MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 96599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011147	CGC	2	6	209905	209910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361387
4502	NC_011147	CGC	2	6	209939	209944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361387
4503	NC_011147	GCC	2	6	209981	209986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361387
4504	NC_011147	T	6	6	210114	210119	0 %	100 %	0 %	0 %	197361387
4505	NC_011147	ACG	2	6	210132	210137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361387
4506	NC_011147	ATG	2	6	210380	210385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361388
4507	NC_011147	CCAGA	2	10	210427	210436	40 %	0 %	20 %	40 %	197361388
4508	NC_011147	CGG	2	6	210447	210452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361388
4509	NC_011147	TAA	2	6	210459	210464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361388
4510	NC_011147	GC	4	8	210488	210495	0 %	0 %	50 %	50 %	197361388
4511	NC_011147	TA	3	6	210508	210513	50 %	50 %	0 %	0 %	197361388
4512	NC_011147	TTG	2	6	210549	210554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361388
4513	NC_011147	TTGA	2	8	210575	210582	25 %	50 %	25 %	0 %	197361388
4514	NC_011147	CAA	2	6	210615	210620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361388
4515	NC_011147	CAT	2	6	210660	210665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361388
4516	NC_011147	CAC	2	6	210678	210683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361388
4517	NC_011147	ACC	2	6	210727	210732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361388
4518	NC_011147	CGT	2	6	210751	210756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361388
4519	NC_011147	GC	3	6	210810	210815	0 %	0 %	50 %	50 %	197361388
4520	NC_011147	CTTT	2	8	210999	211006	0 %	75 %	0 %	25 %	197361389
4521	NC_011147	CAC	2	6	211019	211024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361389
4522	NC_011147	CGC	2	6	211048	211053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361389
4523	NC_011147	GGCCT	2	10	211070	211079	0 %	20 %	40 %	40 %	197361389
4524	NC_011147	CGGTA	2	10	211220	211229	20 %	20 %	40 %	20 %	197361389
4525	NC_011147	GCT	3	9	211349	211357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4526	NC_011147	CGC	2	6	211381	211386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361389
4527	NC_011147	TGC	2	6	211423	211428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4528	NC_011147	CGC	2	6	211444	211449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361389
4529	NC_011147	GCA	2	6	211456	211461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4530	NC_011147	GTC	2	6	211502	211507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4531	NC_011147	GCT	2	6	211541	211546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4532	NC_011147	GCT	2	6	211595	211600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4533	NC_011147	TGT	3	9	211852	211860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361389
4534	NC_011147	CAT	2	6	211891	211896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361389
4535	NC_011147	AGT	2	6	211900	211905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361389
4536	NC_011147	GTT	2	6	211941	211946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361389
4537	NC_011147	TCA	2	6	212019	212024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361389
4538	NC_011147	TGC	2	6	212040	212045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4539	NC_011147	AGC	2	6	212126	212131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4540	NC_011147	ATC	2	6	212210	212215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361389
4541	NC_011147	TAA	2	6	212282	212287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361389
4542	NC_011147	GC	3	6	212317	212322	0 %	0 %	50 %	50 %	197361389
4543	NC_011147	GTT	2	6	212342	212347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361389
4544	NC_011147	ATC	2	6	212399	212404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361389
4545	NC_011147	CGCCGA	2	12	212413	212424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	197361389
4546	NC_011147	TGAC	2	8	212461	212468	25 %	25 %	25 %	25 %	197361389
4547	NC_011147	TGC	2	6	212494	212499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4548	NC_011147	CTT	2	6	212506	212511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361389
4549	NC_011147	CAG	2	6	212522	212527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4550	NC_011147	CGG	2	6	212576	212581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361389
4551	NC_011147	GGT	2	6	212585	212590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361389
4552	NC_011147	CGC	2	6	212647	212652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361389
4553	NC_011147	TAAA	2	8	212807	212814	75 %	25 %	0 %	0 %	197361389
4554	NC_011147	TTG	2	6	212823	212828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361389
4555	NC_011147	TCATA	2	10	212965	212974	40 %	40 %	0 %	20 %	197361389
4556	NC_011147	GCC	2	6	212985	212990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361389
4557	NC_011147	GTA	2	6	213113	213118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361389
4558	NC_011147	T	7	7	213119	213125	0 %	100 %	0 %	0 %	197361389
4559	NC_011147	GTG	2	6	213138	213143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361389
4560	NC_011147	GTC	2	6	213146	213151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4561	NC_011147	GCG	2	6	213174	213179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361389
4562	NC_011147	CCTG	2	8	213189	213196	0 %	25 %	25 %	50 %	197361389
4563	NC_011147	GCG	2	6	213208	213213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361389
4564	NC_011147	GCT	2	6	213362	213367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4565	NC_011147	CAA	2	6	213412	213417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361389
4566	NC_011147	T	6	6	213421	213426	0 %	100 %	0 %	0 %	197361389
4567	NC_011147	CTG	3	9	213427	213435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4568	NC_011147	GCA	2	6	213441	213446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361389
4569	NC_011147	ATA	2	6	213484	213489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361389
4570	NC_011147	AAT	2	6	213519	213524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_011147	CCA	2	6	213607	213612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361390
