MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011149	GGGGA	2	10	187059	187068	20 %	0 %	80 %	0 %	197248333
4002	NC_011149	ATG	2	6	187166	187171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249020
4003	NC_011149	CG	3	6	187188	187193	0 %	0 %	50 %	50 %	197249020
4004	NC_011149	GCG	3	9	187191	187199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249020
4005	NC_011149	ACG	2	6	187226	187231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4006	NC_011149	GCT	2	6	187330	187335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4007	NC_011149	GCG	2	6	187336	187341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249020
4008	NC_011149	GGCG	2	8	187360	187367	0 %	0 %	75 %	25 %	197249020
4009	NC_011149	TC	3	6	187371	187376	0 %	50 %	0 %	50 %	197249020
4010	NC_011149	TGT	2	6	187380	187385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249020
4011	NC_011149	TGC	2	6	187395	187400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4012	NC_011149	TGC	3	9	187428	187436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4013	NC_011149	GTG	2	6	187437	187442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
4014	NC_011149	CTG	2	6	187457	187462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4015	NC_011149	CGC	2	6	187463	187468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249020
4016	NC_011149	CGA	2	6	187473	187478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4017	NC_011149	CTG	2	6	187479	187484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4018	NC_011149	ATT	2	6	187511	187516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249020
4019	NC_011149	CTG	2	6	187538	187543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4020	NC_011149	GCC	2	6	187632	187637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249020
4021	NC_011149	TGC	2	6	187668	187673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4022	NC_011149	CGC	2	6	187687	187692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249020
4023	NC_011149	TGG	2	6	187699	187704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
4024	NC_011149	TAT	2	6	187726	187731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249020
4025	NC_011149	TGC	2	6	187767	187772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4026	NC_011149	ATT	2	6	187820	187825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249020
4027	NC_011149	ACC	2	6	187868	187873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249020
4028	NC_011149	ATG	2	6	187874	187879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249020
4029	NC_011149	ATC	3	9	187883	187891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249020
4030	NC_011149	ATG	2	6	187892	187897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249020
4031	NC_011149	GTC	3	9	187898	187906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4032	NC_011149	TGG	2	6	187908	187913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
4033	NC_011149	TGA	2	6	187914	187919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249020
4034	NC_011149	TCG	2	6	187920	187925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4035	NC_011149	TGC	2	6	187939	187944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4036	NC_011149	AAC	2	6	187947	187952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249020
4037	NC_011149	GGT	2	6	187958	187963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
4038	NC_011149	CTG	2	6	188012	188017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4039	NC_011149	CGG	2	6	188042	188047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249020
4040	NC_011149	ACC	2	6	188106	188111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249020
4041	NC_011149	TGG	2	6	188173	188178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249020
4042	NC_011149	GTC	2	6	188181	188186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249020
4043	NC_011149	CGG	2	6	188191	188196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249020
4044	NC_011149	GAGC	2	8	188266	188273	25 %	0 %	50 %	25 %	197249020
4045	NC_011149	CATC	2	8	188293	188300	25 %	25 %	0 %	50 %	197249020
4046	NC_011149	TGGC	2	8	188421	188428	0 %	25 %	50 %	25 %	197249020
4047	NC_011149	CG	3	6	188470	188475	0 %	0 %	50 %	50 %	197249020
4048	NC_011149	GCC	2	6	188655	188660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249020
4049	NC_011149	CA	3	6	188730	188735	50 %	0 %	0 %	50 %	197249020
4050	NC_011149	TC	3	6	188775	188780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_011149	TGCC	2	8	188810	188817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_011149	T	6	6	188987	188992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_011149	T	6	6	189000	189005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011149	CTA	2	6	189070	189075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_011149	ACT	2	6	189076	189081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_011149	CAA	2	6	189113	189118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_011149	GAG	2	6	189145	189150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011149	TCG	2	6	189154	189159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4059	NC_011149	AGA	2	6	189164	189169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
4060	NC_011149	TGC	2	6	189194	189199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4061	NC_011149	GCT	2	6	189254	189259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4062	NC_011149	GAA	3	9	189279	189287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
4063	NC_011149	TCC	2	6	189317	189322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197249635
4064	NC_011149	GCT	2	6	189363	189368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4065	NC_011149	ACC	2	6	189384	189389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249635
4066	NC_011149	CTG	2	6	189423	189428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4067	NC_011149	ACA	2	6	189448	189453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249635
4068	NC_011149	CTG	2	6	189525	189530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4069	NC_011149	ACG	2	6	189547	189552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4070	NC_011149	AGA	2	6	189554	189559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
