MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011205	TGC	2	6	22434	22439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242908
502	NC_011205	GCT	2	6	22648	22653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242908
503	NC_011205	CGCC	2	8	22656	22663	0 %	0 %	25 %	75 %	198242908
504	NC_011205	GGC	2	6	22682	22687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242908
505	NC_011205	AGA	2	6	22702	22707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242908
506	NC_011205	CGG	2	6	22744	22749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242908
507	NC_011205	T	6	6	22754	22759	0 %	100 %	0 %	0 %	198242908
508	NC_011205	CT	3	6	22796	22801	0 %	50 %	0 %	50 %	198242908
509	NC_011205	GGT	2	6	22949	22954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242908
510	NC_011205	CTA	2	6	22956	22961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242908
511	NC_011205	CGG	2	6	22996	23001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242908
512	NC_011205	CTGG	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	198242908
513	NC_011205	TAT	2	6	23027	23032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242908
514	NC_011205	ATA	2	6	23053	23058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242908
515	NC_011205	TTA	2	6	23168	23173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011205	TCTTAA	2	12	23205	23216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
517	NC_011205	TTAT	2	8	23267	23274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011205	A	7	7	23340	23346	100 %	0 %	0 %	0 %	198243657
519	NC_011205	TGA	2	6	23347	23352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243657
520	NC_011205	ACG	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243657
521	NC_011205	ATA	2	6	23371	23376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243657
522	NC_011205	CTTTT	2	10	23395	23404	0 %	80 %	0 %	20 %	198243657
523	NC_011205	T	6	6	23401	23406	0 %	100 %	0 %	0 %	198243657
524	NC_011205	CAG	2	6	23409	23414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243657
525	NC_011205	TTG	2	6	23454	23459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243657
526	NC_011205	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	198243657
527	NC_011205	ATG	2	6	23515	23520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243657
528	NC_011205	GTT	2	6	23550	23555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243657
529	NC_011205	ATG	2	6	23566	23571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243657
530	NC_011205	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	198243657
531	NC_011205	CG	3	6	23654	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	198243657
532	NC_011205	ACG	2	6	23755	23760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243657
533	NC_011205	TGA	2	6	23791	23796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243657
534	NC_011205	GC	4	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	198243657
535	NC_011205	GCT	2	6	23849	23854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243657
536	NC_011205	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	198243657
537	NC_011205	A	7	7	23969	23975	100 %	0 %	0 %	0 %	198243657
538	NC_011205	GGC	2	6	24001	24006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243657
539	NC_011205	AT	3	6	24058	24063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011205	GTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011205	ACA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011205	GAT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011205	TAA	2	6	24261	24266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011205	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011205	ACG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011205	AAG	2	6	24355	24360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011205	T	7	7	24365	24371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011205	GAA	2	6	24401	24406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011205	CAG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011205	A	6	6	24427	24432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011205	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	198242187
552	NC_011205	TGT	2	6	24523	24528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242187
553	NC_011205	TAC	2	6	24545	24550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242187
554	NC_011205	CGGTA	2	10	24563	24572	20 %	20 %	40 %	20 %	198242187
555	NC_011205	CTGTT	2	10	24602	24611	0 %	60 %	20 %	20 %	198242187
556	NC_011205	TGG	2	6	24682	24687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242187
557	NC_011205	AGA	2	6	24698	24703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242187
558	NC_011205	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	198242187
559	NC_011205	GCG	2	6	24750	24755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242187
560	NC_011205	CGA	2	6	24826	24831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242187
561	NC_011205	T	7	7	25027	25033	0 %	100 %	0 %	0 %	198242340
562	NC_011205	CG	3	6	25066	25071	0 %	0 %	50 %	50 %	198242340
563	NC_011205	A	8	8	25117	25124	100 %	0 %	0 %	0 %	198242340
564	NC_011205	ATT	2	6	25143	25148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242340
565	NC_011205	CTG	2	6	25153	25158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242340
566	NC_011205	CGG	2	6	25160	25165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242340
567	NC_011205	CCT	2	6	25247	25252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198242340
568	NC_011205	ATT	2	6	25258	25263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242340
569	NC_011205	TTC	2	6	25266	25271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242340