4572	NC_011147	ATT	2	6	213651	213656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361390
4573	NC_011147	TCT	2	6	213808	213813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361390
4574	NC_011147	T	6	6	213813	213818	0 %	100 %	0 %	0 %	197361390
4575	NC_011147	AAT	2	6	213883	213888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361390
4576	NC_011147	AGTTGA	2	12	213910	213921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361390
4577	NC_011147	CTT	2	6	213935	213940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361390
4578	NC_011147	CCAG	2	8	214130	214137	25 %	0 %	25 %	50 %	197361390
4579	NC_011147	TGA	2	6	214194	214199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361390
4580	NC_011147	GGT	2	6	214290	214295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361390
4581	NC_011147	TAA	2	6	214310	214315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361390
4582	NC_011147	CCCT	2	8	214333	214340	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4583	NC_011147	TAAAAT	2	12	214353	214364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_011147	GTT	2	6	214565	214570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361391
4585	NC_011147	GTT	2	6	214610	214615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361391
4586	NC_011147	CTG	2	6	214639	214644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361391
4587	NC_011147	GGT	2	6	214662	214667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361391
4588	NC_011147	ACC	2	6	214676	214681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361391
4589	NC_011147	TAT	2	6	214792	214797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361391
4590	NC_011147	TAT	2	6	214876	214881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361391
4591	NC_011147	AG	3	6	214884	214889	50 %	0 %	50 %	0 %	197361391
4592	NC_011147	CTG	2	6	214948	214953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361391
4593	NC_011147	ATAAAT	2	12	215043	215054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_011147	AT	3	6	215058	215063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_011147	TA	3	6	215065	215070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_011147	TTG	2	6	215077	215082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_011147	AG	3	6	215111	215116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_011147	CCAT	2	8	215138	215145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_011147	T	7	7	215161	215167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_011147	TAT	2	6	215185	215190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_011147	ATAA	2	8	215203	215210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_011147	ATA	2	6	215214	215219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_011147	TTAT	2	8	215220	215227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_011147	A	7	7	215237	215243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_011147	TAT	2	6	215285	215290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_011147	CTT	2	6	215386	215391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361392
4607	NC_011147	GCC	2	6	215451	215456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361392
4608	NC_011147	GAT	2	6	215471	215476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361392
4609	NC_011147	CTTGC	2	10	215651	215660	0 %	40 %	20 %	40 %	197361392
4610	NC_011147	CTT	2	6	215680	215685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_011147	GGC	2	6	215826	215831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361393
4612	NC_011147	CAG	2	6	215871	215876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361393
4613	NC_011147	GTC	2	6	215901	215906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361393
4614	NC_011147	TTCA	2	8	215922	215929	25 %	50 %	0 %	25 %	197361393
4615	NC_011147	GGCAAT	2	12	215940	215951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197361393
4616	NC_011147	TCA	2	6	216002	216007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361393
4617	NC_011147	GCT	2	6	216035	216040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361393
4618	NC_011147	TGAGC	2	10	216063	216072	20 %	20 %	40 %	20 %	197361393
4619	NC_011147	AAT	2	6	216093	216098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361393
4620	NC_011147	CGA	2	6	216107	216112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361393
4621	NC_011147	CCA	2	6	216137	216142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361393
4622	NC_011147	CGC	2	6	216239	216244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361393
4623	NC_011147	TGG	2	6	216278	216283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361393
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4733	NC_011147	GTTC	2	8	221316	221323	0 %	50 %	25 %	25 %	197361399
4734	NC_011147	T	6	6	221331	221336	0 %	100 %	0 %	0 %	197361399
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4746	NC_011147	GCA	2	6	222160	222165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361400
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4749	NC_011147	GC	4	8	222223	222230	0 %	0 %	50 %	50 %	197361400
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4752	NC_011147	CG	3	6	222289	222294	0 %	0 %	50 %	50 %	197361400
4753	NC_011147	GC	3	6	222370	222375	0 %	0 %	50 %	50 %	197361400
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4868	NC_011147	GGC	2	6	227169	227174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361402
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4991	NC_011147	CTG	2	6	232211	232216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
4992	NC_011147	GCT	2	6	232234	232239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
4993	NC_011147	GC	3	6	232332	232337	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
4994	NC_011147	GC	3	6	232377	232382	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
4995	NC_011147	GCC	2	6	232397	232402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361405
4996	NC_011147	TCG	2	6	232419	232424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361405
4997	NC_011147	GC	3	6	232425	232430	0 %	0 %	50 %	50 %	197361405
4998	NC_011147	GGCGT	2	10	232439	232448	0 %	20 %	60 %	20 %	197361405
4999	NC_011147	TGG	2	6	232491	232496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361405
5000	NC_011147	CCA	2	6	232540	232545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361405

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