MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011149	CTTT	2	8	115966	115973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2502	NC_011149	CTG	2	6	116003	116008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_011149	GCA	2	6	116023	116028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_011149	GGC	2	6	116097	116102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_011149	CAAA	2	8	116165	116172	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2506	NC_011149	AC	3	6	116179	116184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_011149	TGA	2	6	116189	116194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011149	A	7	7	116380	116386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011149	GCA	2	6	116430	116435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_011149	TGC	2	6	116454	116459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_011149	A	6	6	116514	116519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_011149	GCC	2	6	116564	116569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_011149	TGGG	2	8	116604	116611	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011149	TCAG	2	8	116663	116670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_011149	GTTGAA	2	12	116701	116712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_011149	CA	3	6	116728	116733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_011149	ACGGT	2	10	116789	116798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2518	NC_011149	ACCA	2	8	116801	116808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2519	NC_011149	CAG	2	6	116880	116885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_011149	GAT	2	6	116994	116999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_011149	CAG	2	6	117050	117055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_011149	GCC	2	6	117131	117136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_011149	TGGCG	2	10	117157	117166	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2524	NC_011149	GAAA	2	8	117231	117238	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_011149	TG	3	6	117261	117266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_011149	GCG	2	6	117322	117327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_011149	CGT	2	6	117333	117338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_011149	GCC	2	6	117368	117373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_011149	GTC	2	6	117407	117412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_011149	GGA	2	6	117461	117466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011149	TGT	3	9	117473	117481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449785013
2532	NC_011149	CG	3	6	117513	117518	0 %	0 %	50 %	50 %	449785013
2533	NC_011149	CGC	2	6	117592	117597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449785013
2534	NC_011149	GCC	2	6	117625	117630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449785013
2535	NC_011149	CG	3	6	117643	117648	0 %	0 %	50 %	50 %	449785013
2536	NC_011149	TGT	2	6	117656	117661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449785013
2537	NC_011149	CTGA	2	8	117775	117782	25 %	25 %	25 %	25 %	449785013
2538	NC_011149	TGCC	2	8	117837	117844	0 %	25 %	25 %	50 %	449785013
2539	NC_011149	TGA	2	6	117852	117857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449785013
2540	NC_011149	ATGA	2	8	117872	117879	50 %	25 %	25 %	0 %	449785013
2541	NC_011149	GTTC	2	8	117880	117887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_011149	ATG	2	6	117971	117976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_011149	TA	3	6	117981	117986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_011149	CAG	2	6	117987	117992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_011149	TTTA	2	8	118029	118036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_011149	A	6	6	118144	118149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_011149	T	6	6	118156	118161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_011149	GTTT	2	8	118162	118169	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_011149	ATA	2	6	118227	118232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_011149	TAAA	2	8	118253	118260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_011149	TCG	2	6	118280	118285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_011149	CT	3	6	118290	118295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_011149	TAATT	2	10	118299	118308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_011149	ATTTT	2	10	118325	118334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_011149	CGGGTG	2	12	118341	118352	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2556	NC_011149	T	6	6	118487	118492	0 %	100 %	0 %	0 %	197250479
2557	NC_011149	ATT	2	6	118532	118537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250479
2558	NC_011149	T	7	7	118552	118558	0 %	100 %	0 %	0 %	197250479
2559	NC_011149	A	6	6	118579	118584	100 %	0 %	0 %	0 %	197250479
2560	NC_011149	ATT	2	6	118601	118606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250479
2561	NC_011149	CAA	2	6	118638	118643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197250479
2562	NC_011149	TTC	2	6	118658	118663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250479
2563	NC_011149	GGAA	2	8	118672	118679	50 %	0 %	50 %	0 %	197250479
2564	NC_011149	ATA	2	6	118701	118706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197250479
2565	NC_011149	AT	3	6	118759	118764	50 %	50 %	0 %	0 %	197250479
2566	NC_011149	TCA	2	6	118777	118782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250479
2567	NC_011149	C	6	6	118788	118793	0 %	0 %	0 %	100 %	197250479
2568	NC_011149	CAG	2	6	118867	118872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249821
2569	NC_011149	TGC	2	6	118877	118882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249821
2570	NC_011149	GCG	2	6	118896	118901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249821
2571	NC_011149	GGC	2	6	118908	118913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249821
2572	NC_011149	AGA	2	6	118914	118919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249821
2573	NC_011149	CTT	2	6	118935	118940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249821
2574	NC_011149	GCG	2	6	119030	119035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249821
2575	NC_011149	CAA	2	6	119061	119066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249821
2576	NC_011149	GGT	2	6	119161	119166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197249821
2577	NC_011149	GT	3	6	119225	119230	0 %	50 %	50 %	0 %	197249821
2578	NC_011149	GCC	2	6	119236	119241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249821
2579	NC_011149	ACA	2	6	119262	119267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249821
2580	NC_011149	GAC	2	6	119288	119293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249821
