MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011147	CGG	2	6	22775	22780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784909
502	NC_011147	T	7	7	22784	22790	0 %	100 %	0 %	0 %	449784909
503	NC_011147	CT	3	6	22827	22832	0 %	50 %	0 %	50 %	449784909
504	NC_011147	GGT	2	6	22980	22985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449784909
505	NC_011147	CTA	2	6	22987	22992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449784909
506	NC_011147	CGG	2	6	23027	23032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784909
507	NC_011147	CTGG	2	8	23033	23040	0 %	25 %	50 %	25 %	449784909
508	NC_011147	TAT	2	6	23058	23063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449784909
509	NC_011147	ATA	2	6	23084	23089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449784909
510	NC_011147	TTA	2	6	23199	23204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011147	TCTTAA	2	12	23236	23247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
512	NC_011147	TTAT	2	8	23298	23305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011147	A	7	7	23371	23377	100 %	0 %	0 %	0 %	197361231
514	NC_011147	TGA	2	6	23378	23383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361231
515	NC_011147	ATA	2	6	23402	23407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361231
516	NC_011147	CTTTT	2	10	23426	23435	0 %	80 %	0 %	20 %	197361231
517	NC_011147	T	6	6	23432	23437	0 %	100 %	0 %	0 %	197361231
518	NC_011147	CAG	2	6	23440	23445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361231
519	NC_011147	TTG	2	6	23485	23490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361231
520	NC_011147	TTTA	2	8	23531	23538	25 %	75 %	0 %	0 %	197361231
521	NC_011147	ATG	2	6	23546	23551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361231
522	NC_011147	TTTC	2	8	23585	23592	0 %	75 %	0 %	25 %	197361231
523	NC_011147	TGA	2	6	23598	23603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361231
524	NC_011147	AT	3	6	23615	23620	50 %	50 %	0 %	0 %	197361231
525	NC_011147	CG	3	6	23685	23690	0 %	0 %	50 %	50 %	197361231
526	NC_011147	ACG	2	6	23786	23791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361231
527	NC_011147	TGA	2	6	23822	23827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361231
528	NC_011147	GC	4	8	23828	23835	0 %	0 %	50 %	50 %	197361231
529	NC_011147	GCT	2	6	23880	23885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361231
530	NC_011147	TCTG	2	8	23988	23995	0 %	50 %	25 %	25 %	197361231
531	NC_011147	A	7	7	24000	24006	100 %	0 %	0 %	0 %	197361231
532	NC_011147	GGC	2	6	24032	24037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361231
533	NC_011147	AT	3	6	24089	24094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011147	TAA	2	6	24128	24133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011147	AAG	2	6	24155	24160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011147	ATT	2	6	24161	24166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011147	A	6	6	24169	24174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011147	ACA	2	6	24228	24233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011147	GAT	2	6	24265	24270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011147	TAA	2	6	24292	24297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011147	TAA	2	6	24299	24304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011147	ACG	2	6	24339	24344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011147	AAG	2	6	24386	24391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011147	T	7	7	24396	24402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011147	GAA	2	6	24432	24437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011147	CAG	2	6	24442	24447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011147	A	6	6	24458	24463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011147	TGAA	2	8	24499	24506	50 %	25 %	25 %	0 %	197361232
549	NC_011147	TGT	2	6	24554	24559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361232
550	NC_011147	TAC	2	6	24576	24581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361232
551	NC_011147	CGGTA	2	10	24594	24603	20 %	20 %	40 %	20 %	197361232
552	NC_011147	CGC	2	6	24627	24632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361232
553	NC_011147	CTGTT	2	10	24633	24642	0 %	60 %	20 %	20 %	197361232
554	NC_011147	GGC	2	6	24714	24719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361232
555	NC_011147	AGA	2	6	24729	24734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361232
556	NC_011147	CCAG	2	8	24770	24777	25 %	0 %	25 %	50 %	197361232
557	NC_011147	GCG	2	6	24781	24786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361232
558	NC_011147	CAG	2	6	24802	24807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361232
559	NC_011147	CGA	2	6	24857	24862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361232
560	NC_011147	T	7	7	25058	25064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011147	CG	3	6	25097	25102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_011147	A	8	8	25148	25155	100 %	0 %	0 %	0 %	197361233
563	NC_011147	ATT	2	6	25174	25179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361233
564	NC_011147	CTG	2	6	25184	25189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361233
565	NC_011147	CGG	2	6	25191	25196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361233
566	NC_011147	CCT	2	6	25278	25283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361233
567	NC_011147	ATT	2	6	25289	25294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361233
