106827	106838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245326
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2333	NC_011205	CGGCAG	2	12	107085	107096	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	198245326
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2352	NC_011205	ATA	2	6	107819	107824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245326
2353	NC_011205	ATC	2	6	107839	107844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245326
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2357	NC_011205	GCTC	2	8	107993	108000	0 %	25 %	25 %	50 %	198245326
2358	NC_011205	AGCGC	2	10	108020	108029	20 %	0 %	40 %	40 %	198245326
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2360	NC_011205	GC	3	6	108273	108278	0 %	0 %	50 %	50 %	198245326
2361	NC_011205	CATC	2	8	108329	108336	25 %	25 %	0 %	50 %	198245326
2362	NC_011205	CAA	2	6	108338	108343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245326
2363	NC_011205	GGC	2	6	108561	108566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2364	NC_011205	AGT	2	6	108606	108611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245956
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2366	NC_011205	TTCC	2	8	108643	108650	0 %	50 %	0 %	50 %	198245956
2367	NC_011205	GCG	2	6	108694	108699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2368	NC_011205	CTG	2	6	108701	108706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245956
2369	NC_011205	GAC	2	6	108778	108783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245956
2370	NC_011205	GCG	2	6	108816	108821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2371	NC_011205	GCG	2	6	108829	108834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2372	NC_011205	ACGTT	2	10	108837	108846	20 %	40 %	20 %	20 %	198245956
2373	NC_011205	CGCC	2	8	108904	108911	0 %	0 %	25 %	75 %	198245956
2374	NC_011205	GCG	2	6	109003	109008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2375	NC_011205	GCTG	2	8	109051	109058	0 %	25 %	50 %	25 %	198245956
2376	NC_011205	T	6	6	109088	109093	0 %	100 %	0 %	0 %	198245956
2377	NC_011205	CCGCG	2	10	109105	109114	0 %	0 %	40 %	60 %	198245956
2378	NC_011205	CTCCAG	2	12	109154	109165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198245956
2379	NC_011205	TGT	2	6	109185	109190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245956
2380	NC_011205	CCA	2	6	109202	109207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245956
2381	NC_011205	CCG	2	6	109243	109248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245956
2382	NC_011205	GC	4	8	109264	109271	0 %	0 %	50 %	50 %	198245956
2383	NC_011205	GAC	2	6	109380	109385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245956
2384	NC_011205	GTG	2	6	109416	109421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245956
2385	NC_011205	GGCA	2	8	109533	109540	25 %	0 %	50 %	25 %	198245956
2386	NC_011205	ATCA	2	8	109631	109638	50 %	25 %	0 %	25 %	198245956
2387	NC_011205	GCC	2	6	109727	109732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245956
2388	NC_011205	GCG	2	6	109744	109749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2389	NC_011205	GCG	2	6	109818	109823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2390	NC_011205	CCG	2	6	109830	109835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245956
2391	NC_011205	TCG	2	6	109861	109866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245956
2392	NC_011205	CG	3	6	109865	109870	0 %	0 %	50 %	50 %	198245956
2393	NC_011205	GCG	2	6	109973	109978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2394	NC_011205	A	7	7	110136	110142	100 %	0 %	0 %	0 %	198245956
2395	NC_011205	GCA	2	6	110233	110238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245956
2396	NC_011205	CAC	2	6	110255	110260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245956
2397	NC_011205	GAT	2	6	110270	110275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245956
2398	NC_011205	CAG	2	6	110318	110323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245956
2399	NC_011205	GCGG	2	8	110326	110333	0 %	0 %	75 %	25 %	198245956
2400	NC_011205	GCG	2	6	110485	110490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2401	NC_011205	GGGGT	2	10	110501	110510	0 %	20 %	80 %	0 %	198245956
2402	NC_011205	TAA	2	6	110572	110577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245956
2403	NC_011205	CGG	2	6	110600	110605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2404	NC_011205	GCA	2	6	110644	110649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245956
2405	NC_011205	GCG	2	6	110731	110736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2406	NC_011205	AGC	2	6	110763	110768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245956
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2408	NC_011205	CTGG	2	8	110786	110793	0 %	25 %	50 %	25 %	198245956
2409	NC_011205	GCG	2	6	110818	110823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2410	NC_011205	TGTC	2	8	110848	110855	0 %	50 %	25 %	25 %	198245956
2411	NC_011205	GCCA	2	8	110856	110863	25 %	0 %	25 %	50 %	198245956
2412	NC_011205	GCG	2	6	110884	110889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245956
2413	NC_011205	CCTG	2	8	110919	110926	0 %	25 %	25 %	50 %	198245956
2414	NC_011205	GAT	2	6	110933	110938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2415	NC_011205	A	6	6	110948	110953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2416	NC_011205	TAA	2	6	111034	111039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242615
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2419	NC_011205	TGA	2	6	111105	111110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242615
2420	NC_011205	GCA	2	6	111152	111157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242615
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2423	NC_011205	CGC	2	6	111315	111320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242615
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2427	NC_011205	CG	3	6	111482	111487	0 %	0 %	50 %	50 %	198242615
2428	NC_011205	CTGA	2	8	111498	111505	25 %	25 %	25 %	25 %	198242615
