MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011205	CGT	2	6	252466	252471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245098
5502	NC_011205	CAT	2	6	252505	252510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245098
5503	NC_011205	GTC	2	6	252556	252561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245098
5504	NC_011205	GCAG	2	8	252626	252633	25 %	0 %	50 %	25 %	198245098
5505	NC_011205	AGC	2	6	252662	252667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245098
5506	NC_011205	AGT	2	6	252705	252710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245098
5507	NC_011205	TCA	2	6	252714	252719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245098
5508	NC_011205	CGC	2	6	252744	252749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245098
5509	NC_011205	CAG	2	6	252790	252795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245098
5510	NC_011205	ACC	2	6	252815	252820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245098
5511	NC_011205	CG	3	6	252874	252879	0 %	0 %	50 %	50 %	198245098
5512	NC_011205	CCA	2	6	252906	252911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245098
5513	NC_011205	CGAG	2	8	252918	252925	25 %	0 %	50 %	25 %	198245098
5514	NC_011205	GCC	2	6	252979	252984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245098
5515	NC_011205	GCT	2	6	252988	252993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245098
5516	NC_011205	TGG	2	6	253037	253042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245098
5517	NC_011205	GGC	2	6	253066	253071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245098
5518	NC_011205	CAG	2	6	253150	253155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245098
5519	NC_011205	TTG	2	6	253173	253178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245098
5520	NC_011205	CAGA	2	8	253191	253198	50 %	0 %	25 %	25 %	198245098
5521	NC_011205	CAG	2	6	253204	253209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245098
5522	NC_011205	CGTA	2	8	253222	253229	25 %	25 %	25 %	25 %	198245098
5523	NC_011205	ATA	2	6	253260	253265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245098
5524	NC_011205	CAG	2	6	253270	253275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245098
5525	NC_011205	CGC	2	6	253359	253364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245098
5526	NC_011205	GCC	2	6	253372	253377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245098
5527	NC_011205	CAA	2	6	253438	253443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245098
5528	NC_011205	CCAG	2	8	253512	253519	25 %	0 %	25 %	50 %	198245098
5529	NC_011205	GC	3	6	253568	253573	0 %	0 %	50 %	50 %	198245098
5530	NC_011205	AGGG	2	8	253603	253610	25 %	0 %	75 %	0 %	198245098
5531	NC_011205	CT	3	6	253796	253801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_011205	GCC	2	6	253803	253808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_011205	ATT	2	6	253890	253895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244479
5534	NC_011205	CGT	2	6	253896	253901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244479
5535	NC_011205	GT	3	6	253900	253905	0 %	50 %	50 %	0 %	198244479
5536	NC_011205	GAT	2	6	253906	253911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244479
5537	NC_011205	ACG	2	6	254105	254110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244479
5538	NC_011205	CAT	2	6	254124	254129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244479
5539	NC_011205	GCA	2	6	254133	254138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244479
5540	NC_011205	TTC	2	6	254146	254151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244479
5541	NC_011205	CCTTCG	2	12	254204	254215	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	198244479
5542	NC_011205	GGC	2	6	254230	254235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244479
5543	NC_011205	CT	3	6	254291	254296	0 %	50 %	0 %	50 %	198244479
5544	NC_011205	CGA	2	6	254340	254345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244479
5545	NC_011205	CAC	2	6	254455	254460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244479
5546	NC_011205	AGGC	2	8	254507	254514	25 %	0 %	50 %	25 %	198244479
5547	NC_011205	GTT	2	6	254526	254531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244479
5548	NC_011205	GGT	2	6	254572	254577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244479
5549	NC_011205	T	6	6	254646	254651	0 %	100 %	0 %	0 %	198244479
5550	NC_011205	GAT	2	6	254706	254711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_011205	AAT	2	6	254718	254723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_011205	TCAG	2	8	254746	254753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5553	NC_011205	T	6	6	254822	254827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_011205	GCC	2	6	254875	254880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_011205	CAA	2	6	254924	254929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_011205	GC	3	6	254963	254968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_011205	AC	3	6	254994	254999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_011205	AAC	2	6	255032	255037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_011205	AC	4	8	255036	255043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_011205	GC	3	6	255233	255238	0 %	0 %	50 %	50 %	198243582
5561	NC_011205	CAT	2	6	255252	255257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243582
5562	NC_011205	CTGAA	2	10	255299	255308	40 %	20 %	20 %	20 %	198243582
5563	NC_011205	AAGCG	2	10	255363	255372	40 %	0 %	40 %	20 %	198243582
5564	NC_011205	GCT	2	6	255382	255387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243582
5565	NC_011205	TTC	2	6	255403	255408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198243582
5566	NC_011205	GCTG	2	8	255419	255426	0 %	25 %	50 %	25 %	198243582
5567	NC_011205	AAGA	2	8	255526	255533	75 %	0 %	25 %	0 %	198243582
5568	NC_011205	AAC	2	6	255664	255669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198243582
5569	NC_011205	GAA	2	6	255835	255840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198243582
5570	NC_011205	TAA	2	6	255859	255864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243582
5571	NC_011205	GGC	2	6	255903	255908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_011205	GTA	2	6	256016	256021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011205	ATG	2	6	256176	256181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243113
5574	NC_011205	A	6	6	256188	256193	100 %	0 %	0 %	0 %	198243113
5575	NC_011205	CTGA	2	8	256197	256204	25 %	25 %	25 %	25 %	198243113
5576	NC_011205	GCG	2	6	256263	256268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243113
5577	NC_011205	A	6	6	256269	256274	100 %	0 %	0 %	0 %	198243113
5578	NC_011205	GCT	2	6	256287	256292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243113
5579	NC_011205	GACT	2	8	256355	256362	25 %	25 %	25 %	25 %	198243113
