MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011147	CGC	2	6	163159	163164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361345
3502	NC_011147	CGG	2	6	163198	163203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361345
3503	NC_011147	ATT	2	6	163288	163293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361345
3504	NC_011147	AAG	2	6	163380	163385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361345
3505	NC_011147	CCG	2	6	163436	163441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361345
3506	NC_011147	ATT	2	6	163454	163459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361345
3507	NC_011147	TTA	2	6	163517	163522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361346
3508	NC_011147	GCCG	2	8	163562	163569	0 %	0 %	50 %	50 %	197361346
3509	NC_011147	CAG	2	6	163706	163711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3510	NC_011147	GCA	2	6	163842	163847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3511	NC_011147	TCT	2	6	163851	163856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361346
3512	NC_011147	CGA	2	6	163906	163911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3513	NC_011147	TCT	2	6	164106	164111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361346
3514	NC_011147	TCG	2	6	164269	164274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3515	NC_011147	CGA	2	6	164292	164297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3516	NC_011147	CATA	2	8	164341	164348	50 %	25 %	0 %	25 %	197361346
3517	NC_011147	GTC	2	6	164414	164419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3518	NC_011147	GGCT	2	8	164600	164607	0 %	25 %	50 %	25 %	197361347
3519	NC_011147	TAA	2	6	164608	164613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361347
3520	NC_011147	ATG	2	6	164620	164625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361347
3521	NC_011147	GCG	2	6	164685	164690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361347
3522	NC_011147	GGA	2	6	164738	164743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361347
3523	NC_011147	TTG	2	6	164760	164765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361347
3524	NC_011147	ACC	2	6	164772	164777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361347
3525	NC_011147	TGA	2	6	164846	164851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361347
3526	NC_011147	CGG	2	6	164920	164925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361347
3527	NC_011147	AACG	2	8	165024	165031	50 %	0 %	25 %	25 %	197361347
3528	NC_011147	CGC	2	6	165151	165156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361347
3529	NC_011147	TCA	2	6	165172	165177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361347
3530	NC_011147	TC	3	6	165305	165310	0 %	50 %	0 %	50 %	197361347
3531	NC_011147	CGC	2	6	165311	165316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361347
3532	NC_011147	GAG	2	6	165399	165404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361347
3533	NC_011147	CTGC	2	8	165408	165415	0 %	25 %	25 %	50 %	197361347
3534	NC_011147	TAT	2	6	165435	165440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361347
3535	NC_011147	CG	3	6	165447	165452	0 %	0 %	50 %	50 %	197361347
3536	NC_011147	TATT	2	8	165475	165482	25 %	75 %	0 %	0 %	197361347
3537	NC_011147	ATT	2	6	165484	165489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361347
3538	NC_011147	GTC	2	6	165551	165556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361348
3539	NC_011147	CGC	2	6	165571	165576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361348
3540	NC_011147	CGG	2	6	165598	165603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361348
3541	NC_011147	C	6	6	165667	165672	0 %	0 %	0 %	100 %	197361348
3542	NC_011147	GAC	2	6	165674	165679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361348
3543	NC_011147	ACG	2	6	165705	165710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361348
3544	NC_011147	GCA	2	6	165874	165879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3545	NC_011147	CGT	2	6	165886	165891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3546	NC_011147	GATCA	2	10	165953	165962	40 %	20 %	20 %	20 %	197361349
3547	NC_011147	TGT	2	6	166038	166043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361349
3548	NC_011147	GCC	2	6	166088	166093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361349
3549	NC_011147	GCT	2	6	166144	166149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3550	NC_011147	CCG	2	6	166183	166188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361349
3551	NC_011147	CTG	2	6	166196	166201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3552	NC_011147	GCT	2	6	166264	166269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3553	NC_011147	CAG	2	6	166286	166291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3554	NC_011147	A	6	6	166347	166352	100 %	0 %	0 %	0 %	197361349
3555	NC_011147	TCT	2	6	166435	166440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361349
3556	NC_011147	TTA	2	6	166571	166576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361350
3557	NC_011147	GC	3	6	166603	166608	0 %	0 %	50 %	50 %	197361350
3558	NC_011147	CG	3	6	166650	166655	0 %	0 %	50 %	50 %	197361350
3559	NC_011147	CAT	2	6	166659	166664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361350
3560	NC_011147	ACC	2	6	166709	166714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361350
3561	NC_011147	CAG	2	6	166753	166758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361350
3562	NC_011147	TGT	2	6	166802	166807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361350
3563	NC_011147	CTG	2	6	166816	166821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361350
3564	NC_011147	TTC	2	6	166858	166863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361350
3565	NC_011147	A	6	6	166872	166877	100 %	0 %	0 %	0 %	197361350
3566	NC_011147	CGG	2	6	166914	166919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361350
3567	NC_011147	GGGC	2	8	166959	166966	0 %	0 %	75 %	25 %	197361350
3568	NC_011147	GC	3	6	166987	166992	0 %	0 %	50 %	50 %	197361350
