MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011083	AGT	2	6	45975	45980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448790
1002	NC_011083	GCA	2	6	46050	46055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448790
1003	NC_011083	GGC	2	6	46100	46105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448790
1004	NC_011083	GGC	2	6	46277	46282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448790
1005	NC_011083	TGT	2	6	46297	46302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448790
1006	NC_011083	GCCA	2	8	46308	46315	25 %	0 %	25 %	50 %	194448790
1007	NC_011083	CAT	2	6	46316	46321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448790
1008	NC_011083	CGC	2	6	46324	46329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448790
1009	NC_011083	CAG	2	6	46343	46348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448790
1010	NC_011083	AAG	2	6	46389	46394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448790
1011	NC_011083	GAT	2	6	46403	46408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448790
1012	NC_011083	TCG	2	6	46423	46428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448790
1013	NC_011083	ATA	2	6	46481	46486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448790
1014	NC_011083	GCT	2	6	46504	46509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448790
1015	NC_011083	AGA	2	6	46522	46527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448790
1016	NC_011083	CGC	2	6	46574	46579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448790
1017	NC_011083	T	7	7	46585	46591	0 %	100 %	0 %	0 %	194448790
1018	NC_011083	GC	3	6	46666	46671	0 %	0 %	50 %	50 %	194448790
1019	NC_011083	TAAA	2	8	46701	46708	75 %	25 %	0 %	0 %	194448790
1020	NC_011083	ATC	2	6	46718	46723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448790
1021	NC_011083	A	6	6	46734	46739	100 %	0 %	0 %	0 %	194448790
1022	NC_011083	TAA	2	6	46769	46774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448790
1023	NC_011083	TCA	2	6	46840	46845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448790
1024	NC_011083	GTG	2	6	46864	46869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448790
1025	NC_011083	TGC	2	6	46913	46918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448790
1026	NC_011083	GC	3	6	46966	46971	0 %	0 %	50 %	50 %	194448790
1027	NC_011083	GAC	2	6	47011	47016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448790
1028	NC_011083	GAT	3	9	47045	47053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448790
1029	NC_011083	ATA	2	6	47082	47087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448790
1030	NC_011083	CAG	3	9	47093	47101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448790
1031	NC_011083	CAG	2	6	47180	47185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448790
1032	NC_011083	GTA	2	6	47224	47229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448790
1033	NC_011083	ATG	2	6	47236	47241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448790
1034	NC_011083	AAC	2	6	47319	47324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011083	ATT	2	6	47351	47356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011083	AGTA	2	8	47394	47401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011083	AGT	2	6	47416	47421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011083	ATCA	2	8	47434	47441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_011083	ATT	2	6	47442	47447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011083	TTA	2	6	47470	47475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011083	GGT	2	6	47508	47513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011083	T	6	6	47519	47524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011083	GAAA	2	8	47554	47561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011083	TAT	2	6	47574	47579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011083	AGGG	2	8	47587	47594	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011083	A	6	6	47602	47607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011083	GCT	2	6	47611	47616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011083	A	7	7	47684	47690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011083	TTG	2	6	47747	47752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448125
1050	NC_011083	AGC	2	6	47812	47817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448125
1051	NC_011083	GCA	2	6	47861	47866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448125
1052	NC_011083	TGA	2	6	47904	47909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448125
1053	NC_011083	CAT	2	6	47917	47922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448125
1054	NC_011083	GC	3	6	47969	47974	0 %	0 %	50 %	50 %	194448125
1055	NC_011083	CTT	2	6	48064	48069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011083	GCA	2	6	48108	48113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_011083	GCG	2	6	48194	48199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_011083	TCT	2	6	48239	48244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011083	CATA	2	8	48346	48353	50 %	25 %	0 %	25 %	194448015
1060	NC_011083	TCAG	2	8	48357	48364	25 %	25 %	25 %	25 %	194448015
1061	NC_011083	GT	3	6	48376	48381	0 %	50 %	50 %	0 %	194448015
1062	NC_011083	GAA	2	6	48446	48451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448015
1063	NC_011083	GGT	3	9	48472	48480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448015
1064	NC_011083	GCCC	2	8	48529	48536	0 %	0 %	25 %	75 %	194448015
1065	NC_011083	GCG	2	6	48579	48584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448015
1066	NC_011083	TGTGC	2	10	48592	48601	0 %	40 %	40 %	20 %	194448015
1067	NC_011083	CGC	2	6	48614	48619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448015
1068	NC_011083	CTG	2	6	48656	48661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448015
1069	NC_011083	GAT	2	6	48698	48703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448015
1070	NC_011083	TTA	2	6	48740	48745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448015
1071	NC_011083	GGC	2	6	48803	48808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448015
1072	NC_011083	AGT	2	6	48818	48823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448015
