MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 10686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011147	AGAC	2	8	192	199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011147	ACCA	2	8	505	512	50 %	0 %	0 %	50 %	197361214
3	NC_011147	GATC	2	8	816	823	25 %	25 %	25 %	25 %	197361214
4	NC_011147	ATGA	2	8	3167	3174	50 %	25 %	25 %	0 %	197361215
5	NC_011147	GATG	2	8	4672	4679	25 %	25 %	50 %	0 %	197361216
6	NC_011147	CAGC	2	8	4681	4688	25 %	0 %	25 %	50 %	197361216
7	NC_011147	CTGA	2	8	4739	4746	25 %	25 %	25 %	25 %	197361216
8	NC_011147	AAAG	2	8	4919	4926	75 %	0 %	25 %	0 %	197361216
9	NC_011147	CTGC	2	8	5009	5016	0 %	25 %	25 %	50 %	197361216
10	NC_011147	GCCA	2	8	6703	6710	25 %	0 %	25 %	50 %	197361218
11	NC_011147	GGCG	2	8	6829	6836	0 %	0 %	75 %	25 %	197361218
12	NC_011147	TGAA	2	8	7329	7336	50 %	25 %	25 %	0 %	197361218
13	NC_011147	GCGT	2	8	8195	8202	0 %	25 %	50 %	25 %	197361219
14	NC_011147	AAGA	2	8	8277	8284	75 %	0 %	25 %	0 %	197361219
15	NC_011147	CTGT	2	8	8705	8712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011147	TGGC	2	8	8858	8865	0 %	25 %	50 %	25 %	197361220
17	NC_011147	TCCG	2	8	9318	9325	0 %	25 %	25 %	50 %	197361220
18	NC_011147	GAAC	2	8	9757	9764	50 %	0 %	25 %	25 %	197361221
19	NC_011147	CAGG	2	8	10161	10168	25 %	0 %	50 %	25 %	197361222
20	NC_011147	TGGC	2	8	11043	11050	0 %	25 %	50 %	25 %	197361223
21	NC_011147	TCGT	2	8	11163	11170	0 %	50 %	25 %	25 %	197361223
22	NC_011147	ATTT	2	8	11409	11416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011147	TCTG	2	8	11430	11437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011147	ATGG	2	8	11688	11695	25 %	25 %	50 %	0 %	197361224
25	NC_011147	TGGT	2	8	11779	11786	0 %	50 %	50 %	0 %	197361224
26	NC_011147	CAAC	2	8	12292	12299	50 %	0 %	0 %	50 %	197361224
27	NC_011147	AAGA	2	8	12366	12373	75 %	0 %	25 %	0 %	197361224
28	NC_011147	CCAT	2	8	12943	12950	25 %	25 %	0 %	50 %	197361224
29	NC_011147	GGCT	2	8	13463	13470	0 %	25 %	50 %	25 %	197361224
30	NC_011147	CGGT	2	8	14621	14628	0 %	25 %	50 %	25 %	197361225
31	NC_011147	GTAT	2	8	14798	14805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011147	TCAG	2	8	15276	15283	25 %	25 %	25 %	25 %	197361226
33	NC_011147	TTTG	2	8	15566	15573	0 %	75 %	25 %	0 %	197361226
34	NC_011147	CGAA	2	8	15781	15788	50 %	0 %	25 %	25 %	197361226
35	NC_011147	ATTG	2	8	15793	15800	25 %	50 %	25 %	0 %	197361226
36	NC_011147	ATAA	2	8	16553	16560	75 %	25 %	0 %	0 %	197361228
37	NC_011147	CAGC	2	8	16760	16767	25 %	0 %	25 %	50 %	197361228
38	NC_011147	AATA	2	8	18029	18036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011147	GGGC	2	8	18615	18622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011147	CGTG	2	8	19315	19322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011147	CCAA	2	8	21316	21323	50 %	0 %	0 %	50 %	449784909
42	NC_011147	GACG	2	8	21662	21669	25 %	0 %	50 %	25 %	449784909
43	NC_011147	GCCG	2	8	21914	21921	0 %	0 %	50 %	50 %	449784909
44	NC_011147	TGGC	2	8	22315	22322	0 %	25 %	50 %	25 %	449784909
45	NC_011147	TGGC	2	8	22421	22428	0 %	25 %	50 %	25 %	449784909
46	NC_011147	CGCC	2	8	22687	22694	0 %	0 %	25 %	75 %	449784909
