MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_011083	GAA	2	6	184850	184855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194451851
4003	NC_011083	GCG	2	6	184882	184887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451851
4004	NC_011083	TAA	2	6	184926	184931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451851
4005	NC_011083	ATC	2	6	184974	184979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451851
4006	NC_011083	CGC	2	6	185055	185060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451851
4007	NC_011083	CGC	2	6	185125	185130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451851
4008	NC_011083	GC	3	6	185203	185208	0 %	0 %	50 %	50 %	194451851
4009	NC_011083	TCG	2	6	185271	185276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451851
4010	NC_011083	T	7	7	185341	185347	0 %	100 %	0 %	0 %	194451851
4011	NC_011083	ATG	2	6	185352	185357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451851
4012	NC_011083	AAT	2	6	185363	185368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451851
4013	NC_011083	CGT	2	6	185377	185382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451851
4014	NC_011083	A	6	6	185387	185392	100 %	0 %	0 %	0 %	194451851
4015	NC_011083	CTG	2	6	185432	185437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451851
4016	NC_011083	ACA	2	6	185440	185445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451851
4017	NC_011083	GCG	2	6	185457	185462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451851
4018	NC_011083	GGAG	2	8	185527	185534	25 %	0 %	75 %	0 %	194451851
4019	NC_011083	CAG	2	6	185564	185569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451851
4020	NC_011083	TGCG	2	8	185621	185628	0 %	25 %	50 %	25 %	194451851
4021	NC_011083	AGC	3	9	185640	185648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451851
4022	NC_011083	CTGG	2	8	185649	185656	0 %	25 %	50 %	25 %	194451851
4023	NC_011083	CAA	2	6	185704	185709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194451851
4024	NC_011083	A	6	6	185720	185725	100 %	0 %	0 %	0 %	194451851
4025	NC_011083	CAT	2	6	185768	185773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451851
4026	NC_011083	CGC	2	6	185775	185780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451851
4027	NC_011083	ATA	2	6	185790	185795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451851
4028	NC_011083	GCG	2	6	185876	185881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447673
4029	NC_011083	GAT	2	6	185917	185922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447673
4030	NC_011083	GC	4	8	185955	185962	0 %	0 %	50 %	50 %	194447673
4031	NC_011083	CAG	2	6	186086	186091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447673
4032	NC_011083	TTCT	2	8	186099	186106	0 %	75 %	0 %	25 %	194447673
4033	NC_011083	TGG	2	6	186110	186115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447673
4034	NC_011083	CAT	2	6	186176	186181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448896
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4036	NC_011083	GGT	2	6	186298	186303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448896
4037	NC_011083	ATCGC	2	10	186305	186314	20 %	20 %	20 %	40 %	194448896
4038	NC_011083	CAC	2	6	186376	186381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448896
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4040	NC_011083	CTG	2	6	186445	186450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448896
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4042	NC_011083	TGG	2	6	186548	186553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448896
4043	NC_011083	CCG	2	6	186570	186575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448896
4044	NC_011083	CTG	2	6	186583	186588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448896
4045	NC_011083	CGG	2	6	186643	186648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448896
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4047	NC_011083	GCG	2	6	186695	186700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448896
4048	NC_011083	CCAG	2	8	186718	186725	25 %	0 %	25 %	50 %	194448896
4049	NC_011083	CTG	2	6	186727	186732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448896
4050	NC_011083	TAC	2	6	186769	186774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448896
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4052	NC_011083	CAAA	2	8	186936	186943	75 %	0 %	0 %	25 %	194448896
4053	NC_011083	ATA	2	6	187127	187132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011083	TAT	2	6	187144	187149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011083	T	6	6	187193	187198	0 %	100 %	0 %	0 %	194449021
4056	NC_011083	TGA	2	6	187207	187212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449021
4057	NC_011083	TTG	2	6	187217	187222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449021
4058	NC_011083	GAG	2	6	187299	187304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449021
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4060	NC_011083	AT	3	6	187406	187411	50 %	50 %	0 %	0 %	194449021
4061	NC_011083	AGATGA	2	12	187415	187426	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194449021
4062	NC_011083	CTG	2	6	187452	187457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449021
4063	NC_011083	GGGT	2	8	187473	187480	0 %	25 %	75 %	0 %	194449021
