MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011134	TCT	2	6	261226	261231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977384
5502	NC_011134	GTG	2	6	261253	261258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977384
5503	NC_011134	GTT	2	6	261294	261299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977384
5504	NC_011134	TTG	2	6	261306	261311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977384
5505	NC_011134	TAA	2	6	261314	261319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977384
5506	NC_011134	GAA	2	6	261360	261365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977384
5507	NC_011134	AG	3	6	261400	261405	50 %	0 %	50 %	0 %	195977384
5508	NC_011134	GAAAA	2	10	261410	261419	80 %	0 %	20 %	0 %	195977384
5509	NC_011134	GAA	2	6	261461	261466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977385
5510	NC_011134	A	6	6	261539	261544	100 %	0 %	0 %	0 %	195977385
5511	NC_011134	A	6	6	261600	261605	100 %	0 %	0 %	0 %	195977385
5512	NC_011134	A	6	6	261623	261628	100 %	0 %	0 %	0 %	195977385
5513	NC_011134	GTG	2	6	261636	261641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977385
5514	NC_011134	GTT	2	6	261674	261679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977385
5515	NC_011134	TGA	2	6	261685	261690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977385
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5517	NC_011134	GCT	2	6	261737	261742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977385
5518	NC_011134	TCA	2	6	261754	261759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977385
5519	NC_011134	TCAG	2	8	261784	261791	25 %	25 %	25 %	25 %	195977385
5520	NC_011134	GCT	2	6	261827	261832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977385
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5523	NC_011134	TCG	2	6	261967	261972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977385
5524	NC_011134	TTGA	2	8	262145	262152	25 %	50 %	25 %	0 %	195977385
5525	NC_011134	AGCG	2	8	262223	262230	25 %	0 %	50 %	25 %	195977385
5526	NC_011134	ATC	2	6	262335	262340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_011134	GAG	2	6	262399	262404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011134	TGT	2	6	262410	262415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_011134	AGA	2	6	262565	262570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977386
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5534	NC_011134	AGG	2	6	262708	262713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011134	ATA	2	6	262756	262761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011134	TAA	2	6	262853	262858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011134	GAA	2	6	262884	262889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977387
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5541	NC_011134	GAA	2	6	263097	263102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977387
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5544	NC_011134	GGAAA	2	10	263239	263248	60 %	0 %	40 %	0 %	195977387
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5548	NC_011134	TA	4	8	263383	263390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_011134	GA	3	6	263447	263452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_011134	GGACT	2	10	263453	263462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5551	NC_011134	TC	3	6	263466	263471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_011134	T	6	6	263472	263477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_011134	AAT	2	6	263502	263507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_011134	TTG	2	6	263525	263530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011134	CTGG	2	8	263557	263564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_011134	AAG	2	6	263583	263588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_011134	TTG	2	6	263612	263617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011134	TAA	2	6	263792	263797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_011134	CAAG	2	8	263825	263832	50 %	0 %	25 %	25 %	195977388
5560	NC_011134	CT	3	6	263897	263902	0 %	50 %	0 %	50 %	195977388
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5607	NC_011134	GGT	2	6	266372	266377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977390
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5615	NC_011134	AAAAG	2	10	266747	266756	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_011134	ATTTT	2	10	266789	266798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_011134	G	6	6	266800	266805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5619	NC_011134	TCC	2	6	266814	266819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_011134	ATT	2	6	266870	266875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_011134	TAG	2	6	266882	266887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5867	NC_011134	CCCG	2	8	278124	278131	0 %	0 %	25 %	75 %	195977404
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5994	NC_011134	CTC	2	6	283861	283866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977410
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5996	NC_011134	CAG	2	6	284065	284070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977410
5997	NC_011134	TGC	2	6	284197	284202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977410
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