MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011147	TAA	2	6	280128	280133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361441
6002	NC_011147	T	6	6	280189	280194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011147	CAT	2	6	280211	280216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361442
6004	NC_011147	TAT	2	6	280242	280247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361442
6005	NC_011147	TTG	2	6	280329	280334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361442
6006	NC_011147	GCG	2	6	280363	280368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361442
6007	NC_011147	CT	3	6	280438	280443	0 %	50 %	0 %	50 %	197361442
6008	NC_011147	T	6	6	280509	280514	0 %	100 %	0 %	0 %	197361442
6009	NC_011147	GCTG	2	8	280529	280536	0 %	25 %	50 %	25 %	197361442
6010	NC_011147	TCA	2	6	280556	280561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361442
6011	NC_011147	ATA	2	6	280582	280587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361442
6012	NC_011147	CGC	2	6	280591	280596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361442
6013	NC_011147	AAG	2	6	280627	280632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361442
6014	NC_011147	T	6	6	280713	280718	0 %	100 %	0 %	0 %	197361442
6015	NC_011147	GGC	2	6	280719	280724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361442
6016	NC_011147	GCT	2	6	280772	280777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361442
6017	NC_011147	GTAT	2	8	280888	280895	25 %	50 %	25 %	0 %	197361442
6018	NC_011147	TGA	3	9	280960	280968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361442
6019	NC_011147	CT	3	6	280981	280986	0 %	50 %	0 %	50 %	197361442
6020	NC_011147	CGG	2	6	281021	281026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361442
6021	NC_011147	CTG	2	6	281136	281141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361442
6022	NC_011147	GCG	2	6	281254	281259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361442
6023	NC_011147	GGC	2	6	281312	281317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361442
6024	NC_011147	ATG	2	6	281385	281390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361442
6025	NC_011147	CGG	2	6	281440	281445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361442
6026	NC_011147	TGC	2	6	281449	281454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361442
6027	NC_011147	GATT	2	8	281473	281480	25 %	50 %	25 %	0 %	197361442
6028	NC_011147	AAG	2	6	281515	281520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361442
6029	NC_011147	TGA	2	6	281582	281587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361442
6030	NC_011147	CCGATG	2	12	281635	281646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197361442
6031	NC_011147	GATG	2	8	281696	281703	25 %	25 %	50 %	0 %	197361442
6032	NC_011147	CGC	2	6	281735	281740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361442
6033	NC_011147	TGG	2	6	281743	281748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361442
6034	NC_011147	GTG	3	9	281772	281780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361442
6035	NC_011147	A	6	6	281782	281787	100 %	0 %	0 %	0 %	197361442
6036	NC_011147	CTG	2	6	281802	281807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361442
6037	NC_011147	GCT	2	6	281849	281854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361442
6038	NC_011147	GAT	2	6	282050	282055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361442
6039	NC_011147	CTG	2	6	282231	282236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361442
6040	NC_011147	TGCTC	2	10	282238	282247	0 %	40 %	20 %	40 %	197361442
6041	NC_011147	TCA	2	6	282423	282428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361443
6042	NC_011147	TCCCT	2	10	282585	282594	0 %	40 %	0 %	60 %	197361443
6043	NC_011147	T	6	6	282744	282749	0 %	100 %	0 %	0 %	197361443
6044	NC_011147	CT	3	6	282885	282890	0 %	50 %	0 %	50 %	449784914
6045	NC_011147	GCG	2	6	282916	282921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784914
6046	NC_011147	TCA	2	6	283004	283009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449784914
6047	NC_011147	GC	3	6	283143	283148	0 %	0 %	50 %	50 %	449784914
6048	NC_011147	GCA	2	6	283199	283204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449784914
6049	NC_011147	CTG	2	6	283230	283235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449784914
6050	NC_011147	CCGG	2	8	283257	283264	0 %	0 %	50 %	50 %	449784914
6051	NC_011147	CTT	2	6	283308	283313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449784914
6052	NC_011147	GA	3	6	283325	283330	50 %	0 %	50 %	0 %	449784914
6053	NC_011147	T	6	6	283421	283426	0 %	100 %	0 %	0 %	449784914
6054	NC_011147	GC	4	8	283433	283440	0 %	0 %	50 %	50 %	449784914
6055	NC_011147	GCG	2	6	283454	283459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784914
6056	NC_011147	GCG	2	6	283476	283481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784914
6057	NC_011147	GCT	2	6	283520	283525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449784914
6058	NC_011147	CGG	2	6	283564	283569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784914
6059	NC_011147	CT	3	6	283584	283589	0 %	50 %	0 %	50 %	449784914
6060	NC_011147	TTGATG	2	12	283593	283604	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	449784914
6061	NC_011147	CGG	2	6	283614	283619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784914
