MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 101713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_011149	CAG	2	6	254457	254462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250860
5503	NC_011149	GCG	2	6	254530	254535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250860
5504	NC_011149	CGG	2	6	254540	254545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250860
5505	NC_011149	CGG	2	6	254549	254554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250860
5506	NC_011149	CAA	2	6	254556	254561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197250860
5507	NC_011149	ATT	2	6	254592	254597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250860
5508	NC_011149	CGC	2	6	254600	254605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250860
5509	NC_011149	CGT	2	6	254615	254620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250860
5510	NC_011149	CAA	2	6	254624	254629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197250860
5511	NC_011149	GAA	2	6	254750	254755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250860
5512	NC_011149	CGC	2	6	254924	254929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250860
5513	NC_011149	CGG	2	6	254948	254953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250860
5514	NC_011149	CGG	2	6	255014	255019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250860
5515	NC_011149	TGG	2	6	255079	255084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250860
5516	NC_011149	CAG	2	6	255272	255277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250860
5517	NC_011149	GCG	2	6	255282	255287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250860
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5519	NC_011149	GCA	2	6	255319	255324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250860
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5521	NC_011149	GCA	2	6	255380	255385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250860
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5523	NC_011149	AGC	2	6	255480	255485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250860
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5526	NC_011149	CAG	2	6	255552	255557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250860
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5528	NC_011149	TATT	2	8	255644	255651	25 %	75 %	0 %	0 %	197250860
5529	NC_011149	C	6	6	255717	255722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5530	NC_011149	TGCTC	2	10	255795	255804	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5531	NC_011149	AGG	2	6	255807	255812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_011149	TGGC	3	12	255819	255830	0 %	25 %	50 %	25 %	197251250
5533	NC_011149	GC	3	6	255863	255868	0 %	0 %	50 %	50 %	197251250
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5555	NC_011149	GC	3	6	256739	256744	0 %	0 %	50 %	50 %	197251250
5556	NC_011149	AAC	2	6	256772	256777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197251250
5557	NC_011149	TTA	2	6	256781	256786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197251250
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5559	NC_011149	AT	3	6	257010	257015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_011149	AC	3	6	257055	257060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_011149	CTTA	2	8	257063	257070	25 %	50 %	0 %	25 %	197247544
5562	NC_011149	CGA	2	6	257117	257122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197247544
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5571	NC_011149	CCA	2	6	257509	257514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_011149	A	7	7	257523	257529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011149	AGA	2	6	257544	257549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_011149	GCG	2	6	257577	257582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_011149	CTA	2	6	257716	257721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197251680
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5608	NC_011149	T	6	6	258770	258775	0 %	100 %	0 %	0 %	197251680
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5612	NC_011149	T	6	6	259094	259099	0 %	100 %	0 %	0 %	197248248
5613	NC_011149	CCG	2	6	259171	259176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248248
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5992	NC_011149	TGC	2	6	278179	278184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249560
5993	NC_011149	CGC	2	6	278235	278240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249560
5994	NC_011149	A	6	6	278251	278256	100 %	0 %	0 %	0 %	197249560
5995	NC_011149	CGC	2	6	278282	278287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249560
5996	NC_011149	GC	3	6	278307	278312	0 %	0 %	50 %	50 %	197249560
5997	NC_011149	GAT	2	6	278318	278323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249560
5998	NC_011149	CTG	2	6	278340	278345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249560
5999	NC_011149	CGG	2	6	278356	278361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249560
6000	NC_011149	CTGG	2	8	278426	278433	0 %	25 %	50 %	25 %	197249560

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