MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011134	CTC	2	6	187899	187904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977321
4002	NC_011134	TGA	2	6	187940	187945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
4003	NC_011134	ATG	2	6	188010	188015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
4004	NC_011134	ATG	2	6	188020	188025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
4005	NC_011134	GA	3	6	188063	188068	50 %	0 %	50 %	0 %	195977321
4006	NC_011134	ACA	2	6	188083	188088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977321
4007	NC_011134	CCA	2	6	188107	188112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977321
4008	NC_011134	AGC	2	6	188202	188207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977321
4009	NC_011134	AGG	2	6	188269	188274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977321
4010	NC_011134	ATT	2	6	188281	188286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977321
4011	NC_011134	TGC	2	6	188356	188361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977321
4012	NC_011134	TTC	2	6	188365	188370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977321
4013	NC_011134	AGGT	2	8	188533	188540	25 %	25 %	50 %	0 %	195977321
4014	NC_011134	AGGATC	2	12	188572	188583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	195977321
4015	NC_011134	T	6	6	188746	188751	0 %	100 %	0 %	0 %	195977321
4016	NC_011134	GAG	2	6	188790	188795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977321
4017	NC_011134	GAT	2	6	188859	188864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
4018	NC_011134	AGG	2	6	188891	188896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977321
4019	NC_011134	GAT	2	6	188952	188957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
4020	NC_011134	GCT	2	6	188975	188980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977321
4021	NC_011134	ACA	2	6	189033	189038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977321
4022	NC_011134	TTTGA	2	10	189057	189066	20 %	60 %	20 %	0 %	195977321
4023	NC_011134	CAA	2	6	189088	189093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977321
4024	NC_011134	GAT	2	6	189147	189152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977321
4025	NC_011134	ATT	2	6	189156	189161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977321
4026	NC_011134	TCAT	2	8	189295	189302	25 %	50 %	0 %	25 %	195977321
4027	NC_011134	ATT	2	6	189308	189313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977321
4028	NC_011134	CTA	2	6	189319	189324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_011134	GT	3	6	189429	189434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011134	AAG	2	6	189460	189465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011134	GGA	2	6	189500	189505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011134	GAA	2	6	189587	189592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977322
4033	NC_011134	GAA	2	6	189596	189601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977322
4034	NC_011134	TGG	2	6	189632	189637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977322
4035	NC_011134	GTG	2	6	189672	189677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977322
4036	NC_011134	TGT	2	6	189682	189687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977322
4037	NC_011134	A	6	6	189722	189727	100 %	0 %	0 %	0 %	195977322
4038	NC_011134	GCA	2	6	189893	189898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977322
4039	NC_011134	CAA	2	6	189907	189912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977322
4040	NC_011134	TTG	2	6	189936	189941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977322
4041	NC_011134	TAT	2	6	189994	189999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977322
4042	NC_011134	CTG	2	6	190047	190052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977322
4043	NC_011134	TGAC	2	8	190137	190144	25 %	25 %	25 %	25 %	195977322
4044	NC_011134	AGG	2	6	190189	190194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977322
4045	NC_011134	TGT	2	6	190267	190272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977322
4046	NC_011134	TGA	2	6	190414	190419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977322
4047	NC_011134	CATT	2	8	190473	190480	25 %	50 %	0 %	25 %	195977322
4048	NC_011134	TGG	2	6	190489	190494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977322
4049	NC_011134	CAGGAT	2	12	190511	190522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	195977322
4050	NC_011134	GAC	2	6	190553	190558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977322
4051	NC_011134	CTT	2	6	190561	190566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977322
4052	NC_011134	AGC	2	6	190675	190680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_011134	GAAA	2	8	190691	190698	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011134	TCG	2	6	190712	190717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_011134	GCTT	2	8	190736	190743	0 %	50 %	25 %	25 %	195977323
4056	NC_011134	GTTT	2	8	190760	190767	0 %	75 %	25 %	0 %	195977323
4057	NC_011134	AGG	2	6	190806	190811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977323
4058	NC_011134	CTG	2	6	190812	190817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977323
4059	NC_011134	TGCT	2	8	190853	190860	0 %	50 %	25 %	25 %	195977323
