MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_011134	TCAT	2	8	118704	118711	25 %	50 %	0 %	25 %	195977260
2503	NC_011134	GAA	2	6	118788	118793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977260
2504	NC_011134	TCG	2	6	118832	118837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977260
2505	NC_011134	TAA	2	6	118859	118864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977260
2506	NC_011134	GAT	2	6	118886	118891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977260
2507	NC_011134	CCA	2	6	118914	118919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195977260
2508	NC_011134	GGT	2	6	118947	118952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977260
2509	NC_011134	CGT	2	6	118986	118991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977260
2510	NC_011134	TAA	2	6	119003	119008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977260
2511	NC_011134	TGC	2	6	119071	119076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977260
2512	NC_011134	TGAT	2	8	119095	119102	25 %	50 %	25 %	0 %	195977260
2513	NC_011134	GTC	2	6	119107	119112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977260
2514	NC_011134	GTC	2	6	119116	119121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977260
2515	NC_011134	GTC	2	6	119140	119145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977260
2516	NC_011134	TTG	2	6	119332	119337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977260
2517	NC_011134	AGC	2	6	119363	119368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977260
2518	NC_011134	CGA	2	6	119390	119395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977260
2519	NC_011134	AGA	2	6	119414	119419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977260
2520	NC_011134	TCA	2	6	119422	119427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977260
2521	NC_011134	CTT	2	6	119442	119447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977260
2522	NC_011134	TG	4	8	119534	119541	0 %	50 %	50 %	0 %	195977260
2523	NC_011134	TGCT	2	8	119629	119636	0 %	50 %	25 %	25 %	195977260
2524	NC_011134	ACT	2	6	119707	119712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977260
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2529	NC_011134	AAT	2	6	119955	119960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977260
2530	NC_011134	CTT	2	6	119993	119998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977260
2531	NC_011134	AGG	2	6	120019	120024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977260
2532	NC_011134	AAG	2	6	120057	120062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977260
2533	NC_011134	CAT	2	6	120077	120082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977260
2534	NC_011134	ACA	2	6	120108	120113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977260
2535	NC_011134	CTA	2	6	120152	120157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977260
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2537	NC_011134	ATC	2	6	120225	120230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977260
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2540	NC_011134	TAA	2	6	120260	120265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977260
2541	NC_011134	TGA	2	6	120283	120288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977260
2542	NC_011134	TGA	3	9	120290	120298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977260
2543	NC_011134	CAA	2	6	120316	120321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977260
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2545	NC_011134	ATG	3	9	120393	120401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977260
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2553	NC_011134	ATTG	2	8	120791	120798	25 %	50 %	25 %	0 %	195977260
2554	NC_011134	TTG	2	6	120838	120843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977260
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2556	NC_011134	CA	3	6	121029	121034	50 %	0 %	0 %	50 %	195977260
2557	NC_011134	CA	3	6	121061	121066	50 %	0 %	0 %	50 %	195977260
2558	NC_011134	AGGTTG	2	12	121249	121260	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	195977260
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2562	NC_011134	TCT	2	6	121478	121483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977260
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2570	NC_011134	ATC	2	6	121713	121718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977260
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2574	NC_011134	GAG	2	6	121946	121951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_011134	TCT	2	6	121962	121967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_011134	AGT	2	6	122092	122097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2582	NC_011134	TTA	2	6	122264	122269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2585	NC_011134	TAG	2	6	122341	122346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_011134	TTGT	2	8	122372	122379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_011134	A	7	7	122419	122425	100 %	0 %	0 %	0 %	195977261
2589	NC_011134	TTAT	2	8	122427	122434	25 %	75 %	0 %	0 %	195977261
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2594	NC_011134	TAGA	2	8	122628	122635	50 %	25 %	25 %	0 %	195977261
2595	NC_011134	AAG	2	6	122637	122642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977261
2596	NC_011134	AT	3	6	122676	122681	50 %	50 %	0 %	0 %	195977261
2597	NC_011134	TAAA	2	8	122706	122713	75 %	25 %	0 %	0 %	195977261
2598	NC_011134	TTTA	2	8	122742	122749	25 %	75 %	0 %	0 %	195977261
2599	NC_011134	GCT	2	6	122795	122800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977261