570	NC_011205	T	7	7	25283	25289	0 %	100 %	0 %	0 %	198242340
571	NC_011205	CGC	2	6	25346	25351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242340
572	NC_011205	CT	3	6	25352	25357	0 %	50 %	0 %	50 %	198242340
573	NC_011205	A	6	6	25372	25377	100 %	0 %	0 %	0 %	198242340
574	NC_011205	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	198242340
575	NC_011205	TAT	2	6	25392	25397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242340
576	NC_011205	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	198242340
577	NC_011205	TATTT	2	10	25436	25445	20 %	80 %	0 %	0 %	198242340
578	NC_011205	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	198242340
579	NC_011205	TAC	2	6	25633	25638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242340
580	NC_011205	A	6	6	25669	25674	100 %	0 %	0 %	0 %	198242340
581	NC_011205	CCG	2	6	25693	25698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242340
582	NC_011205	ACG	2	6	25768	25773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242340
583	NC_011205	ATG	2	6	25797	25802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242340
584	NC_011205	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	198245430
585	NC_011205	GGC	2	6	25990	25995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
586	NC_011205	ACG	2	6	26072	26077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245430
587	NC_011205	GC	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	198245430
588	NC_011205	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	198245430
589	NC_011205	GGC	3	9	26182	26190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
590	NC_011205	GCC	2	6	26225	26230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245430
591	NC_011205	GCA	2	6	26251	26256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245430
592	NC_011205	GGC	2	6	26281	26286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
593	NC_011205	GGC	2	6	26399	26404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
594	NC_011205	ACT	2	6	26472	26477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245430
595	NC_011205	GCG	2	6	26496	26501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
596	NC_011205	AGCGAC	2	12	26510	26521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245430
597	NC_011205	GCA	2	6	26524	26529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245430
598	NC_011205	ATT	2	6	26608	26613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245430
599	NC_011205	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	198245430
600	NC_011205	GAC	2	6	26651	26656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245430
601	NC_011205	CAT	2	6	26749	26754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245430
602	NC_011205	GCC	2	6	26770	26775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245430
603	NC_011205	CCG	2	6	26808	26813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245430
604	NC_011205	GCG	2	6	26817	26822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
605	NC_011205	CCG	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245430
606	NC_011205	GGC	2	6	26910	26915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
607	NC_011205	GCG	2	6	26924	26929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
608	NC_011205	AGT	2	6	26954	26959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245430
609	NC_011205	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	198245430
610	NC_011205	GCG	2	6	27075	27080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
611	NC_011205	ATA	2	6	27144	27149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245430
612	NC_011205	GAT	2	6	27263	27268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245430
613	NC_011205	ATT	2	6	27345	27350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245430
614	NC_011205	TTA	2	6	27358	27363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245430
615	NC_011205	AGG	2	6	27368	27373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245430
616	NC_011205	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	198245430
617	NC_011205	TTA	2	6	27426	27431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245430
618	NC_011205	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	198245430
619	NC_011205	TGA	2	6	27460	27465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245430
620	NC_011205	TTG	2	6	27476	27481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245430
621	NC_011205	ACA	2	6	27531	27536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245430
622	NC_011205	GAT	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245430
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624	NC_011205	ACA	2	6	27744	27749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245430
625	NC_011205	GCG	2	6	27786	27791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
626	NC_011205	CAG	2	6	27866	27871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245430
627	NC_011205	GCG	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245430
628	NC_011205	TGG	2	6	27897	27902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245430
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630	NC_011205	CG	3	6	28015	28020	0 %	0 %	50 %	50 %	198245430
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634	NC_011205	TGA	2	6	28108	28113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245430
635	NC_011205	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	198245430
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648	NC_011205	A	6	6	28593	28598	100 %	0 %	0 %	0 %	198246163
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767	NC_011205	TTGG	2	8	33914	33921	0 %	50 %	50 %	0 %	198244833
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