MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011205	ATT	2	6	518977	518982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245198
11002	NC_011205	GTTCA	2	10	519040	519049	20 %	40 %	20 %	20 %	198245198
11003	NC_011205	GGC	2	6	519067	519072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245198
11004	NC_011205	GCC	2	6	519109	519114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245198
11005	NC_011205	CG	3	6	519191	519196	0 %	0 %	50 %	50 %	198245198
11006	NC_011205	TGA	2	6	519226	519231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245198
11007	NC_011205	AAT	2	6	519238	519243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245198
11008	NC_011205	CTT	2	6	519252	519257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245198
11009	NC_011205	AGCG	2	8	519290	519297	25 %	0 %	50 %	25 %	198245198
11010	NC_011205	CCG	2	6	519402	519407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245198
11011	NC_011205	TGG	2	6	519413	519418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245198
11012	NC_011205	TCA	2	6	519462	519467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245198
11013	NC_011205	A	6	6	519514	519519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_011205	TTG	2	6	519520	519525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_011205	TGCTT	2	10	519606	519615	0 %	60 %	20 %	20 %	198244718
11016	NC_011205	GCA	2	6	519619	519624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244718
11017	NC_011205	CT	3	6	519635	519640	0 %	50 %	0 %	50 %	198244718
11018	NC_011205	GAC	2	6	519670	519675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244718
11019	NC_011205	GCT	2	6	519739	519744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244718
11020	NC_011205	GCA	2	6	519796	519801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244718
11021	NC_011205	CAG	2	6	519805	519810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244718
11022	NC_011205	CGT	2	6	519835	519840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244718
11023	NC_011205	GAC	2	6	519932	519937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244718
11024	NC_011205	ACC	2	6	520016	520021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244718
11025	NC_011205	AAT	2	6	520035	520040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198244718
11026	NC_011205	ATT	2	6	520085	520090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244286
11027	NC_011205	TGCTTA	2	12	520150	520161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	198244286
11028	NC_011205	GTG	2	6	520191	520196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244286
11029	NC_011205	TTG	2	6	520293	520298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244286
11030	NC_011205	TGC	2	6	520315	520320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244286
11031	NC_011205	CTT	2	6	520330	520335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244286
11032	NC_011205	ATT	2	6	520363	520368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244286
11033	NC_011205	GTC	2	6	520381	520386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244286
11034	NC_011205	CG	3	6	520430	520435	0 %	0 %	50 %	50 %	198244286
11035	NC_011205	CGA	2	6	520438	520443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244286
11036	NC_011205	ATG	2	6	520444	520449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244286
11037	NC_011205	CGT	2	6	520457	520462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244286
11038	NC_011205	GCG	2	6	520467	520472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244286
11039	NC_011205	TGCCGA	2	12	520576	520587	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198244286
11040	NC_011205	TGA	2	6	520597	520602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244286
11041	NC_011205	GCC	2	6	520650	520655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244286
11042	NC_011205	CGCA	2	8	520674	520681	25 %	0 %	25 %	50 %	198244286
11043	NC_011205	GGA	2	6	520724	520729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244286
11044	NC_011205	GCG	2	6	520749	520754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244286
11045	NC_011205	CG	3	6	520802	520807	0 %	0 %	50 %	50 %	198244286
11046	NC_011205	GCG	2	6	520861	520866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244286
11047	NC_011205	TGG	2	6	520876	520881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244286
11048	NC_011205	ATG	2	6	520920	520925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244286
11049	NC_011205	TGA	2	6	520936	520941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244286
11050	NC_011205	GCTGGC	2	12	520952	520963	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	198244286
11051	NC_011205	CGG	2	6	521065	521070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244286
11052	NC_011205	GCG	2	6	521074	521079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244286
11053	NC_011205	CGG	2	6	521086	521091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244286
11054	NC_011205	ACG	2	6	521118	521123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244286
11055	NC_011205	GA	3	6	521251	521256	50 %	0 %	50 %	0 %	198244286
11056	NC_011205	GTC	2	6	521319	521324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244286
11057	NC_011205	AAT	2	6	521361	521366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198244286
11058	NC_011205	AGG	2	6	521395	521400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244286
11059	NC_011205	AGGT	2	8	521473	521480	25 %	25 %	50 %	0 %	198244286
11060	NC_011205	GAT	2	6	521568	521573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244286
11061	NC_011205	TCA	3	9	521650	521658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244286
11062	NC_011205	GC	3	6	521659	521664	0 %	0 %	50 %	50 %	198244286
11063	NC_011205	TGT	2	6	521720	521725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244286
11064	NC_011205	GCG	2	6	521731	521736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244286
11065	NC_011205	GCA	2	6	521753	521758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244286
11066	NC_011205	GAG	2	6	521832	521837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244286
11067	NC_011205	CT	3	6	521917	521922	0 %	50 %	0 %	50 %	198242112
11068	NC_011205	TGA	2	6	521930	521935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242112
11069	NC_011205	GCG	4	12	521947	521958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
11070	NC_011205	GCT	2	6	521973	521978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242112
11071	NC_011205	TGG	2	6	522002	522007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242112
11072	NC_011205	CCA	2	6	522012	522017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242112
11073	NC_011205	GGC	2	6	522045	522050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
11074	NC_011205	GGC	2	6	522075	522080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
