MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011134	GA	3	6	237290	237295	50 %	0 %	50 %	0 %	195977361
5002	NC_011134	TGG	3	9	237447	237455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977361
5003	NC_011134	CTA	2	6	237456	237461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977361
5004	NC_011134	GGA	2	6	237522	237527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977361
5005	NC_011134	AGG	2	6	237560	237565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977361
5006	NC_011134	TGA	2	6	237583	237588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977362
5007	NC_011134	A	6	6	237591	237596	100 %	0 %	0 %	0 %	195977362
5008	NC_011134	T	7	7	237637	237643	0 %	100 %	0 %	0 %	195977362
5009	NC_011134	TGT	2	6	237689	237694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977362
5010	NC_011134	TGG	2	6	237701	237706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977362
5011	NC_011134	TTG	2	6	237718	237723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977362
5012	NC_011134	T	6	6	237791	237796	0 %	100 %	0 %	0 %	195977362
5013	NC_011134	GGCT	2	8	237829	237836	0 %	25 %	50 %	25 %	195977362
5014	NC_011134	TGC	2	6	237865	237870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977362
5015	NC_011134	TG	3	6	237875	237880	0 %	50 %	50 %	0 %	195977362
5016	NC_011134	AGC	2	6	237932	237937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977362
5017	NC_011134	CT	3	6	237950	237955	0 %	50 %	0 %	50 %	195977362
5018	NC_011134	GCG	2	6	237969	237974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195977362
5019	NC_011134	AGG	2	6	237992	237997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977362
5020	NC_011134	AAC	2	6	237999	238004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977362
5021	NC_011134	GA	3	6	238013	238018	50 %	0 %	50 %	0 %	195977362
5022	NC_011134	TGA	2	6	238048	238053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977362
5023	NC_011134	AGG	2	6	238103	238108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977362
5024	NC_011134	TGT	2	6	238109	238114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977362
5025	NC_011134	TGG	2	6	238115	238120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977362
5026	NC_011134	AAG	2	6	238181	238186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977362
5027	NC_011134	CTTG	2	8	238295	238302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_011134	TGC	2	6	238326	238331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_011134	CCAA	2	8	238410	238417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_011134	A	6	6	238421	238426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011134	TGC	2	6	238503	238508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_011134	CTG	2	6	238557	238562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977363
5033	NC_011134	GTC	2	6	238611	238616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977363
5034	NC_011134	CAT	2	6	238682	238687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977363
5035	NC_011134	TTG	2	6	238729	238734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977363
5036	NC_011134	CAA	2	6	238818	238823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977363
5037	NC_011134	AAT	2	6	238833	238838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977363
5038	NC_011134	CAA	2	6	238877	238882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977363
5039	NC_011134	CCT	2	6	238949	238954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977363
5040	NC_011134	TCA	2	6	238967	238972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977363
5041	NC_011134	GT	3	6	238989	238994	0 %	50 %	50 %	0 %	195977363
5042	NC_011134	GCT	2	6	239015	239020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977363
5043	NC_011134	CAA	2	6	239096	239101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977363
5044	NC_011134	CTTGG	2	10	239106	239115	0 %	40 %	40 %	20 %	195977363
5045	NC_011134	TCA	2	6	239182	239187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977363
5046	NC_011134	CTTGG	2	10	239214	239223	0 %	40 %	40 %	20 %	195977363
5047	NC_011134	GAC	2	6	239289	239294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977363
5048	NC_011134	CGA	2	6	239330	239335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977363
5049	NC_011134	TGAAT	2	10	239336	239345	40 %	40 %	20 %	0 %	195977363
5050	NC_011134	CGA	2	6	239357	239362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977363
5051	NC_011134	TGG	2	6	239390	239395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977363
5052	NC_011134	CGG	2	6	239420	239425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195977363
5053	NC_011134	TCC	2	6	239461	239466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195977363
5054	NC_011134	CAT	2	6	239521	239526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977364
5055	NC_011134	CTTT	2	8	239537	239544	0 %	75 %	0 %	25 %	195977364
5056	NC_011134	TAGA	2	8	239561	239568	50 %	25 %	25 %	0 %	195977364
5057	NC_011134	CGC	2	6	239694	239699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977364
5058	NC_011134	AGC	2	6	239707	239712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977364
5059	NC_011134	AATCA	2	10	239755	239764	60 %	20 %	0 %	20 %	195977364
5060	NC_011134	TGA	2	6	239847	239852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977364
5061	NC_011134	CAG	2	6	239931	239936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977364
5062	NC_011134	AGT	2	6	239976	239981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977364
5063	NC_011134	AGC	2	6	240010	240015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977364
5064	NC_011134	ACGA	2	8	240055	240062	50 %	0 %	25 %	25 %	195977364
5065	NC_011134	ACA	2	6	240194	240199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977364
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5067	NC_011134	CTTC	2	8	240294	240301	0 %	50 %	0 %	50 %	195977364
5068	NC_011134	AAT	2	6	240348	240353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977364
5069	NC_011134	TTTTG	2	10	240488	240497	0 %	80 %	20 %	0 %	195977364
5070	NC_011134	TTA	2	6	240530	240535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011134	CTG	2	6	240572	240577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_011134	GTG	2	6	240596	240601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977365