1073	NC_011083	GGA	2	6	48847	48852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194448015
1074	NC_011083	CTG	2	6	48875	48880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448015
1075	NC_011083	CGA	2	6	48919	48924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448015
1076	NC_011083	TGGC	2	8	49071	49078	0 %	25 %	50 %	25 %	194448015
1077	NC_011083	CAA	2	6	49085	49090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448015
1078	NC_011083	CTG	2	6	49103	49108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448015
1079	NC_011083	AGC	2	6	49173	49178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448015
1080	NC_011083	TGA	2	6	49192	49197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448015
1081	NC_011083	T	6	6	49241	49246	0 %	100 %	0 %	0 %	194448015
1082	NC_011083	TGA	2	6	49310	49315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447430
1083	NC_011083	GCG	2	6	49364	49369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447430
1084	NC_011083	GAT	3	9	49411	49419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447430
1085	NC_011083	CAT	2	6	49428	49433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447430
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1087	NC_011083	A	7	7	49453	49459	100 %	0 %	0 %	0 %	194447430
1088	NC_011083	ATG	2	6	49472	49477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447430
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1091	NC_011083	CAT	2	6	49803	49808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447430
1092	NC_011083	CG	3	6	49810	49815	0 %	0 %	50 %	50 %	194447430
1093	NC_011083	GCGGAA	2	12	49897	49908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	194447430
1094	NC_011083	ACC	2	6	50032	50037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447430
1095	NC_011083	GAC	2	6	50332	50337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1096	NC_011083	CTG	2	6	50467	50472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1097	NC_011083	GC	3	6	50483	50488	0 %	0 %	50 %	50 %	194447430
1098	NC_011083	A	6	6	50501	50506	100 %	0 %	0 %	0 %	194447430
1099	NC_011083	GCA	2	6	50508	50513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1100	NC_011083	CG	3	6	50557	50562	0 %	0 %	50 %	50 %	194447430
1101	NC_011083	AAG	2	6	50591	50596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447430
1102	NC_011083	GCT	2	6	50763	50768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1103	NC_011083	GGC	2	6	50787	50792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447430
1104	NC_011083	GTG	2	6	50838	50843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447430
1105	NC_011083	GTTTG	2	10	50914	50923	0 %	60 %	40 %	0 %	194447430
1106	NC_011083	CCA	2	6	50933	50938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447430
1107	NC_011083	TGC	2	6	50979	50984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447430
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1109	NC_011083	TGA	2	6	51038	51043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447430
1110	NC_011083	CGC	2	6	51152	51157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447430
1111	NC_011083	TGA	2	6	51164	51169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447430
1112	NC_011083	TGC	2	6	51258	51263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1113	NC_011083	TCG	2	6	51273	51278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1114	NC_011083	CG	3	6	51291	51296	0 %	0 %	50 %	50 %	194447430
1115	NC_011083	CTG	2	6	51301	51306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1116	NC_011083	TGG	2	6	51359	51364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447430
1117	NC_011083	GCA	2	6	51402	51407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1118	NC_011083	CAT	2	6	51504	51509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447430
1119	NC_011083	CG	3	6	51546	51551	0 %	0 %	50 %	50 %	194447430
1120	NC_011083	TGA	2	6	51630	51635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447430
1121	NC_011083	ACG	2	6	51692	51697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1122	NC_011083	GTT	2	6	51699	51704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447430
1123	NC_011083	GAA	2	6	51721	51726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447430
1124	NC_011083	CAA	2	6	51774	51779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447430
1125	NC_011083	AAG	2	6	51871	51876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447430
1126	NC_011083	G	6	6	51945	51950	0 %	0 %	100 %	0 %	194447430
1127	NC_011083	TGA	3	9	51954	51962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447430
1128	NC_011083	GCT	2	6	52037	52042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447430
1129	NC_011083	CACTA	2	10	52045	52054	40 %	20 %	0 %	40 %	194447430
1130	NC_011083	AAC	2	6	52127	52132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447430
1131	NC_011083	TGA	2	6	52144	52149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447430
1132	NC_011083	GTA	2	6	52191	52196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449317
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1136	NC_011083	TGA	2	6	52399	52404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449317
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1142	NC_011083	AGCGC	2	10	52691	52700	20 %	0 %	40 %	40 %	194448653
1143	NC_011083	GTG	2	6	52713	52718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448653
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1163	NC_011083	TGG	2	6	53905	53910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449983
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1246	NC_011083	T	7	7	58020	58026	0 %	100 %	0 %	0 %	194448113
1247	NC_011083	GCG	2	6	58027	58032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448113
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1249	NC_011083	TGG	2	6	58065	58070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448113
1250	NC_011083	GCG	2	6	58118	58123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448113
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1253	NC_011083	GCG	2	6	58277	58282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448113
1254	NC_011083	ACA	2	6	58291	58296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448113
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