MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 102321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011205	ATT	2	6	207631	207636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245891
4502	NC_011205	TGG	2	6	207826	207831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245891
4503	NC_011205	ATT	2	6	207849	207854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245891
4504	NC_011205	GGCT	2	8	207910	207917	0 %	25 %	50 %	25 %	198245891
4505	NC_011205	ATC	2	6	207970	207975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245891
4506	NC_011205	TGA	2	6	207986	207991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245891
4507	NC_011205	CCA	2	6	208018	208023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245891
4508	NC_011205	TTCGG	2	10	208028	208037	0 %	40 %	40 %	20 %	198245891
4509	NC_011205	GGA	2	6	208103	208108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245891
4510	NC_011205	GC	4	8	208137	208144	0 %	0 %	50 %	50 %	198245891
4511	NC_011205	TGA	2	6	208160	208165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245891
4512	NC_011205	TAT	2	6	208235	208240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245891
4513	NC_011205	T	6	6	208355	208360	0 %	100 %	0 %	0 %	198245891
4514	NC_011205	CGC	2	6	208380	208385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245891
4515	NC_011205	TA	3	6	208393	208398	50 %	50 %	0 %	0 %	198245891
4516	NC_011205	ATA	2	6	208411	208416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245891
4517	NC_011205	CA	3	6	208451	208456	50 %	0 %	0 %	50 %	198245891
4518	NC_011205	TCTT	2	8	208478	208485	0 %	75 %	0 %	25 %	198245891
4519	NC_011205	GGC	2	6	208494	208499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245891
4520	NC_011205	AGC	2	6	208520	208525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245891
4521	NC_011205	CAC	2	6	208553	208558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245891
4522	NC_011205	TGC	2	6	208594	208599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245891
4523	NC_011205	CTT	2	6	208772	208777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242710
4524	NC_011205	GCC	2	6	208837	208842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242710
4525	NC_011205	GAT	2	6	208857	208862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242710
4526	NC_011205	CTTGC	2	10	209037	209046	0 %	40 %	20 %	40 %	198242710
4527	NC_011205	CTT	2	6	209066	209071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_011205	GGC	3	9	209212	209220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243382
4529	NC_011205	GTC	2	6	209287	209292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243382
4530	NC_011205	TTCA	2	8	209308	209315	25 %	50 %	0 %	25 %	198243382
4531	NC_011205	GGCAAT	2	12	209326	209337	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	198243382
4532	NC_011205	TCA	2	6	209388	209393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243382
4533	NC_011205	GCT	2	6	209421	209426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243382
4534	NC_011205	TGAGC	2	10	209449	209458	20 %	20 %	40 %	20 %	198243382
4535	NC_011205	AAT	2	6	209479	209484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243382
4536	NC_011205	CGA	2	6	209493	209498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243382
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4538	NC_011205	CGC	2	6	209625	209630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243382
4539	NC_011205	AG	3	6	209668	209673	50 %	0 %	50 %	0 %	198243382
4540	NC_011205	ACGT	2	8	209687	209694	25 %	25 %	25 %	25 %	198243382
4541	NC_011205	CCGG	2	8	209817	209824	0 %	0 %	50 %	50 %	198243382
4542	NC_011205	CAC	2	6	209860	209865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198243382
4543	NC_011205	CGT	2	6	209907	209912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243382
4544	NC_011205	TGG	2	6	209925	209930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243382
4545	NC_011205	GAC	2	6	209964	209969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243382
4546	NC_011205	GCA	2	6	209982	209987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243382
4547	NC_011205	CAA	2	6	210012	210017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198243382
4548	NC_011205	TGA	2	6	210034	210039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_011205	GCGCT	2	10	210052	210061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4550	NC_011205	CGCGT	2	10	210104	210113	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4551	NC_011205	TTC	2	6	210153	210158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198243907
4552	NC_011205	CTG	2	6	210195	210200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243907
4553	NC_011205	CGG	2	6	210203	210208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243907
4554	NC_011205	GCC	2	6	210261	210266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243907
4555	NC_011205	GCCGAT	2	12	210324	210335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198243907
4556	NC_011205	GCAC	2	8	210383	210390	25 %	0 %	25 %	50 %	198243907
4557	NC_011205	CCAGCA	2	12	210392	210403	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198243907
