MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 42588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011134	AATC	2	8	213487	213494	50 %	25 %	0 %	25 %	195977340
4502	NC_011134	ATT	2	6	213567	213572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977340
4503	NC_011134	TTA	2	6	213735	213740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977340
4504	NC_011134	TG	3	6	213757	213762	0 %	50 %	50 %	0 %	195977340
4505	NC_011134	GAG	2	6	213833	213838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977340
4506	NC_011134	TGC	2	6	213850	213855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977340
4507	NC_011134	CAT	2	6	213905	213910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977340
4508	NC_011134	GCC	2	6	213988	213993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977340
4509	NC_011134	GCC	2	6	213997	214002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977340
4510	NC_011134	TGC	2	6	214035	214040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977340
4511	NC_011134	CAAGAG	2	12	214141	214152	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	195977341
4512	NC_011134	AGG	2	6	214175	214180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977341
4513	NC_011134	GAG	2	6	214270	214275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977341
4514	NC_011134	ATGC	2	8	214291	214298	25 %	25 %	25 %	25 %	195977341
4515	NC_011134	GAC	2	6	214540	214545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977341
4516	NC_011134	A	6	6	214641	214646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_011134	TGTC	2	8	214711	214718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_011134	CAG	2	6	214789	214794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977342
4519	NC_011134	TGC	2	6	214923	214928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977342
4520	NC_011134	TCTG	2	8	215046	215053	0 %	50 %	25 %	25 %	195977342
4521	NC_011134	CTG	2	6	215070	215075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977342
4522	NC_011134	TAAT	2	8	215124	215131	50 %	50 %	0 %	0 %	195977342
4523	NC_011134	GATC	2	8	215250	215257	25 %	25 %	25 %	25 %	195977342
4524	NC_011134	TGAC	2	8	215263	215270	25 %	25 %	25 %	25 %	195977342
4525	NC_011134	CAGA	2	8	215340	215347	50 %	0 %	25 %	25 %	195977342
4526	NC_011134	GAT	2	6	215350	215355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977342
4527	NC_011134	AAGA	2	8	215357	215364	75 %	0 %	25 %	0 %	195977342
4528	NC_011134	TGA	2	6	215452	215457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977342
4529	NC_011134	GAT	2	6	215513	215518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977342
4530	NC_011134	CAT	2	6	215654	215659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977342
4531	NC_011134	TCA	2	6	215677	215682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977342
4532	NC_011134	GCTAG	2	10	215703	215712	20 %	20 %	40 %	20 %	195977342
4533	NC_011134	TCTG	2	8	215766	215773	0 %	50 %	25 %	25 %	195977342
4534	NC_011134	GCT	2	6	215779	215784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977342
4535	NC_011134	TAA	3	9	215787	215795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977342
4536	NC_011134	CTG	2	6	215819	215824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977342
4537	NC_011134	CTG	2	6	215849	215854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977342
4538	NC_011134	GA	3	6	215895	215900	50 %	0 %	50 %	0 %	195977342
4539	NC_011134	TGC	2	6	215915	215920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977342
4540	NC_011134	ATC	2	6	215951	215956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977342
4541	NC_011134	TCAAGT	2	12	216078	216089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	195977343
4542	NC_011134	GTT	2	6	216146	216151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977343
4543	NC_011134	TTG	3	9	216176	216184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977343
4544	NC_011134	AAG	2	6	216259	216264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195977343
4545	NC_011134	TAG	2	6	216279	216284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977343
4546	NC_011134	GAT	2	6	216425	216430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977343
4547	NC_011134	T	6	6	216474	216479	0 %	100 %	0 %	0 %	195977343
4548	NC_011134	TTA	2	6	216531	216536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977343
4549	NC_011134	ATG	2	6	216659	216664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977343
4550	NC_011134	AGT	2	6	216670	216675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977343
4551	NC_011134	TGG	2	6	216679	216684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977343
4552	NC_011134	CAT	2	6	216716	216721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977343
4553	NC_011134	TTTG	2	8	216736	216743	0 %	75 %	25 %	0 %	195977343
4554	NC_011134	TCTTT	2	10	216757	216766	0 %	80 %	0 %	20 %	195977343
4555	NC_011134	TTG	2	6	216875	216880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977343
4556	NC_011134	GAG	2	6	216919	216924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977343
4557	NC_011134	CTT	2	6	216964	216969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977343
4558	NC_011134	ATA	2	6	217028	217033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195977343
4559	NC_011134	TTG	3	9	217059	217067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_011134	TC	3	6	217085	217090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_011134	T	6	6	217098	217103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_011134	ACA	2	6	217199	217204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_011134	GGA	2	6	217253	217258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011134	CAG	2	6	217262	217267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_011134	GT	3	6	217284	217289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_011134	T	7	7	217294	217300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_011134	T	6	6	217318	217323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_011134	TAAT	2	8	217327	217334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_011134	AGATT	2	10	217365	217374	40 %	40 %	20 %	0 %	195977344
4570	NC_011134	ATT	3	9	217400	217408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977344
4571	NC_011134	CAT	2	6	217411	217416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977344
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4573	NC_011134	TTTG	2	8	217603	217610	0 %	75 %	25 %	0 %	195977344
4574	NC_011134	TTG	2	6	217626	217631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977344
4575	NC_011134	TTG	2	6	217658	217663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977344