568	NC_011147	TTC	2	6	25297	25302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361233
569	NC_011147	T	7	7	25314	25320	0 %	100 %	0 %	0 %	197361233
570	NC_011147	CGC	2	6	25377	25382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361233
571	NC_011147	CT	3	6	25383	25388	0 %	50 %	0 %	50 %	197361233
572	NC_011147	A	6	6	25403	25408	100 %	0 %	0 %	0 %	197361233
573	NC_011147	AT	3	6	25413	25418	50 %	50 %	0 %	0 %	197361233
574	NC_011147	TAT	2	6	25423	25428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361233
575	NC_011147	ACCG	2	8	25447	25454	25 %	0 %	25 %	50 %	197361233
576	NC_011147	TTTA	2	8	25470	25477	25 %	75 %	0 %	0 %	197361233
577	NC_011147	TAC	2	6	25664	25669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361233
578	NC_011147	A	6	6	25700	25705	100 %	0 %	0 %	0 %	197361233
579	NC_011147	CCG	2	6	25724	25729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361233
580	NC_011147	ACG	2	6	25799	25804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361233
581	NC_011147	ATG	2	6	25828	25833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361233
582	NC_011147	GCGCCT	2	12	25920	25931	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	197361234
583	NC_011147	TCTG	2	8	25964	25971	0 %	50 %	25 %	25 %	197361234
584	NC_011147	GGC	2	6	26021	26026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361234
585	NC_011147	GAC	2	6	26102	26107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361234
586	NC_011147	GC	3	6	26116	26121	0 %	0 %	50 %	50 %	197361234
587	NC_011147	GCCT	2	8	26145	26152	0 %	25 %	25 %	50 %	197361234
588	NC_011147	GGC	3	9	26213	26221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361234
589	NC_011147	GCC	2	6	26256	26261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361234
590	NC_011147	GCA	2	6	26282	26287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361234
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592	NC_011147	GGC	2	6	26430	26435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361234
593	NC_011147	ACT	2	6	26503	26508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361234
594	NC_011147	GCG	2	6	26527	26532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361234
595	NC_011147	AGCGAC	2	12	26541	26552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361234
596	NC_011147	GCA	2	6	26555	26560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361234
597	NC_011147	ATT	2	6	26639	26644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361234
598	NC_011147	CCTT	2	8	26651	26658	0 %	50 %	0 %	50 %	197361234
599	NC_011147	GAC	2	6	26682	26687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361234
600	NC_011147	CAT	2	6	26780	26785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361234
601	NC_011147	GCC	2	6	26801	26806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361234
602	NC_011147	CCG	2	6	26839	26844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361234
603	NC_011147	CCG	2	6	26914	26919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361234
604	NC_011147	GGC	2	6	26941	26946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361234
605	NC_011147	GCG	2	6	26955	26960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361234
606	NC_011147	TAG	2	6	26984	26989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361234
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608	NC_011147	GCG	2	6	27106	27111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361234
609	NC_011147	ATA	2	6	27175	27180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361234
610	NC_011147	GAT	2	6	27294	27299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361234
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612	NC_011147	TAT	2	6	27390	27395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361234
613	NC_011147	AGG	2	6	27399	27404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361234
614	NC_011147	ATCA	2	8	27423	27430	50 %	25 %	0 %	25 %	197361234
615	NC_011147	TTA	2	6	27457	27462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361234
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619	NC_011147	ATG	3	9	27649	27657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361234
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621	NC_011147	ACA	2	6	27775	27780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361234
622	NC_011147	GCG	2	6	27817	27822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361234
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628	NC_011147	GGT	2	6	28061	28066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361234
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630	NC_011147	TGA	2	6	28124	28129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361234
631	NC_011147	TGA	2	6	28139	28144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361234
632	NC_011147	CCGA	2	8	28164	28171	25 %	0 %	25 %	50 %	197361234
633	NC_011147	GC	3	6	28174	28179	0 %	0 %	50 %	50 %	197361234
634	NC_011147	GCGT	2	8	28210	28217	0 %	25 %	50 %	25 %	197361234
635	NC_011147	ACGGTG	2	12	28266	28277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	197361234
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637	NC_011147	GCGTC	2	10	28390	28399	0 %	20 %	40 %	40 %	197361234
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652	NC_011147	CCG	2	6	28978	28983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361235
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757	NC_011147	TTGG	2	8	33946	33953	0 %	50 %	50 %	0 %	197361241
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