MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011083	TGC	2	6	22433	22438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449860
502	NC_011083	GCT	2	6	22647	22652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449860
503	NC_011083	CGCC	2	8	22655	22662	0 %	0 %	25 %	75 %	194449860
504	NC_011083	GGC	2	6	22681	22686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449860
505	NC_011083	AGA	2	6	22701	22706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194449860
506	NC_011083	CGG	2	6	22743	22748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449860
507	NC_011083	T	6	6	22753	22758	0 %	100 %	0 %	0 %	194449860
508	NC_011083	CT	3	6	22795	22800	0 %	50 %	0 %	50 %	194449860
509	NC_011083	GGT	2	6	22948	22953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449860
510	NC_011083	CTA	2	6	22955	22960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449860
511	NC_011083	CGG	2	6	22995	23000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449860
512	NC_011083	CTGG	2	8	23001	23008	0 %	25 %	50 %	25 %	194449860
513	NC_011083	TAT	2	6	23026	23031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449860
514	NC_011083	GCT	2	6	23032	23037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449860
515	NC_011083	ATA	2	6	23052	23057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449860
516	NC_011083	GC	3	6	23105	23110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_011083	TTA	2	6	23167	23172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011083	TCTTAA	2	12	23204	23215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_011083	TTAT	2	8	23266	23273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011083	A	7	7	23339	23345	100 %	0 %	0 %	0 %	194450804
521	NC_011083	TGA	2	6	23346	23351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450804
522	NC_011083	ACG	2	6	23352	23357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450804
523	NC_011083	ATA	2	6	23370	23375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194450804
524	NC_011083	CTTTT	2	10	23394	23403	0 %	80 %	0 %	20 %	194450804
525	NC_011083	T	6	6	23400	23405	0 %	100 %	0 %	0 %	194450804
526	NC_011083	CAG	2	6	23408	23413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450804
527	NC_011083	TTG	2	6	23453	23458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450804
528	NC_011083	TTTA	2	8	23499	23506	25 %	75 %	0 %	0 %	194450804
529	NC_011083	GTT	2	6	23549	23554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194450804
530	NC_011083	ATG	2	6	23565	23570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450804
531	NC_011083	AT	3	6	23583	23588	50 %	50 %	0 %	0 %	194450804
532	NC_011083	CG	3	6	23653	23658	0 %	0 %	50 %	50 %	194450804
533	NC_011083	ACG	2	6	23754	23759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450804
534	NC_011083	TGA	2	6	23790	23795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194450804
535	NC_011083	GC	4	8	23796	23803	0 %	0 %	50 %	50 %	194450804
536	NC_011083	GCT	2	6	23848	23853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450804
537	NC_011083	TCTG	2	8	23956	23963	0 %	50 %	25 %	25 %	194450804
538	NC_011083	A	7	7	23968	23974	100 %	0 %	0 %	0 %	194450804
539	NC_011083	GGC	2	6	24000	24005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450804
540	NC_011083	AT	3	6	24057	24062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011083	TAA	2	6	24096	24101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011083	GTT	2	6	24117	24122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011083	A	6	6	24137	24142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011083	GAT	2	6	24233	24238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011083	TAA	2	6	24260	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011083	TAA	2	6	24267	24272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011083	ACG	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011083	AAG	2	6	24354	24359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011083	T	7	7	24364	24370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011083	GAA	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011083	CAG	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011083	A	6	6	24426	24431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011083	TGAA	2	8	24467	24474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011083	ATC	2	6	24518	24523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011083	CAT	2	6	24553	24558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448112
556	NC_011083	TGC	2	6	24735	24740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448112
557	NC_011083	TGCA	2	8	24749	24756	25 %	25 %	25 %	25 %	194448112
558	NC_011083	CAC	2	6	24862	24867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448112
559	NC_011083	CAT	2	6	24868	24873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448112
560	NC_011083	AGC	2	6	24894	24899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448112
561	NC_011083	GCTG	2	8	24936	24943	0 %	25 %	50 %	25 %	194448112
562	NC_011083	ATG	2	6	24959	24964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448112
563	NC_011083	TGG	2	6	24978	24983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448112
564	NC_011083	CCA	2	6	24987	24992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448112
565	NC_011083	AGC	2	6	25026	25031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448112
566	NC_011083	CAC	2	6	25138	25143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194448112