4071	NC_011149	CCG	2	6	189636	189641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249635
4072	NC_011149	A	6	6	189649	189654	100 %	0 %	0 %	0 %	197249635
4073	NC_011149	TCACCG	2	12	189655	189666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	197249635
4074	NC_011149	CGA	2	6	189695	189700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4075	NC_011149	A	6	6	189840	189845	100 %	0 %	0 %	0 %	197249635
4076	NC_011149	GTG	2	6	189873	189878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249635
4077	NC_011149	TTC	2	6	189887	189892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249635
4078	NC_011149	GCG	3	9	189961	189969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
4079	NC_011149	TCT	2	6	190000	190005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249635
4080	NC_011149	GC	3	6	190027	190032	0 %	0 %	50 %	50 %	197249635
4081	NC_011149	TGAT	2	8	190075	190082	25 %	50 %	25 %	0 %	197249635
4082	NC_011149	GTGC	2	8	190173	190180	0 %	25 %	50 %	25 %	197249635
4083	NC_011149	GGT	2	6	190182	190187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249635
4084	NC_011149	ACC	2	6	190218	190223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249635
4085	NC_011149	AGC	2	6	190290	190295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4086	NC_011149	GGTC	2	8	190322	190329	0 %	25 %	50 %	25 %	197249635
4087	NC_011149	GCG	2	6	190336	190341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
4088	NC_011149	TCCG	2	8	190351	190358	0 %	25 %	25 %	50 %	197249635
4089	NC_011149	TAC	2	6	190403	190408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249635
4090	NC_011149	CCG	2	6	190459	190464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249635
4091	NC_011149	CAC	2	6	190520	190525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249635
4092	NC_011149	CAC	2	6	190527	190532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249635
4093	NC_011149	TGC	3	9	190615	190623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4094	NC_011149	CGG	2	6	190640	190645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
4095	NC_011149	CGG	2	6	190684	190689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
4096	NC_011149	TGG	2	6	190699	190704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249635
4097	NC_011149	GCC	2	6	190710	190715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249635
4098	NC_011149	CTG	2	6	190842	190847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4099	NC_011149	GAA	2	6	190856	190861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
4100	NC_011149	TCT	2	6	190876	190881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249635
4101	NC_011149	CTG	2	6	191034	191039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4102	NC_011149	GAT	2	6	191045	191050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249635
4103	NC_011149	CGT	2	6	191070	191075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4104	NC_011149	CGT	2	6	191085	191090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4105	NC_011149	TGGC	2	8	191109	191116	0 %	25 %	50 %	25 %	197249635
4106	NC_011149	GCT	2	6	191126	191131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4107	NC_011149	GAC	2	6	191223	191228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4108	NC_011149	CTG	2	6	191235	191240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4109	NC_011149	CGA	2	6	191264	191269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4110	NC_011149	CG	3	6	191310	191315	0 %	0 %	50 %	50 %	197249635
4111	NC_011149	GCT	2	6	191324	191329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249635
4112	NC_011149	GCC	2	6	191372	191377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249635
4113	NC_011149	GAA	2	6	191406	191411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249635
4114	NC_011149	TAC	2	6	191415	191420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249635
4115	NC_011149	GCG	2	6	191437	191442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
4116	NC_011149	CG	3	6	191441	191446	0 %	0 %	50 %	50 %	197249635
4117	NC_011149	GTT	2	6	191461	191466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249635
4118	NC_011149	GGT	2	6	191510	191515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249635
4119	NC_011149	CTCTAC	2	12	191516	191527	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	197249635
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4121	NC_011149	GGC	2	6	191597	191602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
4122	NC_011149	CGG	2	6	191665	191670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249635
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4241	NC_011149	TACC	2	8	196517	196524	25 %	25 %	0 %	50 %	197250964
4242	NC_011149	CT	3	6	196545	196550	0 %	50 %	0 %	50 %	197250964
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4244	NC_011149	TAT	2	6	196643	196648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248316
4245	NC_011149	ATT	2	6	196696	196701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248316
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4259	NC_011149	A	6	6	197140	197145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_011149	ATA	2	6	197391	197396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4370	NC_011149	GCCCA	2	10	202096	202105	20 %	0 %	20 %	60 %	197251561
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4491	NC_011149	GCG	2	6	208567	208572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449785015
4492	NC_011149	GGCC	2	8	208604	208611	0 %	0 %	50 %	50 %	449785015
4493	NC_011149	TCG	2	6	208617	208622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449785015
4494	NC_011149	CGA	2	6	208628	208633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449785015
4495	NC_011149	TTG	2	6	208636	208641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449785015
4496	NC_011149	CGG	2	6	208642	208647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449785015
4497	NC_011149	AGCC	2	8	208696	208703	25 %	0 %	25 %	50 %	449785015
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4499	NC_011149	CAG	2	6	208727	208732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449785015
4500	NC_011149	GGAA	2	8	208763	208770	50 %	0 %	50 %	0 %	449785015

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