2429	NC_011205	TGCC	2	8	111560	111567	0 %	25 %	25 %	50 %	198242615
2430	NC_011205	TGA	2	6	111575	111580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242615
2431	NC_011205	ATGA	2	8	111595	111602	50 %	25 %	25 %	0 %	198242615
2432	NC_011205	GTTC	2	8	111603	111610	0 %	50 %	25 %	25 %	198242615
2433	NC_011205	ATG	2	6	111694	111699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2434	NC_011205	TA	3	6	111704	111709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2435	NC_011205	CAG	2	6	111710	111715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2436	NC_011205	TTTA	2	8	111752	111759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2437	NC_011205	A	6	6	111867	111872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2438	NC_011205	T	6	6	111879	111884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2439	NC_011205	GTTT	2	8	111885	111892	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2440	NC_011205	ATA	2	6	111950	111955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2441	NC_011205	TAAA	2	8	111976	111983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2442	NC_011205	TCG	2	6	112003	112008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2443	NC_011205	CT	3	6	112013	112018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2444	NC_011205	TAATT	2	10	112022	112031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2445	NC_011205	ATTTT	2	10	112048	112057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2446	NC_011205	CGGGTG	2	12	112064	112075	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2447	NC_011205	GA	3	6	112146	112151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2448	NC_011205	T	6	6	112210	112215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2449	NC_011205	ACAGA	2	10	112231	112240	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2450	NC_011205	ATT	2	6	112255	112260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2451	NC_011205	T	7	7	112275	112281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2452	NC_011205	A	6	6	112302	112307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2453	NC_011205	ATT	2	6	112324	112329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2454	NC_011205	CAA	2	6	112361	112366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2455	NC_011205	TTC	2	6	112381	112386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2456	NC_011205	GGAA	2	8	112395	112402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2457	NC_011205	ATA	2	6	112424	112429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2458	NC_011205	AT	3	6	112482	112487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2459	NC_011205	TCA	2	6	112500	112505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2460	NC_011205	C	6	6	112511	112516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2461	NC_011205	CAG	2	6	112590	112595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242714
2462	NC_011205	TGC	2	6	112600	112605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242714
2463	NC_011205	GCG	2	6	112619	112624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242714
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2466	NC_011205	CTT	2	6	112658	112663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242714
2467	NC_011205	GCG	2	6	112753	112758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242714
2468	NC_011205	CAA	2	6	112784	112789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242714
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2470	NC_011205	GT	3	6	112948	112953	0 %	50 %	50 %	0 %	198242714
2471	NC_011205	GCC	2	6	112959	112964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242714
2472	NC_011205	ACA	2	6	112985	112990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242714
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2475	NC_011205	CGC	2	6	113123	113128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242714
2476	NC_011205	TCT	2	6	113224	113229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242714
2477	NC_011205	AAATG	2	10	113341	113350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2478	NC_011205	CAGCG	2	10	113406	113415	20 %	0 %	40 %	40 %	198243370
2479	NC_011205	ATCA	2	8	113447	113454	50 %	25 %	0 %	25 %	198243370
2480	NC_011205	GC	3	6	113533	113538	0 %	0 %	50 %	50 %	198243370
2481	NC_011205	GCCA	2	8	113540	113547	25 %	0 %	25 %	50 %	198243370
2482	NC_011205	GCG	2	6	113629	113634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243370
2483	NC_011205	CAG	2	6	113660	113665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243370
2484	NC_011205	CGA	2	6	113698	113703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243370
2485	NC_011205	GCCGG	2	10	113706	113715	0 %	0 %	60 %	40 %	198243370
2486	NC_011205	GCC	2	6	113753	113758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243370
2487	NC_011205	AC	3	6	113813	113818	50 %	0 %	0 %	50 %	198243370
2488	NC_011205	CGAGC	2	10	113831	113840	20 %	0 %	40 %	40 %	198243370
2489	NC_011205	TCC	2	6	113877	113882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198243370
2490	NC_011205	GCC	2	6	113894	113899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243370
2491	NC_011205	GCG	2	6	113940	113945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243370
2492	NC_011205	GTT	2	6	114016	114021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243370
2493	NC_011205	GTC	2	6	114045	114050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243370
2494	NC_011205	GC	3	6	114104	114109	0 %	0 %	50 %	50 %	198243370
2495	NC_011205	GGCG	2	8	114152	114159	0 %	0 %	75 %	25 %	198243370
2496	NC_011205	GCT	2	6	114170	114175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243370
2497	NC_011205	CAC	2	6	114224	114229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198243370
2498	NC_011205	ATTTG	2	10	114274	114283	20 %	60 %	20 %	0 %	198243370
2499	NC_011205	GTCA	2	8	114302	114309	25 %	25 %	25 %	25 %	198243370
2500	NC_011205	GAC	2	6	114437	114442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243370

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