MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_011083	TGC	2	6	115420	115425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449795
2503	NC_011083	CAC	2	6	115524	115529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449795
2504	NC_011083	CGC	2	6	115685	115690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449795
2505	NC_011083	CGG	2	6	115763	115768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449795
2506	NC_011083	TCA	2	6	115825	115830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449795
2507	NC_011083	AAG	2	6	115831	115836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194449795
2508	NC_011083	GGC	2	6	115843	115848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449795
2509	NC_011083	CGG	2	6	115903	115908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449795
2510	NC_011083	GTG	2	6	115924	115929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449795
2511	NC_011083	AGC	2	6	115936	115941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449795
2512	NC_011083	CGG	2	6	115976	115981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449795
2513	NC_011083	GCC	2	6	116052	116057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449795
2514	NC_011083	AGT	2	6	116069	116074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449795
2515	NC_011083	TCG	2	6	116110	116115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449795
2516	NC_011083	CGG	2	6	116126	116131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449795
2517	NC_011083	GCG	2	6	116275	116280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449795
2518	NC_011083	CG	3	6	116333	116338	0 %	0 %	50 %	50 %	194449795
2519	NC_011083	GAT	2	6	116339	116344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449795
2520	NC_011083	GTT	2	6	116355	116360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449795
2521	NC_011083	CTT	2	6	116381	116386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194449795
2522	NC_011083	TGG	2	6	116411	116416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449795
2523	NC_011083	TCG	2	6	116422	116427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449795
2524	NC_011083	GC	3	6	116452	116457	0 %	0 %	50 %	50 %	194449795
2525	NC_011083	CAATTG	2	12	116483	116494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194449795
2526	NC_011083	TCCA	2	8	116507	116514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_011083	AG	3	6	116539	116544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011083	CAGG	2	8	116561	116568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_011083	AATGCT	2	12	116591	116602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2530	NC_011083	TCA	2	6	116743	116748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_011083	GTC	2	6	116779	116784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_011083	TCT	2	6	116808	116813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_011083	G	6	6	116823	116828	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_011083	T	7	7	116937	116943	0 %	100 %	0 %	0 %	194451591
2535	NC_011083	ATCG	2	8	116944	116951	25 %	25 %	25 %	25 %	194451591
2536	NC_011083	AT	3	6	116970	116975	50 %	50 %	0 %	0 %	194451591
2537	NC_011083	TAA	3	9	117009	117017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451591
2538	NC_011083	TGTC	2	8	117030	117037	0 %	50 %	25 %	25 %	194451591
2539	NC_011083	AT	3	6	117047	117052	50 %	50 %	0 %	0 %	194451591
2540	NC_011083	CCG	2	6	117061	117066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451591
2541	NC_011083	TCA	2	6	117075	117080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451591
2542	NC_011083	GC	3	6	117211	117216	0 %	0 %	50 %	50 %	194451591
2543	NC_011083	ATC	2	6	117247	117252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451591
2544	NC_011083	CTG	2	6	117301	117306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451591
2545	NC_011083	GTT	2	6	117312	117317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451591
2546	NC_011083	TAAT	2	8	117335	117342	50 %	50 %	0 %	0 %	194451591
2547	NC_011083	CCG	2	6	117355	117360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451591
2548	NC_011083	TGCC	2	8	117381	117388	0 %	25 %	25 %	50 %	194451591
2549	NC_011083	CAG	2	6	117487	117492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451591
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2551	NC_011083	ATG	2	6	117692	117697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_011083	TCA	2	6	117781	117786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2554	NC_011083	CTG	2	6	117812	117817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451052
2555	NC_011083	CGCTGG	2	12	117885	117896	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194451052
2556	NC_011083	GC	3	6	117939	117944	0 %	0 %	50 %	50 %	194451052
2557	NC_011083	GCG	2	6	117954	117959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451052
2558	NC_011083	CTGG	2	8	117979	117986	0 %	25 %	50 %	25 %	194451052
2559	NC_011083	TAT	2	6	117991	117996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451052
2560	NC_011083	CTGG	2	8	118027	118034	0 %	25 %	50 %	25 %	194451052
2561	NC_011083	GCT	2	6	118090	118095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451052
2562	NC_011083	CGA	2	6	118164	118169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451052