5580	NC_011205	CGC	2	6	256412	256417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243113
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5582	NC_011205	TCG	2	6	256514	256519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243113
5583	NC_011205	GC	3	6	256566	256571	0 %	0 %	50 %	50 %	198243113
5584	NC_011205	AGC	2	6	256618	256623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243113
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5588	NC_011205	GAA	2	6	256778	256783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198243113
5589	NC_011205	CTG	2	6	256851	256856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243113
5590	NC_011205	GACT	2	8	256925	256932	25 %	25 %	25 %	25 %	198243113
5591	NC_011205	GCA	2	6	256935	256940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243113
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5593	NC_011205	GAG	2	6	256978	256983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011205	CTT	2	6	256998	257003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_011205	CT	3	6	257011	257016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_011205	GAAA	2	8	257106	257113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_011205	GCG	2	6	257164	257169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242567
5598	NC_011205	TGGTG	2	10	257267	257276	0 %	40 %	60 %	0 %	198242567
5599	NC_011205	GGT	2	6	257283	257288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242567
5600	NC_011205	CGCC	2	8	257417	257424	0 %	0 %	25 %	75 %	198242567
5601	NC_011205	CTG	2	6	257487	257492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242567
5602	NC_011205	TAA	2	6	257495	257500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242567
5603	NC_011205	TCTG	2	8	257513	257520	0 %	50 %	25 %	25 %	198242567
5604	NC_011205	TTC	2	6	257538	257543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242567
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5606	NC_011205	GC	3	6	257785	257790	0 %	0 %	50 %	50 %	198242567
5607	NC_011205	CGT	2	6	257793	257798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242567
5608	NC_011205	GTG	2	6	257799	257804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242567
5609	NC_011205	AAG	2	6	257815	257820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242567
5610	NC_011205	AAT	2	6	257836	257841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242567
5611	NC_011205	TTA	2	6	257889	257894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_011205	TG	3	6	257939	257944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_011205	GTCTG	2	10	257948	257957	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5614	NC_011205	CTG	2	6	258092	258097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242060
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5619	NC_011205	CGTC	2	8	258376	258383	0 %	25 %	25 %	50 %	198242060
5620	NC_011205	TCG	2	6	258445	258450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242060
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5624	NC_011205	TGAT	2	8	258542	258549	25 %	50 %	25 %	0 %	198242060
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5747	NC_011205	ACA	2	6	264782	264787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241995
5748	NC_011205	CTG	2	6	264881	264886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241995
5749	NC_011205	CAG	2	6	264891	264896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241995
5750	NC_011205	TGA	2	6	264906	264911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241995
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5752	NC_011205	TAC	2	6	265027	265032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241995
5753	NC_011205	GTGG	2	8	265083	265090	0 %	25 %	75 %	0 %	198241995
5754	NC_011205	GGC	2	6	265129	265134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241995
5755	NC_011205	GGT	2	6	265168	265173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241995
5756	NC_011205	CGTG	2	8	265182	265189	0 %	25 %	50 %	25 %	198241995
5757	NC_011205	ATG	2	6	265259	265264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241995
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5764	NC_011205	TCT	2	6	265550	265555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241995
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5766	NC_011205	GCT	2	6	265812	265817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242621
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5772	NC_011205	A	6	6	266127	266132	100 %	0 %	0 %	0 %	198242621
5773	NC_011205	TGG	2	6	266158	266163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242621
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5781	NC_011205	TCG	2	6	266665	266670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245250
5782	NC_011205	A	6	6	266672	266677	100 %	0 %	0 %	0 %	198245250
5783	NC_011205	TCCAG	2	10	266758	266767	20 %	20 %	20 %	40 %	198245250
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5794	NC_011205	TGA	2	6	267212	267217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245250
5795	NC_011205	CAA	2	6	267258	267263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245250
5796	NC_011205	TTA	2	6	267335	267340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5807	NC_011205	TGAT	2	8	267835	267842	25 %	50 %	25 %	0 %	198244535
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5826	NC_011205	CCGT	2	8	268988	268995	0 %	25 %	25 %	50 %	198242586
5827	NC_011205	ATGCC	2	10	269130	269139	20 %	20 %	20 %	40 %	198242586
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5846	NC_011205	CG	3	6	269980	269985	0 %	0 %	50 %	50 %	198243184
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5988	NC_011205	CAT	2	6	276865	276870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245178
5989	NC_011205	TTG	2	6	276983	276988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245178
5990	NC_011205	GCG	2	6	277017	277022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245178
5991	NC_011205	CT	3	6	277092	277097	0 %	50 %	0 %	50 %	198245178
5992	NC_011205	T	6	6	277163	277168	0 %	100 %	0 %	0 %	198245178
5993	NC_011205	GCTG	2	8	277183	277190	0 %	25 %	50 %	25 %	198245178
5994	NC_011205	TCA	2	6	277210	277215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245178
5995	NC_011205	ATA	2	6	277236	277241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245178
5996	NC_011205	CGC	2	6	277245	277250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245178
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5998	NC_011205	T	6	6	277367	277372	0 %	100 %	0 %	0 %	198245178
5999	NC_011205	GGC	2	6	277373	277378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245178
6000	NC_011205	GCT	2	6	277426	277431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245178

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