MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 11264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011149	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011149	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	197250740
3	NC_011149	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	197250740
4	NC_011149	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	197249934
5	NC_011149	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	197249168
6	NC_011149	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	197249168
7	NC_011149	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	197249168
8	NC_011149	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	197249168
9	NC_011149	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	197249168
10	NC_011149	TGAG	2	8	6623	6630	25 %	25 %	50 %	0 %	197248129
11	NC_011149	GCCA	2	8	6663	6670	25 %	0 %	25 %	50 %	197248129
12	NC_011149	GGCG	2	8	6789	6796	0 %	0 %	75 %	25 %	197248129
13	NC_011149	TGAA	2	8	7289	7296	50 %	25 %	25 %	0 %	197248129
14	NC_011149	GCGT	2	8	8155	8162	0 %	25 %	50 %	25 %	197248384
15	NC_011149	AAGA	2	8	8237	8244	75 %	0 %	25 %	0 %	197248384
16	NC_011149	CTGT	2	8	8665	8672	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011149	TCCG	2	8	9278	9285	0 %	25 %	25 %	50 %	197251166
18	NC_011149	GAAC	2	8	9717	9724	50 %	0 %	25 %	25 %	197251907
19	NC_011149	CAGG	2	8	10121	10128	25 %	0 %	50 %	25 %	197250147
20	NC_011149	TTGA	2	8	10976	10983	25 %	50 %	25 %	0 %	197248692
21	NC_011149	TGGC	2	8	11003	11010	0 %	25 %	50 %	25 %	197248692
22	NC_011149	TCGT	2	8	11123	11130	0 %	50 %	25 %	25 %	197248692
23	NC_011149	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	197247366
24	NC_011149	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	197247979
25	NC_011149	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	197247979
26	NC_011149	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	197247979
27	NC_011149	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	197247979
28	NC_011149	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	197247979
29	NC_011149	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	197247979
30	NC_011149	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	197250919
31	NC_011149	TCAG	2	8	15244	15251	25 %	25 %	25 %	25 %	197251857
32	NC_011149	TTTG	2	8	15534	15541	0 %	75 %	25 %	0 %	197251857
33	NC_011149	CGAA	2	8	15749	15756	50 %	0 %	25 %	25 %	197251857
34	NC_011149	ATTG	2	8	15761	15768	25 %	50 %	25 %	0 %	197251857
35	NC_011149	ATTA	2	8	16429	16436	50 %	50 %	0 %	0 %	197249970
36	NC_011149	ATAA	2	8	16521	16528	75 %	25 %	0 %	0 %	197250023
37	NC_011149	AATA	2	8	17997	18004	75 %	25 %	0 %	0 %	197248226
38	NC_011149	GGGC	2	8	18583	18590	0 %	0 %	75 %	25 %	197248226
39	NC_011149	CGTG	2	8	19283	19290	0 %	25 %	50 %	25 %	197248226
40	NC_011149	TCCA	2	8	20069	20076	25 %	25 %	0 %	50 %	197248849
41	NC_011149	CCAA	2	8	21285	21292	50 %	0 %	0 %	50 %	197248849
42	NC_011149	GACG	2	8	21631	21638	25 %	0 %	50 %	25 %	197248849
43	NC_011149	TGGC	2	8	22284	22291	0 %	25 %	50 %	25 %	197248849
44	NC_011149	TGGC	2	8	22390	22397	0 %	25 %	50 %	25 %	197248849
45	NC_011149	GCCA	2	8	22657	22664	25 %	0 %	25 %	50 %	197248849
46	NC_011149	CTGG	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	197248849
47	NC_011149	TTAT	2	8	23267	23274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011149	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	197250746
49	NC_011149	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	197250746
50	NC_011149	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	197250118
51	NC_011149	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	197250118
52	NC_011149	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	449785010
53	NC_011149	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	449785010
54	NC_011149	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	197251618
55	NC_011149	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	197251618
56	NC_011149	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	197251618
57	NC_011149	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	197251618
58	NC_011149	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	197251618
59	NC_011149	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	197251618
60	NC_011149	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	197251618
61	NC_011149	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	197250867
62	NC_011149	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	197250867
63	NC_011149	ATGA	2	8	29973	29980	50 %	25 %	25 %	0 %	197250403
64	NC_011149	TGCT	2	8	30543	30550	0 %	50 %	25 %	25 %	449785011
65	NC_011149	TATC	2	8	30599	30606	25 %	50 %	0 %	25 %	449785011
66	NC_011149	GTAA	2	8	30636	30643	50 %	25 %	25 %	0 %	449785011
67	NC_011149	TTCG	2	8	30898	30905	0 %	50 %	25 %	25 %	449785011
68	NC_011149	GTCA	2	8	31408	31415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011149	ACCG	2	8	32228	32235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011149	AGGC	2	8	32266	32273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011149	CCTG	2	8	32702	32709	0 %	25 %	25 %	50 %	197247417
