MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011134	TGG	2	6	24276	24281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011134	GCGT	2	8	24339	24346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_011134	TCC	2	6	24363	24368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_011134	TCG	2	6	24405	24410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011134	AT	3	6	24466	24471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011134	CGG	2	6	24526	24531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011134	TGT	2	6	24596	24601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011134	GGT	2	6	24671	24676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011134	GGT	2	6	24706	24711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011134	CAT	2	6	24729	24734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011134	T	7	7	24860	24866	0 %	100 %	0 %	0 %	195977172
512	NC_011134	T	7	7	24913	24919	0 %	100 %	0 %	0 %	195977172
513	NC_011134	CAT	2	6	24926	24931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977172
514	NC_011134	TTC	2	6	24956	24961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977172
515	NC_011134	AGG	2	6	25058	25063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977172
516	NC_011134	A	6	6	25116	25121	100 %	0 %	0 %	0 %	195977172
517	NC_011134	ATA	2	6	25240	25245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977172
518	NC_011134	GAA	2	6	25401	25406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977172
519	NC_011134	GATAAG	2	12	25432	25443	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	195977172
520	NC_011134	TGC	2	6	25611	25616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977172
521	NC_011134	CGT	2	6	25630	25635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977172
522	NC_011134	CTGATA	2	12	25655	25666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	195977172
523	NC_011134	TTG	3	9	25682	25690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977172
524	NC_011134	A	6	6	25707	25712	100 %	0 %	0 %	0 %	195977173
525	NC_011134	CTTTT	2	10	25738	25747	0 %	80 %	0 %	20 %	195977173
526	NC_011134	T	6	6	25749	25754	0 %	100 %	0 %	0 %	195977173
527	NC_011134	GTA	2	6	25809	25814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977173
528	NC_011134	TCT	2	6	25882	25887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977173
529	NC_011134	CT	3	6	25886	25891	0 %	50 %	0 %	50 %	195977173
530	NC_011134	ATT	2	6	25901	25906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977173
531	NC_011134	ATT	4	12	25912	25923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977173
532	NC_011134	CTTGC	2	10	25947	25956	0 %	40 %	20 %	40 %	195977173
533	NC_011134	TTTTG	2	10	26164	26173	0 %	80 %	20 %	0 %	195977173
534	NC_011134	ATT	2	6	26207	26212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977173
535	NC_011134	T	6	6	26252	26257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011134	T	7	7	26293	26299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011134	A	7	7	26306	26312	100 %	0 %	0 %	0 %	195977174
538	NC_011134	GAT	2	6	26375	26380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977174
539	NC_011134	GCA	2	6	26441	26446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977174
540	NC_011134	AAG	2	6	26447	26452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977174
541	NC_011134	AGT	2	6	26455	26460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977174
542	NC_011134	TGCT	2	8	26568	26575	0 %	50 %	25 %	25 %	195977174
543	NC_011134	ATT	2	6	26582	26587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977174
544	NC_011134	TTA	2	6	26688	26693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977174
545	NC_011134	GAA	2	6	26774	26779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977174
546	NC_011134	AAG	2	6	26796	26801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977174
547	NC_011134	CAA	2	6	26864	26869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977174
548	NC_011134	CTG	2	6	26916	26921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977174
549	NC_011134	GCAG	2	8	26965	26972	25 %	0 %	50 %	25 %	195977174
550	NC_011134	AGC	3	9	27004	27012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977174
551	NC_011134	AGC	2	6	27016	27021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977174
552	NC_011134	GCTCAA	2	12	27026	27037	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	195977174
553	NC_011134	AGC	2	6	27061	27066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977174
554	NC_011134	TGT	2	6	27112	27117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977174
555	NC_011134	CAG	2	6	27123	27128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977174
556	NC_011134	ATT	2	6	27234	27239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977174
557	NC_011134	TGG	2	6	27247	27252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977174
558	NC_011134	GCA	2	6	27275	27280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977174
559	NC_011134	TGT	3	9	27316	27324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977174
560	NC_011134	ATG	2	6	27330	27335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977174
