MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011147	GCG	2	6	232605	232610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5002	NC_011147	GCG	2	6	232638	232643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5003	NC_011147	TTG	2	6	232658	232663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361405
5004	NC_011147	GGC	2	6	232741	232746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5005	NC_011147	GC	3	6	232770	232775	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
5006	NC_011147	GCT	2	6	232825	232830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5007	NC_011147	CTG	2	6	232856	232861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5008	NC_011147	GC	3	6	232862	232867	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
5009	NC_011147	ATGG	2	8	232942	232949	25 %	25 %	50 %	0 %	197361405
5010	NC_011147	GC	3	6	232983	232988	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
5011	NC_011147	GCT	2	6	232990	232995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5012	NC_011147	GCT	2	6	233002	233007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5013	NC_011147	GC	3	6	233028	233033	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
5014	NC_011147	GGC	2	6	233059	233064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5015	NC_011147	GC	3	6	233103	233108	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
5016	NC_011147	CTG	3	9	233111	233119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5017	NC_011147	CT	3	6	233135	233140	0 %	50 %	0 %	50 %	197361405
5018	NC_011147	GCT	2	6	233182	233187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5019	NC_011147	GAA	2	6	233189	233194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361405
5020	NC_011147	GGC	2	6	233224	233229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5021	NC_011147	GGCG	2	8	233236	233243	0 %	0 %	75 %	25 %	197361405
5022	NC_011147	ATT	2	6	233267	233272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361405
5023	NC_011147	GTG	2	6	233342	233347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361405
5024	NC_011147	CTGC	2	8	233390	233397	0 %	25 %	25 %	50 %	197361405
5025	NC_011147	GCG	3	9	233411	233419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5026	NC_011147	CTG	2	6	233423	233428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5027	NC_011147	ATT	2	6	233429	233434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361405
5028	NC_011147	GCC	2	6	233441	233446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361405
5029	NC_011147	GCG	2	6	233451	233456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5030	NC_011147	CGC	2	6	233463	233468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361405
5031	NC_011147	TGC	2	6	233514	233519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5032	NC_011147	ATG	2	6	233522	233527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361405
5033	NC_011147	GCG	2	6	233538	233543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5034	NC_011147	CGC	2	6	233663	233668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361405
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5036	NC_011147	CG	5	10	233701	233710	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
5037	NC_011147	GCT	2	6	233743	233748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5038	NC_011147	CGA	2	6	233778	233783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361405
5039	NC_011147	CGG	2	6	233952	233957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361405
5040	NC_011147	GC	3	6	233979	233984	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
5041	NC_011147	A	8	8	234021	234028	100 %	0 %	0 %	0 %	197361405
5042	NC_011147	CAATAT	2	12	234085	234096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5043	NC_011147	ATA	2	6	234103	234108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011147	AAG	2	6	234198	234203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011147	GC	3	6	234247	234252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_011147	TGA	2	6	234305	234310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011147	TC	3	6	234326	234331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_011147	AAT	2	6	234333	234338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011147	TAA	3	9	234428	234436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011147	ATA	2	6	234457	234462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011147	T	6	6	234471	234476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011147	TAA	2	6	234485	234490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_011147	A	6	6	234489	234494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_011147	AAAT	2	8	234506	234513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011147	A	8	8	234532	234539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011147	T	6	6	234552	234557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011147	T	7	7	234560	234566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011147	AAAT	2	8	234584	234591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_011147	CAT	2	6	234598	234603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_011147	T	6	6	234634	234639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011147	CTTG	2	8	234680	234687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_011147	TTTG	2	8	234689	234696	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011147	T	6	6	234697	234702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011147	A	6	6	234710	234715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_011147	TATT	2	8	234716	234723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_011147	TGA	2	6	234733	234738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011147	TAAA	2	8	234744	234751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011147	A	6	6	234749	234754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011147	TTAT	2	8	234806	234813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_011147	GTT	2	6	234820	234825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011147	CTT	2	6	234828	234833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_011147	ATATA	2	10	234867	234876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011147	TAA	2	6	234948	234953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011147	CAG	2	6	234970	234975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_011147	TGC	2	6	234989	234994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_011147	TGC	2	6	235028	235033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_011147	CGA	2	6	235103	235108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_011147	CAC	2	6	235211	235216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_011147	AAG	2	6	235222	235227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011147	CGG	3	9	235298	235306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_011147	ACC	2	6	235339	235344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_011147	GCG	3	9	235407	235415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_011147	CTG	2	6	235456	235461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_011147	CCA	2	6	235462	235467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_011147	CAG	2	6	235487	235492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_011147	ATC	2	6	235531	235536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_011147	TA	3	6	235583	235588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011147	A	6	6	235621	235626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011147	GTG	2	6	235651	235656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011147	TAT	2	6	235659	235664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_011147	GAT	2	6	235738	235743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_011147	TTA	2	6	235847	235852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_011147	ATA	2	6	235865	235870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011147	CTG	2	6	235918	235923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_011147	ATT	2	6	236044	236049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_011147	TAT	2	6	236123	236128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011147	ATG	2	6	236168	236173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011147	TGG	2	6	236207	236212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011147	GC	3	6	236238	236243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_011147	GGCG	2	8	236345	236352	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_011147	GGC	2	6	236431	236436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_011147	CGA	2	6	236448	236453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_011147	AT	3	6	236492	236497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_011147	GC	3	6	236506	236511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_011147	GCGG	2	8	236540	236547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_011147	GAA	2	6	236635	236640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011147	GGC	2	6	236764	236769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_011147	CCT	2	6	236789	236794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_011147	CGG	2	6	236823	236828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_011147	GCT	2	6	236886	236891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_011147	TGA	2	6	237006	237011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_011147	GAA	2	6	237052	237057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011147	CAACC	2	10	237220	237229	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5116	NC_011147	ATG	3	9	237320	237328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011147	ACA	3	9	237413	237421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_011147	CTA	2	6	237513	237518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_011147	TCA	2	6	237522	237527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_011147	CGG	2	6	237585	237590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_011147	GCG	2	6	237605	237610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_011147	GCACC	2	10	237639	237648	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5123	NC_011147	CGG	2	6	237657	237662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_011147	GCT	2	6	237669	237674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_011147	TA	3	6	237728	237733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011147	ACT	2	6	237773	237778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_011147	CT	3	6	237835	237840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_011147	CGC	2	6	237880	237885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_011147	CAG	2	6	237897	237902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5131	NC_011147	GGC	2	6	237937	237942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5255	NC_011147	GC	3	6	244024	244029	0 %	0 %	50 %	50 %	197361411
5256	NC_011147	G	6	6	244031	244036	0 %	0 %	100 %	0 %	197361411
5257	NC_011147	GCT	2	6	244067	244072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361411
5258	NC_011147	GGC	3	9	244091	244099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361411
5259	NC_011147	GGC	2	6	244166	244171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361411
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5261	NC_011147	TGCTGG	2	12	244201	244212	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	197361411
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5263	NC_011147	GGC	2	6	244352	244357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361411
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5268	NC_011147	TGG	2	6	244711	244716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361412
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