MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011092	GC	3	6	1277	1282	0 %	0 %	50 %	50 %	194733880
2	NC_011092	TG	3	6	1825	1830	0 %	50 %	50 %	0 %	194733858
3	NC_011092	TG	3	6	1938	1943	0 %	50 %	50 %	0 %	194733858
4	NC_011092	TC	3	6	2241	2246	0 %	50 %	0 %	50 %	194733822
5	NC_011092	AT	3	6	2486	2491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011092	AG	3	6	3406	3411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011092	GA	3	6	3900	3905	50 %	0 %	50 %	0 %	194733850
8	NC_011092	AG	3	6	4325	4330	50 %	0 %	50 %	0 %	194733850
9	NC_011092	CG	3	6	4359	4364	0 %	0 %	50 %	50 %	194733850
10	NC_011092	TG	3	6	4430	4435	0 %	50 %	50 %	0 %	194733850
11	NC_011092	AG	3	6	4533	4538	50 %	0 %	50 %	0 %	194733786
12	NC_011092	CA	3	6	5830	5835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011092	AT	3	6	5950	5955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011092	CG	3	6	9279	9284	0 %	0 %	50 %	50 %	194733809
15	NC_011092	CG	3	6	9298	9303	0 %	0 %	50 %	50 %	194733809
16	NC_011092	CT	3	6	9475	9480	0 %	50 %	0 %	50 %	194733884
17	NC_011092	GC	3	6	10495	10500	0 %	0 %	50 %	50 %	194733838
18	NC_011092	CA	3	6	11026	11031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011092	GC	4	8	11669	11676	0 %	0 %	50 %	50 %	194733781
20	NC_011092	GC	3	6	12496	12501	0 %	0 %	50 %	50 %	194733891
21	NC_011092	GA	3	6	12615	12620	50 %	0 %	50 %	0 %	194733891
22	NC_011092	AC	3	6	13338	13343	50 %	0 %	0 %	50 %	194733836
23	NC_011092	TG	3	6	13785	13790	0 %	50 %	50 %	0 %	194733836
24	NC_011092	TA	3	6	15301	15306	50 %	50 %	0 %	0 %	194733877
25	NC_011092	GA	3	6	16783	16788	50 %	0 %	50 %	0 %	194733790
26	NC_011092	CT	3	6	17141	17146	0 %	50 %	0 %	50 %	194733790
27	NC_011092	CT	3	6	18282	18287	0 %	50 %	0 %	50 %	194733834
28	NC_011092	GT	3	6	18469	18474	0 %	50 %	50 %	0 %	194733834
29	NC_011092	GC	3	6	19736	19741	0 %	0 %	50 %	50 %	194733834
30	NC_011092	CA	3	6	20571	20576	50 %	0 %	0 %	50 %	194733826
31	NC_011092	TG	3	6	20722	20727	0 %	50 %	50 %	0 %	194733826
32	NC_011092	CT	3	6	21824	21829	0 %	50 %	0 %	50 %	194733826
33	NC_011092	GA	3	6	21846	21851	50 %	0 %	50 %	0 %	194733826
34	NC_011092	GT	3	6	22521	22526	0 %	50 %	50 %	0 %	194733826
35	NC_011092	AC	3	6	22892	22897	50 %	0 %	0 %	50 %	194733826
36	NC_011092	CA	3	6	24268	24273	50 %	0 %	0 %	50 %	194733821
37	NC_011092	CT	3	6	24678	24683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011092	GC	3	6	24715	24720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011092	CG	3	6	25021	25026	0 %	0 %	50 %	50 %	194733830
40	NC_011092	GC	3	6	25992	25997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011092	GC	3	6	27360	27365	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
42	NC_011092	CG	3	6	27957	27962	0 %	0 %	50 %	50 %	194733886
43	NC_011092	CG	3	6	29008	29013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011092	CG	4	8	31057	31064	0 %	0 %	50 %	50 %	194733848
45	NC_011092	GC	3	6	31253	31258	0 %	0 %	50 %	50 %	194733848
46	NC_011092	CG	3	6	31487	31492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011092	GC	4	8	31840	31847	0 %	0 %	50 %	50 %	194733819