2581	NC_011149	ACC	3	9	119336	119344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249821
2582	NC_011149	CGC	2	6	119400	119405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249821
2583	NC_011149	TCT	2	6	119501	119506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249821
2584	NC_011149	CAGCG	2	10	119683	119692	20 %	0 %	40 %	40 %	197251437
2585	NC_011149	GC	3	6	119810	119815	0 %	0 %	50 %	50 %	197251437
2586	NC_011149	GCCA	2	8	119817	119824	25 %	0 %	25 %	50 %	197251437
2587	NC_011149	CAG	2	6	119937	119942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251437
2588	NC_011149	CGA	2	6	119975	119980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251437
2589	NC_011149	GCCGG	2	10	119983	119992	0 %	0 %	60 %	40 %	197251437
2590	NC_011149	GCC	2	6	120030	120035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251437
2591	NC_011149	GGAC	2	8	120084	120091	25 %	0 %	50 %	25 %	197251437
2592	NC_011149	AC	3	6	120090	120095	50 %	0 %	0 %	50 %	197251437
2593	NC_011149	TCC	2	6	120154	120159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197251437
2594	NC_011149	GCC	2	6	120171	120176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251437
2595	NC_011149	GCG	2	6	120217	120222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251437
2596	NC_011149	AGT	3	9	120321	120329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251437
2597	NC_011149	GC	3	6	120381	120386	0 %	0 %	50 %	50 %	197251437
2598	NC_011149	GGCG	2	8	120429	120436	0 %	0 %	75 %	25 %	197251437
2599	NC_011149	GCT	2	6	120447	120452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251437
2600	NC_011149	TCGCCG	2	12	120481	120492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	197251437
2601	NC_011149	CAC	2	6	120501	120506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251437
2602	NC_011149	ATTTG	2	10	120551	120560	20 %	60 %	20 %	0 %	197251437
2603	NC_011149	GTCA	2	8	120579	120586	25 %	25 %	25 %	25 %	197251437
2604	NC_011149	GAC	2	6	120714	120719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251437
2605	NC_011149	TGC	2	6	120724	120729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251437
2606	NC_011149	CCG	2	6	120766	120771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251437
2607	NC_011149	GGTTCA	2	12	120782	120793	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197251437
2608	NC_011149	GCG	2	6	120826	120831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251437
2609	NC_011149	AGT	2	6	120853	120858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251437
2610	NC_011149	ACC	2	6	120922	120927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197251437
2611	NC_011149	GCTG	2	8	121106	121113	0 %	25 %	50 %	25 %	197251437
2612	NC_011149	TGT	2	6	121229	121234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248443
2613	NC_011149	CTG	2	6	121252	121257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248443
2614	NC_011149	GCG	2	6	121261	121266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2615	NC_011149	GGC	2	6	121345	121350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2616	NC_011149	CGG	2	6	121380	121385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2617	NC_011149	GCG	2	6	121394	121399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
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2621	NC_011149	GC	5	10	121556	121565	0 %	0 %	50 %	50 %	197248443
2622	NC_011149	GCG	2	6	121669	121674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
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2625	NC_011149	CTGG	2	8	121762	121769	0 %	25 %	50 %	25 %	197248443
2626	NC_011149	TGC	2	6	121796	121801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248443
2627	NC_011149	CAC	2	6	121900	121905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248443
2628	NC_011149	GC	3	6	122022	122027	0 %	0 %	50 %	50 %	197248443
2629	NC_011149	CGC	2	6	122061	122066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248443
2630	NC_011149	CGG	2	6	122139	122144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248443
2631	NC_011149	TCA	2	6	122201	122206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248443
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2652	NC_011149	AG	3	6	122915	122920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_011149	CAGG	2	8	122937	122944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2654	NC_011149	AATGCT	2	12	122967	122978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2657	NC_011149	G	6	6	123199	123204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_011149	T	7	7	123313	123319	0 %	100 %	0 %	0 %	197247811
2659	NC_011149	ATCG	2	8	123320	123327	25 %	25 %	25 %	25 %	197247811
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2663	NC_011149	AT	3	6	123423	123428	50 %	50 %	0 %	0 %	197247811
2664	NC_011149	CCG	2	6	123437	123442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197247811
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2724	NC_011149	CGCC	2	8	126260	126267	0 %	0 %	25 %	75 %	197248623
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2729	NC_011149	GCGTCA	2	12	126461	126472	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197248623
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2732	NC_011149	GCGG	2	8	126561	126568	0 %	0 %	75 %	25 %	197248623
2733	NC_011149	GTG	2	6	126613	126618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248623
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2737	NC_011149	GCG	2	6	126766	126771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248623
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2740	NC_011149	A	6	6	126840	126845	100 %	0 %	0 %	0 %	197248623
2741	NC_011149	GCCA	2	8	126922	126929	25 %	0 %	25 %	50 %	197248623
2742	NC_011149	GCA	2	6	127007	127012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248623
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2744	NC_011149	CCG	2	6	127064	127069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248623
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2747	NC_011149	ATC	2	6	127216	127221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248623
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2859	NC_011149	TGCCGA	2	12	132213	132224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197247828
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2996	NC_011149	ATA	2	6	139219	139224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248052
2997	NC_011149	AGC	2	6	139321	139326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248052
2998	NC_011149	TGC	2	6	139345	139350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248052
2999	NC_011149	ACGG	2	8	139423	139430	25 %	0 %	50 %	25 %	197248052
3000	NC_011149	ATT	2	6	139470	139475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197248052

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