MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011147	GCA	2	6	255177	255182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5502	NC_011147	ACGC	2	8	255208	255215	25 %	0 %	25 %	50 %	197361422
5503	NC_011147	GCA	2	6	255285	255290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5504	NC_011147	TGAC	2	8	255444	255451	25 %	25 %	25 %	25 %	197361422
5505	NC_011147	CAG	2	6	255454	255459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5506	NC_011147	CCAG	2	8	255471	255478	25 %	0 %	25 %	50 %	197361422
5507	NC_011147	GC	3	6	255540	255545	0 %	0 %	50 %	50 %	197361422
5508	NC_011147	CGC	3	9	255561	255569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361422
5509	NC_011147	GCG	2	6	255596	255601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361422
5510	NC_011147	TCT	2	6	255671	255676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361422
5511	NC_011147	GT	3	6	255713	255718	0 %	50 %	50 %	0 %	197361422
5512	NC_011147	CGA	2	6	255762	255767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5513	NC_011147	GCA	2	6	255819	255824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5514	NC_011147	GC	3	6	255874	255879	0 %	0 %	50 %	50 %	197361422
5515	NC_011147	GGC	2	6	255912	255917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361422
5516	NC_011147	CGT	2	6	255940	255945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5517	NC_011147	CAT	2	6	255979	255984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361422
5518	NC_011147	GTC	2	6	256030	256035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5519	NC_011147	GCAG	2	8	256100	256107	25 %	0 %	50 %	25 %	197361422
5520	NC_011147	AGC	2	6	256136	256141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5521	NC_011147	AGT	2	6	256179	256184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361422
5522	NC_011147	TCA	2	6	256188	256193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361422
5523	NC_011147	CGC	2	6	256218	256223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361422
5524	NC_011147	CAG	2	6	256264	256269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5525	NC_011147	ACC	2	6	256289	256294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361422
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5527	NC_011147	CCA	2	6	256380	256385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361422
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5529	NC_011147	GCC	2	6	256453	256458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361422
5530	NC_011147	GCT	2	6	256462	256467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361422
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5536	NC_011147	CAG	2	6	256678	256683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
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5538	NC_011147	AAAGT	2	10	256734	256743	60 %	20 %	20 %	0 %	197361422
5539	NC_011147	CAG	2	6	256744	256749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361422
5540	NC_011147	CGC	2	6	256833	256838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361422
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5542	NC_011147	CAA	2	6	256912	256917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361422
5543	NC_011147	TTCGG	2	10	256930	256939	0 %	40 %	40 %	20 %	197361422
5544	NC_011147	CCAG	2	8	256986	256993	25 %	0 %	25 %	50 %	197361422
5545	NC_011147	GC	3	6	257042	257047	0 %	0 %	50 %	50 %	197361422
5546	NC_011147	AGGG	2	8	257077	257084	25 %	0 %	75 %	0 %	197361422
5547	NC_011147	TGG	2	6	257153	257158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_011147	AGT	2	6	257184	257189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5552	NC_011147	GAT	2	6	257255	257260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361423
5553	NC_011147	ACG	2	6	257454	257459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361423
5554	NC_011147	CCA	2	6	257460	257465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361423
5555	NC_011147	CAT	2	6	257473	257478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361423
5556	NC_011147	GCA	2	6	257482	257487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361423
5557	NC_011147	TTC	2	6	257495	257500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361423
5558	NC_011147	CCTTCG	2	12	257553	257564	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	197361423
5559	NC_011147	GGC	2	6	257579	257584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361423
5560	NC_011147	CT	3	6	257640	257645	0 %	50 %	0 %	50 %	197361423
5561	NC_011147	CGA	2	6	257689	257694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361423
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5569	NC_011147	TCAG	2	8	258095	258102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5570	NC_011147	T	6	6	258171	258176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_011147	GCC	2	6	258224	258229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_011147	CAA	2	6	258273	258278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_011147	GC	3	6	258312	258317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_011147	AC	3	6	258343	258348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5576	NC_011147	AC	4	8	258385	258392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_011147	GC	3	6	258582	258587	0 %	0 %	50 %	50 %	197361424
5578	NC_011147	CAT	2	6	258601	258606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361424
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5580	NC_011147	AAGCG	2	10	258712	258721	40 %	0 %	40 %	20 %	197361424
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5584	NC_011147	AAGA	2	8	258875	258882	75 %	0 %	25 %	0 %	197361424
5585	NC_011147	AAC	2	6	259013	259018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361424
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5589	NC_011147	GTA	2	6	259365	259370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_011147	ATG	2	6	259525	259530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361425
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5592	NC_011147	CTGA	2	8	259546	259553	25 %	25 %	25 %	25 %	197361425
5593	NC_011147	AGC	2	6	259611	259616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361425
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5595	NC_011147	GCT	2	6	259636	259641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361425
5596	NC_011147	GACT	2	8	259704	259711	25 %	25 %	25 %	25 %	197361425
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5599	NC_011147	GC	3	6	259915	259920	0 %	0 %	50 %	50 %	197361425