48	NC_011092	CT	3	6	32359	32364	0 %	50 %	0 %	50 %	194733882
49	NC_011092	CG	3	6	32420	32425	0 %	0 %	50 %	50 %	194733882
50	NC_011092	GC	3	6	32848	32853	0 %	0 %	50 %	50 %	194733801
51	NC_011092	GC	3	6	33861	33866	0 %	0 %	50 %	50 %	194733856
52	NC_011092	GT	3	6	34728	34733	0 %	50 %	50 %	0 %	194733856
53	NC_011092	GC	4	8	35241	35248	0 %	0 %	50 %	50 %	194733856
54	NC_011092	GC	3	6	36028	36033	0 %	0 %	50 %	50 %	194733856
55	NC_011092	GC	3	6	36723	36728	0 %	0 %	50 %	50 %	194733888
56	NC_011092	GC	3	6	37622	37627	0 %	0 %	50 %	50 %	194733804
57	NC_011092	GC	3	6	37733	37738	0 %	0 %	50 %	50 %	194733804
58	NC_011092	GC	3	6	38189	38194	0 %	0 %	50 %	50 %	194733797
59	NC_011092	GA	3	6	38308	38313	50 %	0 %	50 %	0 %	194733797
60	NC_011092	GC	3	6	38833	38838	0 %	0 %	50 %	50 %	194733885
61	NC_011092	GC	3	6	39538	39543	0 %	0 %	50 %	50 %	194733885
62	NC_011092	GC	3	6	39868	39873	0 %	0 %	50 %	50 %	194733885
63	NC_011092	GC	3	6	40267	40272	0 %	0 %	50 %	50 %	194733823
64	NC_011092	CG	3	6	40664	40669	0 %	0 %	50 %	50 %	194733823
65	NC_011092	GC	3	6	40740	40745	0 %	0 %	50 %	50 %	194733806
66	NC_011092	GC	3	6	41027	41032	0 %	0 %	50 %	50 %	194733868
67	NC_011092	CG	3	6	41152	41157	0 %	0 %	50 %	50 %	194733868
68	NC_011092	CG	3	6	41567	41572	0 %	0 %	50 %	50 %	194733879
69	NC_011092	GC	4	8	41588	41595	0 %	0 %	50 %	50 %	194733879
70	NC_011092	GT	3	6	41918	41923	0 %	50 %	50 %	0 %	194733879
71	NC_011092	GC	3	6	41927	41932	0 %	0 %	50 %	50 %	194733879
72	NC_011092	GC	3	6	41959	41964	0 %	0 %	50 %	50 %	194733879
73	NC_011092	GT	3	6	42040	42045	0 %	50 %	50 %	0 %	194733879
74	NC_011092	CA	3	6	42606	42611	50 %	0 %	0 %	50 %	194733879
75	NC_011092	TA	3	6	43165	43170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011092	TC	3	6	44760	44765	0 %	50 %	0 %	50 %	194733817
77	NC_011092	CG	3	6	44878	44883	0 %	0 %	50 %	50 %	194733817
78	NC_011092	GA	3	6	45769	45774	50 %	0 %	50 %	0 %	194733796
79	NC_011092	AG	3	6	46131	46136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011092	TC	3	6	46138	46143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011092	GC	3	6	47027	47032	0 %	0 %	50 %	50 %	194733874
82	NC_011092	GC	3	6	48298	48303	0 %	0 %	50 %	50 %	194733874
83	NC_011092	GC	3	6	49886	49891	0 %	0 %	50 %	50 %	194733864
84	NC_011092	GC	3	6	50041	50046	0 %	0 %	50 %	50 %	194733864
85	NC_011092	TC	3	6	50869	50874	0 %	50 %	0 %	50 %	194733843
86	NC_011092	CG	3	6	50987	50992	0 %	0 %	50 %	50 %	194733843
87	NC_011092	AG	3	6	51875	51880	50 %	0 %	50 %	0 %	194733815
88	NC_011092	GA	3	6	52563	52568	50 %	0 %	50 %	0 %	194733815
89	NC_011092	AT	3	6	52772	52777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011092	GC	3	6	54900	54905	0 %	0 %	50 %	50 %	194733845
91	NC_011092	GA	4	8	55489	55496	50 %	0 %	50 %	0 %	194733807
92	NC_011092	CT	3	6	56358	56363	0 %	50 %	0 %	50 %	194733859
93	NC_011092	TG	3	6	56461	56466	0 %	50 %	50 %	0 %	194733859
94	NC_011092	TC	3	6	56685	56690	0 %	50 %	0 %	50 %	194733791
95	NC_011092	AC	3	6	57210	57215	50 %	0 %	0 %	50 %	194733791
96	NC_011092	GA	3	6	59659	59664	50 %	0 %	50 %	0 %	194733892
97	NC_011092	TC	3	6	59967	59972	0 %	50 %	0 %	50 %	194733803
