MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011134	AAT	2	6	164159	164164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_011134	T	7	7	164186	164192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011134	CCT	2	6	164197	164202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_011134	GATT	2	8	164230	164237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_011134	TGT	2	6	164257	164262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_011134	GAT	2	6	164319	164324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_011134	TGC	2	6	164349	164354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_011134	TGA	2	6	164376	164381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_011134	GTA	2	6	164391	164396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_011134	GTG	2	6	164400	164405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011134	GCT	2	6	164431	164436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_011134	AAT	2	6	164475	164480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_011134	T	6	6	164486	164491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011134	ATA	2	6	164495	164500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011134	AAGG	2	8	164509	164516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_011134	T	6	6	164539	164544	0 %	100 %	0 %	0 %	195977300
3517	NC_011134	A	8	8	164546	164553	100 %	0 %	0 %	0 %	195977300
3518	NC_011134	CAAG	2	8	164656	164663	50 %	0 %	25 %	25 %	195977300
3519	NC_011134	TCA	2	6	164665	164670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977300
3520	NC_011134	CAAG	2	8	164746	164753	50 %	0 %	25 %	25 %	195977300
3521	NC_011134	AAGC	2	8	164793	164800	50 %	0 %	25 %	25 %	195977300
3522	NC_011134	TCA	2	6	164802	164807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977300
3523	NC_011134	TGA	2	6	164829	164834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977300
3524	NC_011134	TATG	2	8	164835	164842	25 %	50 %	25 %	0 %	195977300
3525	NC_011134	TTG	2	6	164944	164949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977300
3526	NC_011134	GCT	2	6	165013	165018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977300
3527	NC_011134	TAT	2	6	165043	165048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977300
3528	NC_011134	ATG	2	6	165080	165085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977300
3529	NC_011134	GAA	2	6	165214	165219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977300
3530	NC_011134	AGCA	2	8	165286	165293	50 %	0 %	25 %	25 %	195977300
3531	NC_011134	TGG	2	6	165377	165382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977300
3532	NC_011134	TCAA	2	8	165410	165417	50 %	25 %	0 %	25 %	195977300
3533	NC_011134	CAG	2	6	165428	165433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977300
3534	NC_011134	TAA	2	6	165462	165467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977300
3535	NC_011134	TAAG	2	8	165560	165567	50 %	25 %	25 %	0 %	195977300
3536	NC_011134	GCT	2	6	165610	165615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977300
3537	NC_011134	A	6	6	165703	165708	100 %	0 %	0 %	0 %	195977300
3538	NC_011134	AGTC	2	8	165730	165737	25 %	25 %	25 %	25 %	195977300
3539	NC_011134	A	7	7	165767	165773	100 %	0 %	0 %	0 %	195977300
3540	NC_011134	GAT	2	6	165849	165854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977300
3541	NC_011134	GCA	2	6	165869	165874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977300
3542	NC_011134	CAA	2	6	165878	165883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977300
3543	NC_011134	GGA	2	6	165945	165950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977300
3544	NC_011134	AGC	2	6	165999	166004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977300
3545	NC_011134	AGG	2	6	166014	166019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977300
3546	NC_011134	GTG	2	6	166028	166033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977300
3547	NC_011134	TGGAG	2	10	166063	166072	20 %	20 %	60 %	0 %	195977300
3548	NC_011134	AAT	2	6	166105	166110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977300
3549	NC_011134	AGG	2	6	166202	166207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_011134	CT	3	6	166228	166233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_011134	AAG	2	6	166251	166256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_011134	AG	3	6	166255	166260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011134	GAG	2	6	166287	166292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_011134	GCT	2	6	166313	166318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977301
3555	NC_011134	CTT	2	6	166325	166330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977301
3556	NC_011134	ATC	2	6	166360	166365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977301
3557	NC_011134	TGA	2	6	166396	166401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977301
3558	NC_011134	GCA	2	6	166406	166411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977301
3559	NC_011134	ATG	2	6	166467	166472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977301
3560	NC_011134	TAA	2	6	166551	166556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977301
3561	NC_011134	TGC	2	6	166657	166662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977301
3562	NC_011134	AAT	2	6	166688	166693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977301
3563	NC_011134	TTG	2	6	166891	166896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977301
3564	NC_011134	ATG	2	6	166900	166905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977301
3565	NC_011134	TCA	2	6	167041	167046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977301
3566	NC_011134	TCT	2	6	167110	167115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977301
3567	NC_011134	GTT	2	6	167131	167136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977301