6062	NC_011147	GCTG	2	8	283636	283643	0 %	25 %	50 %	25 %	449784914
6063	NC_011147	TGGCGC	2	12	283702	283713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	449784914
6064	NC_011147	CGA	2	6	283715	283720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449784914
6065	NC_011147	TGG	2	6	283779	283784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449784914
6066	NC_011147	ACA	2	6	283802	283807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449784914
6067	NC_011147	ACG	2	6	283812	283817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449784914
6068	NC_011147	GTC	2	6	283818	283823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449784914
6069	NC_011147	CTGC	2	8	283851	283858	0 %	25 %	25 %	50 %	449784914
6070	NC_011147	GGC	2	6	283887	283892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784914
6071	NC_011147	GAA	2	6	283914	283919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449784914
6072	NC_011147	CGA	2	6	284025	284030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449784914
6073	NC_011147	GTT	3	9	284042	284050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449784914
6074	NC_011147	AGC	2	6	284102	284107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449784914
6075	NC_011147	AGA	2	6	284108	284113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449784914
6076	NC_011147	AAG	2	6	284116	284121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449784914
6077	NC_011147	GCGCT	2	10	284150	284159	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6078	NC_011147	CAC	2	6	284207	284212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_011147	CAA	2	6	284220	284225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_011147	T	6	6	284391	284396	0 %	100 %	0 %	0 %	197361445
6081	NC_011147	ATG	2	6	284417	284422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361445
6082	NC_011147	TCAT	2	8	284478	284485	25 %	50 %	0 %	25 %	197361445
6083	NC_011147	GCA	2	6	284515	284520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361446
6084	NC_011147	GCC	2	6	284563	284568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361446
6085	NC_011147	CCT	2	6	284683	284688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361446
6086	NC_011147	CGT	2	6	284905	284910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361447
6087	NC_011147	ATG	2	6	284993	284998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361447
6088	NC_011147	TGA	2	6	285028	285033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361447
6089	NC_011147	ATC	2	6	285096	285101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361447
6090	NC_011147	GCGA	2	8	285170	285177	25 %	0 %	50 %	25 %	197361447
6091	NC_011147	GCG	2	6	285206	285211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361447
6092	NC_011147	TGG	2	6	285218	285223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361447
6093	NC_011147	CAG	2	6	285224	285229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361447
6094	NC_011147	GC	3	6	285243	285248	0 %	0 %	50 %	50 %	197361447
6095	NC_011147	CGA	2	6	285336	285341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361447
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6097	NC_011147	CG	3	6	285478	285483	0 %	0 %	50 %	50 %	197361448
6098	NC_011147	GGT	2	6	285493	285498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361448
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6101	NC_011147	GAT	2	6	285613	285618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361448
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6103	NC_011147	CGC	2	6	285766	285771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361448
6104	NC_011147	TCT	2	6	285793	285798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361448
6105	NC_011147	TCG	2	6	285822	285827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361448
6106	NC_011147	TAA	2	6	285934	285939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361449
6107	NC_011147	GGC	2	6	285973	285978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361449
6108	NC_011147	GCA	2	6	285994	285999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361449
6109	NC_011147	GCG	2	6	286008	286013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361449
6110	NC_011147	TGC	2	6	286014	286019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361449
6111	NC_011147	TGA	2	6	286080	286085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361449
6112	NC_011147	GAA	2	6	286109	286114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361449
6113	NC_011147	CGG	2	6	286152	286157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361449
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6115	NC_011147	CG	3	6	286202	286207	0 %	0 %	50 %	50 %	197361449
6116	NC_011147	GTAT	3	12	286323	286334	25 %	50 %	25 %	0 %	197361449
6117	NC_011147	GCG	2	6	286346	286351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361449
6118	NC_011147	GGC	2	6	286423	286428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361449
6119	NC_011147	TGC	2	6	286452	286457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361449
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6121	NC_011147	CAA	2	6	286633	286638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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