MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 1524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011204	GTTC	2	8	23857	23864	0 %	50 %	25 %	25 %	198241645
502	NC_011204	TGC	2	6	23914	23919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241645
503	NC_011204	CGC	2	6	23992	23997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241645
504	NC_011204	CCA	2	6	24073	24078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241645
505	NC_011204	CGC	2	6	24155	24160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241645
506	NC_011204	AAT	2	6	24180	24185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241645
507	NC_011204	CTG	2	6	24321	24326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241645
508	NC_011204	GCC	2	6	24345	24350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241645
509	NC_011204	AGC	2	6	24412	24417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011204	A	6	6	24450	24455	100 %	0 %	0 %	0 %	198241675
511	NC_011204	AAT	2	6	24501	24506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241675
512	NC_011204	TAC	2	6	24555	24560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241675
513	NC_011204	A	6	6	24578	24583	100 %	0 %	0 %	0 %	198241675
514	NC_011204	TA	3	6	24586	24591	50 %	50 %	0 %	0 %	198241675
515	NC_011204	GAG	2	6	24709	24714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241675
516	NC_011204	TGC	2	6	24775	24780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011204	G	6	6	24786	24791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011204	CGT	2	6	24815	24820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241671
519	NC_011204	CACC	2	8	24950	24957	25 %	0 %	0 %	75 %	198241671
520	NC_011204	GCC	2	6	24959	24964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241671
521	NC_011204	GCC	2	6	25015	25020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241671
522	NC_011204	AG	3	6	25107	25112	50 %	0 %	50 %	0 %	198241671
523	NC_011204	A	6	6	25134	25139	100 %	0 %	0 %	0 %	198241671
524	NC_011204	TC	3	6	25177	25182	0 %	50 %	0 %	50 %	198241671
525	NC_011204	CAGGGT	2	12	25238	25249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198241671
526	NC_011204	CGG	2	6	25259	25264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241671
527	NC_011204	TGG	2	6	25290	25295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241671
528	NC_011204	GTG	2	6	25296	25301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241671
529	NC_011204	GGACA	2	10	25322	25331	40 %	0 %	40 %	20 %	198241671
530	NC_011204	GCA	2	6	25396	25401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241671
531	NC_011204	CCGT	2	8	25407	25414	0 %	25 %	25 %	50 %	198241671
532	NC_011204	CCA	2	6	25423	25428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241671
533	NC_011204	CGA	2	6	25430	25435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241671
534	NC_011204	GGTC	2	8	25441	25448	0 %	25 %	50 %	25 %	198241671
535	NC_011204	GA	3	6	25491	25496	50 %	0 %	50 %	0 %	198241671
536	NC_011204	TCC	2	6	25548	25553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241671
537	NC_011204	CCA	2	6	25594	25599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241671
538	NC_011204	AGA	2	6	25602	25607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241671
539	NC_011204	GCCA	2	8	25610	25617	25 %	0 %	25 %	50 %	198241671
540	NC_011204	GTTCA	2	10	25668	25677	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
541	NC_011204	CAG	3	9	25755	25763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241654
542	NC_011204	TGT	2	6	25829	25834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198241654
543	NC_011204	A	7	7	25843	25849	100 %	0 %	0 %	0 %	198241668
544	NC_011204	ATTC	2	8	25933	25940	25 %	50 %	0 %	25 %	198241668
545	NC_011204	A	6	6	25968	25973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011204	GAC	2	6	25989	25994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011204	TAA	2	6	26011	26016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011204	ATC	2	6	26017	26022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011204	TCA	2	6	26033	26038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011204	TC	3	6	26073	26078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_011204	GCC	2	6	26113	26118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241684
552	NC_011204	CATT	2	8	26143	26150	25 %	50 %	0 %	25 %	198241684
553	NC_011204	CCA	2	6	26155	26160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241684
554	NC_011204	CCTGG	2	10	26192	26201	0 %	20 %	40 %	40 %	198241684
555	NC_011204	CCA	2	6	26479	26484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241687
556	NC_011204	TAA	2	6	26499	26504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241687
557	NC_011204	GCC	2	6	26517	26522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241687
558	NC_011204	TCAG	2	8	26583	26590	25 %	25 %	25 %	25 %	198241687
559	NC_011204	CCGGC	2	10	26605	26614	0 %	0 %	40 %	60 %	198241687
560	NC_011204	GCA	2	6	26635	26640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241687
561	NC_011204	GGA	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241687
562	NC_011204	AAC	2	6	26732	26737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241687
563	NC_011204	GCA	2	6	26761	26766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241687
564	NC_011204	GCC	2	6	26785	26790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241687
565	NC_011204	CCA	2	6	26821	26826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241687
566	NC_011204	CAC	2	6	26867	26872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241687
567	NC_011204	CAG	2	6	26909	26914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241687
568	NC_011204	CAG	2	6	26936	26941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241687
569	NC_011204	CGG	2	6	26952	26957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241687
570	NC_011204	CAG	2	6	27045	27050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011204	CAC	2	6	27111	27116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241693
572	NC_011204	CTC	2	6	27150	27155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241693
573	NC_011204	T	6	6	27217	27222	0 %	100 %	0 %	0 %	198241693
574	NC_011204	CCGG	2	8	27269	27276	0 %	0 %	50 %	50 %	198241693
575	NC_011204	CAG	2	6	27327	27332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241693
576	NC_011204	GGT	2	6	27399	27404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241693
577	NC_011204	GCCAG	2	10	27413	27422	20 %	0 %	40 %	40 %	198241693
578	NC_011204	TGGC	2	8	27427	27434	0 %	25 %	50 %	25 %	198241693
579	NC_011204	GAC	2	6	27498	27503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241693
580	NC_011204	GCA	2	6	27518	27523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241693
581	NC_011204	TAA	2	6	27589	27594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241693
582	NC_011204	TCAC	2	8	27613	27620	25 %	25 %	0 %	50 %	198241693
583	NC_011204	CCT	2	6	27626	27631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241693