567	NC_011083	GAG	2	6	25193	25198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194448112
568	NC_011083	GAG	2	6	25244	25249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194448112
569	NC_011083	AGC	2	6	25311	25316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448112
570	NC_011083	CAT	2	6	25396	25401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448112
571	NC_011083	GCT	2	6	25441	25446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448112
572	NC_011083	GA	3	6	25523	25528	50 %	0 %	50 %	0 %	194448112
573	NC_011083	GAA	2	6	25564	25569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011083	A	6	6	25607	25612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011083	GAA	2	6	25626	25631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011083	GAA	2	6	25654	25659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011083	TGT	2	6	25721	25726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447857
578	NC_011083	TAC	2	6	25743	25748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447857
579	NC_011083	CGGTA	2	10	25761	25770	20 %	20 %	40 %	20 %	194447857
580	NC_011083	CGC	2	6	25794	25799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447857
581	NC_011083	CTGTT	2	10	25800	25809	0 %	60 %	20 %	20 %	194447857
582	NC_011083	TGG	2	6	25880	25885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447857
583	NC_011083	AGA	2	6	25896	25901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447857
584	NC_011083	CCAG	2	8	25937	25944	25 %	0 %	25 %	50 %	194447857
585	NC_011083	GCG	2	6	25948	25953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447857
586	NC_011083	CGA	2	6	26024	26029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447857
587	NC_011083	T	7	7	26225	26231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011083	CG	3	6	26264	26269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_011083	A	8	8	26315	26322	100 %	0 %	0 %	0 %	448967568
590	NC_011083	ATT	2	6	26341	26346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967568
591	NC_011083	CTG	2	6	26351	26356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967568
592	NC_011083	CGG	2	6	26358	26363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967568
593	NC_011083	CCT	2	6	26445	26450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448967568
594	NC_011083	ATT	2	6	26456	26461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967568
595	NC_011083	TTC	2	6	26464	26469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967568
596	NC_011083	T	7	7	26481	26487	0 %	100 %	0 %	0 %	448967568
597	NC_011083	CGC	2	6	26544	26549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967568
598	NC_011083	CT	3	6	26550	26555	0 %	50 %	0 %	50 %	448967568
599	NC_011083	A	6	6	26570	26575	100 %	0 %	0 %	0 %	448967568
600	NC_011083	AT	3	6	26580	26585	50 %	50 %	0 %	0 %	448967568
601	NC_011083	TAT	2	6	26590	26595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448967568
602	NC_011083	ACCG	2	8	26614	26621	25 %	0 %	25 %	50 %	448967568
603	NC_011083	TATTT	2	10	26634	26643	20 %	80 %	0 %	0 %	448967568
604	NC_011083	AAAT	2	8	26674	26681	75 %	25 %	0 %	0 %	448967568
605	NC_011083	TAC	2	6	26831	26836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967568
606	NC_011083	A	6	6	26867	26872	100 %	0 %	0 %	0 %	448967568
607	NC_011083	CCG	2	6	26891	26896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967568
608	NC_011083	ACG	2	6	26966	26971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967568
609	NC_011083	ATG	2	6	26995	27000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967568
610	NC_011083	TCTG	2	8	27131	27138	0 %	50 %	25 %	25 %	194449449
611	NC_011083	GGC	2	6	27188	27193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
612	NC_011083	GAC	2	6	27269	27274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
613	NC_011083	GC	3	6	27283	27288	0 %	0 %	50 %	50 %	194449449
614	NC_011083	GCCT	2	8	27312	27319	0 %	25 %	25 %	50 %	194449449
615	NC_011083	TTG	2	6	27369	27374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449449
616	NC_011083	GGC	3	9	27380	27388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
617	NC_011083	GCC	2	6	27423	27428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449449
618	NC_011083	GCA	2	6	27449	27454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
619	NC_011083	GGC	2	6	27479	27484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
620	NC_011083	GGC	2	6	27597	27602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
621	NC_011083	ACT	2	6	27670	27675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449449
622	NC_011083	GCG	2	6	27694	27699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
623	NC_011083	AGCGAC	2	12	27708	27719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
624	NC_011083	GCA	2	6	27722	27727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
625	NC_011083	ATT	2	6	27806	27811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449449
626	NC_011083	CCTT	2	8	27818	27825	0 %	50 %	0 %	50 %	194449449
627	NC_011083	GAC	2	6	27849	27854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449449
628	NC_011083	CAT	2	6	27947	27952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449449
629	NC_011083	GCC	2	6	27968	27973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449449
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631	NC_011083	GCG	2	6	28015	28020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449449
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