MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011147	GAAA	2	8	117203	117210	75 %	0 %	25 %	0 %	197361307
2502	NC_011147	TG	3	6	117233	117238	0 %	50 %	50 %	0 %	197361307
2503	NC_011147	GCG	2	6	117294	117299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361307
2504	NC_011147	GCC	2	6	117340	117345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361307
2505	NC_011147	GTC	2	6	117379	117384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_011147	GGA	2	6	117433	117438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_011147	TGT	3	9	117445	117453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011147	CG	3	6	117485	117490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_011147	CGC	2	6	117564	117569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2510	NC_011147	GCC	2	6	117597	117602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_011147	CG	3	6	117615	117620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_011147	TGT	2	6	117628	117633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_011147	CG	3	6	117731	117736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_011147	CTGA	2	8	117747	117754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_011147	ATG	2	6	117805	117810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_011147	ATGA	2	8	117844	117851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_011147	GTTC	2	8	117852	117859	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_011147	ATG	2	6	117943	117948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_011147	TA	3	6	117953	117958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011147	CAG	2	6	117959	117964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_011147	TTTA	2	8	118001	118008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_011147	A	6	6	118116	118121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_011147	T	6	6	118128	118133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_011147	GTTT	2	8	118134	118141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_011147	TAAT	2	8	118142	118149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_011147	ATA	2	6	118199	118204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_011147	TAAA	2	8	118225	118232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011147	TCG	2	6	118252	118257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_011147	CT	3	6	118262	118267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_011147	TAATT	2	10	118271	118280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011147	ATTTT	2	10	118297	118306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_011147	CGGGTG	2	12	118313	118324	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2533	NC_011147	T	6	6	118459	118464	0 %	100 %	0 %	0 %	197361308
2534	NC_011147	ACAGA	2	10	118480	118489	60 %	0 %	20 %	20 %	197361308
2535	NC_011147	ATT	2	6	118504	118509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361308
2536	NC_011147	T	7	7	118524	118530	0 %	100 %	0 %	0 %	197361308
2537	NC_011147	ATT	2	6	118573	118578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361308
2538	NC_011147	CAA	2	6	118610	118615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361308
2539	NC_011147	TTC	2	6	118630	118635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361308
2540	NC_011147	GGAA	2	8	118644	118651	50 %	0 %	50 %	0 %	197361308
2541	NC_011147	ATA	2	6	118673	118678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361308
2542	NC_011147	AT	3	6	118731	118736	50 %	50 %	0 %	0 %	197361308
2543	NC_011147	TCA	2	6	118749	118754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361308
2544	NC_011147	C	6	6	118760	118765	0 %	0 %	0 %	100 %	197361308
2545	NC_011147	CAG	2	6	118839	118844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361309
2546	NC_011147	TGC	2	6	118849	118854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361309
2547	NC_011147	GCG	2	6	118868	118873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361309
2548	NC_011147	GGC	2	6	118880	118885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361309
2549	NC_011147	AGA	2	6	118886	118891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361309
2550	NC_011147	CTT	2	6	118907	118912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361309
2551	NC_011147	GCG	2	6	119002	119007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361309
2552	NC_011147	CAA	2	6	119033	119038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361309
2553	NC_011147	GTGG	2	8	119130	119137	0 %	25 %	75 %	0 %	197361309
2554	NC_011147	GT	3	6	119197	119202	0 %	50 %	50 %	0 %	197361309
2555	NC_011147	GCC	2	6	119208	119213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361309
2556	NC_011147	GAC	2	6	119260	119265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361309
2557	NC_011147	ACC	3	9	119308	119316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361309
2558	NC_011147	CGC	2	6	119372	119377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361309
2559	NC_011147	TCT	2	6	119473	119478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361309
2560	NC_011147	CAGCG	2	10	119655	119664	20 %	0 %	40 %	40 %	197361310
2561	NC_011147	ATCA	2	8	119696	119703	50 %	25 %	0 %	25 %	197361310
2562	NC_011147	GC	3	6	119782	119787	0 %	0 %	50 %	50 %	197361310
2563	NC_011147	GCCA	2	8	119789	119796	25 %	0 %	25 %	50 %	197361310
2564	NC_011147	GCG	2	6	119878	119883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361310
2565	NC_011147	CAG	2	6	119909	119914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361310
2566	NC_011147	CGA	2	6	119947	119952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361310
2567	NC_011147	GCCGG	2	10	119955	119964	0 %	0 %	60 %	40 %	197361310
2568	NC_011147	GCC	2	6	120002	120007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361310
2569	NC_011147	AC	3	6	120062	120067	50 %	0 %	0 %	50 %	197361310
