MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_011083	TGG	2	6	4884586	4884591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450553
103002	NC_011083	GAT	2	6	4884707	4884712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450553
103003	NC_011083	TTA	2	6	4884720	4884725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450553
103004	NC_011083	TTG	2	6	4884736	4884741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103005	NC_011083	TA	3	6	4884774	4884779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103006	NC_011083	AAATA	2	10	4884780	4884789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103007	NC_011083	CTT	2	6	4884811	4884816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103008	NC_011083	TCTGT	2	10	4884817	4884826	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103009	NC_011083	GGC	2	6	4884836	4884841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103010	NC_011083	TAA	2	6	4884928	4884933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103011	NC_011083	AAG	2	6	4884944	4884949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103012	NC_011083	TGA	2	6	4884956	4884961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103013	NC_011083	T	6	6	4884985	4884990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103014	NC_011083	ATA	2	6	4884992	4884997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103015	NC_011083	ATT	3	9	4884998	4885006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103016	NC_011083	GGA	2	6	4885011	4885016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103017	NC_011083	TTTA	2	8	4885017	4885024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103018	NC_011083	ACG	2	6	4885054	4885059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103019	NC_011083	TA	3	6	4885123	4885128	50 %	50 %	0 %	0 %	194451135
103020	NC_011083	CTG	2	6	4885189	4885194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451135
103021	NC_011083	TCA	2	6	4885370	4885375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451135
103022	NC_011083	ATA	2	6	4885408	4885413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451135
103023	NC_011083	GGT	2	6	4885420	4885425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451135
103024	NC_011083	A	6	6	4885435	4885440	100 %	0 %	0 %	0 %	194451135
103025	NC_011083	TCT	2	6	4885454	4885459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451135
103026	NC_011083	GATT	2	8	4885586	4885593	25 %	50 %	25 %	0 %	194451135
103027	NC_011083	T	7	7	4885688	4885694	0 %	100 %	0 %	0 %	194451135
103028	NC_011083	CCG	2	6	4885721	4885726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451135
103029	NC_011083	ATT	2	6	4885750	4885755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103030	NC_011083	CAA	2	6	4885840	4885845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103031	NC_011083	TGA	2	6	4885922	4885927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103032	NC_011083	AGCGA	2	10	4885999	4886008	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103033	NC_011083	GGA	2	6	4886023	4886028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103034	NC_011083	GA	3	6	4886036	4886041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103035	NC_011083	GGCG	2	8	4886057	4886064	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103036	NC_011083	CGC	2	6	4886084	4886089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103037	NC_011083	CTC	2	6	4886099	4886104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103038	NC_011083	CGG	2	6	4886106	4886111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103039	NC_011083	GAT	2	6	4886160	4886165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103040	NC_011083	TCA	2	6	4886202	4886207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103041	NC_011083	ATT	2	6	4886257	4886262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103042	NC_011083	AGC	2	6	4886368	4886373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103043	NC_011083	TGA	2	6	4886383	4886388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103044	NC_011083	AGC	2	6	4886415	4886420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103045	NC_011083	T	6	6	4886431	4886436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103046	NC_011083	T	6	6	4886475	4886480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103047	NC_011083	AGG	2	6	4886608	4886613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103048	NC_011083	CGC	2	6	4886720	4886725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450106
103049	NC_011083	TGG	2	6	4886750	4886755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450106
103050	NC_011083	GAT	2	6	4886757	4886762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450106
103051	NC_011083	ACG	2	6	4886802	4886807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450106
103052	NC_011083	TTC	2	6	4886860	4886865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194450106
103053	NC_011083	CG	3	6	4886919	4886924	0 %	0 %	50 %	50 %	194450106
103054	NC_011083	ACG	2	6	4887027	4887032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450106
103055	NC_011083	CAG	2	6	4887069	4887074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450106
103056	NC_011083	ATC	2	6	4887126	4887131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450106
103057	NC_011083	AG	3	6	4887291	4887296	50 %	0 %	50 %	0 %	194450106
103058	NC_011083	CAT	2	6	4887335	4887340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450106
103059	NC_011083	CCTG	2	8	4887477	4887484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103060	NC_011083	CAA	2	6	4887565	4887570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103061	NC_011083	CAT	2	6	4887571	4887576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103062	NC_011083	TAA	2	6	4887682	4887687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103063	NC_011083	AT	3	6	4887705	4887710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103064	NC_011083	TGA	2	6	4887739	4887744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103065	NC_011083	ATC	2	6	4887746	4887751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103066	NC_011083	TCA	2	6	4887770	4887775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103067	NC_011083	TAA	2	6	4887813	4887818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103068	NC_011083	TGA	2	6	4887822	4887827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103069	NC_011083	TAAAT	2	10	4887850	4887859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103070	NC_011083	TAAA	2	8	4887865	4887872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103071	NC_011083	CAG	2	6	4887873	4887878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103072	NC_011083	GCC	2	6	4888112	4888117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450554
103073	NC_011083	ATT	2	6	4888217	4888222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450554
103074	NC_011083	ATA	2	6	4888224	4888229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450554
103075	NC_011083	CGA	2	6	4888284	4888289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450554
103076	NC_011083	TAC	2	6	4888316	4888321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194450554
103077	NC_011083	TTA	2	6	4888346	4888351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194450554
103078	NC_011083	GCTGGC	2	12	4888426	4888437	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194450554
103079	NC_011083	GGC	2	6	4888462	4888467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450554
103080	NC_011083	TGA	2	6	4888564	4888569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450554
103081	NC_011083	CG	4	8	4888589	4888596	0 %	0 %	50 %	50 %	194450554
103082	NC_011083	GGC	2	6	4888624	4888629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450554
103083	NC_011083	TGA	2	6	4888630	4888635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450554
103084	NC_011083	ACA	2	6	4888657	4888662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450554
103085	NC_011083	CTG	2	6	4888673	4888678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450554
103086	NC_011083	A	8	8	4888725	4888732	100 %	0 %	0 %	0 %	194450554
103087	NC_011083	ATA	2	6	4888763	4888768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.