4060	NC_011134	AT	3	6	190965	190970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_011134	TA	3	6	190971	190976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011134	T	7	7	191004	191010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011134	A	6	6	191015	191020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011134	ATT	2	6	191029	191034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011134	TGG	2	6	191044	191049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011134	AG	3	6	191101	191106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011134	A	6	6	191159	191164	100 %	0 %	0 %	0 %	195977324
4068	NC_011134	AGC	2	6	191170	191175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
4069	NC_011134	ATG	2	6	191247	191252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977324
4070	NC_011134	AAGGA	2	10	191376	191385	60 %	0 %	40 %	0 %	195977324
4071	NC_011134	AG	3	6	191414	191419	50 %	0 %	50 %	0 %	195977324
4072	NC_011134	GA	3	6	191538	191543	50 %	0 %	50 %	0 %	195977324
4073	NC_011134	TCAG	2	8	191563	191570	25 %	25 %	25 %	25 %	195977324
4074	NC_011134	CTT	2	6	191573	191578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977324
4075	NC_011134	TGG	2	6	191611	191616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977324
4076	NC_011134	GCA	2	6	191620	191625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
4077	NC_011134	TTGGC	2	10	191631	191640	0 %	40 %	40 %	20 %	195977324
4078	NC_011134	TCG	2	6	191710	191715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977324
4079	NC_011134	GCT	2	6	191731	191736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977324
4080	NC_011134	ATT	2	6	191765	191770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977324
4081	NC_011134	TGA	2	6	191823	191828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977324
4082	NC_011134	GAG	2	6	192020	192025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977324
4083	NC_011134	TCG	3	9	192049	192057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977324
4084	NC_011134	CAG	2	6	192078	192083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
4085	NC_011134	TTA	2	6	192168	192173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977324
4086	NC_011134	AGC	2	6	192228	192233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
4087	NC_011134	TTA	2	6	192249	192254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977324
4088	NC_011134	GAC	2	6	192296	192301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977324
4089	NC_011134	GA	3	6	192315	192320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_011134	ACAA	2	8	192342	192349	75 %	0 %	0 %	25 %	195977325
4091	NC_011134	AACT	2	8	192377	192384	50 %	25 %	0 %	25 %	195977325
4092	NC_011134	CTT	2	6	192411	192416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977325
4093	NC_011134	CTG	2	6	192421	192426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
4094	NC_011134	TGGAT	2	10	192449	192458	20 %	40 %	40 %	0 %	195977325
4095	NC_011134	A	7	7	192534	192540	100 %	0 %	0 %	0 %	195977325
4096	NC_011134	CCT	2	6	192561	192566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977325
4097	NC_011134	CTTG	2	8	192654	192661	0 %	50 %	25 %	25 %	195977325
4098	NC_011134	T	6	6	192778	192783	0 %	100 %	0 %	0 %	195977325
4099	NC_011134	GCC	2	6	192831	192836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977325
4100	NC_011134	ATG	2	6	192988	192993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977325
4101	NC_011134	GCA	2	6	193068	193073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977325
4102	NC_011134	TGGCT	2	10	193101	193110	0 %	40 %	40 %	20 %	195977325
4103	NC_011134	ATT	2	6	193126	193131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977325
4104	NC_011134	GCT	2	6	193213	193218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
4105	NC_011134	TGT	2	6	193232	193237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977325
4106	NC_011134	TGC	2	6	193257	193262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
4107	NC_011134	TCA	2	6	193267	193272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977325
4108	NC_011134	TCA	2	6	193276	193281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977325
4109	NC_011134	CAA	2	6	193448	193453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977325
4110	NC_011134	CAG	3	9	193477	193485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977325
4111	NC_011134	ATT	2	6	193618	193623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977325
4112	NC_011134	TAT	2	6	193644	193649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977325
4113	NC_011134	CTG	3	9	193652	193660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
4114	NC_011134	TGC	2	6	193707	193712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977325
4115	NC_011134	ACC	2	6	193729	193734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977325
4116	NC_011134	A	6	6	193756	193761	100 %	0 %	0 %	0 %	195977325
4117	NC_011134	TTG	2	6	193919	193924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977325
4118	NC_011134	ATCA	2	8	193972	193979	50 %	25 %	0 %	25 %	195977325
4119	NC_011134	GCCA	2	8	194017	194024	25 %	0 %	25 %	50 %	195977325