3569	NC_011147	ATA	2	6	166994	166999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361350
3570	NC_011147	CCG	2	6	167069	167074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361350
3571	NC_011147	CTA	2	6	167180	167185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_011147	A	7	7	167217	167223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011147	GAA	2	6	167332	167337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361351
3574	NC_011147	CTG	2	6	167540	167545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361351
3575	NC_011147	GAA	2	6	167566	167571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361351
3576	NC_011147	A	6	6	167654	167659	100 %	0 %	0 %	0 %	197361351
3577	NC_011147	TCG	2	6	167744	167749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361351
3578	NC_011147	ACG	2	6	167881	167886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361351
3579	NC_011147	CGG	2	6	167921	167926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3580	NC_011147	GGC	2	6	167959	167964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3581	NC_011147	GGC	2	6	167980	167985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3582	NC_011147	CGG	3	9	168018	168026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3583	NC_011147	AG	3	6	168069	168074	50 %	0 %	50 %	0 %	197361351
3584	NC_011147	CGG	2	6	168075	168080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3585	NC_011147	AGA	2	6	168090	168095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361351
3586	NC_011147	CGG	2	6	168159	168164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3587	NC_011147	CG	3	6	168178	168183	0 %	0 %	50 %	50 %	197361351
3588	NC_011147	CCGC	2	8	168233	168240	0 %	0 %	25 %	75 %	197361351
3589	NC_011147	CAC	2	6	168312	168317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361351
3590	NC_011147	CTGG	2	8	168371	168378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_011147	ATCCC	2	10	168399	168408	20 %	20 %	0 %	60 %	197361352
3592	NC_011147	CCA	3	9	168450	168458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361352
3593	NC_011147	TGA	2	6	168480	168485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361352
3594	NC_011147	GCCAGC	2	12	168524	168535	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	197361352
3595	NC_011147	GCA	2	6	168567	168572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3596	NC_011147	T	6	6	168644	168649	0 %	100 %	0 %	0 %	197361352
3597	NC_011147	GAA	2	6	168756	168761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361352
3598	NC_011147	CTT	2	6	168821	168826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361352
3599	NC_011147	AGA	2	6	168857	168862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361352
3600	NC_011147	CGCTGC	2	12	168863	168874	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	197361352
3601	NC_011147	CTG	2	6	168902	168907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3602	NC_011147	ATA	2	6	168980	168985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361352
3603	NC_011147	CG	3	6	168987	168992	0 %	0 %	50 %	50 %	197361352
3604	NC_011147	AGA	2	6	168995	169000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361352
3605	NC_011147	GGC	2	6	169030	169035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361352
3606	NC_011147	GCA	2	6	169056	169061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3607	NC_011147	GGC	2	6	169078	169083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361352
3608	NC_011147	AAT	2	6	169093	169098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361352
3609	NC_011147	TAGCG	2	10	169106	169115	20 %	20 %	40 %	20 %	197361352
3610	NC_011147	AGC	2	6	169173	169178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3611	NC_011147	ATC	2	6	169214	169219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361352
3612	NC_011147	GCG	2	6	169230	169235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361352
3613	NC_011147	ATGA	2	8	169384	169391	50 %	25 %	25 %	0 %	197361352
3614	NC_011147	TGA	2	6	169403	169408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361352
3615	NC_011147	CTT	2	6	169428	169433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361352
3616	NC_011147	GCG	2	6	169442	169447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361352
3617	NC_011147	TGA	2	6	169500	169505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361352
3618	NC_011147	TGCCAG	2	12	169571	169582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3619	NC_011147	CTG	2	6	169694	169699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361353
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3621	NC_011147	GC	3	6	169846	169851	0 %	0 %	50 %	50 %	197361353
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3987	NC_011147	ATG	2	6	187136	187141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361367
3988	NC_011147	CG	3	6	187158	187163	0 %	0 %	50 %	50 %	197361367
3989	NC_011147	GCG	3	9	187161	187169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361367
3990	NC_011147	GCT	2	6	187300	187305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361367
3991	NC_011147	GCG	2	6	187306	187311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361367
3992	NC_011147	GGCG	2	8	187330	187337	0 %	0 %	75 %	25 %	197361367
3993	NC_011147	TC	3	6	187341	187346	0 %	50 %	0 %	50 %	197361367
3994	NC_011147	TGC	2	6	187347	187352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361367
3995	NC_011147	TGC	2	6	187365	187370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361367
3996	NC_011147	TGC	3	9	187398	187406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361367
3997	NC_011147	GTG	2	6	187407	187412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361367
3998	NC_011147	CTG	2	6	187427	187432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361367
3999	NC_011147	CGC	2	6	187433	187438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361367
4000	NC_011147	CGA	2	6	187443	187448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361367

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