72	NC_011149	CGCA	2	8	32892	32899	25 %	0 %	25 %	50 %	197247417
73	NC_011149	TAAA	2	8	32962	32969	75 %	25 %	0 %	0 %	197247417
74	NC_011149	CCAG	2	8	33348	33355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011149	TTAT	2	8	33531	33538	25 %	75 %	0 %	0 %	197249381
76	NC_011149	TTGG	2	8	33915	33922	0 %	50 %	50 %	0 %	197249381
77	NC_011149	CTTC	2	8	33991	33998	0 %	50 %	0 %	50 %	197249381
78	NC_011149	CTTT	2	8	34295	34302	0 %	75 %	0 %	25 %	197249381
79	NC_011149	GAAG	2	8	34335	34342	50 %	0 %	50 %	0 %	197249381
80	NC_011149	TAAA	2	8	34387	34394	75 %	25 %	0 %	0 %	197250600
81	NC_011149	GTGC	2	8	34786	34793	0 %	25 %	50 %	25 %	197250600
82	NC_011149	TTAA	2	8	34796	34803	50 %	50 %	0 %	0 %	197250600
83	NC_011149	TGAT	2	8	35031	35038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011149	TGGA	2	8	35548	35555	25 %	25 %	50 %	0 %	197251278
85	NC_011149	GGGA	2	8	36492	36499	25 %	0 %	75 %	0 %	197251278
86	NC_011149	ATAC	2	8	37477	37484	50 %	25 %	0 %	25 %	197250571
87	NC_011149	CACG	2	8	38112	38119	25 %	0 %	25 %	50 %	197250571
88	NC_011149	TAAT	2	8	38214	38221	50 %	50 %	0 %	0 %	197250571
89	NC_011149	CCAT	2	8	38670	38677	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011149	ATTA	2	8	38764	38771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011149	AATT	2	8	40045	40052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011149	GCGG	2	8	40536	40543	0 %	0 %	75 %	25 %	197249148
93	NC_011149	CTGG	2	8	40754	40761	0 %	25 %	50 %	25 %	197249148
94	NC_011149	ATCG	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	197249148
95	NC_011149	TCAA	2	8	41488	41495	50 %	25 %	0 %	25 %	197249148
96	NC_011149	AACC	2	8	41754	41761	50 %	0 %	0 %	50 %	197247602
97	NC_011149	GAAA	2	8	41806	41813	75 %	0 %	25 %	0 %	197247602
98	NC_011149	GGTC	2	8	42378	42385	0 %	25 %	50 %	25 %	197247602
99	NC_011149	TTTG	2	8	42902	42909	0 %	75 %	25 %	0 %	197247602
100	NC_011149	GTAT	2	8	43197	43204	25 %	50 %	25 %	0 %	197247498
101	NC_011149	TCCG	2	8	43591	43598	0 %	25 %	25 %	50 %	197247498
102	NC_011149	ATGA	2	8	45653	45660	50 %	25 %	25 %	0 %	197248163
103	NC_011149	AACG	2	8	45955	45962	50 %	0 %	25 %	25 %	197248163
104	NC_011149	GAAA	2	8	46903	46910	75 %	0 %	25 %	0 %	197251902
105	NC_011149	TCGC	2	8	46918	46925	0 %	25 %	25 %	50 %	197251902
106	NC_011149	GCTG	2	8	47109	47116	0 %	25 %	50 %	25 %	197251902
107	NC_011149	CAGC	2	8	47834	47841	25 %	0 %	25 %	50 %	197250162
108	NC_011149	CTGC	2	8	47971	47978	0 %	25 %	25 %	50 %	197250162
109	NC_011149	TACC	2	8	48318	48325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011149	CATG	2	8	48539	48546	25 %	25 %	25 %	25 %	197248810
111	NC_011149	AAGT	2	8	49333	49340	50 %	25 %	25 %	0 %	197248810
112	NC_011149	CCAG	2	8	49391	49398	25 %	0 %	25 %	50 %	197248810
113	NC_011149	TTGA	2	8	50172	50179	25 %	50 %	25 %	0 %	197248810
114	NC_011149	GAAA	2	8	50507	50514	75 %	0 %	25 %	0 %	197249256
115	NC_011149	GCCA	2	8	50848	50855	25 %	0 %	25 %	50 %	197249256
116	NC_011149	TAAA	2	8	51241	51248	75 %	25 %	0 %	0 %	197249256
117	NC_011149	AGTA	2	8	51934	51941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011149	ATCA	2	8	51974	51981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011149	GAAA	2	8	52094	52101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011149	GAGG	2	8	52126	52133	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011149	CATA	2	8	52886	52893	50 %	25 %	0 %	25 %	197248853
122	NC_011149	TCAG	2	8	52897	52904	25 %	25 %	25 %	25 %	197248853
123	NC_011149	TGGC	2	8	53611	53618	0 %	25 %	50 %	25 %	197248853
124	NC_011149	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	197249034
125	NC_011149	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	197249034
126	NC_011149	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	197249034
127	NC_011149	TGAT	2	8	58322	58329	25 %	50 %	25 %	0 %	197251022
128	NC_011149	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	197247355
129	NC_011149	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	197247355
130	NC_011149	GATC	2	8	59758	59765	25 %	25 %	25 %	25 %	197247355
131	NC_011149	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	197250636
132	NC_011149	GTGG	2	8	61048	61055	0 %	25 %	75 %	0 %	197250636
133	NC_011149	CTGC	2	8	61258	61265	0 %	25 %	25 %	50 %	197248621
134	NC_011149	ACCA	2	8	61894	61901	50 %	0 %	0 %	50 %	197249131
135	NC_011149	GTGG	2	8	61929	61936	0 %	25 %	75 %	0 %	197249131
136	NC_011149	CATT	2	8	62119	62126	25 %	50 %	0 %	25 %	197249131
137	NC_011149	TACT	2	8	63479	63486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011149	TTTC	2	8	63487	63494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011149	GCCA	2	8	64746	64753	25 %	0 %	25 %	50 %	197250360
140	NC_011149	GCTG	2	8	65128	65135	0 %	25 %	50 %	25 %	197250006
141	NC_011149	CCCG	2	8	65735	65742	0 %	0 %	25 %	75 %	197250006
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