MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011083	A	6	6	253512	253517	100 %	0 %	0 %	0 %	194450352
5502	NC_011083	CAG	2	6	253542	253547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450352
5503	NC_011083	GTG	2	6	253621	253626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450352
5504	NC_011083	TATT	2	8	253634	253641	25 %	75 %	0 %	0 %	194450352
5505	NC_011083	C	6	6	253707	253712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5506	NC_011083	TGCTC	2	10	253785	253794	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5507	NC_011083	AGG	2	6	253797	253802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011083	TGGC	3	12	253809	253820	0 %	25 %	50 %	25 %	194448090
5509	NC_011083	GC	3	6	253853	253858	0 %	0 %	50 %	50 %	194448090
5510	NC_011083	CAT	2	6	253867	253872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448090
5511	NC_011083	GCG	2	6	253920	253925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448090
5512	NC_011083	GC	3	6	253956	253961	0 %	0 %	50 %	50 %	194448090
5513	NC_011083	CGA	2	6	253996	254001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448090
5514	NC_011083	GT	3	6	254129	254134	0 %	50 %	50 %	0 %	194448090
5515	NC_011083	ATG	2	6	254147	254152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448090
5516	NC_011083	TGA	2	6	254214	254219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448090
5517	NC_011083	GAA	2	6	254234	254239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448090
5518	NC_011083	TGG	2	6	254253	254258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448090
5519	NC_011083	GGC	2	6	254302	254307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448090
5520	NC_011083	GGT	2	6	254308	254313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448090
5521	NC_011083	CAG	2	6	254363	254368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448090
5522	NC_011083	AAC	2	6	254399	254404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448090
5523	NC_011083	TC	3	6	254420	254425	0 %	50 %	0 %	50 %	194448090
5524	NC_011083	TGG	2	6	254433	254438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194448090
5525	NC_011083	ATC	2	6	254484	254489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194448090
5526	NC_011083	AGC	2	6	254502	254507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448090
5527	NC_011083	CCGGG	2	10	254571	254580	0 %	0 %	60 %	40 %	194448090
5528	NC_011083	GC	3	6	254606	254611	0 %	0 %	50 %	50 %	194448090
5529	NC_011083	GAT	2	6	254617	254622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448090
5530	NC_011083	TGC	2	6	254676	254681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448090
5531	NC_011083	GGC	2	6	254705	254710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448090
5532	NC_011083	GC	3	6	254729	254734	0 %	0 %	50 %	50 %	194448090
5533	NC_011083	AAC	2	6	254762	254767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448090
5534	NC_011083	TTA	2	6	254771	254776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194448090
5535	NC_011083	CGG	2	6	254969	254974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_011083	AT	3	6	255000	255005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011083	AC	3	6	255045	255050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_011083	CGA	2	6	255107	255112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451409
5539	NC_011083	GTC	2	6	255132	255137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451409
5540	NC_011083	CTT	2	6	255236	255241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451409
5541	NC_011083	CCA	2	6	255266	255271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451409
5542	NC_011083	CTT	2	6	255368	255373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194451409
5543	NC_011083	CGAT	2	8	255388	255395	25 %	25 %	25 %	25 %	194451409
5544	NC_011083	CATA	2	8	255434	255441	50 %	25 %	0 %	25 %	194451409
5545	NC_011083	TCA	2	6	255452	255457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_011083	AAT	2	6	255472	255477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_011083	CCA	2	6	255499	255504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_011083	A	7	7	255513	255519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_011083	AGA	2	6	255534	255539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_011083	GCG	2	6	255567	255572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_011083	CTA	2	6	255706	255711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449138
5552	NC_011083	GTG	2	6	255720	255725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449138
5553	NC_011083	TAT	2	6	255769	255774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449138
5554	NC_011083	GC	3	6	255787	255792	0 %	0 %	50 %	50 %	194449138
5555	NC_011083	T	7	7	255808	255814	0 %	100 %	0 %	0 %	194449138
5556	NC_011083	TCT	2	6	255846	255851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194449138
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5558	NC_011083	T	6	6	255900	255905	0 %	100 %	0 %	0 %	194449138
5559	NC_011083	TTA	2	6	255942	255947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194449138
5560	NC_011083	G	6	6	255957	255962	0 %	0 %	100 %	0 %	194449138
5561	NC_011083	TGCC	2	8	255990	255997	0 %	25 %	25 %	50 %	194449138
5562	NC_011083	GC	3	6	256015	256020	0 %	0 %	50 %	50 %	194449138
5563	NC_011083	TGC	2	6	256112	256117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449138
