MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 plasmid pCVM19633_110

Total Repeats: 2203

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011092	AAT	2	6	52428	52433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194733815
1002	NC_011092	GCA	2	6	52456	52461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733815
1003	NC_011092	GAA	2	6	52512	52517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733815
1004	NC_011092	GA	3	6	52563	52568	50 %	0 %	50 %	0 %	194733815
1005	NC_011092	GAA	2	6	52666	52671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733847
1006	NC_011092	AAAAT	2	10	52675	52684	80 %	20 %	0 %	0 %	194733847
1007	NC_011092	T	6	6	52692	52697	0 %	100 %	0 %	0 %	194733847
1008	NC_011092	AT	3	6	52772	52777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011092	CAC	2	6	52842	52847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_011092	TTTG	2	8	52874	52881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011092	TCT	2	6	52913	52918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011092	CTT	2	6	53078	53083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733840
1013	NC_011092	GTT	2	6	53119	53124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733840
1014	NC_011092	A	6	6	53154	53159	100 %	0 %	0 %	0 %	194733840
1015	NC_011092	A	7	7	53231	53237	100 %	0 %	0 %	0 %	194733840
1016	NC_011092	ACC	2	6	53362	53367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733777
1017	NC_011092	GGA	2	6	53383	53388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194733777
1018	NC_011092	TTTA	2	8	53390	53397	25 %	75 %	0 %	0 %	194733777
1019	NC_011092	TGAT	2	8	53453	53460	25 %	50 %	25 %	0 %	194733777
1020	NC_011092	GAA	2	6	53509	53514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733777
1021	NC_011092	ATTTCT	2	12	53560	53571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	194733777
1022	NC_011092	TTA	2	6	53627	53632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733777
1023	NC_011092	CTA	2	6	53732	53737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733777
1024	NC_011092	ATG	2	6	53773	53778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733777
1025	NC_011092	T	6	6	53782	53787	0 %	100 %	0 %	0 %	194733777
1026	NC_011092	AAAG	2	8	53788	53795	75 %	0 %	25 %	0 %	194733777
1027	NC_011092	TGC	2	6	53799	53804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733777
1028	NC_011092	ATT	2	6	53836	53841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733777
1029	NC_011092	CTT	2	6	53859	53864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733777
1030	NC_011092	AAG	2	6	53921	53926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733777
1031	NC_011092	GCA	2	6	54022	54027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733777
1032	NC_011092	A	6	6	54043	54048	100 %	0 %	0 %	0 %	194733777
1033	NC_011092	ATG	2	6	54071	54076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733777
1034	NC_011092	T	7	7	54129	54135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011092	TAG	2	6	54361	54366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011092	TGTT	2	8	54367	54374	0 %	75 %	25 %	0 %	194733845
1037	NC_011092	AAT	2	6	54385	54390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194733845
1038	NC_011092	ATGT	2	8	54520	54527	25 %	50 %	25 %	0 %	194733845
1039	NC_011092	AGTA	2	8	54534	54541	50 %	25 %	25 %	0 %	194733845
1040	NC_011092	TCG	2	6	54560	54565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733845
1041	NC_011092	CAG	2	6	54603	54608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733845
1042	NC_011092	ACG	2	6	54846	54851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733845
1043	NC_011092	TGA	2	6	54882	54887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733845
1044	NC_011092	GC	3	6	54900	54905	0 %	0 %	50 %	50 %	194733845
1045	NC_011092	GCA	2	6	54960	54965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733845
1046	NC_011092	A	6	6	54988	54993	100 %	0 %	0 %	0 %	194733845
1047	NC_011092	AGC	2	6	55088	55093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011092	CGT	2	6	55132	55137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011092	GCA	2	6	55185	55190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011092	TGGTT	2	10	55195	55204	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011092	T	6	6	55207	55212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011092	GCCGC	2	10	55251	55260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1053	NC_011092	GCG	2	6	55264	55269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011092	TGAA	2	8	55276	55283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011092	AACG	2	8	55369	55376	50 %	0 %	25 %	25 %	194733807
1056	NC_011092	GA	4	8	55489	55496	50 %	0 %	50 %	0 %	194733807
1057	NC_011092	AGCC	2	8	55518	55525	25 %	0 %	25 %	50 %	194733807
1058	NC_011092	ACA	2	6	55532	55537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733807
1059	NC_011092	AACT	2	8	55543	55550	50 %	25 %	0 %	25 %	194733807
1060	NC_011092	CGA	2	6	55587	55592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733807
1061	NC_011092	TTC	2	6	55628	55633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733807
1062	NC_011092	GTG	2	6	55669	55674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011092	GCCGC	2	10	55762	55771	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1064	NC_011092	GCG	2	6	55775	55780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011092	ATT	2	6	55804	55809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194733859
1066	NC_011092	TTC	2	6	55853	55858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733859
1067	NC_011092	TCT	3	9	55887	55895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733859
1068	NC_011092	GCG	2	6	56068	56073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733859
1069	NC_011092	TCC	2	6	56142	56147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194733859