5073	NC_011134	AGG	2	6	240699	240704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977365
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5075	NC_011134	GTT	2	6	240951	240956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977366
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5077	NC_011134	AAGAG	2	10	241076	241085	60 %	0 %	40 %	0 %	195977366
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5079	NC_011134	A	6	6	241097	241102	100 %	0 %	0 %	0 %	195977366
5080	NC_011134	TGA	2	6	241169	241174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
5081	NC_011134	TGA	2	6	241205	241210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
5082	NC_011134	TGCTC	2	10	241230	241239	0 %	40 %	20 %	40 %	195977367
5083	NC_011134	GCT	2	6	241267	241272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977367
5084	NC_011134	TGA	2	6	241523	241528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
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5086	NC_011134	TGG	2	6	241609	241614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977367
5087	NC_011134	TGA	2	6	241634	241639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
5088	NC_011134	TGA	2	6	241661	241666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
5089	NC_011134	A	6	6	241775	241780	100 %	0 %	0 %	0 %	195977367
5090	NC_011134	AGG	2	6	241799	241804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977367
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5092	NC_011134	CTG	2	6	241940	241945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977367
5093	NC_011134	TGGT	2	8	242006	242013	0 %	50 %	50 %	0 %	195977367
5094	NC_011134	AGG	2	6	242111	242116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977367
5095	NC_011134	TGA	2	6	242139	242144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
5096	NC_011134	TGGT	2	8	242219	242226	0 %	50 %	50 %	0 %	195977367
5097	NC_011134	GTTT	2	8	242279	242286	0 %	75 %	25 %	0 %	195977367
5098	NC_011134	TGG	2	6	242313	242318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977367
5099	NC_011134	TGC	2	6	242372	242377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977367
5100	NC_011134	T	6	6	242390	242395	0 %	100 %	0 %	0 %	195977367
5101	NC_011134	GC	3	6	242464	242469	0 %	0 %	50 %	50 %	195977367
5102	NC_011134	AGA	2	6	242526	242531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977367
5103	NC_011134	AAT	2	6	242539	242544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977367
5104	NC_011134	TGG	2	6	242550	242555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977367
5105	NC_011134	GTG	2	6	242582	242587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977367
5106	NC_011134	TAA	2	6	242592	242597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977367
5107	NC_011134	TGA	2	6	242616	242621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977367
5108	NC_011134	AGG	2	6	242663	242668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977367
5109	NC_011134	ACA	3	9	242692	242700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195977367
5110	NC_011134	TCA	2	6	242702	242707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977367
5111	NC_011134	A	6	6	242714	242719	100 %	0 %	0 %	0 %	195977367
5112	NC_011134	TTCTTG	2	12	242747	242758	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	195977367
5113	NC_011134	GATT	2	8	242768	242775	25 %	50 %	25 %	0 %	195977367
5114	NC_011134	AG	3	6	242848	242853	50 %	0 %	50 %	0 %	195977367
5115	NC_011134	TTTTA	2	10	242886	242895	20 %	80 %	0 %	0 %	195977368
5116	NC_011134	CT	3	6	242907	242912	0 %	50 %	0 %	50 %	195977368
5117	NC_011134	TGT	2	6	242915	242920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977368
5118	NC_011134	ACCT	2	8	242946	242953	25 %	25 %	0 %	50 %	195977368
5119	NC_011134	CT	3	6	242984	242989	0 %	50 %	0 %	50 %	195977368
5120	NC_011134	AGCTG	2	10	242990	242999	20 %	20 %	40 %	20 %	195977368
5121	NC_011134	AGGCTC	2	12	243025	243036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	195977368
5122	NC_011134	TTG	2	6	243108	243113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977368
5123	NC_011134	AGC	2	6	243128	243133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977368
5124	NC_011134	TTAT	2	8	243142	243149	25 %	75 %	0 %	0 %	195977368
5125	NC_011134	ATT	2	6	243168	243173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977368
5126	NC_011134	T	6	6	243237	243242	0 %	100 %	0 %	0 %	195977368
5127	NC_011134	ATA	2	6	243292	243297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977368
5128	NC_011134	TGA	2	6	243367	243372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977368
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5130	NC_011134	TCA	2	6	243445	243450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977368
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5137	NC_011134	TGA	2	6	243655	243660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977368
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5146	NC_011134	TGT	2	6	244028	244033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977368
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5152	NC_011134	TGA	3	9	244331	244339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977368
5153	NC_011134	AGC	2	6	244363	244368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977368
5154	NC_011134	TGA	2	6	244541	244546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977368
5155	NC_011134	ATC	2	6	244548	244553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977368
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5158	NC_011134	GTT	2	6	244689	244694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_011134	T	6	6	244748	244753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_011134	TAA	2	6	244783	244788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_011134	AGAC	2	8	244792	244799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5162	NC_011134	AGA	2	6	244810	244815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_011134	CTAG	2	8	244841	244848	25 %	25 %	25 %	25 %	195977369
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5176	NC_011134	T	6	6	245631	245636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5177	NC_011134	TAA	2	6	245660	245665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5178	NC_011134	A	6	6	245673	245678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5179	NC_011134	AG	3	6	245690	245695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5181	NC_011134	GCT	2	6	245729	245734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5182	NC_011134	TACTGA	2	12	245805	245816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	195977370