5564	NC_011083	GC	3	6	256141	256146	0 %	0 %	50 %	50 %	194449138
5565	NC_011083	AGG	2	6	256157	256162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194449138
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5577	NC_011083	CGA	2	6	256492	256497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449138
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5579	NC_011083	CAT	2	6	256583	256588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449138
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5581	NC_011083	GCT	2	6	256667	256672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449138
5582	NC_011083	TGA	2	6	256693	256698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194449138
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5585	NC_011083	T	6	6	256760	256765	0 %	100 %	0 %	0 %	194449138
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5591	NC_011083	CG	3	6	257289	257294	0 %	0 %	50 %	50 %	194449938
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5594	NC_011083	CGC	2	6	257365	257370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449938
5595	NC_011083	GC	3	6	257398	257403	0 %	0 %	50 %	50 %	194449938
5596	NC_011083	ACG	2	6	257532	257537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449938
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5603	NC_011083	GC	3	6	257722	257727	0 %	0 %	50 %	50 %	194449938
5604	NC_011083	CGGCG	2	10	257800	257809	0 %	0 %	60 %	40 %	194449938
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5607	NC_011083	AC	3	6	257873	257878	50 %	0 %	0 %	50 %	194448092
5608	NC_011083	GTT	2	6	257916	257921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194448092
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5612	NC_011083	TCT	2	6	257984	257989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448092
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5615	NC_011083	TGGG	2	8	258122	258129	0 %	25 %	75 %	0 %	194448092
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5624	NC_011083	GCA	2	6	258600	258605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448092
5625	NC_011083	ACGC	2	8	258631	258638	25 %	0 %	25 %	50 %	194448092
5626	NC_011083	TGA	2	6	258828	258833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448092
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5871	NC_011083	GAA	2	6	270686	270691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447664
5872	NC_011083	GTG	2	6	270727	270732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447664
5873	NC_011083	CGT	2	6	270736	270741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447664
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5875	NC_011083	CTA	2	6	270799	270804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447664
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5877	NC_011083	CG	3	6	271074	271079	0 %	0 %	50 %	50 %	194447664
5878	NC_011083	CTT	2	6	271294	271299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447664
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5881	NC_011083	CAG	2	6	271448	271453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447664
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5883	NC_011083	TCT	2	6	271581	271586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447664
5884	NC_011083	GAT	2	6	271604	271609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447664
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5891	NC_011083	TAC	2	6	271922	271927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447664
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5893	NC_011083	GGC	2	6	272024	272029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447664
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5935	NC_011083	TTA	2	6	274230	274235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5978	NC_011083	CTG	2	6	276465	276470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450186
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5982	NC_011083	TGG	2	6	276729	276734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447841
5983	NC_011083	CCG	3	9	276747	276755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447841
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5985	NC_011083	A	6	6	276800	276805	100 %	0 %	0 %	0 %	194447841
5986	NC_011083	CGT	2	6	276818	276823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447841
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5988	NC_011083	TGA	2	6	276895	276900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447841
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5991	NC_011083	GTG	2	6	277025	277030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447841
5992	NC_011083	GCG	2	6	277061	277066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447841
5993	NC_011083	GGC	2	6	277102	277107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447841
5994	NC_011083	GCA	2	6	277141	277146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447841
5995	NC_011083	CAC	2	6	277205	277210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447841
5996	NC_011083	ACT	2	6	277322	277327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194449006
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6000	NC_011083	GGC	2	6	277542	277547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449006

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