MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011134	AGA	2	6	284342	284347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977410
6002	NC_011134	CAT	2	6	284379	284384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977410
6003	NC_011134	ATT	2	6	284436	284441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977410
6004	NC_011134	TGAT	2	8	284446	284453	25 %	50 %	25 %	0 %	195977410
6005	NC_011134	ATG	4	12	284469	284480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977410
6006	NC_011134	TAA	2	6	284580	284585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_011134	A	6	6	284584	284589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_011134	T	6	6	284615	284620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_011134	GTTAT	2	10	284622	284631	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_011134	ATA	2	6	284635	284640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_011134	AAT	2	6	284655	284660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_011134	AT	3	6	284666	284671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_011134	GTT	2	6	284697	284702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977411
6014	NC_011134	AAC	2	6	284721	284726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977411
6015	NC_011134	GGC	2	6	284771	284776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195977411
6016	NC_011134	ATC	2	6	284780	284785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977411
6017	NC_011134	AGA	2	6	284792	284797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977411
6018	NC_011134	A	6	6	284811	284816	100 %	0 %	0 %	0 %	195977411
6019	NC_011134	GAA	2	6	284823	284828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977411
6020	NC_011134	GA	3	6	284839	284844	50 %	0 %	50 %	0 %	195977411
6021	NC_011134	GTG	3	9	284866	284874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977411
6022	NC_011134	CAGAGG	2	12	284896	284907	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	195977411
6023	NC_011134	AGA	2	6	284921	284926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977411
6024	NC_011134	TGG	2	6	284966	284971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977411
6025	NC_011134	TATC	2	8	284975	284982	25 %	50 %	0 %	25 %	195977411
6026	NC_011134	TGA	2	6	285070	285075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977411
6027	NC_011134	TTGTAA	2	12	285136	285147	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	195977411
6028	NC_011134	A	6	6	285220	285225	100 %	0 %	0 %	0 %	195977411
6029	NC_011134	TTG	2	6	285271	285276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977411
6030	NC_011134	T	6	6	285281	285286	0 %	100 %	0 %	0 %	195977411
6031	NC_011134	GTG	2	6	285292	285297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977411
6032	NC_011134	ATG	2	6	285312	285317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977411
6033	NC_011134	TGG	2	6	285346	285351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977411
6034	NC_011134	ATA	2	6	285442	285447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977411
6035	NC_011134	GTT	2	6	285453	285458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977411
6036	NC_011134	ATAA	2	8	285478	285485	75 %	25 %	0 %	0 %	195977411
6037	NC_011134	GAT	2	6	285630	285635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977412
6038	NC_011134	GCTA	2	8	285680	285687	25 %	25 %	25 %	25 %	195977412
6039	NC_011134	GAG	2	6	285702	285707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977412
6040	NC_011134	AGA	2	6	285731	285736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977412
6041	NC_011134	AGG	2	6	285826	285831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977412
6042	NC_011134	GAG	2	6	285858	285863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977412
6043	NC_011134	TGAG	2	8	285886	285893	25 %	25 %	50 %	0 %	195977412
6044	NC_011134	ACT	2	6	285966	285971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977412
6045	NC_011134	AGGCAG	2	12	285985	285996	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	195977412
6046	NC_011134	AGC	2	6	286003	286008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6047	NC_011134	GCA	2	6	286020	286025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6048	NC_011134	AGCT	2	8	286045	286052	25 %	25 %	25 %	25 %	195977412
6049	NC_011134	AGC	3	9	286061	286069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6050	NC_011134	AGCC	2	8	286104	286111	25 %	0 %	25 %	50 %	195977412
6051	NC_011134	AGA	2	6	286145	286150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977412
6052	NC_011134	TGA	2	6	286166	286171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977412
6053	NC_011134	CAGC	2	8	286217	286224	25 %	0 %	25 %	50 %	195977412
6054	NC_011134	AGC	2	6	286241	286246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6055	NC_011134	GCT	2	6	286263	286268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6056	NC_011134	TTC	2	6	286345	286350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977412
6057	NC_011134	GAG	2	6	286368	286373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977412
6058	NC_011134	AGC	2	6	286385	286390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6059	NC_011134	CAG	2	6	286408	286413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6060	NC_011134	TAT	2	6	286425	286430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977412
6061	NC_011134	GTT	2	6	286518	286523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977412