5600	NC_011147	GCAA	2	8	259990	259997	50 %	0 %	25 %	25 %	197361425
5601	NC_011147	GAAA	2	8	260091	260098	75 %	0 %	25 %	0 %	197361425
5602	NC_011147	GAA	2	6	260127	260132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361425
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5604	NC_011147	GACT	2	8	260274	260281	25 %	25 %	25 %	25 %	197361425
5605	NC_011147	GCA	2	6	260284	260289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361425
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5608	NC_011147	CTT	2	6	260347	260352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_011147	CT	3	6	260360	260365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_011147	GAAA	2	8	260455	260462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_011147	GCG	2	6	260513	260518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361426
5612	NC_011147	TGGTG	2	10	260616	260625	0 %	40 %	60 %	0 %	197361426
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5747	NC_011147	CTA	2	6	267251	267256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361432
5748	NC_011147	CG	3	6	267272	267277	0 %	0 %	50 %	50 %	197361432
5749	NC_011147	CG	3	6	267526	267531	0 %	0 %	50 %	50 %	197361432
5750	NC_011147	CTT	2	6	267746	267751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361432
5751	NC_011147	CGACAC	2	12	267761	267772	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	197361432
5752	NC_011147	TGT	2	6	267806	267811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361432
5753	NC_011147	GCG	2	6	267874	267879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361432
5754	NC_011147	CAG	2	6	267900	267905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361432
5755	NC_011147	GGT	2	6	268023	268028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361432
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5757	NC_011147	GAT	2	6	268056	268061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361432
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5759	NC_011147	TACGG	2	10	268092	268101	20 %	20 %	40 %	20 %	197361432
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5761	NC_011147	TGC	2	6	268247	268252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361432
5762	NC_011147	CGA	2	6	268253	268258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361432
5763	NC_011147	GACG	2	8	268313	268320	25 %	0 %	50 %	25 %	197361432
5764	NC_011147	TAC	2	6	268374	268379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361432
5765	NC_011147	GTGG	2	8	268430	268437	0 %	25 %	75 %	0 %	197361432
5766	NC_011147	GGC	2	6	268476	268481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361432
5767	NC_011147	GGT	2	6	268515	268520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361432
5768	NC_011147	CGTG	2	8	268529	268536	0 %	25 %	50 %	25 %	197361432
5769	NC_011147	ATG	2	6	268606	268611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361432
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5776	NC_011147	TCT	2	6	268897	268902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361432
5777	NC_011147	TTA	2	6	269114	269119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361433
5778	NC_011147	GCT	2	6	269159	269164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361433
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5781	NC_011147	TCG	2	6	269419	269424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361433
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5785	NC_011147	TGG	2	6	269505	269510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361433
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5793	NC_011147	TCG	2	6	270012	270017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361434
5794	NC_011147	A	6	6	270019	270024	100 %	0 %	0 %	0 %	197361434
5795	NC_011147	TCCAG	2	10	270105	270114	20 %	20 %	20 %	40 %	197361434
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5800	NC_011147	CGT	2	6	270310	270315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361434
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5804	NC_011147	CTG	2	6	270537	270542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361434
5805	NC_011147	TGA	2	6	270549	270554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361434
5806	NC_011147	TGA	2	6	270559	270564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361434
5807	NC_011147	CAA	2	6	270605	270610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361434
5808	NC_011147	TTA	2	6	270682	270687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5809	NC_011147	ACT	2	6	270725	270730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361435
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5812	NC_011147	TGA	2	6	271009	271014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361435
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5839	NC_011147	CCGT	2	8	272335	272342	0 %	25 %	25 %	50 %	197361437
5840	NC_011147	ATGCC	2	10	272477	272486	20 %	20 %	20 %	40 %	197361437
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5851	NC_011147	CTG	2	6	272917	272922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361437
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5854	NC_011147	CA	3	6	273133	273138	50 %	0 %	0 %	50 %	197361438
5855	NC_011147	TGG	2	6	273181	273186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361438
5856	NC_011147	CCG	3	9	273199	273207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361438
5857	NC_011147	TCG	2	6	273232	273237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361438
5858	NC_011147	A	6	6	273252	273257	100 %	0 %	0 %	0 %	197361438
5859	NC_011147	CGT	2	6	273270	273275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361438
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5864	NC_011147	GTG	2	6	273477	273482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361438
5865	NC_011147	GCG	2	6	273513	273518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361438
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5989	NC_011147	AGTT	2	8	279496	279503	25 %	50 %	25 %	0 %	197361441
5990	NC_011147	ATT	2	6	279562	279567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361441
5991	NC_011147	GTC	2	6	279579	279584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361441
5992	NC_011147	GAT	2	6	279585	279590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361441
5993	NC_011147	CG	3	6	279659	279664	0 %	0 %	50 %	50 %	197361441
5994	NC_011147	GCCGG	2	10	279669	279678	0 %	0 %	60 %	40 %	197361441
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