MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011134	GGT	2	6	140823	140828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977279
3002	NC_011134	GCTA	2	8	140861	140868	25 %	25 %	25 %	25 %	195977279
3003	NC_011134	TTG	2	6	140872	140877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977279
3004	NC_011134	TGT	2	6	140885	140890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977279
3005	NC_011134	CAG	2	6	140899	140904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977279
3006	NC_011134	AGG	2	6	140908	140913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977279
3007	NC_011134	GCA	2	6	140963	140968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011134	ATC	2	6	141000	141005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_011134	GCTG	2	8	141049	141056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_011134	CAGA	2	8	141240	141247	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_011134	GAC	2	6	141271	141276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_011134	CT	3	6	141280	141285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_011134	CAC	2	6	141342	141347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_011134	CAG	2	6	141425	141430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_011134	TCTTTG	2	12	141441	141452	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3016	NC_011134	TGA	2	6	141454	141459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_011134	AAG	2	6	141464	141469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011134	AAC	2	6	141481	141486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_011134	GTC	2	6	141498	141503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_011134	TTG	2	6	141513	141518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011134	TCA	2	6	141608	141613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_011134	ACC	2	6	141690	141695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_011134	CAG	2	6	141708	141713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_011134	TGCT	2	8	141726	141733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_011134	GCT	3	9	141731	141739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_011134	CCAA	2	8	141830	141837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_011134	GTC	2	6	141853	141858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_011134	CCA	2	6	141887	141892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_011134	TGGT	2	8	141953	141960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_011134	GGC	2	6	141963	141968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_011134	CGT	2	6	142027	142032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_011134	GT	3	6	142031	142036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011134	AATG	2	8	142116	142123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_011134	GCT	2	6	142155	142160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_011134	TGA	2	6	142197	142202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011134	AAGGA	2	10	142337	142346	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011134	TGAT	2	8	142433	142440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011134	TGA	2	6	142464	142469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011134	GCTG	2	8	142482	142489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_011134	CAG	2	6	142661	142666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_011134	AGC	2	6	142673	142678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_011134	A	6	6	142748	142753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011134	T	6	6	142931	142936	0 %	100 %	0 %	0 %	195977280
3044	NC_011134	CTA	2	6	142967	142972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977280
3045	NC_011134	GAA	2	6	143013	143018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977280
3046	NC_011134	AGC	2	6	143081	143086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_011134	CTAT	2	8	143097	143104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_011134	GAA	2	6	143117	143122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011134	T	6	6	143173	143178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011134	A	7	7	143240	143246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011134	ACA	2	6	143260	143265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977281
3052	NC_011134	AAG	2	6	143270	143275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977281
3053	NC_011134	TTGG	2	8	143403	143410	0 %	50 %	50 %	0 %	195977281
3054	NC_011134	GAA	2	6	143527	143532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977281
3055	NC_011134	GCT	2	6	143730	143735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977281
3056	NC_011134	ACC	2	6	143891	143896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977281
3057	NC_011134	GAT	2	6	143944	143949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977281
3058	NC_011134	AT	3	6	143948	143953	50 %	50 %	0 %	0 %	195977281
3059	NC_011134	GTT	2	6	143986	143991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977281
3060	NC_011134	TAT	2	6	144031	144036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977281
3061	NC_011134	GAA	2	6	144042	144047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977281
3062	NC_011134	GCT	2	6	144054	144059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977281
3063	NC_011134	CAG	3	9	144080	144088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977281
3064	NC_011134	TGAC	2	8	144107	144114	25 %	25 %	25 %	25 %	195977281
3065	NC_011134	A	6	6	144181	144186	100 %	0 %	0 %	0 %	195977281
3066	NC_011134	GAT	2	6	144297	144302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977281
3067	NC_011134	CTG	2	6	144329	144334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977281
3068	NC_011134	CA	3	6	144392	144397	50 %	0 %	0 %	50 %	195977281
3069	NC_011134	TGA	2	6	144444	144449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977281
3070	NC_011134	TTG	2	6	144461	144466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977281
3071	NC_011134	TCAT	2	8	144501	144508	25 %	50 %	0 %	25 %	195977281
3072	NC_011134	TGCC	2	8	144551	144558	0 %	25 %	25 %	50 %	195977281
3073	NC_011134	TTA	2	6	144573	144578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977281
3074	NC_011134	CAG	2	6	144608	144613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977281