584	NC_011204	CTGCCA	2	12	27657	27668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198241693
585	NC_011204	GGCT	2	8	27757	27764	0 %	25 %	50 %	25 %	198241693
586	NC_011204	CGGATG	2	12	27770	27781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198241693
587	NC_011204	ATA	2	6	27798	27803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241693
588	NC_011204	A	7	7	27851	27857	100 %	0 %	0 %	0 %	198241647
589	NC_011204	AGC	2	6	27881	27886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241647
590	NC_011204	CGG	2	6	28036	28041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241647
591	NC_011204	GCG	2	6	28198	28203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241700
592	NC_011204	GCT	2	6	28230	28235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241700
593	NC_011204	GCA	2	6	28286	28291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241700
594	NC_011204	CTGCC	2	10	28302	28311	0 %	20 %	20 %	60 %	198241700
595	NC_011204	GGC	2	6	28330	28335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241700
596	NC_011204	GCA	2	6	28400	28405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241700
597	NC_011204	CGC	2	6	28410	28415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241700
598	NC_011204	TCCC	2	8	28452	28459	0 %	25 %	0 %	75 %	198241700
599	NC_011204	GCG	2	6	28544	28549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241700
600	NC_011204	CGGC	2	8	28561	28568	0 %	0 %	50 %	50 %	198241700
601	NC_011204	GGT	2	6	28572	28577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241700
602	NC_011204	CAG	2	6	28593	28598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241700
603	NC_011204	TG	3	6	28675	28680	0 %	50 %	50 %	0 %	198241700
604	NC_011204	TTCCC	2	10	28681	28690	0 %	40 %	0 %	60 %	198241700
605	NC_011204	GCCC	2	8	28730	28737	0 %	0 %	25 %	75 %	198241700
606	NC_011204	CA	3	6	28785	28790	50 %	0 %	0 %	50 %	198241700
607	NC_011204	GCA	2	6	28796	28801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241700
608	NC_011204	GGC	2	6	28806	28811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241700
609	NC_011204	CAG	2	6	28812	28817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241700
610	NC_011204	TTC	2	6	28843	28848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_011204	ACCGTC	2	12	28873	28884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198241651
612	NC_011204	CGG	2	6	28952	28957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241651
613	NC_011204	GCC	3	9	28966	28974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241651
614	NC_011204	CAGC	2	8	28994	29001	25 %	0 %	25 %	50 %	198241651
615	NC_011204	CTGA	2	8	29007	29014	25 %	25 %	25 %	25 %	198241651
616	NC_011204	TCAGCA	2	12	29063	29074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	198241651
617	NC_011204	TGCC	2	8	29156	29163	0 %	25 %	25 %	50 %	198241651
618	NC_011204	GAAA	2	8	29223	29230	75 %	0 %	25 %	0 %	198241651
619	NC_011204	CGT	2	6	29295	29300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241651
620	NC_011204	GCC	2	6	29304	29309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241651
621	NC_011204	CTG	2	6	29338	29343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241651
622	NC_011204	ACC	2	6	29370	29375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241651
623	NC_011204	CCG	2	6	29566	29571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241651
624	NC_011204	TGC	2	6	29592	29597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241651
625	NC_011204	ATA	2	6	29632	29637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241651
626	NC_011204	ATG	2	6	29646	29651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241651
627	NC_011204	TAAT	2	8	29694	29701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011204	AAC	2	6	29703	29708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011204	CTGA	2	8	29765	29772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_011204	TTA	2	6	29810	29815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011204	CTGC	2	8	29887	29894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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645	NC_011204	TA	3	6	30519	30524	50 %	50 %	0 %	0 %	198241646
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652	NC_011204	CCA	2	6	30677	30682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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661	NC_011204	AAC	2	6	31161	31166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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663	NC_011204	TTA	2	6	31260	31265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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752	NC_011204	GACGA	2	10	36305	36314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
753	NC_011204	CTT	2	6	36336	36341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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759	NC_011204	TCT	3	9	36506	36514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241698
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762	NC_011204	ACTT	2	8	36657	36664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
763	NC_011204	GAC	2	6	36809	36814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_011204	CTG	2	6	36841	36846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
765	NC_011204	GAA	2	6	36910	36915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
766	NC_011204	AC	3	6	36922	36927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
767	NC_011204	CAG	2	6	36959	36964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_011204	CTG	2	6	36978	36983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_011204	T	6	6	36993	36998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_011204	TCCAG	2	10	37013	37022	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
771	NC_011204	C	6	6	37025	37030	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
772	NC_011204	TAA	2	6	37058	37063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_011204	GCCA	2	8	37068	37075	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
774	NC_011204	GCT	2	6	37148	37153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_011204	ACGG	2	8	37186	37193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
776	NC_011204	CAG	2	6	37218	37223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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778	NC_011204	TTA	2	6	37314	37319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241683
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782	NC_011204	CGC	2	6	37500	37505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241694
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788	NC_011204	GCG	2	6	37664	37669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241694
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1000	NC_011204	T	7	7	47975	47981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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