1070	NC_011092	TGGC	2	8	56221	56228	0 %	25 %	50 %	25 %	194733859
1071	NC_011092	ATG	2	6	56307	56312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733859
1072	NC_011092	TCG	2	6	56313	56318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733859
1073	NC_011092	CAA	2	6	56323	56328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733859
1074	NC_011092	CT	3	6	56358	56363	0 %	50 %	0 %	50 %	194733859
1075	NC_011092	CGC	2	6	56406	56411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733859
1076	NC_011092	GTT	2	6	56412	56417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194733859
1077	NC_011092	TCA	2	6	56418	56423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733859
1078	NC_011092	TG	3	6	56461	56466	0 %	50 %	50 %	0 %	194733859
1079	NC_011092	GCC	2	6	56474	56479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733859
1080	NC_011092	ATG	2	6	56595	56600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733859
1081	NC_011092	CCGA	2	8	56619	56626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_011092	TTG	2	6	56661	56666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011092	TC	3	6	56685	56690	0 %	50 %	0 %	50 %	194733791
1084	NC_011092	CAT	2	6	56736	56741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733791
1085	NC_011092	AGAC	2	8	56782	56789	50 %	0 %	25 %	25 %	194733791
1086	NC_011092	GCAA	2	8	57059	57066	50 %	0 %	25 %	25 %	194733791
1087	NC_011092	TCCCAT	2	12	57088	57099	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	194733791
1088	NC_011092	CAG	2	6	57187	57192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733791
1089	NC_011092	AC	3	6	57210	57215	50 %	0 %	0 %	50 %	194733791
1090	NC_011092	TGCC	2	8	57218	57225	0 %	25 %	25 %	50 %	194733791
1091	NC_011092	CAT	2	6	57226	57231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733791
1092	NC_011092	GAA	2	6	57259	57264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733791
1093	NC_011092	GCG	2	6	57278	57283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733791
1094	NC_011092	AGC	2	6	57329	57334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733791
1095	NC_011092	GCT	2	6	57392	57397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733791
1096	NC_011092	CGA	2	6	57462	57467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194733791
1097	NC_011092	CCG	2	6	57489	57494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733791
1098	NC_011092	CAC	2	6	57603	57608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194733791
1099	NC_011092	GAA	2	6	57615	57620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194733791
1100	NC_011092	GCG	2	6	57712	57717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733791
1101	NC_011092	CTG	2	6	57840	57845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733791
1102	NC_011092	AAC	3	9	57893	57901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733791
1103	NC_011092	GGC	2	6	57907	57912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194733791
1104	NC_011092	T	6	6	57935	57940	0 %	100 %	0 %	0 %	194733791
1105	NC_011092	GGC	2	6	57976	57981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011092	CGC	2	6	58012	58017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_011092	AAC	2	6	58018	58023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011092	TGC	2	6	58038	58043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011092	CTG	2	6	58077	58082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011092	TTGAAT	2	12	58095	58106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011092	AAC	2	6	58110	58115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_011092	GCC	2	6	58167	58172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_011092	CAT	2	6	58208	58213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733865
1114	NC_011092	TGA	2	6	58227	58232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733865
1115	NC_011092	TTC	2	6	58258	58263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733865
1116	NC_011092	TCT	2	6	58292	58297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194733865
1117	NC_011092	GCTT	2	8	58313	58320	0 %	50 %	25 %	25 %	194733865
1118	NC_011092	TCC	2	6	58547	58552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194733865
1119	NC_011092	TGGC	2	8	58626	58633	0 %	25 %	50 %	25 %	194733865
1120	NC_011092	GAT	2	6	58711	58716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733865
1121	NC_011092	GTC	2	6	58717	58722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194733865
1122	NC_011092	TCTCGC	2	12	58758	58769	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194733865
1123	NC_011092	CGC	2	6	58811	58816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733865
1124	NC_011092	TCA	2	6	58823	58828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194733865
1125	NC_011092	CAA	2	6	58849	58854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733865
1126	NC_011092	GCC	2	6	58879	58884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733865
1127	NC_011092	ATG	2	6	59000	59005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194733865
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1129	NC_011092	GCG	2	6	59036	59041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1255	NC_011092	CAA	2	6	64973	64978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194733792
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1258	NC_011092	CCG	2	6	65047	65052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733792
1259	NC_011092	CGC	2	6	65090	65095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733792
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1262	NC_011092	CGC	2	6	65194	65199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194733792
1263	NC_011092	TGG	2	6	65287	65292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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