3568	NC_011134	TCAA	2	8	167219	167226	50 %	25 %	0 %	25 %	195977302
3569	NC_011134	TCA	2	6	167309	167314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977302
3570	NC_011134	CT	3	6	167330	167335	0 %	50 %	0 %	50 %	195977302
3571	NC_011134	TAT	2	6	167411	167416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_011134	GAT	2	6	167450	167455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011134	TGC	2	6	167459	167464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_011134	AAGAT	2	10	167490	167499	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_011134	TGTC	2	8	167515	167522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_011134	TAT	2	6	167526	167531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011134	AT	3	6	167551	167556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011134	ATGA	2	8	167585	167592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011134	TGCT	2	8	167636	167643	0 %	50 %	25 %	25 %	195977303
3580	NC_011134	GCA	2	6	167674	167679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3581	NC_011134	AC	3	6	167725	167730	50 %	0 %	0 %	50 %	195977303
3582	NC_011134	TAT	2	6	167731	167736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977303
3583	NC_011134	ACA	2	6	167747	167752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977303
3584	NC_011134	CTG	2	6	167762	167767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3585	NC_011134	CGCTAT	2	12	167800	167811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	195977303
3586	NC_011134	AG	3	6	167815	167820	50 %	0 %	50 %	0 %	195977303
3587	NC_011134	TAT	2	6	167824	167829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977303
3588	NC_011134	CAG	2	6	167848	167853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3589	NC_011134	ACTT	2	8	167863	167870	25 %	50 %	0 %	25 %	195977303
3590	NC_011134	CAA	2	6	167914	167919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977303
3591	NC_011134	CAG	2	6	167923	167928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3592	NC_011134	CTGG	2	8	167936	167943	0 %	25 %	50 %	25 %	195977303
3593	NC_011134	AGC	2	6	167966	167971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3594	NC_011134	TGT	2	6	167988	167993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977303
3595	NC_011134	TTG	2	6	168011	168016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977303
3596	NC_011134	TGC	2	6	168050	168055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3597	NC_011134	AGC	2	6	168056	168061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3598	NC_011134	CAGC	2	8	168081	168088	25 %	0 %	25 %	50 %	195977303
3599	NC_011134	TGG	2	6	168151	168156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977303
3600	NC_011134	CTT	2	6	168244	168249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977303
3601	NC_011134	GGA	2	6	168291	168296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977303
3602	NC_011134	GACA	2	8	168324	168331	50 %	0 %	25 %	25 %	195977303
3603	NC_011134	GAAT	2	8	168423	168430	50 %	25 %	25 %	0 %	195977303
3604	NC_011134	GACA	2	8	168462	168469	50 %	0 %	25 %	25 %	195977303
3605	NC_011134	GTC	2	6	168605	168610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3606	NC_011134	CTT	2	6	168661	168666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977303
3607	NC_011134	ATC	2	6	168690	168695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977303
3608	NC_011134	TGA	2	6	168771	168776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977303
3609	NC_011134	ACC	2	6	168797	168802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977303
3610	NC_011134	GGA	2	6	168913	168918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977303
3611	NC_011134	CAAGGA	2	12	168963	168974	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	195977303
3612	NC_011134	GGC	2	6	169069	169074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195977303
3613	NC_011134	CAATCA	2	12	169164	169175	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	195977303
3614	NC_011134	TGC	2	6	169227	169232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3615	NC_011134	TGC	2	6	169257	169262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977303
3616	NC_011134	AGG	2	6	169270	169275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977303
3617	NC_011134	TAA	2	6	169348	169353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977303
3618	NC_011134	TCA	2	6	169363	169368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_011134	GAAA	2	8	169439	169446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_011134	AAAAT	2	10	169483	169492	80 %	20 %	0 %	0 %	195977304
3621	NC_011134	ATG	2	6	169510	169515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977304
3622	NC_011134	TAG	2	6	169543	169548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977304
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3752	NC_011134	ATC	2	6	176009	176014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977310
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3755	NC_011134	GAT	2	6	176092	176097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977310
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3867	NC_011134	AAG	2	6	181876	181881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3868	NC_011134	ATA	2	6	181889	181894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3870	NC_011134	TAA	2	6	181919	181924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3871	NC_011134	GGA	2	6	181927	181932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3872	NC_011134	A	6	6	181945	181950	100 %	0 %	0 %	0 %	195977314
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3999	NC_011134	ATC	2	6	187789	187794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977321
4000	NC_011134	CTGC	2	8	187885	187892	0 %	25 %	25 %	50 %	195977321

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