98	NC_011092	CG	3	6	61433	61438	0 %	0 %	50 %	50 %	194733854
99	NC_011092	GC	3	6	61545	61550	0 %	0 %	50 %	50 %	194733854
100	NC_011092	GC	3	6	62543	62548	0 %	0 %	50 %	50 %	194733805
101	NC_011092	GA	3	6	62662	62667	50 %	0 %	50 %	0 %	194733805
102	NC_011092	TC	3	6	63700	63705	0 %	50 %	0 %	50 %	194733792
103	NC_011092	GC	3	6	66840	66845	0 %	0 %	50 %	50 %	194733860
104	NC_011092	GA	3	6	66959	66964	50 %	0 %	50 %	0 %	194733860
105	NC_011092	GC	3	6	68436	68441	0 %	0 %	50 %	50 %	194733779
106	NC_011092	GA	3	6	68555	68560	50 %	0 %	50 %	0 %	194733779
107	NC_011092	GC	3	6	70697	70702	0 %	0 %	50 %	50 %	194733782
108	NC_011092	GC	3	6	71146	71151	0 %	0 %	50 %	50 %	194733795
109	NC_011092	GC	3	6	71792	71797	0 %	0 %	50 %	50 %	194733808
110	NC_011092	GA	3	6	72002	72007	50 %	0 %	50 %	0 %	194733876
111	NC_011092	GC	3	6	72276	72281	0 %	0 %	50 %	50 %	194733876
112	NC_011092	GA	3	6	72422	72427	50 %	0 %	50 %	0 %	194733876
113	NC_011092	GC	3	6	72783	72788	0 %	0 %	50 %	50 %	194733775
114	NC_011092	TC	3	6	73590	73595	0 %	50 %	0 %	50 %	194733775
115	NC_011092	TA	3	6	73737	73742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011092	AT	3	6	73774	73779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011092	AT	3	6	73785	73790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011092	GT	3	6	74592	74597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011092	CA	3	6	74649	74654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011092	CG	3	6	76285	76290	0 %	0 %	50 %	50 %	194733893
121	NC_011092	CG	3	6	76555	76560	0 %	0 %	50 %	50 %	194733893
122	NC_011092	GC	4	8	76738	76745	0 %	0 %	50 %	50 %	194733893
123	NC_011092	CA	3	6	76831	76836	50 %	0 %	0 %	50 %	194733893
124	NC_011092	AC	3	6	78373	78378	50 %	0 %	0 %	50 %	194733853
125	NC_011092	CA	3	6	79101	79106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011092	GC	3	6	80333	80338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011092	CG	3	6	80572	80577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011092	CG	3	6	80708	80713	0 %	0 %	50 %	50 %	194733827
129	NC_011092	GC	3	6	81031	81036	0 %	0 %	50 %	50 %	194733841
130	NC_011092	GA	3	6	81150	81155	50 %	0 %	50 %	0 %	194733841
131	NC_011092	AT	3	6	82617	82622	50 %	50 %	0 %	0 %	194733794
132	NC_011092	TG	3	6	82818	82823	0 %	50 %	50 %	0 %	194733794
133	NC_011092	GC	3	6	83250	83255	0 %	0 %	50 %	50 %	194733890
134	NC_011092	GA	3	6	83369	83374	50 %	0 %	50 %	0 %	194733890
135	NC_011092	AT	3	6	84390	84395	50 %	50 %	0 %	0 %	194733789
136	NC_011092	TA	3	6	85332	85337	50 %	50 %	0 %	0 %	194733789
137	NC_011092	GT	3	6	86520	86525	0 %	50 %	50 %	0 %	194733833
138	NC_011092	GC	3	6	89203	89208	0 %	0 %	50 %	50 %	194733837
139	NC_011092	CG	3	6	90042	90047	0 %	0 %	50 %	50 %	194733818
140	NC_011092	CG	3	6	90413	90418	0 %	0 %	50 %	50 %	194733818
141	NC_011092	GT	3	6	91213	91218	0 %	50 %	50 %	0 %	194733818
142	NC_011092	CG	3	6	91741	91746	0 %	0 %	50 %	50 %	194733818
143	NC_011092	CG	3	6	93155	93160	0 %	0 %	50 %	50 %	194733862
144	NC_011092	GC	3	6	93753	93758	0 %	0 %	50 %	50 %	194733870
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.