3075	NC_011134	TCA	2	6	144652	144657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977281
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3077	NC_011134	TGA	2	6	144732	144737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977281
3078	NC_011134	TGG	2	6	144757	144762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977281
3079	NC_011134	GCC	2	6	144778	144783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977281
3080	NC_011134	GGT	2	6	144889	144894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977281
3081	NC_011134	CCA	2	6	144965	144970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977281
3082	NC_011134	ATG	2	6	145006	145011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977281
3083	NC_011134	TGA	2	6	145071	145076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977281
3084	NC_011134	CCA	2	6	145080	145085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977281
3085	NC_011134	AAG	2	6	145100	145105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977281
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3087	NC_011134	A	7	7	145165	145171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011134	CCT	2	6	145193	145198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_011134	GGA	2	6	145226	145231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011134	T	7	7	145280	145286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_011134	A	7	7	145293	145299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_011134	GTT	2	6	145355	145360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977282
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3095	NC_011134	GTC	2	6	145499	145504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977282
3096	NC_011134	ATG	2	6	145506	145511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977282
3097	NC_011134	AAG	2	6	145523	145528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977282
3098	NC_011134	CAG	2	6	145621	145626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977282
3099	NC_011134	TCT	2	6	145644	145649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977282
3100	NC_011134	CTTG	2	8	145855	145862	0 %	50 %	25 %	25 %	195977282
3101	NC_011134	CAA	2	6	145885	145890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977282
3102	NC_011134	GCC	2	6	145910	145915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977282
3103	NC_011134	TCA	2	6	145944	145949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977282
3104	NC_011134	T	6	6	145951	145956	0 %	100 %	0 %	0 %	195977282
3105	NC_011134	T	6	6	145984	145989	0 %	100 %	0 %	0 %	195977282
3106	NC_011134	TCG	2	6	146064	146069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977282
3107	NC_011134	TTA	2	6	146070	146075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977282
3108	NC_011134	CAA	2	6	146170	146175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977282
3109	NC_011134	CAG	2	6	146176	146181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977282
3110	NC_011134	CAG	2	6	146218	146223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977282
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3112	NC_011134	CAA	2	6	146308	146313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977282
3113	NC_011134	TCC	2	6	146400	146405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977282
3114	NC_011134	CTG	2	6	146454	146459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_011134	CTTA	2	8	146466	146473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_011134	A	6	6	146473	146478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011134	CAA	2	6	146580	146585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977283
3118	NC_011134	TTC	2	6	146596	146601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977283
3119	NC_011134	CTT	2	6	146805	146810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977283
3120	NC_011134	TG	3	6	146829	146834	0 %	50 %	50 %	0 %	195977283
3121	NC_011134	CAA	2	6	146838	146843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977283
3122	NC_011134	ACATC	2	10	146847	146856	40 %	20 %	0 %	40 %	195977283
3123	NC_011134	ACC	2	6	146881	146886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977283
3124	NC_011134	AAG	2	6	146920	146925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977283
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3126	NC_011134	CTT	2	6	146961	146966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977283
3127	NC_011134	TTTC	2	8	146982	146989	0 %	75 %	0 %	25 %	195977283
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3139	NC_011134	TGT	2	6	147432	147437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3142	NC_011134	CGT	2	6	147503	147508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3151	NC_011134	CAA	2	6	147931	147936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_011134	CAA	2	6	148093	148098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3157	NC_011134	CAA	2	6	148437	148442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3158	NC_011134	T	6	6	148447	148452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_011134	TAGC	2	8	148464	148471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3240	NC_011134	AGCC	2	8	152365	152372	25 %	0 %	25 %	50 %	195977287
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3243	NC_011134	GAT	2	6	152496	152501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977287
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3251	NC_011134	AC	3	6	152822	152827	50 %	0 %	0 %	50 %	195977287
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3253	NC_011134	AACT	2	8	152860	152867	50 %	25 %	0 %	25 %	195977287
3254	NC_011134	A	6	6	152880	152885	100 %	0 %	0 %	0 %	195977287
3255	NC_011134	GTT	2	6	152919	152924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977287
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3273	NC_011134	TTAAG	2	10	153830	153839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3282	NC_011134	T	6	6	154410	154415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3285	NC_011134	T	6	6	154487	154492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3343	NC_011134	TAT	2	6	157006	157011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_011134	GT	3	6	164135	164140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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