MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011149	GTT	2	6	45292	45297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248163
1002	NC_011149	TCA	2	6	45313	45318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248163
1003	NC_011149	GAC	2	6	45389	45394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248163
1004	NC_011149	AGG	2	6	45462	45467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248163
1005	NC_011149	CGT	2	6	45514	45519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248163
1006	NC_011149	AAT	2	6	45530	45535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197248163
1007	NC_011149	TGA	2	6	45589	45594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248163
1008	NC_011149	CCG	2	6	45611	45616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248163
1009	NC_011149	GTG	2	6	45644	45649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248163
1010	NC_011149	ATGA	2	8	45653	45660	50 %	25 %	25 %	0 %	197248163
1011	NC_011149	GC	3	6	45702	45707	0 %	0 %	50 %	50 %	197248163
1012	NC_011149	CAG	2	6	45743	45748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248163
1013	NC_011149	TGA	2	6	45787	45792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248163
1014	NC_011149	GCT	2	6	45868	45873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248163
1015	NC_011149	TAC	2	6	45938	45943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248163
1016	NC_011149	AACG	2	8	45955	45962	50 %	0 %	25 %	25 %	197248163
1017	NC_011149	ATC	2	6	46031	46036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011149	A	6	6	46053	46058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011149	A	6	6	46087	46092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011149	TCA	2	6	46101	46106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011149	TA	3	6	46107	46112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011149	TAG	2	6	46147	46152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011149	GAA	2	6	46157	46162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_011149	GA	3	6	46174	46179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011149	T	6	6	46205	46210	0 %	100 %	0 %	0 %	197251902
1026	NC_011149	AGC	2	6	46211	46216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197251902
1027	NC_011149	CAT	2	6	46231	46236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251902
1028	NC_011149	TCA	2	6	46239	46244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251902
1029	NC_011149	CGC	2	6	46246	46251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251902
1030	NC_011149	CAA	2	6	46351	46356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197251902
1031	NC_011149	TGC	2	6	46362	46367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251902
1032	NC_011149	GCC	2	6	46484	46489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197251902
1033	NC_011149	CGG	2	6	46492	46497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251902
1034	NC_011149	GAT	2	6	46498	46503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251902
1035	NC_011149	ACT	2	6	46533	46538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251902
1036	NC_011149	GGGCT	2	10	46558	46567	0 %	20 %	60 %	20 %	197251902
1037	NC_011149	ATC	2	6	46667	46672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251902
1038	NC_011149	GAT	2	6	46673	46678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197251902
1039	NC_011149	TTA	2	6	46692	46697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251902
1040	NC_011149	GGC	2	6	46744	46749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251902
1041	NC_011149	GCT	2	6	46771	46776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251902
1042	NC_011149	GCG	2	6	46785	46790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251902
1043	NC_011149	TA	3	6	46806	46811	50 %	50 %	0 %	0 %	197251902
1044	NC_011149	CGG	2	6	46836	46841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197251902
1045	NC_011149	CTT	2	6	46888	46893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197251902
1046	NC_011149	GAAA	2	8	46903	46910	75 %	0 %	25 %	0 %	197251902
1047	NC_011149	TCGC	2	8	46918	46925	0 %	25 %	25 %	50 %	197251902
1048	NC_011149	TGC	2	6	47046	47051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251902
1049	NC_011149	ATT	2	6	47060	47065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251902
1050	NC_011149	CTG	2	6	47072	47077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197251902
1051	NC_011149	GCTG	2	8	47109	47116	0 %	25 %	50 %	25 %	197251902
1052	NC_011149	TG	3	6	47187	47192	0 %	50 %	50 %	0 %	197251902
1053	NC_011149	TTA	2	6	47256	47261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251902
1054	NC_011149	GTG	2	6	47306	47311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197251902
1055	NC_011149	GC	4	8	47326	47333	0 %	0 %	50 %	50 %	197251902
1056	NC_011149	GA	3	6	47408	47413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011149	TTA	2	6	47447	47452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250162
1058	NC_011149	AAG	2	6	47470	47475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250162
1059	NC_011149	CGC	2	6	47512	47517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250162
1060	NC_011149	TGT	2	6	47698	47703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250162
1061	NC_011149	CAG	2	6	47744	47749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250162
1062	NC_011149	GCG	2	6	47760	47765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250162
1063	NC_011149	GTG	2	6	47766	47771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250162
1064	NC_011149	CAGC	2	8	47834	47841	25 %	0 %	25 %	50 %	197250162
