MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 chromosome

Total Repeats: 10961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011094	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011094	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	194737774
3	NC_011094	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	194737774
4	NC_011094	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	194734054
5	NC_011094	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	194736906
6	NC_011094	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	194736906
7	NC_011094	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	194736906
8	NC_011094	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	194736906
9	NC_011094	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	194736906
10	NC_011094	TGAG	2	8	6624	6631	25 %	25 %	50 %	0 %	194735924
11	NC_011094	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	194735924
12	NC_011094	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	194735924
13	NC_011094	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	194735924
14	NC_011094	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	194736669
15	NC_011094	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	194736669
16	NC_011094	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011094	TCCG	2	8	9279	9286	0 %	25 %	25 %	50 %	194734929
18	NC_011094	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	194735180
19	NC_011094	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	194737389
20	NC_011094	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	194737872
21	NC_011094	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	194737872
22	NC_011094	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	194737872
23	NC_011094	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	194737078
24	NC_011094	TCTG	2	8	11390	11397	0 %	50 %	25 %	25 %	194737078
25	NC_011094	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	194735871
26	NC_011094	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	194735871
27	NC_011094	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	194735871
28	NC_011094	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	194735871
29	NC_011094	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	194735871
30	NC_011094	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	194735871
31	NC_011094	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	194733969
32	NC_011094	TCAG	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	194735063
33	NC_011094	TTTG	2	8	15535	15542	0 %	75 %	25 %	0 %	194735063
34	NC_011094	CGAA	2	8	15750	15757	50 %	0 %	25 %	25 %	194735063
35	NC_011094	ATTG	2	8	15762	15769	25 %	50 %	25 %	0 %	194735063
36	NC_011094	ATTA	2	8	16430	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	194735831
37	NC_011094	ATAA	2	8	16522	16529	75 %	25 %	0 %	0 %	194734342
38	NC_011094	AATA	2	8	17998	18005	75 %	25 %	0 %	0 %	194737593
39	NC_011094	GGGC	2	8	18584	18591	0 %	0 %	75 %	25 %	194737593
40	NC_011094	CGTG	2	8	19284	19291	0 %	25 %	50 %	25 %	194737593
41	NC_011094	TCCA	2	8	20070	20077	25 %	25 %	0 %	50 %	194738313
42	NC_011094	CCAA	2	8	21286	21293	50 %	0 %	0 %	50 %	194738313
43	NC_011094	GCCT	2	8	21499	21506	0 %	25 %	25 %	50 %	194738313
44	NC_011094	GACG	2	8	21632	21639	25 %	0 %	50 %	25 %	194738313
45	NC_011094	TTAT	2	8	22012	22019	25 %	75 %	0 %	0 %	194738313
46	NC_011094	TGGC	2	8	22285	22292	0 %	25 %	50 %	25 %	194738313
47	NC_011094	TGGC	2	8	22391	22398	0 %	25 %	50 %	25 %	194738313
48	NC_011094	CGCC	2	8	22657	22664	0 %	0 %	25 %	75 %	194738313
49	NC_011094	CTGG	2	8	23003	23010	0 %	25 %	50 %	25 %	194738313
50	NC_011094	TTAT	2	8	23268	23275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011094	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	194738006
52	NC_011094	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	194738006
53	NC_011094	TGAA	2	8	24469	24476	50 %	25 %	25 %	0 %	194737212
54	NC_011094	CCAG	2	8	24740	24747	25 %	0 %	25 %	50 %	194737212
55	NC_011094	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	194735713
56	NC_011094	AAAT	2	8	25478	25485	75 %	25 %	0 %	0 %	194735713
57	NC_011094	TCTG	2	8	25935	25942	0 %	50 %	25 %	25 %	194733954
58	NC_011094	GCCT	2	8	26116	26123	0 %	25 %	25 %	50 %	194733954
59	NC_011094	ATCA	2	8	27394	27401	50 %	25 %	0 %	25 %	194733954
60	NC_011094	AGCC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	25 %	50 %	194733954
61	NC_011094	CCGA	2	8	28135	28142	25 %	0 %	25 %	50 %	194733954
62	NC_011094	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	194735351
63	NC_011094	GGCG	2	8	28770	28777	0 %	0 %	75 %	25 %	194735351
64	NC_011094	ATGA	2	8	29975	29982	50 %	25 %	25 %	0 %	194737224
65	NC_011094	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	194736384
66	NC_011094	TATC	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	194736384
67	NC_011094	GTAA	2	8	30638	30645	50 %	25 %	25 %	0 %	194736384
68	NC_011094	GTTT	2	8	30831	30838	0 %	75 %	25 %	0 %	194736384
