MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 69527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011149	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011149	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011149	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011149	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011149	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011149	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
7	NC_011149	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250740
8	NC_011149	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
9	NC_011149	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
10	NC_011149	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
11	NC_011149	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
12	NC_011149	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
13	NC_011149	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
14	NC_011149	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250740
15	NC_011149	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
16	NC_011149	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
17	NC_011149	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
18	NC_011149	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
19	NC_011149	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250740
20	NC_011149	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250740
21	NC_011149	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
22	NC_011149	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
23	NC_011149	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
24	NC_011149	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250740
25	NC_011149	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197250740
26	NC_011149	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
27	NC_011149	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
28	NC_011149	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250740
29	NC_011149	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250740
30	NC_011149	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250740
31	NC_011149	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250740
32	NC_011149	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250740
33	NC_011149	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250740
34	NC_011149	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
35	NC_011149	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
36	NC_011149	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250740
37	NC_011149	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
38	NC_011149	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250740
39	NC_011149	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250740
40	NC_011149	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
41	NC_011149	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250740
42	NC_011149	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
43	NC_011149	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
44	NC_011149	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
45	NC_011149	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250740
46	NC_011149	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
47	NC_011149	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
48	NC_011149	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250740
49	NC_011149	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
50	NC_011149	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
51	NC_011149	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
52	NC_011149	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249934
53	NC_011149	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249934
54	NC_011149	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249934
55	NC_011149	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249934
56	NC_011149	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249934
57	NC_011149	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249934
58	NC_011149	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249934
59	NC_011149	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249934
60	NC_011149	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249934
61	NC_011149	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249934
62	NC_011149	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249934
63	NC_011149	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249934
64	NC_011149	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249934
65	NC_011149	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249168
66	NC_011149	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249168
67	NC_011149	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249168
68	NC_011149	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
69	NC_011149	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
70	NC_011149	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249168
71	NC_011149	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
72	NC_011149	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249168
73	NC_011149	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249168
74	NC_011149	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249168
75	NC_011149	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249168
76	NC_011149	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249168
77	NC_011149	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249168
78	NC_011149	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197249168
79	NC_011149	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249168
80	NC_011149	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
81	NC_011149	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249168
82	NC_011149	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
83	NC_011149	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249168
84	NC_011149	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249168
85	NC_011149	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249168
86	NC_011149	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249168
87	NC_011149	GTG	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011149	TCA	2	6	5162	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249510
89	NC_011149	AAT	2	6	5227	5232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197249510
90	NC_011149	TCA	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249510
91	NC_011149	ACC	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249510
92	NC_011149	TCA	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249510
93	NC_011149	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249510
94	NC_011149	CAC	3	9	5383	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249510
95	NC_011149	TGT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249510
96	NC_011149	CGT	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249510
97	NC_011149	GCG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249510
98	NC_011149	GCT	2	6	5787	5792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249510
99	NC_011149	CGC	2	6	5930	5935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011149	ACC	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248129
101	NC_011149	CAA	2	6	6109	6114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248129
102	NC_011149	CGA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248129
103	NC_011149	CAG	2	6	6436	6441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248129
104	NC_011149	ATC	2	6	6446	6451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248129
105	NC_011149	GAT	2	6	6466	6471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248129
106	NC_011149	ACG	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248129
107	NC_011149	GCG	2	6	6861	6866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248129
108	NC_011149	CGA	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248129
109	NC_011149	GCC	2	6	7012	7017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248129
110	NC_011149	AGG	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248129
111	NC_011149	ATG	2	6	7094	7099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248129
112	NC_011149	GCG	2	6	7139	7144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248129
113	NC_011149	GCC	2	6	7225	7230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248129
114	NC_011149	AGC	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248129
115	NC_011149	TAA	2	6	7371	7376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248129
116	NC_011149	TTG	2	6	7407	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248129
117	NC_011149	TGA	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011149	ATG	2	6	7452	7457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011149	CGG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011149	CGT	2	6	7598	7603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011149	ATC	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011149	CAC	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248384
123	NC_011149	CAG	2	6	7844	7849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248384
124	NC_011149	AGC	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248384
125	NC_011149	CAG	2	6	7865	7870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248384
126	NC_011149	GTT	2	6	7871	7876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248384
127	NC_011149	ATG	2	6	8022	8027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248384
128	NC_011149	AAG	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248384
129	NC_011149	GCT	2	6	8131	8136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248384
130	NC_011149	TAC	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248384
131	NC_011149	CGT	2	6	8323	8328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248384
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258	NC_011149	CGA	2	6	15907	15912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251857
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261	NC_011149	ATT	2	6	16056	16061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_011149	TAT	2	6	16154	16159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249970
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