4120	NC_011134	GCT	2	6	194060	194065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_011134	GAT	2	6	194148	194153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011134	TCA	2	6	194155	194160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_011134	ATTAG	2	10	194257	194266	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011134	TAA	2	6	194268	194273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011134	T	7	7	194305	194311	0 %	100 %	0 %	0 %	195977326
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4130	NC_011134	T	6	6	194536	194541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011134	T	6	6	194556	194561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4133	NC_011134	TA	3	6	194577	194582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_011134	TAA	2	6	194588	194593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_011134	ATTAG	2	10	196396	196405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_011134	TAA	2	6	196407	196412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4240	NC_011134	GA	3	6	200710	200715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_011134	T	7	7	200731	200737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_011134	ATT	2	6	200763	200768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_011134	A	6	6	200775	200780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_011134	A	6	6	200823	200828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_011134	A	6	6	200835	200840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_011134	T	6	6	200869	200874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_011134	CTA	2	6	200929	200934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_011134	AGC	2	6	200941	200946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_011134	AGA	2	6	201004	201009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_011134	GAA	2	6	201012	201017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977332
4251	NC_011134	TTG	2	6	201050	201055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977332
4252	NC_011134	ATA	2	6	201092	201097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977332
4253	NC_011134	ACT	2	6	201130	201135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977332
4254	NC_011134	AAT	2	6	201151	201156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977332
4255	NC_011134	GTA	2	6	201272	201277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977332
4256	NC_011134	ATG	2	6	201290	201295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977332
4257	NC_011134	TGC	2	6	201381	201386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977332
4258	NC_011134	TGA	2	6	201405	201410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977332
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4260	NC_011134	A	6	6	201516	201521	100 %	0 %	0 %	0 %	195977332
4261	NC_011134	CAGC	2	8	201579	201586	25 %	0 %	25 %	50 %	195977332
4262	NC_011134	TGA	2	6	201603	201608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977332
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4264	NC_011134	CTA	2	6	201698	201703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977332
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4272	NC_011134	AAAC	2	8	202136	202143	75 %	0 %	0 %	25 %	195977332
4273	NC_011134	GTT	2	6	202147	202152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977332
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4276	NC_011134	CAG	2	6	202268	202273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977332
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4278	NC_011134	AGG	2	6	202313	202318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977332
4279	NC_011134	GCA	3	9	202321	202329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977332
4280	NC_011134	GCA	2	6	202426	202431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977332
4281	NC_011134	AAG	2	6	202540	202545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977332
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4287	NC_011134	TTG	2	6	202741	202746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4288	NC_011134	TGGT	2	8	202766	202773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4289	NC_011134	AGC	2	6	202849	202854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977333
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4322	NC_011134	GCTA	2	8	204771	204778	25 %	25 %	25 %	25 %	195977333
4323	NC_011134	TGC	2	6	204781	204786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977333
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4331	NC_011134	CAATC	2	10	205208	205217	40 %	20 %	0 %	40 %	195977333
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4333	NC_011134	GAT	2	6	205239	205244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977333
4334	NC_011134	TGA	2	6	205355	205360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977333
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4359	NC_011134	A	6	6	206917	206922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4361	NC_011134	GCTA	2	8	206977	206984	25 %	25 %	25 %	25 %	195977334
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4498	NC_011134	GAC	2	6	213400	213405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977340
4499	NC_011134	ATG	2	6	213426	213431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977340
4500	NC_011134	ATT	2	6	213439	213444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977340

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