47	NC_011147	CTGG	2	8	23033	23040	0 %	25 %	50 %	25 %	449784909
48	NC_011147	TTAT	2	8	23298	23305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011147	TTTA	2	8	23531	23538	25 %	75 %	0 %	0 %	197361231
50	NC_011147	TTTC	2	8	23585	23592	0 %	75 %	0 %	25 %	197361231
51	NC_011147	TCTG	2	8	23988	23995	0 %	50 %	25 %	25 %	197361231
52	NC_011147	TGAA	2	8	24499	24506	50 %	25 %	25 %	0 %	197361232
53	NC_011147	CCAG	2	8	24770	24777	25 %	0 %	25 %	50 %	197361232
54	NC_011147	ACCG	2	8	25447	25454	25 %	0 %	25 %	50 %	197361233
55	NC_011147	TTTA	2	8	25470	25477	25 %	75 %	0 %	0 %	197361233
56	NC_011147	TCTG	2	8	25964	25971	0 %	50 %	25 %	25 %	197361234
57	NC_011147	GCCT	2	8	26145	26152	0 %	25 %	25 %	50 %	197361234
58	NC_011147	CCTT	2	8	26651	26658	0 %	50 %	0 %	50 %	197361234
59	NC_011147	TCAG	2	8	27010	27017	25 %	25 %	25 %	25 %	197361234
60	NC_011147	ATCA	2	8	27423	27430	50 %	25 %	0 %	25 %	197361234
61	NC_011147	AGCC	2	8	27957	27964	25 %	0 %	25 %	50 %	197361234
62	NC_011147	CCGA	2	8	28164	28171	25 %	0 %	25 %	50 %	197361234
63	NC_011147	GCGT	2	8	28210	28217	0 %	25 %	50 %	25 %	197361234
64	NC_011147	ATTA	2	8	28557	28564	50 %	50 %	0 %	0 %	197361235
65	NC_011147	GGCG	2	8	28799	28806	0 %	0 %	75 %	25 %	197361235
66	NC_011147	ATGA	2	8	30004	30011	50 %	25 %	25 %	0 %	197361236
67	NC_011147	TGCT	2	8	30574	30581	0 %	50 %	25 %	25 %	197361237
68	NC_011147	TATC	2	8	30630	30637	25 %	50 %	0 %	25 %	197361237
69	NC_011147	GTAA	2	8	30667	30674	50 %	25 %	25 %	0 %	197361237
70	NC_011147	TTCG	2	8	30929	30936	0 %	50 %	25 %	25 %	197361237
71	NC_011147	GTCA	2	8	31439	31446	25 %	25 %	25 %	25 %	197361238
72	NC_011147	ACCG	2	8	32259	32266	25 %	0 %	25 %	50 %	197361239
73	NC_011147	AGGC	2	8	32297	32304	25 %	0 %	50 %	25 %	197361239
74	NC_011147	CCTG	2	8	32733	32740	0 %	25 %	25 %	50 %	197361240
75	NC_011147	CGCA	2	8	32923	32930	25 %	0 %	25 %	50 %	197361240
76	NC_011147	TAAA	2	8	32993	33000	75 %	25 %	0 %	0 %	197361240
77	NC_011147	TTAT	2	8	33562	33569	25 %	75 %	0 %	0 %	197361241
78	NC_011147	TTTG	2	8	33916	33923	0 %	75 %	25 %	0 %	197361241
79	NC_011147	TTGG	2	8	33946	33953	0 %	50 %	50 %	0 %	197361241
80	NC_011147	CTTT	2	8	34326	34333	0 %	75 %	0 %	25 %	197361241
81	NC_011147	GAAG	2	8	34366	34373	50 %	0 %	50 %	0 %	197361241
82	NC_011147	TAAA	2	8	34418	34425	75 %	25 %	0 %	0 %	197361242
83	NC_011147	ATAA	2	8	34694	34701	75 %	25 %	0 %	0 %	197361242
84	NC_011147	GTGC	2	8	34817	34824	0 %	25 %	50 %	25 %	197361242
85	NC_011147	TTAA	2	8	34827	34834	50 %	50 %	0 %	0 %	197361242
86	NC_011147	TGAT	2	8	35062	35069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011147	TGAC	2	8	35766	35773	25 %	25 %	25 %	25 %	197361243
88	NC_011147	GGGA	2	8	36523	36530	25 %	0 %	75 %	0 %	197361243
89	NC_011147	ATAC	2	8	37508	37515	50 %	25 %	0 %	25 %	197361244
90	NC_011147	GAAG	2	8	37580	37587	50 %	0 %	50 %	0 %	197361244
91	NC_011147	CACG	2	8	38143	38150	25 %	0 %	25 %	50 %	197361244
92	NC_011147	TAAT	2	8	38245	38252	50 %	50 %	0 %	0 %	197361244
93	NC_011147	TCGT	2	8	38589	38596	0 %	50 %	25 %	25 %	197361244
94	NC_011147	CCAT	2	8	38701	38708	25 %	25 %	0 %	50 %	197361244