4064	NC_011083	GC	3	6	187510	187515	0 %	0 %	50 %	50 %	194449021
4065	NC_011083	AGCA	2	8	187519	187526	50 %	0 %	25 %	25 %	194449021
4066	NC_011083	CG	3	6	187572	187577	0 %	0 %	50 %	50 %	194449021
4067	NC_011083	TGCC	2	8	187608	187615	0 %	25 %	25 %	50 %	194449021
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4077	NC_011083	TGCG	2	8	187992	187999	0 %	25 %	50 %	25 %	194449021
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4094	NC_011083	GTA	2	6	188664	188669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449525
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4106	NC_011083	ATT	2	6	188987	188992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449525
4107	NC_011083	TCCT	2	8	189016	189023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_011083	A	6	6	189047	189052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_011083	TGA	2	6	189201	189206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011083	A	8	8	189213	189220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011083	ATA	2	6	189299	189304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_011083	GC	3	6	189321	189326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4124	NC_011083	GT	3	6	189791	189796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4373	NC_011083	TGG	2	6	201902	201907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448935
4374	NC_011083	GCA	2	6	201926	201931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448935
4375	NC_011083	CAT	2	6	201935	201940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448935
4376	NC_011083	TGG	2	6	202004	202009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448935
4377	NC_011083	GCA	2	6	202127	202132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448935
4378	NC_011083	TTA	2	6	202138	202143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448935
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4382	NC_011083	AACA	2	8	202305	202312	75 %	0 %	0 %	25 %	194448935
4383	NC_011083	ATCCA	2	10	202367	202376	40 %	20 %	0 %	40 %	194448935
4384	NC_011083	TTGCGC	2	12	202392	202403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448935
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4390	NC_011083	AT	3	6	202561	202566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_011083	AAGT	2	8	202583	202590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_011083	CAA	2	6	202620	202625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449593
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4394	NC_011083	CGG	2	6	202643	202648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449593
4395	NC_011083	ACC	2	6	202734	202739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449593
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4402	NC_011083	CGC	2	6	203025	203030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449593
4403	NC_011083	TGA	2	6	203032	203037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449593
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4411	NC_011083	TGG	2	6	203353	203358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449593
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4430	NC_011083	GCT	2	6	204097	204102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451255
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4438	NC_011083	TC	3	6	204405	204410	0 %	50 %	0 %	50 %	194450775
4439	NC_011083	GAATCT	2	12	204414	204425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194450775
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4446	NC_011083	GCT	2	6	204892	204897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450775
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4452	NC_011083	CT	3	6	205304	205309	0 %	50 %	0 %	50 %	194450775
4453	NC_011083	CCTG	2	8	205322	205329	0 %	25 %	25 %	50 %	194450775
4454	NC_011083	TGGTC	2	10	205350	205359	0 %	40 %	40 %	20 %	194450775
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4465	NC_011083	ACC	2	6	205777	205782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194450545
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4482	NC_011083	TCG	2	6	206596	206601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450545
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4484	NC_011083	GAC	2	6	206685	206690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450545
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4490	NC_011083	CGTCA	2	10	207048	207057	20 %	20 %	20 %	40 %	194450545
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4493	NC_011083	TCG	2	6	207188	207193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450545
4494	NC_011083	GCTG	2	8	207206	207213	0 %	25 %	50 %	25 %	194450545
4495	NC_011083	CGG	2	6	207299	207304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450545
4496	NC_011083	TCG	2	6	207466	207471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450545
4497	NC_011083	CCT	2	6	207539	207544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194450545
4498	NC_011083	CGG	2	6	207555	207560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450545
4499	NC_011083	GTT	2	6	207576	207581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450545
4500	NC_011083	GCTG	2	8	207638	207645	0 %	25 %	50 %	25 %	194450545

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