69	NC_011094	TTCG	2	8	30900	30907	0 %	50 %	25 %	25 %	194736384
70	NC_011094	GTCA	2	8	31410	31417	25 %	25 %	25 %	25 %	513549428
71	NC_011094	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	194734689
72	NC_011094	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	194734689
73	NC_011094	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	194734441
74	NC_011094	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	194734441
75	NC_011094	CCAG	2	8	33350	33357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011094	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	194734337
77	NC_011094	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	194734337
78	NC_011094	CTTT	2	8	34297	34304	0 %	75 %	0 %	25 %	194734337
79	NC_011094	GAAG	2	8	34337	34344	50 %	0 %	50 %	0 %	194734337
80	NC_011094	AATA	2	8	34391	34398	75 %	25 %	0 %	0 %	194735987
81	NC_011094	ATAA	2	8	34665	34672	75 %	25 %	0 %	0 %	194735987
82	NC_011094	GTGC	2	8	34788	34795	0 %	25 %	50 %	25 %	194735987
83	NC_011094	TTAA	2	8	34798	34805	50 %	50 %	0 %	0 %	194735987
84	NC_011094	TGAT	2	8	35033	35040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011094	GGGA	2	8	36494	36501	25 %	0 %	75 %	0 %	194736972
86	NC_011094	ATAC	2	8	37479	37486	50 %	25 %	0 %	25 %	194736342
87	NC_011094	CACG	2	8	38114	38121	25 %	0 %	25 %	50 %	194736342
88	NC_011094	TAAT	2	8	38216	38223	50 %	50 %	0 %	0 %	194736342
89	NC_011094	CCAT	2	8	38672	38679	25 %	25 %	0 %	50 %	194736342
90	NC_011094	AATT	2	8	40047	40054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011094	GCGG	2	8	40538	40545	0 %	0 %	75 %	25 %	194734352
92	NC_011094	CTGG	2	8	40756	40763	0 %	25 %	50 %	25 %	194734352
93	NC_011094	CCGA	2	8	41273	41280	25 %	0 %	25 %	50 %	194734352
94	NC_011094	ATCG	2	8	41429	41436	25 %	25 %	25 %	25 %	194734352
95	NC_011094	TCAA	2	8	41490	41497	50 %	25 %	0 %	25 %	194734352
96	NC_011094	AACC	2	8	41756	41763	50 %	0 %	0 %	50 %	194735938
97	NC_011094	GAAA	2	8	41808	41815	75 %	0 %	25 %	0 %	194735938
98	NC_011094	GGTC	2	8	42380	42387	0 %	25 %	50 %	25 %	194735938
99	NC_011094	TTTG	2	8	42904	42911	0 %	75 %	25 %	0 %	194735938
100	NC_011094	GTAT	2	8	43199	43206	25 %	50 %	25 %	0 %	194735317
101	NC_011094	ATGA	2	8	45655	45662	50 %	25 %	25 %	0 %	194735149
102	NC_011094	AACG	2	8	45957	45964	50 %	0 %	25 %	25 %	194735149
103	NC_011094	TGAC	2	8	46041	46048	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011094	GAAA	2	8	46905	46912	75 %	0 %	25 %	0 %	194736826
105	NC_011094	TCGC	2	8	46920	46927	0 %	25 %	25 %	50 %	194736826
106	NC_011094	GCTG	2	8	47111	47118	0 %	25 %	50 %	25 %	194736826
107	NC_011094	CAGC	2	8	47836	47843	25 %	0 %	25 %	50 %	194736409
108	NC_011094	CTGC	2	8	47973	47980	0 %	25 %	25 %	50 %	194736409
109	NC_011094	TACC	2	8	48320	48327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011094	CATG	2	8	48541	48548	25 %	25 %	25 %	25 %	194737987
111	NC_011094	TTCG	2	8	48764	48771	0 %	50 %	25 %	25 %	194737987
112	NC_011094	AAGT	2	8	49335	49342	50 %	25 %	25 %	0 %	194737987
113	NC_011094	CCAG	2	8	49393	49400	25 %	0 %	25 %	50 %	194737987
114	NC_011094	TGCG	2	8	49638	49645	0 %	25 %	50 %	25 %	194737987
115	NC_011094	TTGA	2	8	50174	50181	25 %	50 %	25 %	0 %	194737987
116	NC_011094	GAAA	2	8	50509	50516	75 %	0 %	25 %	0 %	194738222
117	NC_011094	GCCA	2	8	50850	50857	25 %	0 %	25 %	50 %	194738222
118	NC_011094	TAAA	2	8	51243	51250	75 %	25 %	0 %	0 %	194738222
119	NC_011094	TGAG	2	8	51934	51941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011094	ATCA	2	8	51976	51983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011094	GAAA	2	8	52096	52103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011094	CATA	2	8	52893	52900	50 %	25 %	0 %	25 %	194734968
123	NC_011094	TCAG	2	8	52904	52911	25 %	25 %	25 %	25 %	194734968
124	NC_011094	TGGC	2	8	53618	53625	0 %	25 %	50 %	25 %	194734968
125	NC_011094	AGCC	2	8	57445	57452	25 %	0 %	25 %	50 %	194737896
126	NC_011094	AAAG	2	8	57524	57531	75 %	0 %	25 %	0 %	194737896
127	NC_011094	ATGG	2	8	57657	57664	25 %	25 %	50 %	0 %	194737896
128	NC_011094	TGAT	2	8	58329	58336	25 %	50 %	25 %	0 %	194735346
129	NC_011094	GATT	2	8	59396	59403	25 %	50 %	25 %	0 %	194734594
130	NC_011094	AACA	2	8	59587	59594	75 %	0 %	0 %	25 %	194734594
131	NC_011094	GATC	2	8	59765	59772	25 %	25 %	25 %	25 %	194734594
132	NC_011094	CTGG	2	8	60890	60897	0 %	25 %	50 %	25 %	194734027
133	NC_011094	GTGG	2	8	61055	61062	0 %	25 %	75 %	0 %	194734027
134	NC_011094	CTGC	2	8	61265	61272	0 %	25 %	25 %	50 %	194735861
135	NC_011094	ACCA	2	8	61901	61908	50 %	0 %	0 %	50 %	194735213
136	NC_011094	GTGG	2	8	61936	61943	0 %	25 %	75 %	0 %	194735213
137	NC_011094	CATT	2	8	62126	62133	25 %	50 %	0 %	25 %	194735213
138	NC_011094	TACT	2	8	63486	63493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011094	TTTC	2	8	63494	63501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011094	GCCA	2	8	64753	64760	25 %	0 %	25 %	50 %	194737067
141	NC_011094	GCTG	2	8	65135	65142	0 %	25 %	50 %	25 %	194736505
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