95	NC_011147	ATTA	2	8	38795	38802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011147	AATT	2	8	40075	40082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011147	GCGG	2	8	40566	40573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011147	CTGG	2	8	40784	40791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011147	CCGA	2	8	41301	41308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011147	ATCG	2	8	41437	41444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011147	TCAA	2	8	41498	41505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011147	AACC	2	8	41763	41770	50 %	0 %	0 %	50 %	197361246
103	NC_011147	GAAA	2	8	41815	41822	75 %	0 %	25 %	0 %	197361246
104	NC_011147	GGTC	2	8	42387	42394	0 %	25 %	50 %	25 %	197361246
105	NC_011147	TTTG	2	8	42911	42918	0 %	75 %	25 %	0 %	197361246
106	NC_011147	GTAT	2	8	43206	43213	25 %	50 %	25 %	0 %	197361247
107	NC_011147	TCCG	2	8	43600	43607	0 %	25 %	25 %	50 %	197361247
108	NC_011147	ATGA	2	8	45662	45669	50 %	25 %	25 %	0 %	197361248
109	NC_011147	AACG	2	8	45964	45971	50 %	0 %	25 %	25 %	197361248
110	NC_011147	TGAC	2	8	46048	46055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011147	GAAA	2	8	46912	46919	75 %	0 %	25 %	0 %	197361249
112	NC_011147	GCTG	2	8	47118	47125	0 %	25 %	50 %	25 %	197361249
113	NC_011147	CACG	2	8	47816	47823	25 %	0 %	25 %	50 %	197361250
114	NC_011147	CAGC	2	8	47843	47850	25 %	0 %	25 %	50 %	197361250
115	NC_011147	CCTG	3	12	47979	47990	0 %	25 %	25 %	50 %	197361250
116	NC_011147	TACC	2	8	48327	48334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011147	CATG	2	8	48548	48555	25 %	25 %	25 %	25 %	197361251
118	NC_011147	AAGT	2	8	49342	49349	50 %	25 %	25 %	0 %	197361251
119	NC_011147	CCAG	2	8	49400	49407	25 %	0 %	25 %	50 %	197361251
120	NC_011147	TTGA	2	8	50181	50188	25 %	50 %	25 %	0 %	197361251
121	NC_011147	GAAA	2	8	50516	50523	75 %	0 %	25 %	0 %	197361252
122	NC_011147	GCCA	2	8	50857	50864	25 %	0 %	25 %	50 %	197361252
123	NC_011147	TAAA	2	8	51250	51257	75 %	25 %	0 %	0 %	197361252
124	NC_011147	AGTA	2	8	51943	51950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011147	ATCA	2	8	51983	51990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011147	GAAA	2	8	52103	52110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011147	GAGG	2	8	52135	52142	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011147	CATA	2	8	52895	52902	50 %	25 %	0 %	25 %	197361255
129	NC_011147	TCAG	2	8	52906	52913	25 %	25 %	25 %	25 %	197361255
130	NC_011147	TGGC	2	8	53620	53627	0 %	25 %	50 %	25 %	197361255
131	NC_011147	GTTC	2	8	56037	56044	0 %	50 %	25 %	25 %	197361256
132	NC_011147	AGCC	2	8	57447	57454	25 %	0 %	25 %	50 %	197361258
133	NC_011147	AAAG	2	8	57526	57533	75 %	0 %	25 %	0 %	197361258
134	NC_011147	ATGG	2	8	57659	57666	25 %	25 %	50 %	0 %	197361258
135	NC_011147	TGAT	2	8	58331	58338	25 %	50 %	25 %	0 %	197361259
136	NC_011147	TGGA	2	8	59000	59007	25 %	25 %	50 %	0 %	197361260
137	NC_011147	CCTG	2	8	59036	59043	0 %	25 %	25 %	50 %	197361260
138	NC_011147	GATT	2	8	59398	59405	25 %	50 %	25 %	0 %	197361260
139	NC_011147	GATC	2	8	59767	59774	25 %	25 %	25 %	25 %	197361260
140	NC_011147	CTGG	2	8	60892	60899	0 %	25 %	50 %	25 %	197361261
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