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2566	NC_011083	GCT	3	9	118339	118347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451052
2567	NC_011083	TGC	2	6	118359	118364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451052
2568	NC_011083	GGCT	2	8	118376	118383	0 %	25 %	50 %	25 %	194451052
2569	NC_011083	GGC	2	6	118389	118394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451052
2570	NC_011083	TGG	2	6	118500	118505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451052
2571	NC_011083	TA	3	6	118533	118538	50 %	50 %	0 %	0 %	194451052
2572	NC_011083	TAG	2	6	118663	118668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447680
2573	NC_011083	TTGCC	2	10	118679	118688	0 %	40 %	20 %	40 %	194447680
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2581	NC_011083	GCTG	2	8	118998	119005	0 %	25 %	50 %	25 %	194447680
2582	NC_011083	TGC	2	6	119048	119053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447680
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2585	NC_011083	TCG	2	6	119132	119137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447680
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2588	NC_011083	CGC	2	6	119241	119246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447680
2589	NC_011083	ATG	2	6	119278	119283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447680
2590	NC_011083	ATCA	2	8	119299	119306	50 %	25 %	0 %	25 %	194447680
2591	NC_011083	AGCAG	2	10	119356	119365	40 %	0 %	40 %	20 %	194449238
2592	NC_011083	CAG	3	9	119363	119371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449238
2593	NC_011083	CTG	2	6	119417	119422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449238
2594	NC_011083	CGA	2	6	119470	119475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449238
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2598	NC_011083	CAG	2	6	119852	119857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449238
2599	NC_011083	CAT	2	6	119858	119863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449238
2600	NC_011083	CAC	2	6	119870	119875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449238
2601	NC_011083	AC	3	6	119874	119879	50 %	0 %	0 %	50 %	194449238
2602	NC_011083	CGCC	2	8	119884	119891	0 %	0 %	25 %	75 %	194449238
2603	NC_011083	ACC	2	6	119979	119984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449238
2604	NC_011083	GCG	2	6	119995	120000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449238
2605	NC_011083	AGC	5	15	120003	120017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449238
2606	NC_011083	TAA	2	6	120029	120034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449238
2607	NC_011083	CGTC	2	8	120037	120044	0 %	25 %	25 %	50 %	194449238
2608	NC_011083	GCGTCA	2	12	120085	120096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194449238
2609	NC_011083	GCA	2	6	120149	120154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449238
2610	NC_011083	CGC	2	6	120179	120184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449238
2611	NC_011083	GCGG	2	8	120185	120192	0 %	0 %	75 %	25 %	194449238
2612	NC_011083	GTG	2	6	120237	120242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449238
2613	NC_011083	GCC	3	9	120251	120259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449238
2614	NC_011083	GGC	2	6	120328	120333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449238
2615	NC_011083	A	6	6	120360	120365	100 %	0 %	0 %	0 %	194449238
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2617	NC_011083	GCT	2	6	120403	120408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449238
2618	NC_011083	GCA	2	6	120433	120438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449238
2619	NC_011083	A	6	6	120464	120469	100 %	0 %	0 %	0 %	194449238
2620	NC_011083	GCCA	2	8	120546	120553	25 %	0 %	25 %	50 %	194449238
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2622	NC_011083	GC	3	6	120670	120675	0 %	0 %	50 %	50 %	194449238
2623	NC_011083	CCG	2	6	120688	120693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449238
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2739	NC_011083	CGGCG	2	10	125745	125754	0 %	0 %	60 %	40 %	194448813
2740	NC_011083	TGCCGA	2	12	125837	125848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194448813
2741	NC_011083	GTGG	2	8	125871	125878	0 %	25 %	75 %	0 %	194448813
2742	NC_011083	CGC	2	6	125891	125896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448813
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2990	NC_011083	CAT	2	6	138580	138585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450364
2991	NC_011083	GCG	2	6	138588	138593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450364
2992	NC_011083	A	7	7	138639	138645	100 %	0 %	0 %	0 %	194450364
2993	NC_011083	TAAT	2	8	138654	138661	50 %	50 %	0 %	0 %	194450364
2994	NC_011083	CTT	2	6	138702	138707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194449143
2995	NC_011083	GTGG	2	8	138713	138720	0 %	25 %	75 %	0 %	194449143
2996	NC_011083	CG	3	6	138731	138736	0 %	0 %	50 %	50 %	194449143
2997	NC_011083	GA	3	6	138745	138750	50 %	0 %	50 %	0 %	194449143
2998	NC_011083	GCG	2	6	138774	138779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449143
2999	NC_011083	GTG	2	6	138798	138803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449143
3000	NC_011083	TCA	2	6	138806	138811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449143

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