1065	NC_011149	GCA	2	6	47885	47890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250162
1066	NC_011149	CTGC	2	8	47971	47978	0 %	25 %	25 %	50 %	197250162
1067	NC_011149	TTG	2	6	48033	48038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250162
1068	NC_011149	TGA	2	6	48086	48091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250162
1069	NC_011149	GAA	2	6	48216	48221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250162
1070	NC_011149	GA	3	6	48240	48245	50 %	0 %	50 %	0 %	197250162
1071	NC_011149	CGG	2	6	48259	48264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250162
1072	NC_011149	ACT	2	6	48286	48291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250162
1073	NC_011149	TACC	2	8	48318	48325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_011149	GCGTA	2	10	48434	48443	20 %	20 %	40 %	20 %	197248810
1075	NC_011149	CCT	2	6	48457	48462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197248810
1076	NC_011149	CATG	2	8	48539	48546	25 %	25 %	25 %	25 %	197248810
1077	NC_011149	CAG	2	6	48558	48563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248810
1078	NC_011149	TCC	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197248810
1079	NC_011149	CCG	2	6	48937	48942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248810
1080	NC_011149	CGT	2	6	48948	48953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248810
1081	NC_011149	CCA	2	6	48954	48959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248810
1082	NC_011149	CGG	2	6	48989	48994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248810
1083	NC_011149	GAG	2	6	49021	49026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197248810
1084	NC_011149	GACCA	2	10	49039	49048	40 %	0 %	20 %	40 %	197248810
1085	NC_011149	A	6	6	49131	49136	100 %	0 %	0 %	0 %	197248810
1086	NC_011149	CCGGC	2	10	49181	49190	0 %	0 %	40 %	60 %	197248810
1087	NC_011149	GTCGTA	2	12	49206	49217	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197248810
1088	NC_011149	CG	4	8	49307	49314	0 %	0 %	50 %	50 %	197248810
1089	NC_011149	AAGT	2	8	49333	49340	50 %	25 %	25 %	0 %	197248810
1090	NC_011149	CCAG	2	8	49391	49398	25 %	0 %	25 %	50 %	197248810
1091	NC_011149	CG	3	6	49520	49525	0 %	0 %	50 %	50 %	197248810
1092	NC_011149	AAG	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197248810
1093	NC_011149	GCG	2	6	49596	49601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248810
1094	NC_011149	CAG	2	6	49623	49628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248810
1095	NC_011149	CAT	2	6	49686	49691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197248810
1096	NC_011149	CGG	2	6	49692	49697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197248810
1097	NC_011149	AGT	2	6	49760	49765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248810
1098	NC_011149	GTT	2	6	49836	49841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248810
1099	NC_011149	T	6	6	49970	49975	0 %	100 %	0 %	0 %	197248810
1100	NC_011149	GAT	2	6	50080	50085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248810
1101	NC_011149	TG	3	6	50138	50143	0 %	50 %	50 %	0 %	197248810
1102	NC_011149	TTGA	2	8	50172	50179	25 %	50 %	25 %	0 %	197248810
1103	NC_011149	TGG	2	6	50215	50220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248810
1104	NC_011149	TGC	2	6	50365	50370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197248810
1105	NC_011149	CAGAC	2	10	50371	50380	40 %	0 %	20 %	40 %	197248810
1106	NC_011149	TTG	2	6	50391	50396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197248810
1107	NC_011149	TGG	2	6	50408	50413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197248810
1108	NC_011149	TCT	2	6	50480	50485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249256
1109	NC_011149	GAAA	2	8	50507	50514	75 %	0 %	25 %	0 %	197249256
1110	NC_011149	AGT	2	6	50515	50520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249256
1111	NC_011149	GCA	2	6	50590	50595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249256
1112	NC_011149	GGC	2	6	50640	50645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249256
1113	NC_011149	GGC	2	6	50817	50822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249256
1114	NC_011149	TGT	2	6	50837	50842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249256
1115	NC_011149	GCCA	2	8	50848	50855	25 %	0 %	25 %	50 %	197249256
1116	NC_011149	CAT	2	6	50856	50861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249256
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1118	NC_011149	CAG	2	6	50883	50888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249256
1119	NC_011149	AAG	2	6	50929	50934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249256
1120	NC_011149	GAT	2	6	50943	50948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249256
1121	NC_011149	TCG	2	6	50963	50968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249256
1122	NC_011149	ATA	2	6	51021	51026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197249256
1123	NC_011149	GCT	2	6	51044	51049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249256
1124	NC_011149	AGA	2	6	51062	51067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249256
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1126	NC_011149	T	7	7	51125	51131	0 %	100 %	0 %	0 %	197249256
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1250	NC_011149	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	197249530
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1253	NC_011149	GAT	2	6	57398	57403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249034
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1362	NC_011149	TTTC	2	8	63487	63494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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