MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011149	GCC	2	6	162854	162859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3502	NC_011149	GCC	2	6	162875	162880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248857
3503	NC_011149	CCTTGC	2	12	162914	162925	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	197248857
3504	NC_011149	ATT	2	6	163029	163034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_011149	T	6	6	163102	163107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_011149	A	6	6	163125	163130	100 %	0 %	0 %	0 %	197250671
3507	NC_011149	ACG	2	6	163165	163170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250671
3508	NC_011149	TTA	2	6	163177	163182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250671
3509	NC_011149	CGC	2	6	163190	163195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250671
3510	NC_011149	CGG	2	6	163229	163234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250671
3511	NC_011149	CGA	2	6	163247	163252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250671
3512	NC_011149	ATT	2	6	163319	163324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250671
3513	NC_011149	AAG	2	6	163411	163416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250671
3514	NC_011149	CCG	2	6	163467	163472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250671
3515	NC_011149	ATT	2	6	163485	163490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250671
3516	NC_011149	TTA	2	6	163548	163553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247778
3517	NC_011149	CGG	3	9	163595	163603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247778
3518	NC_011149	CGT	2	6	163604	163609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3519	NC_011149	GCC	2	6	163630	163635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247778
3520	NC_011149	CAG	2	6	163737	163742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3521	NC_011149	GCA	2	6	163873	163878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3522	NC_011149	TCT	2	6	163882	163887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247778
3523	NC_011149	CGA	2	6	163937	163942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3524	NC_011149	TCT	2	6	164137	164142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247778
3525	NC_011149	GTA	2	6	164172	164177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247778
3526	NC_011149	TCG	2	6	164300	164305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3527	NC_011149	CGA	2	6	164323	164328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3528	NC_011149	CATA	2	8	164372	164379	50 %	25 %	0 %	25 %	197247778
3529	NC_011149	GTC	2	6	164445	164450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247778
3530	NC_011149	TAC	2	6	164540	164545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247778
3531	NC_011149	AGG	2	6	164550	164555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_011149	GGCA	2	8	164569	164576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_011149	GGCT	2	8	164631	164638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_011149	TAA	2	6	164639	164644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197247928
3535	NC_011149	ATG	2	6	164651	164656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247928
3536	NC_011149	GCG	2	6	164716	164721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247928
3537	NC_011149	GGA	2	6	164769	164774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247928
3538	NC_011149	TTG	2	6	164791	164796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247928
3539	NC_011149	ACC	2	6	164803	164808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197247928
3540	NC_011149	TGA	2	6	164877	164882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197247928
3541	NC_011149	CGG	2	6	164951	164956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197247928
3542	NC_011149	AACG	2	8	165055	165062	50 %	0 %	25 %	25 %	197247928
3543	NC_011149	CGC	2	6	165182	165187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247928
3544	NC_011149	TCA	2	6	165203	165208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197247928
3545	NC_011149	TC	3	6	165336	165341	0 %	50 %	0 %	50 %	197247928
3546	NC_011149	CGC	2	6	165342	165347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247928
3547	NC_011149	GAG	2	6	165430	165435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197247928
3548	NC_011149	CTGC	2	8	165439	165446	0 %	25 %	25 %	50 %	197247928
3549	NC_011149	TAT	2	6	165466	165471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247928
3550	NC_011149	CG	3	6	165478	165483	0 %	0 %	50 %	50 %	197247928
3551	NC_011149	TATT	2	8	165506	165513	25 %	75 %	0 %	0 %	197247928
3552	NC_011149	ATT	2	6	165515	165520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197247928
3553	NC_011149	GTC	2	6	165582	165587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248595
3554	NC_011149	CGC	2	6	165602	165607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248595
3555	NC_011149	CGG	2	6	165629	165634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248595
3556	NC_011149	C	6	6	165698	165703	0 %	0 %	0 %	100 %	197248595
3557	NC_011149	GAC	2	6	165705	165710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248595
3558	NC_011149	ACG	2	6	165736	165741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248595
3559	NC_011149	GCA	2	6	165905	165910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3560	NC_011149	CGT	2	6	165917	165922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3561	NC_011149	GATCA	2	10	165984	165993	40 %	20 %	20 %	20 %	197247589
3562	NC_011149	TGT	2	6	166069	166074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197247589
3563	NC_011149	GCC	2	6	166119	166124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247589
3564	NC_011149	GCT	2	6	166175	166180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3565	NC_011149	CTG	2	6	166227	166232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3566	NC_011149	GCT	2	6	166295	166300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3567	NC_011149	CAG	2	6	166317	166322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247589
