MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 2203

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011092	GCGCA	2	10	100572	100581	20 %	0 %	40 %	40 %	194733844
2002	NC_011092	TAC	2	6	100741	100746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733844
2003	NC_011092	G	6	6	100853	100858	0 %	0 %	100 %	0 %	194733844
2004	NC_011092	GCC	2	6	100906	100911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733844
2005	NC_011092	ACCG	2	8	100912	100919	25 %	0 %	25 %	50 %	194733844
2006	NC_011092	CTG	2	6	100954	100959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2007	NC_011092	GCA	2	6	101001	101006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2008	NC_011092	ACG	2	6	101096	101101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2009	NC_011092	GGT	2	6	101109	101114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733844
2010	NC_011092	GGC	2	6	101115	101120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733844
2011	NC_011092	ACC	2	6	101152	101157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733844
2012	NC_011092	A	6	6	101168	101173	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
2013	NC_011092	GCG	2	6	101176	101181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733844
2014	NC_011092	A	6	6	101191	101196	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
2015	NC_011092	CGA	3	9	101222	101230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2016	NC_011092	GCC	2	6	101246	101251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733844
2017	NC_011092	ACG	2	6	101407	101412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2018	NC_011092	ACG	2	6	101420	101425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2019	NC_011092	GAA	2	6	101428	101433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733844
2020	NC_011092	GAC	2	6	101434	101439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2021	NC_011092	GAG	2	6	101440	101445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733844
2022	NC_011092	GCC	2	6	101477	101482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733844
2023	NC_011092	GGT	2	6	101514	101519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194733844
2024	NC_011092	A	7	7	101530	101536	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
2025	NC_011092	CCGCTG	2	12	101542	101553	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194733844
2026	NC_011092	A	6	6	101620	101625	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
2027	NC_011092	A	6	6	101650	101655	100 %	0 %	0 %	0 %	194733844
2028	NC_011092	CGG	2	6	101664	101669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733844
2029	NC_011092	CG	3	6	101689	101694	0 %	0 %	50 %	50 %	194733844
2030	NC_011092	TAT	2	6	101697	101702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733844
2031	NC_011092	GCC	2	6	101761	101766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733844
2032	NC_011092	TGCCC	2	10	101784	101793	0 %	20 %	20 %	60 %	194733844
2033	NC_011092	CCG	2	6	101819	101824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733844
2034	NC_011092	GGC	2	6	101841	101846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733844
2035	NC_011092	CGT	2	6	101996	102001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2036	NC_011092	TTA	2	6	102137	102142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733844
2037	NC_011092	GAA	2	6	102156	102161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733844
2038	NC_011092	ACG	2	6	102164	102169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733844
2039	NC_011092	GAT	2	6	102180	102185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733844
2040	NC_011092	CCA	2	6	102232	102237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733844
2041	NC_011092	GC	4	8	102320	102327	0 %	0 %	50 %	50 %	194733774
2042	NC_011092	CAG	2	6	102388	102393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733774
2043	NC_011092	TGA	2	6	102398	102403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733774
2044	NC_011092	GAA	2	6	102450	102455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733774
2045	NC_011092	A	6	6	102585	102590	100 %	0 %	0 %	0 %	194733774
2046	NC_011092	TCCT	2	8	102657	102664	0 %	50 %	0 %	50 %	194733774
2047	NC_011092	ACC	2	6	102669	102674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733774
2048	NC_011092	AAC	2	6	102679	102684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733774
2049	NC_011092	A	6	6	102753	102758	100 %	0 %	0 %	0 %	194733842
2050	NC_011092	GCC	2	6	102773	102778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733842
2051	NC_011092	AGG	2	6	102796	102801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733842
2052	NC_011092	GAA	2	6	102819	102824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733842