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11078	NC_011205	AATT	2	8	522212	522219	50 %	50 %	0 %	0 %	198242112
11079	NC_011205	GTC	2	6	522268	522273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242112
11080	NC_011205	GCG	2	6	522292	522297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
11081	NC_011205	TGG	2	6	522350	522355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242112
11082	NC_011205	CGG	2	6	522371	522376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
11083	NC_011205	CGC	2	6	522424	522429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242112
11084	NC_011205	ACG	2	6	522455	522460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242112
11085	NC_011205	ATC	2	6	522472	522477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242112
11086	NC_011205	CAG	2	6	522496	522501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242112
11087	NC_011205	CAG	2	6	522508	522513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242112
11088	NC_011205	GC	3	6	522514	522519	0 %	0 %	50 %	50 %	198242112
11089	NC_011205	GCT	2	6	522606	522611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242112
11090	NC_011205	TTG	2	6	522643	522648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242112
11091	NC_011205	ACC	2	6	522748	522753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242112
11092	NC_011205	CAG	2	6	522769	522774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242112
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11098	NC_011205	CT	3	6	523062	523067	0 %	50 %	0 %	50 %	198242112
11099	NC_011205	ATC	2	6	523070	523075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242112
11100	NC_011205	GC	3	6	523219	523224	0 %	0 %	50 %	50 %	198242112
11101	NC_011205	TGGCGC	2	12	523298	523309	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	198242112
11102	NC_011205	TGA	2	6	523344	523349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242112
11103	NC_011205	CAG	2	6	523390	523395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242112
11104	NC_011205	GGC	2	6	523401	523406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
11105	NC_011205	CAC	2	6	523419	523424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242112
11106	NC_011205	TGG	2	6	523427	523432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242112
11107	NC_011205	CAA	2	6	523519	523524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242112
11108	NC_011205	GGC	2	6	523530	523535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242112
11109	NC_011205	AGTT	2	8	523568	523575	25 %	50 %	25 %	0 %	198242112
11110	NC_011205	GAG	2	6	523579	523584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242112
11111	NC_011205	GCC	2	6	523588	523593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242112
11112	NC_011205	GAA	2	6	523603	523608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242112
11113	NC_011205	CAC	2	6	523634	523639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_011205	CGT	2	6	523666	523671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243908
11115	NC_011205	TTTC	2	8	523680	523687	0 %	75 %	0 %	25 %	198243908
11116	NC_011205	CGC	2	6	523724	523729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243908
11117	NC_011205	CTCG	2	8	523744	523751	0 %	25 %	25 %	50 %	198243908
11118	NC_011205	GCG	2	6	523800	523805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_011205	GGA	2	6	523877	523882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245729
11120	NC_011205	TTC	2	6	523898	523903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245729
11121	NC_011205	CGCGG	2	10	523977	523986	0 %	0 %	60 %	40 %	198245729
11122	NC_011205	CGA	2	6	524036	524041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245729
11123	NC_011205	ATC	2	6	524064	524069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245729
11124	NC_011205	TCG	2	6	524113	524118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245729
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11127	NC_011205	A	6	6	524204	524209	100 %	0 %	0 %	0 %	198245268
11128	NC_011205	GAT	2	6	524220	524225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245268
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11162	NC_011205	GCGCT	2	10	525515	525524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11163	NC_011205	CGC	2	6	525574	525579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11164	NC_011205	T	6	6	525591	525596	0 %	100 %	0 %	0 %	198242813
11165	NC_011205	GC	3	6	525642	525647	0 %	0 %	50 %	50 %	198242813
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11172	NC_011205	CGG	2	6	526018	526023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242813
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11187	NC_011205	CTG	2	6	526639	526644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11210	NC_011205	CCCA	2	8	527845	527852	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11211	NC_011205	CTG	2	6	527879	527884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11238	NC_011205	GCCA	2	8	529357	529364	25 %	0 %	25 %	50 %	198242666
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11482	NC_011205	TGC	2	6	540225	540230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242010
11483	NC_011205	GGT	2	6	540349	540354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242010
11484	NC_011205	ATT	2	6	540389	540394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242010
11485	NC_011205	TGG	2	6	540402	540407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242010
11486	NC_011205	CAC	2	6	540496	540501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242010
11487	NC_011205	TGGC	2	8	540581	540588	0 %	25 %	50 %	25 %	198242010
11488	NC_011205	GGC	3	9	540586	540594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242010
11489	NC_011205	ATC	2	6	540656	540661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242010
11490	NC_011205	CCA	2	6	540744	540749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242010
11491	NC_011205	AAG	2	6	540771	540776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242010
11492	NC_011205	GGC	2	6	540913	540918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242010
11493	NC_011205	TTC	2	6	540962	540967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242010
11494	NC_011205	ACC	2	6	540968	540973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242010
11495	NC_011205	TGAAC	2	10	541048	541057	40 %	20 %	20 %	20 %	198242010
11496	NC_011205	CG	3	6	541058	541063	0 %	0 %	50 %	50 %	198242010
11497	NC_011205	ATCG	2	8	541064	541071	25 %	25 %	25 %	25 %	198242010
11498	NC_011205	CGA	2	6	541141	541146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242010
11499	NC_011205	TGAAG	2	10	541153	541162	40 %	20 %	40 %	0 %	198242010
11500	NC_011205	CGG	2	6	541174	541179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242010

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