2570	NC_011147	CGAGC	2	10	120080	120089	20 %	0 %	40 %	40 %	197361310
2571	NC_011147	TCC	2	6	120126	120131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361310
2572	NC_011147	GCC	2	6	120143	120148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361310
2573	NC_011147	GCG	2	6	120189	120194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361310
2574	NC_011147	CTG	2	6	120230	120235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361310
2575	NC_011147	GTT	2	6	120265	120270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361310
2576	NC_011147	AGT	3	9	120293	120301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361310
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2578	NC_011147	GC	3	6	120353	120358	0 %	0 %	50 %	50 %	197361310
2579	NC_011147	GGCG	2	8	120401	120408	0 %	0 %	75 %	25 %	197361310
2580	NC_011147	GCT	2	6	120419	120424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361310
2581	NC_011147	TCGCCG	2	12	120453	120464	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	197361310
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2583	NC_011147	ATTTG	2	10	120523	120532	20 %	60 %	20 %	0 %	197361310
2584	NC_011147	GTCA	2	8	120551	120558	25 %	25 %	25 %	25 %	197361310
2585	NC_011147	GAC	2	6	120686	120691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361310
2586	NC_011147	TGC	2	6	120696	120701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361310
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2588	NC_011147	GCC	2	6	120737	120742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361310
2589	NC_011147	GGTTCA	2	12	120754	120765	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197361310
2590	NC_011147	GCG	2	6	120798	120803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361310
2591	NC_011147	AGT	2	6	120825	120830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361310
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2593	NC_011147	GCTG	2	8	121078	121085	0 %	25 %	50 %	25 %	197361310
2594	NC_011147	TGT	2	6	121201	121206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361311
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2596	NC_011147	GCG	2	6	121233	121238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361311
2597	NC_011147	GGC	2	6	121317	121322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361311
2598	NC_011147	CGG	2	6	121352	121357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361311
2599	NC_011147	GCG	2	6	121366	121371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361311
2600	NC_011147	CGA	2	6	121397	121402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361311
2601	NC_011147	GCA	2	6	121428	121433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361311
2602	NC_011147	GCC	2	6	121467	121472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361311
2603	NC_011147	GC	5	10	121528	121537	0 %	0 %	50 %	50 %	197361311
2604	NC_011147	CAC	2	6	121665	121670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361311
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2606	NC_011147	CTGG	2	8	121734	121741	0 %	25 %	50 %	25 %	197361311
2607	NC_011147	TGC	2	6	121768	121773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361311
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2609	NC_011147	CAC	2	6	121872	121877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361311
2610	NC_011147	CGC	2	6	122033	122038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361311
2611	NC_011147	CAC	2	6	122046	122051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361311
2612	NC_011147	CGG	2	6	122111	122116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361311
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2620	NC_011147	CGG	2	6	122324	122329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361311
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2625	NC_011147	CGG	2	6	122474	122479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361311
2626	NC_011147	GCG	2	6	122623	122628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361311
2627	NC_011147	CG	3	6	122681	122686	0 %	0 %	50 %	50 %	197361311
2628	NC_011147	GAT	2	6	122687	122692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361311
2629	NC_011147	GTT	2	6	122703	122708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361311
2630	NC_011147	CTT	2	6	122729	122734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361311
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2637	NC_011147	CAGG	2	8	122909	122916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2638	NC_011147	AATGCT	2	12	122939	122950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2640	NC_011147	GTC	2	6	123127	123132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2641	NC_011147	TCT	2	6	123156	123161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2642	NC_011147	G	6	6	123171	123176	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2643	NC_011147	T	7	7	123285	123291	0 %	100 %	0 %	0 %	197361312
2644	NC_011147	ATCG	2	8	123292	123299	25 %	25 %	25 %	25 %	197361312
2645	NC_011147	AT	3	6	123318	123323	50 %	50 %	0 %	0 %	197361312
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2664	NC_011147	CTG	2	6	124160	124165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361313
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2994	NC_011147	CG	3	6	139572	139577	0 %	0 %	50 %	50 %	197361325
2995	NC_011147	GCTGA	2	10	139593	139602	20 %	20 %	40 %	20 %	197361325
2996	NC_011147	GAC	2	6	139613	139618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2997	NC_011147	CAGG	2	8	139683	139690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2998	NC_011147	CCCAA	2	10	139722	139731	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2999	NC_011147	T	8	8	139747	139754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_011147	AAAGC	2	10	139950	139959	60 %	0 %	20 %	20 %	197361326

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