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5184	NC_011134	A	6	6	245983	245988	100 %	0 %	0 %	0 %	195977370
5185	NC_011134	ATT	2	6	246029	246034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977370
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5196	NC_011134	GA	3	6	246848	246853	50 %	0 %	50 %	0 %	195977371
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5204	NC_011134	CTG	2	6	247308	247313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977371
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5214	NC_011134	AG	3	6	247750	247755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5215	NC_011134	TAG	2	6	247792	247797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5216	NC_011134	TTA	2	6	247919	247924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5217	NC_011134	CAG	3	9	248037	248045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5218	NC_011134	ATT	2	6	248057	248062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5219	NC_011134	TTTG	2	8	248063	248070	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_011134	TAT	2	6	248097	248102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_011134	AGC	2	6	248109	248114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5222	NC_011134	CTT	2	6	248174	248179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5223	NC_011134	T	13	13	248203	248215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_011134	TTTG	2	8	248260	248267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_011134	CTA	2	6	248293	248298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5226	NC_011134	CAG	2	6	248307	248312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5227	NC_011134	AGAC	2	8	248351	248358	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5228	NC_011134	GGA	2	6	248393	248398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5229	NC_011134	TGG	2	6	248586	248591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977372
5230	NC_011134	GAT	2	6	248602	248607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977372
5231	NC_011134	GCA	3	9	248631	248639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977372
5232	NC_011134	GTT	2	6	248659	248664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977372
5233	NC_011134	TCA	2	6	248667	248672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977372
5234	NC_011134	GTG	2	6	248852	248857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977372
5235	NC_011134	ATG	2	6	248864	248869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977372
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5237	NC_011134	TGC	2	6	248982	248987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5238	NC_011134	A	6	6	248989	248994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_011134	CAA	2	6	249013	249018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5240	NC_011134	GTG	2	6	249033	249038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_011134	CAG	2	6	249073	249078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977373
5242	NC_011134	TTG	2	6	249093	249098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977373
5243	NC_011134	GTCT	2	8	249121	249128	0 %	50 %	25 %	25 %	195977373
5244	NC_011134	CA	3	6	249155	249160	50 %	0 %	0 %	50 %	195977373
5245	NC_011134	TGGT	2	8	249216	249223	0 %	50 %	50 %	0 %	195977373
5246	NC_011134	CA	3	6	249265	249270	50 %	0 %	0 %	50 %	195977373
5247	NC_011134	ATG	2	6	249282	249287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977373
5248	NC_011134	CTT	2	6	249379	249384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977373
5249	NC_011134	GCTCA	2	10	249396	249405	20 %	20 %	20 %	40 %	195977373
5250	NC_011134	T	6	6	249461	249466	0 %	100 %	0 %	0 %	195977373
5251	NC_011134	CTG	2	6	249494	249499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977373
5252	NC_011134	A	7	7	249521	249527	100 %	0 %	0 %	0 %	195977373
5253	NC_011134	ATA	2	6	249558	249563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977373
5254	NC_011134	CTTT	2	8	249837	249844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5255	NC_011134	GCA	2	6	249928	249933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5256	NC_011134	GCT	2	6	249948	249953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_011134	TCA	2	6	250023	250028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5258	NC_011134	TGA	2	6	250085	250090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_011134	CTT	2	6	250325	250330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_011134	TCA	2	6	250454	250459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977374
5261	NC_011134	GTCA	2	8	250597	250604	25 %	25 %	25 %	25 %	195977374
5262	NC_011134	ATT	2	6	250640	250645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977374
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5265	NC_011134	GCA	2	6	250692	250697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977374
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5269	NC_011134	AGC	2	6	250799	250804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977374
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5273	NC_011134	TGT	2	6	250958	250963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977374
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5277	NC_011134	TGA	2	6	251276	251281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977374
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5289	NC_011134	CAT	2	6	251852	251857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5296	NC_011134	AAAT	2	8	252007	252014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5299	NC_011134	TA	3	6	252173	252178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5300	NC_011134	A	6	6	252178	252183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5303	NC_011134	ATA	2	6	252219	252224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5304	NC_011134	AGG	2	6	252234	252239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_011134	ATC	2	6	261100	261105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977384

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