MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_011134	TAC	2	6	2020030	2020035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979046
42502	NC_011134	TCA	2	6	2020056	2020061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979046
42503	NC_011134	GGT	2	6	2020169	2020174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195979046
42504	NC_011134	TTA	2	6	2020176	2020181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979046
42505	NC_011134	CTT	2	6	2020285	2020290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195979046
42506	NC_011134	TAC	2	6	2020295	2020300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979046
42507	NC_011134	AT	3	6	2020346	2020351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42508	NC_011134	TC	3	6	2020478	2020483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42509	NC_011134	A	7	7	2020496	2020502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42510	NC_011134	CAT	2	6	2020561	2020566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42511	NC_011134	CTA	2	6	2020583	2020588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42512	NC_011134	A	7	7	2020612	2020618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42513	NC_011134	CCG	2	6	2020669	2020674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42514	NC_011134	TTA	3	9	2020743	2020751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42515	NC_011134	T	6	6	2020779	2020784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42516	NC_011134	A	7	7	2020786	2020792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42517	NC_011134	T	6	6	2020799	2020804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42518	NC_011134	AAAT	2	8	2020830	2020837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42519	NC_011134	A	6	6	2020860	2020865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42520	NC_011134	TCT	2	6	2020877	2020882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42521	NC_011134	ACT	2	6	2020890	2020895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42522	NC_011134	AC	3	6	2020901	2020906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42523	NC_011134	T	7	7	2020966	2020972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42524	NC_011134	CTG	2	6	2021054	2021059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42525	NC_011134	A	7	7	2021074	2021080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42526	NC_011134	ATC	2	6	2021210	2021215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42527	NC_011134	ATC	2	6	2021242	2021247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42528	NC_011134	CTT	2	6	2021324	2021329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42529	NC_011134	TTG	2	6	2021386	2021391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195979047
42530	NC_011134	TGA	2	6	2021441	2021446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979047
42531	NC_011134	TCA	2	6	2021469	2021474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979047
42532	NC_011134	CCA	2	6	2021519	2021524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195979047
42533	NC_011134	TAG	2	6	2021569	2021574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979047
42534	NC_011134	TTGC	2	8	2021599	2021606	0 %	50 %	25 %	25 %	195979047
42535	NC_011134	CCT	2	6	2021667	2021672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195979047
42536	NC_011134	CTG	2	6	2021683	2021688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979047
42537	NC_011134	T	6	6	2021769	2021774	0 %	100 %	0 %	0 %	195979047
42538	NC_011134	CTT	2	6	2021805	2021810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195979047
42539	NC_011134	TA	3	6	2021911	2021916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42540	NC_011134	CTTTT	2	10	2021977	2021986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42541	NC_011134	T	6	6	2021983	2021988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42542	NC_011134	A	6	6	2022065	2022070	100 %	0 %	0 %	0 %	195979048
42543	NC_011134	TTA	2	6	2022117	2022122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979048
42544	NC_011134	GTT	2	6	2022132	2022137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195979048
42545	NC_011134	ACA	2	6	2022189	2022194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979048
42546	NC_011134	TAA	2	6	2022209	2022214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979048
42547	NC_011134	ACA	2	6	2022225	2022230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979048
42548	NC_011134	GGT	2	6	2022242	2022247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195979048
42549	NC_011134	TTA	2	6	2022268	2022273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979048
42550	NC_011134	GCT	2	6	2022285	2022290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979048
42551	NC_011134	GAA	2	6	2022330	2022335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195979048
42552	NC_011134	CAG	2	6	2022346	2022351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979048
42553	NC_011134	A	6	6	2022405	2022410	100 %	0 %	0 %	0 %	195979048
42554	NC_011134	CAA	2	6	2022437	2022442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979048
42555	NC_011134	CAG	2	6	2022481	2022486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979048
42556	NC_011134	TGT	2	6	2022542	2022547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195979048
42557	NC_011134	TGC	2	6	2022554	2022559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979048
42558	NC_011134	AGGC	2	8	2022718	2022725	25 %	0 %	50 %	25 %	195979048
42559	NC_011134	CAA	2	6	2022736	2022741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979048
42560	NC_011134	TGC	2	6	2022758	2022763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979048
42561	NC_011134	TCA	2	6	2022793	2022798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979048
42562	NC_011134	GCG	2	6	2022859	2022864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195979048
42563	NC_011134	TGT	2	6	2022905	2022910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195979048
42564	NC_011134	ATT	2	6	2022915	2022920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979048
42565	NC_011134	CAA	2	6	2023024	2023029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979048
42566	NC_011134	ATG	2	6	2023099	2023104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979048
42567	NC_011134	AAG	2	6	2023126	2023131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195979048
42568	NC_011134	TA	3	6	2023162	2023167	50 %	50 %	0 %	0 %	195979048
42569	NC_011134	AAG	2	6	2023218	2023223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195979048
42570	NC_011134	AAC	2	6	2023247	2023252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979048
42571	NC_011134	CTAA	2	8	2023260	2023267	50 %	25 %	0 %	25 %	195979048
42572	NC_011134	GCTCTT	2	12	2023323	2023334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42573	NC_011134	TAA	2	6	2023353	2023358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42574	NC_011134	GAG	2	6	2023484	2023489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195979049
42575	NC_011134	CATTC	2	10	2023496	2023505	20 %	40 %	0 %	40 %	195979049
42576	NC_011134	ACG	2	6	2023579	2023584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979049
42577	NC_011134	AGC	2	6	2023591	2023596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979049
42578	NC_011134	GCA	2	6	2023660	2023665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979049
42579	NC_011134	ACAT	2	8	2023772	2023779	50 %	25 %	0 %	25 %	195979049
42580	NC_011134	GCT	2	6	2023816	2023821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979049
42581	NC_011134	TTA	2	6	2023836	2023841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979049
42582	NC_011134	TTA	2	6	2023889	2023894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979049
42583	NC_011134	A	6	6	2024001	2024006	100 %	0 %	0 %	0 %	195979049
42584	NC_011134	TC	3	6	2024084	2024089	0 %	50 %	0 %	50 %	195979049
42585	NC_011134	A	8	8	2024090	2024097	100 %	0 %	0 %	0 %	195979049
42586	NC_011134	GCAGCT	2	12	2024107	2024118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	195979049
42587	NC_011134	AAG	2	6	2024133	2024138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195979049
42588	NC_011134	CAA	2	6	2024155	2024160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979049

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.