4576	NC_011134	TATTT	2	10	217681	217690	20 %	80 %	0 %	0 %	195977344
4577	NC_011134	TGA	2	6	217720	217725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977344
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4579	NC_011134	TGC	2	6	217833	217838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977344
4580	NC_011134	AGGA	2	8	217851	217858	50 %	0 %	50 %	0 %	195977344
4581	NC_011134	ATC	2	6	217949	217954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977344
4582	NC_011134	GCT	2	6	218042	218047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_011134	T	6	6	218047	218052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_011134	A	6	6	218059	218064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_011134	GCT	2	6	218116	218121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977345
4586	NC_011134	T	6	6	218175	218180	0 %	100 %	0 %	0 %	195977345
4587	NC_011134	TGA	2	6	218190	218195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977345
4588	NC_011134	ATCT	2	8	218247	218254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4589	NC_011134	TGCT	2	8	218285	218292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_011134	TAT	2	6	218306	218311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_011134	A	6	6	218377	218382	100 %	0 %	0 %	0 %	195977346
4592	NC_011134	TGT	2	6	218392	218397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977346
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4594	NC_011134	T	7	7	218522	218528	0 %	100 %	0 %	0 %	195977346
4595	NC_011134	AAGGG	2	10	218540	218549	40 %	0 %	60 %	0 %	195977346
4596	NC_011134	ATT	2	6	218573	218578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977346
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4599	NC_011134	TGA	2	6	218683	218688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977346
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4601	NC_011134	TGC	2	6	218911	218916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977346
4602	NC_011134	GGT	2	6	219073	219078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977346
4603	NC_011134	ATAG	2	8	219089	219096	50 %	25 %	25 %	0 %	195977346
4604	NC_011134	TGA	2	6	219139	219144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977346
4605	NC_011134	TACT	2	8	219235	219242	25 %	50 %	0 %	25 %	195977346
4606	NC_011134	AGC	2	6	219246	219251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977346
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4608	NC_011134	AG	3	6	219278	219283	50 %	0 %	50 %	0 %	195977346
4609	NC_011134	ATT	2	6	219287	219292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977346
4610	NC_011134	ATG	2	6	219359	219364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195977346
4611	NC_011134	TGG	2	6	219378	219383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977346
4612	NC_011134	TTG	2	6	219453	219458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977346
4613	NC_011134	CATT	2	8	219472	219479	25 %	50 %	0 %	25 %	195977346
4614	NC_011134	CTT	2	6	219502	219507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195977346
4615	NC_011134	TGC	2	6	219528	219533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977346
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4617	NC_011134	A	6	6	219605	219610	100 %	0 %	0 %	0 %	195977346
4618	NC_011134	TTA	2	6	219611	219616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977346
4619	NC_011134	AGCTA	2	10	219648	219657	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4620	NC_011134	AGC	2	6	219688	219693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_011134	A	6	6	219868	219873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_011134	TGT	2	6	219955	219960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977347
4623	NC_011134	ATT	2	6	219965	219970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977347
4624	NC_011134	ATCA	2	8	219989	219996	50 %	25 %	0 %	25 %	195977347
4625	NC_011134	GAG	2	6	220028	220033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195977347
4626	NC_011134	A	6	6	220039	220044	100 %	0 %	0 %	0 %	195977347
4627	NC_011134	TTA	2	6	220104	220109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977347
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4629	NC_011134	ATT	2	6	220214	220219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977347
4630	NC_011134	ATCAA	2	10	220220	220229	60 %	20 %	0 %	20 %	195977347
4631	NC_011134	CAGA	2	8	220271	220278	50 %	0 %	25 %	25 %	195977347
4632	NC_011134	TAT	2	6	220282	220287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195977347
4633	NC_011134	GAC	2	6	220370	220375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195977347
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4641	NC_011134	AGCA	2	8	220670	220677	50 %	0 %	25 %	25 %	195977347
4642	NC_011134	TTG	2	6	220725	220730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977347
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4649	NC_011134	GCC	2	6	221163	221168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195977348
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4653	NC_011134	TCG	2	6	221254	221259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195977348
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4727	NC_011134	CTT	2	6	225175	225180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4728	NC_011134	AGT	2	6	225209	225214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4732	NC_011134	AGG	2	6	225485	225490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4736	NC_011134	GTCT	2	8	225625	225632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4737	NC_011134	ATC	2	6	225637	225642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4740	NC_011134	TCA	2	6	225744	225749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195977351
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4742	NC_011134	TTG	2	6	225814	225819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195977351
4743	NC_011134	ACGTC	2	10	225867	225876	20 %	20 %	20 %	40 %	195977351
4744	NC_011134	GGT	2	6	225902	225907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195977351
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4861	NC_011134	A	7	7	231203	231209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4863	NC_011134	AAT	2	6	231244	231249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4864	NC_011134	CCAGA	2	10	231254	231263	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4865	NC_011134	CTT	2	6	231411	231416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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