6062	NC_011134	AGCT	2	8	286558	286565	25 %	25 %	25 %	25 %	195977412
6063	NC_011134	ATG	2	6	286588	286593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977412
6064	NC_011134	AGC	2	6	286600	286605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6065	NC_011134	GTAACA	2	12	286620	286631	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	195977412
6066	NC_011134	CCTT	2	8	286698	286705	0 %	50 %	0 %	50 %	195977412
6067	NC_011134	CAGG	2	8	286716	286723	25 %	0 %	50 %	25 %	195977412
6068	NC_011134	CAG	2	6	286726	286731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977412
6069	NC_011134	TAT	2	6	286763	286768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977412
6070	NC_011134	ATG	2	6	286804	286809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977412
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6073	NC_011134	AGCA	2	8	287120	287127	50 %	0 %	25 %	25 %	195977412
6074	NC_011134	TCCT	2	8	287198	287205	0 %	50 %	0 %	50 %	195977412
6075	NC_011134	TAA	2	6	287282	287287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977412
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6083	NC_011134	TCT	2	6	287837	287842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977412
6084	NC_011134	GGAGCA	2	12	287898	287909	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	195977412
6085	NC_011134	TGA	2	6	287927	287932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977412
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6087	NC_011134	A	6	6	288003	288008	100 %	0 %	0 %	0 %	195977412
6088	NC_011134	A	6	6	288015	288020	100 %	0 %	0 %	0 %	195977412
6089	NC_011134	TTA	2	6	288067	288072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_011134	TC	3	6	288099	288104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_011134	TTG	2	6	288131	288136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_011134	A	7	7	288188	288194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_011134	ACA	2	6	288290	288295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977413
6094	NC_011134	A	6	6	288301	288306	100 %	0 %	0 %	0 %	195977413
6095	NC_011134	TGC	2	6	288321	288326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977413
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6097	NC_011134	A	6	6	288373	288378	100 %	0 %	0 %	0 %	195977413
6098	NC_011134	TCGT	2	8	288536	288543	0 %	50 %	25 %	25 %	195977413
6099	NC_011134	ATA	2	6	288618	288623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977413
6100	NC_011134	G	6	6	288626	288631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_011134	TA	3	6	288691	288696	50 %	50 %	0 %	0 %	195977414
6102	NC_011134	TAT	2	6	288728	288733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977414
6103	NC_011134	TCA	2	6	288759	288764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977414
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6106	NC_011134	ATG	2	6	288808	288813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977414
6107	NC_011134	ACA	2	6	288841	288846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977414
6108	NC_011134	GTGC	2	8	288864	288871	0 %	25 %	50 %	25 %	195977414
6109	NC_011134	CGT	2	6	288873	288878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977414
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6111	NC_011134	CGT	2	6	288924	288929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977414
6112	NC_011134	ACA	2	6	288930	288935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977414
6113	NC_011134	GTTG	2	8	288946	288953	0 %	50 %	50 %	0 %	195977414
6114	NC_011134	GTG	2	6	288973	288978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977414
6115	NC_011134	AC	3	6	288980	288985	50 %	0 %	0 %	50 %	195977414
6116	NC_011134	ACA	2	6	289027	289032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977414
6117	NC_011134	GTCA	2	8	289040	289047	25 %	25 %	25 %	25 %	195977414
6118	NC_011134	AAG	2	6	289165	289170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_011134	TGA	2	6	289335	289340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_011134	TAA	2	6	289402	289407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_011134	TAAA	2	8	289412	289419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_011134	A	6	6	289417	289422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_011134	A	6	6	289431	289436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_011134	ACA	2	6	289516	289521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977415
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6281	NC_011134	GATT	2	8	297133	297140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6369	NC_011134	TGCTA	2	10	301466	301475	20 %	40 %	20 %	20 %	195977426
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6494	NC_011134	AGC	3	9	308038	308046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977432
6495	NC_011134	GCA	2	6	308116	308121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977432
6496	NC_011134	ATT	2	6	308133	308138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977432
6497	NC_011134	ATC	2	6	308148	308153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977432
6498	NC_011134	GCA	2	6	308329	308334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977432
6499	NC_011134	ATT	2	6	308379	308384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977432
6500	NC_011134	AGC	2	6	308401	308406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977432

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