3568	NC_011149	A	6	6	166378	166383	100 %	0 %	0 %	0 %	197247589
3569	NC_011149	TCT	2	6	166466	166471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197247589
3570	NC_011149	TTA	2	6	166602	166607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251746
3571	NC_011149	GC	3	6	166634	166639	0 %	0 %	50 %	50 %	197251746
3572	NC_011149	CG	3	6	166681	166686	0 %	0 %	50 %	50 %	197251746
3573	NC_011149	CAT	2	6	166690	166695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251746
3574	NC_011149	CGTCA	2	10	166730	166739	20 %	20 %	20 %	40 %	197251746
3575	NC_011149	ACC	2	6	166740	166745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251746
3576	NC_011149	CAG	2	6	166784	166789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251746
3577	NC_011149	CTG	2	6	166847	166852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251746
3578	NC_011149	TTC	2	6	166889	166894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251746
3579	NC_011149	A	6	6	166903	166908	100 %	0 %	0 %	0 %	197251746
3580	NC_011149	CGG	2	6	166926	166931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251746
3581	NC_011149	CGG	2	6	166945	166950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251746
3582	NC_011149	GGGC	2	8	166990	166997	0 %	0 %	75 %	25 %	197251746
3583	NC_011149	GC	3	6	167018	167023	0 %	0 %	50 %	50 %	197251746
3584	NC_011149	ATA	2	6	167025	167030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197251746
3585	NC_011149	CCG	2	6	167100	167105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251746
3586	NC_011149	CTA	2	6	167211	167216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_011149	A	7	7	167248	167254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_011149	GAA	2	6	167363	167368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250913
3589	NC_011149	CTG	2	6	167571	167576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250913
3590	NC_011149	GAA	2	6	167597	167602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250913
3591	NC_011149	A	6	6	167685	167690	100 %	0 %	0 %	0 %	197250913
3592	NC_011149	TCG	2	6	167775	167780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250913
3593	NC_011149	ACG	2	6	167912	167917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250913
3594	NC_011149	CGG	2	6	167952	167957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3595	NC_011149	GGC	2	6	167990	167995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3596	NC_011149	GGC	2	6	168011	168016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3597	NC_011149	GGC	3	9	168050	168058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3598	NC_011149	GGC	2	6	168077	168082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3599	NC_011149	AG	3	6	168100	168105	50 %	0 %	50 %	0 %	197250913
3600	NC_011149	CGG	2	6	168106	168111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3601	NC_011149	AGA	2	6	168121	168126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250913
3602	NC_011149	CGG	2	6	168190	168195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250913
3603	NC_011149	CG	3	6	168209	168214	0 %	0 %	50 %	50 %	197250913
3604	NC_011149	CCGC	2	8	168264	168271	0 %	0 %	25 %	75 %	197250913
3605	NC_011149	CAC	2	6	168343	168348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250913
3606	NC_011149	CTGG	2	8	168402	168409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_011149	ATCCC	2	10	168430	168439	20 %	20 %	0 %	60 %	197250502
3608	NC_011149	CCA	3	9	168481	168489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250502
3609	NC_011149	TGA	2	6	168511	168516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250502
3610	NC_011149	GCCAGC	2	12	168555	168566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	197250502
3611	NC_011149	GCA	2	6	168598	168603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250502
3612	NC_011149	T	6	6	168675	168680	0 %	100 %	0 %	0 %	197250502
3613	NC_011149	CT	3	6	168762	168767	0 %	50 %	0 %	50 %	197250502
3614	NC_011149	GAA	2	6	168787	168792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250502
3615	NC_011149	AGA	2	6	168888	168893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250502
3616	NC_011149	CGCTGC	2	12	168894	168905	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	197250502
3617	NC_011149	ATA	2	6	169011	169016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197250502
3618	NC_011149	CG	3	6	169018	169023	0 %	0 %	50 %	50 %	197250502
3619	NC_011149	AGA	2	6	169026	169031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250502
3620	NC_011149	GGC	2	6	169061	169066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250502
3621	NC_011149	GCA	2	6	169087	169092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250502
3622	NC_011149	GGC	2	6	169109	169114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250502
3623	NC_011149	AAT	2	6	169124	169129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197250502
3624	NC_011149	TAGCG	2	10	169137	169146	20 %	20 %	40 %	20 %	197250502
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3632	NC_011149	TGA	2	6	169531	169536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250502
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3989	NC_011149	GTAA	2	8	186691	186698	50 %	25 %	25 %	0 %	197248333
3990	NC_011149	CTG	2	6	186704	186709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248333
3991	NC_011149	GCAT	2	8	186723	186730	25 %	25 %	25 %	25 %	197248333
3992	NC_011149	GCC	2	6	186792	186797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248333
3993	NC_011149	GCC	2	6	186812	186817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248333
3994	NC_011149	TCT	2	6	186852	186857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197248333
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3997	NC_011149	CGTTT	2	10	187007	187016	0 %	60 %	20 %	20 %	197248333
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