4558	NC_011205	CAG	2	6	210441	210446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243907
4559	NC_011205	GCC	2	6	210483	210488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243907
4560	NC_011205	CGGCA	2	10	210534	210543	20 %	0 %	40 %	40 %	198243907
4561	NC_011205	CCAG	2	8	210572	210579	25 %	0 %	25 %	50 %	198243907
4562	NC_011205	GCC	2	6	210582	210587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243907
4563	NC_011205	CGCA	2	8	210612	210619	25 %	0 %	25 %	50 %	198243907
4564	NC_011205	GC	3	6	210701	210706	0 %	0 %	50 %	50 %	198243907
4565	NC_011205	GCACG	2	10	210713	210722	20 %	0 %	40 %	40 %	198243907
4566	NC_011205	TCG	2	6	210823	210828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243907
4567	NC_011205	T	6	6	210879	210884	0 %	100 %	0 %	0 %	198243907
4568	NC_011205	CTTG	2	8	210887	210894	0 %	50 %	25 %	25 %	198243907
4569	NC_011205	GCA	2	6	210902	210907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243907
4570	NC_011205	GTG	2	6	210916	210921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243907
4571	NC_011205	G	6	6	210984	210989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_011205	GCA	2	6	211069	211074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243902
4573	NC_011205	AGATC	2	10	211118	211127	40 %	20 %	20 %	20 %	198243902
4574	NC_011205	CGGT	2	8	211198	211205	0 %	25 %	50 %	25 %	198243902
4575	NC_011205	GCGT	2	8	211247	211254	0 %	25 %	50 %	25 %	198243902
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4581	NC_011205	CGG	3	9	211572	211580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245984
4582	NC_011205	TCG	2	6	211593	211598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245984
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4587	NC_011205	CGCGG	2	10	211724	211733	0 %	0 %	60 %	40 %	198245984
4588	NC_011205	GAC	2	6	211774	211779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245984
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4590	NC_011205	T	6	6	211927	211932	0 %	100 %	0 %	0 %	198245984
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4592	NC_011205	GGC	2	6	211964	211969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245984
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4594	NC_011205	ATG	2	6	212040	212045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245984
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4599	NC_011205	GGA	2	6	212196	212201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245984
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4601	NC_011205	CTT	2	6	212356	212361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245984
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4603	NC_011205	GTA	2	6	212414	212419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245984
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4605	NC_011205	TGT	2	6	212476	212481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245984
4606	NC_011205	GCA	3	9	212485	212493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245984
4607	NC_011205	ATG	2	6	212543	212548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245984
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4610	NC_011205	AAT	2	6	212637	212642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245984
4611	NC_011205	CCG	3	9	212721	212729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245984
4612	NC_011205	CTC	2	6	212873	212878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_011205	TAA	2	6	212949	212954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_011205	AG	3	6	212999	213004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_011205	CAT	2	6	213026	213031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_011205	CGC	2	6	213035	213040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_011205	GCA	2	6	213168	213173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245792
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4619	NC_011205	ACG	2	6	213203	213208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245792
4620	NC_011205	GCCA	2	8	213351	213358	25 %	0 %	25 %	50 %	198245792
4621	NC_011205	TCG	2	6	213443	213448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245792
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4992	NC_011205	GTT	2	6	228167	228172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4993	NC_011205	CTT	2	6	228175	228180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4994	NC_011205	ATATA	2	10	228214	228223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_011205	CTA	2	6	228227	228232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4996	NC_011205	TAA	2	6	228295	228300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_011205	CAG	2	6	228317	228322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244279
4998	NC_011205	TGC	2	6	228336	228341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244279
4999	NC_011205	TGC	2	6	228375	228380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244279
5000	NC_011205	CGA	2	6	228450	228455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244279

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