2053	NC_011092	A	6	6	102880	102885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_011092	G	8	8	102889	102896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_011092	GCC	2	6	102910	102915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2056	NC_011092	G	6	6	102955	102960	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_011092	C	6	6	102965	102970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2058	NC_011092	CGT	2	6	102975	102980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_011092	ACC	2	6	103018	103023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2060	NC_011092	GAAC	2	8	103063	103070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2061	NC_011092	GAA	2	6	103076	103081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_011092	CG	3	6	103115	103120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2063	NC_011092	GC	3	6	103123	103128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2064	NC_011092	CG	3	6	103220	103225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2065	NC_011092	CCT	2	6	103259	103264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2066	NC_011092	CTT	2	6	103289	103294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_011092	GCA	2	6	103297	103302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_011092	GTCA	2	8	103311	103318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2069	NC_011092	CTGA	2	8	103343	103350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2070	NC_011092	GCT	2	6	103484	103489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733778
2071	NC_011092	TGC	2	6	103501	103506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733778
2072	NC_011092	CGG	2	6	103529	103534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733778
2073	NC_011092	TGTTT	2	10	103587	103596	0 %	80 %	20 %	0 %	194733778
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2081	NC_011092	ACG	2	6	104068	104073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733778
2082	NC_011092	GCACC	2	10	104079	104088	20 %	0 %	20 %	60 %	194733778
2083	NC_011092	A	6	6	104094	104099	100 %	0 %	0 %	0 %	194733778
2084	NC_011092	CCG	2	6	104182	104187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733778
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2087	NC_011092	AGGCG	2	10	104234	104243	20 %	0 %	60 %	20 %	194733778
2088	NC_011092	CGA	2	6	104261	104266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733778
2089	NC_011092	GGC	2	6	104273	104278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733778
2090	NC_011092	CGG	2	6	104284	104289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733778
2091	NC_011092	GAG	2	6	104394	104399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733778
2092	NC_011092	GCT	3	9	104467	104475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733778
2093	NC_011092	ATC	2	6	104478	104483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733778
2094	NC_011092	AT	3	6	104674	104679	50 %	50 %	0 %	0 %	194733778
2095	NC_011092	CGG	2	6	104719	104724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733778
2096	NC_011092	TA	3	6	104782	104787	50 %	50 %	0 %	0 %	194733778
2097	NC_011092	CCG	2	6	104806	104811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733778
2098	NC_011092	GC	3	6	104820	104825	0 %	0 %	50 %	50 %	194733778
2099	NC_011092	GAT	2	6	104847	104852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733778
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2101	NC_011092	CGT	2	6	105010	105015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733778
2102	NC_011092	A	6	6	105036	105041	100 %	0 %	0 %	0 %	194733778
2103	NC_011092	GCC	2	6	105065	105070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733778
2104	NC_011092	CTGGAT	2	12	105108	105119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194733778
2105	NC_011092	ATT	2	6	105156	105161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733778
2106	NC_011092	CAA	2	6	105172	105177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733778
2107	NC_011092	CCA	2	6	105178	105183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733778
2108	NC_011092	A	6	6	105183	105188	100 %	0 %	0 %	0 %	194733778
2109	NC_011092	CCG	2	6	105213	105218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733778
2110	NC_011092	GAG	2	6	105231	105236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733778
2111	NC_011092	TCG	2	6	105320	105325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733839
2112	NC_011092	GCA	2	6	105345	105350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733839
2113	NC_011092	A	6	6	105354	105359	100 %	0 %	0 %	0 %	194733839
2114	NC_011092	CTG	2	6	105368	105373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733839
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2119	NC_011092	CG	3	6	105512	105517	0 %	0 %	50 %	50 %	194733839
2120	NC_011092	ACC	2	6	105542	105547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733839
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2122	NC_011092	ACA	2	6	105579	105584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733839
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2124	NC_011092	GAA	2	6	105673	105678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733839
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2154	NC_011092	GCG	3	9	107254	107262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2203	NC_011092	CAA	2	6	110212	110217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.