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2602	NC_011134	AATT	2	8	122997	123004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_011134	ATT	2	6	123009	123014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_011134	TTG	2	6	123020	123025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_011134	ATT	2	6	123030	123035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_011134	ATA	2	6	123041	123046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_011134	T	6	6	123050	123055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_011134	T	7	7	123062	123068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_011134	T	7	7	123098	123104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_011134	CAGG	2	8	123120	123127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2611	NC_011134	ATT	2	6	123190	123195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_011134	GAAA	2	8	123257	123264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011134	TC	3	6	123353	123358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_011134	TAA	2	6	123436	123441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_011134	ACA	2	6	123444	123449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_011134	ATTGA	2	10	123521	123530	40 %	40 %	20 %	0 %	195977262
2617	NC_011134	AG	3	6	123538	123543	50 %	0 %	50 %	0 %	195977262
2618	NC_011134	GTTATT	2	12	123611	123622	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	195977262
2619	NC_011134	GAA	2	6	123681	123686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977262
2620	NC_011134	T	6	6	123719	123724	0 %	100 %	0 %	0 %	195977262
2621	NC_011134	AG	3	6	123740	123745	50 %	0 %	50 %	0 %	195977262
2622	NC_011134	CTTATG	2	12	123816	123827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	195977262
2623	NC_011134	T	7	7	123829	123835	0 %	100 %	0 %	0 %	195977262
2624	NC_011134	ATC	2	6	123909	123914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977262
2625	NC_011134	GGGT	2	8	123941	123948	0 %	25 %	75 %	0 %	195977262
2626	NC_011134	TCA	2	6	123993	123998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977262
2627	NC_011134	T	6	6	124045	124050	0 %	100 %	0 %	0 %	195977262
2628	NC_011134	T	6	6	124119	124124	0 %	100 %	0 %	0 %	195977262
2629	NC_011134	GCT	2	6	124149	124154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977262
2630	NC_011134	T	6	6	124182	124187	0 %	100 %	0 %	0 %	195977262
2631	NC_011134	A	6	6	124202	124207	100 %	0 %	0 %	0 %	195977262
2632	NC_011134	CAT	2	6	124256	124261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977262
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2638	NC_011134	CTG	2	6	124490	124495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977262
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2641	NC_011134	TCTT	2	8	124597	124604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2642	NC_011134	TGG	2	6	124676	124681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977263
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2652	NC_011134	TGT	2	6	125086	125091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_011134	TTA	2	6	125153	125158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2654	NC_011134	TGT	2	6	125182	125187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2655	NC_011134	T	6	6	125187	125192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2656	NC_011134	ACA	2	6	125210	125215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2657	NC_011134	GTG	2	6	125277	125282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_011134	G	6	6	125304	125309	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2659	NC_011134	ATC	2	6	125325	125330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2662	NC_011134	GT	4	8	125479	125486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_011134	TTA	2	6	125487	125492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_011134	GA	3	6	125499	125504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_011134	TAAGG	2	10	125517	125526	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2688	NC_011134	CT	3	6	126663	126668	0 %	50 %	0 %	50 %	195977264
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2723	NC_011134	GTC	2	6	128224	128229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2724	NC_011134	A	7	7	128299	128305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2725	NC_011134	T	8	8	128326	128333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2726	NC_011134	GAG	2	6	128354	128359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2730	NC_011134	TGA	2	6	128463	128468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977266
2731	NC_011134	TGA	2	6	128476	128481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977266
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2735	NC_011134	A	6	6	128568	128573	100 %	0 %	0 %	0 %	195977266
2736	NC_011134	ATC	3	9	128688	128696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977266
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2742	NC_011134	CAT	2	6	129206	129211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977266
2743	NC_011134	AGCC	2	8	129214	129221	25 %	0 %	25 %	50 %	195977266
2744	NC_011134	AGA	2	6	129231	129236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977266
2745	NC_011134	CTT	2	6	129245	129250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977266
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2747	NC_011134	AGC	2	6	129304	129309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977266
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2750	NC_011134	AAGC	2	8	129427	129434	50 %	0 %	25 %	25 %	195977267
2751	NC_011134	AGC	2	6	129467	129472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977267
2752	NC_011134	A	6	6	129547	129552	100 %	0 %	0 %	0 %	195977267
2753	NC_011134	T	6	6	129632	129637	0 %	100 %	0 %	0 %	195977267
2754	NC_011134	AG	3	6	129683	129688	50 %	0 %	50 %	0 %	195977267
2755	NC_011134	TGAC	2	8	129700	129707	25 %	25 %	25 %	25 %	195977267
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2999	NC_011134	TTA	2	6	140701	140706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977279
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