561	NC_011134	AT	3	6	27418	27423	50 %	50 %	0 %	0 %	195977174
562	NC_011134	TGGT	2	8	27436	27443	0 %	50 %	50 %	0 %	195977174
563	NC_011134	ATTG	2	8	27535	27542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011134	GGA	2	6	27576	27581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977175
565	NC_011134	A	6	6	27581	27586	100 %	0 %	0 %	0 %	195977175
566	NC_011134	TGC	3	9	27648	27656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977175
567	NC_011134	CAA	2	6	27764	27769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977175
568	NC_011134	TTA	2	6	27861	27866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977175
569	NC_011134	TGC	2	6	27981	27986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977175
570	NC_011134	CTT	2	6	27999	28004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977175
571	NC_011134	ATC	2	6	28019	28024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977175
572	NC_011134	ATT	2	6	28049	28054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977175
573	NC_011134	TAG	2	6	28070	28075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977175
574	NC_011134	TGA	2	6	28077	28082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977175
575	NC_011134	GTT	3	9	28087	28095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977175
576	NC_011134	TGG	2	6	28107	28112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977175
577	NC_011134	TCC	2	6	28142	28147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977175
578	NC_011134	TAT	2	6	28161	28166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977175
579	NC_011134	CGT	2	6	28174	28179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977175
580	NC_011134	TGA	2	6	28208	28213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977175
581	NC_011134	A	6	6	28237	28242	100 %	0 %	0 %	0 %	195977175
582	NC_011134	TGAT	2	8	28250	28257	25 %	50 %	25 %	0 %	195977175
583	NC_011134	TGAT	2	8	28262	28269	25 %	50 %	25 %	0 %	195977175
584	NC_011134	CTG	2	6	28271	28276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977175
585	NC_011134	TGC	2	6	28290	28295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977175
586	NC_011134	CAG	2	6	28322	28327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977175
587	NC_011134	CAT	2	6	28334	28339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977175
588	NC_011134	ATA	2	6	28373	28378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977175
589	NC_011134	ATTG	2	8	28401	28408	25 %	50 %	25 %	0 %	195977175
590	NC_011134	AGA	2	6	28431	28436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977175
591	NC_011134	TGAT	2	8	28442	28449	25 %	50 %	25 %	0 %	195977175
592	NC_011134	GTA	2	6	28564	28569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011134	T	6	6	28580	28585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011134	ATAG	2	8	28635	28642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011134	CTT	2	6	28755	28760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011134	GTT	2	6	28770	28775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011134	ATT	2	6	28872	28877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011134	AT	3	6	28904	28909	50 %	50 %	0 %	0 %	195977176
599	NC_011134	GAT	2	6	28962	28967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977176
600	NC_011134	GCG	2	6	28992	28997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195977176
601	NC_011134	GCT	2	6	29067	29072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977176
602	NC_011134	TA	3	6	29109	29114	50 %	50 %	0 %	0 %	195977176
603	NC_011134	T	7	7	29159	29165	0 %	100 %	0 %	0 %	195977176
604	NC_011134	GTT	2	6	29237	29242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977176
605	NC_011134	T	6	6	29246	29251	0 %	100 %	0 %	0 %	195977176
606	NC_011134	AGA	2	6	29273	29278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977176
607	NC_011134	GAAT	2	8	29344	29351	50 %	25 %	25 %	0 %	195977176
608	NC_011134	T	6	6	29365	29370	0 %	100 %	0 %	0 %	195977176
609	NC_011134	GCA	2	6	29429	29434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977176
610	NC_011134	ATGAGG	2	12	29440	29451	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	195977176
611	NC_011134	ATTT	2	8	29478	29485	25 %	75 %	0 %	0 %	195977176
612	NC_011134	GAA	2	6	29549	29554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977176
613	NC_011134	TGA	2	6	29627	29632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977176
614	NC_011134	TAT	2	6	29651	29656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977176
615	NC_011134	A	7	7	29797	29803	100 %	0 %	0 %	0 %	195977177
616	NC_011134	GTG	2	6	29822	29827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977177
617	NC_011134	TTG	2	6	29846	29851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977177
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619	NC_011134	GT	3	6	29948	29953	0 %	50 %	50 %	0 %	195977177
620	NC_011134	A	6	6	29972	29977	100 %	0 %	0 %	0 %	195977177
621	NC_011134	TGA	3	9	29985	29993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977177
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