MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 chromosome

Total Repeats: 103087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011083	TATTGA	2	12	207824	207835	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	194450545
4502	NC_011083	CG	3	6	207950	207955	0 %	0 %	50 %	50 %	194450545
4503	NC_011083	TGC	2	6	207977	207982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450545
4504	NC_011083	AC	3	6	207993	207998	50 %	0 %	0 %	50 %	194450545
4505	NC_011083	AGCGC	2	10	207999	208008	20 %	0 %	40 %	40 %	194450545
4506	NC_011083	ATAA	2	8	208010	208017	75 %	25 %	0 %	0 %	194450545
4507	NC_011083	GTTT	2	8	208077	208084	0 %	75 %	25 %	0 %	194448854
4508	NC_011083	TGA	2	6	208114	208119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448854
4509	NC_011083	GGC	3	9	208142	208150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448854
4510	NC_011083	ATA	2	6	208241	208246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448854
4511	NC_011083	TTC	2	6	208257	208262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194448854
4512	NC_011083	ATCG	2	8	208297	208304	25 %	25 %	25 %	25 %	194448854
4513	NC_011083	GT	3	6	208381	208386	0 %	50 %	50 %	0 %	194448854
4514	NC_011083	TGC	2	6	208405	208410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448854
4515	NC_011083	CCAG	2	8	208429	208436	25 %	0 %	25 %	50 %	194448854
4516	NC_011083	GCC	2	6	208466	208471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448854
4517	NC_011083	GTA	2	6	208486	208491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448854
4518	NC_011083	GCG	2	6	208522	208527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448854
4519	NC_011083	CGC	2	6	208549	208554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194448854
4520	NC_011083	CAA	2	6	208719	208724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194448854
4521	NC_011083	TGA	2	6	208754	208759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_011083	CCA	2	6	208792	208797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_011083	GCGG	2	8	208876	208883	0 %	0 %	75 %	25 %	194451718
4524	NC_011083	CTG	2	6	208914	208919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451718
4525	NC_011083	GTG	2	6	208970	208975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451718
4526	NC_011083	TCG	2	6	209007	209012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451718
4527	NC_011083	CAC	2	6	209016	209021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451718
4528	NC_011083	GC	3	6	209071	209076	0 %	0 %	50 %	50 %	194451718
4529	NC_011083	CTG	2	6	209084	209089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451718
4530	NC_011083	AG	3	6	209165	209170	50 %	0 %	50 %	0 %	194451718
4531	NC_011083	GTT	2	6	209207	209212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451718
4532	NC_011083	GCG	2	6	209282	209287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451718
4533	NC_011083	AGTG	2	8	209317	209324	25 %	25 %	50 %	0 %	194451718
4534	NC_011083	GAT	2	6	209448	209453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_011083	GGC	2	6	209457	209462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_011083	GAA	2	6	209465	209470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_011083	AT	4	8	209504	209511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_011083	ATT	2	6	209519	209524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_011083	GTTT	2	8	209533	209540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_011083	GCT	2	6	209587	209592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449917
4541	NC_011083	AAT	2	6	209605	209610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449917
4542	NC_011083	T	6	6	209617	209622	0 %	100 %	0 %	0 %	194449917
4543	NC_011083	A	6	6	209627	209632	100 %	0 %	0 %	0 %	194449917
4544	NC_011083	GT	3	6	209647	209652	0 %	50 %	50 %	0 %	194449917
4545	NC_011083	A	7	7	209661	209667	100 %	0 %	0 %	0 %	194449917
4546	NC_011083	CAT	2	6	209676	209681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_011083	GGA	2	6	209700	209705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_011083	AAG	2	6	209775	209780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448364
4549	NC_011083	ATG	2	6	209850	209855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448364
4550	NC_011083	TG	3	6	209854	209859	0 %	50 %	50 %	0 %	194448364
4551	NC_011083	CGGCG	2	10	209915	209924	0 %	0 %	60 %	40 %	194448364
4552	NC_011083	GTCGC	2	10	209934	209943	0 %	20 %	40 %	40 %	194448364
4553	NC_011083	TGA	2	6	209944	209949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448364
4554	NC_011083	GAA	2	6	210003	210008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194448364
4555	NC_011083	GC	3	6	210070	210075	0 %	0 %	50 %	50 %	194448364
4556	NC_011083	CAG	3	9	210099	210107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194448364
4557	NC_011083	TGC	2	6	210127	210132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194448364
4558	NC_011083	GAC	2	6	210164	210169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_011083	T	6	6	210191	210196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_011083	AT	3	6	210210	210215	50 %	50 %	0 %	0 %	194451211
4561	NC_011083	GTT	2	6	210226	210231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194451211
4562	NC_011083	ACG	2	6	210295	210300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451211
4563	NC_011083	GCC	2	6	210307	210312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451211
4564	NC_011083	ATT	2	6	210398	210403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451211
4565	NC_011083	TGG	2	6	210593	210598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451211
4566	NC_011083	ATT	2	6	210616	210621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451211
4567	NC_011083	GGCT	2	8	210677	210684	0 %	25 %	50 %	25 %	194451211
4568	NC_011083	ATC	2	6	210737	210742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194451211
4569	NC_011083	TGA	2	6	210753	210758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194451211
4570	NC_011083	CCA	2	6	210785	210790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451211
4571	NC_011083	TTCGG	2	10	210795	210804	0 %	40 %	40 %	20 %	194451211
4572	NC_011083	GGA	2	6	210870	210875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194451211
4573	NC_011083	CG	3	6	210889	210894	0 %	0 %	50 %	50 %	194451211
4574	NC_011083	GC	4	8	210904	210911	0 %	0 %	50 %	50 %	194451211
4575	NC_011083	GGT	2	6	210912	210917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194451211
4576	NC_011083	TAT	2	6	211002	211007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194451211
4577	NC_011083	T	6	6	211122	211127	0 %	100 %	0 %	0 %	194451211
4578	NC_011083	CGC	2	6	211147	211152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194451211
4579	NC_011083	TA	3	6	211160	211165	50 %	50 %	0 %	0 %	194451211
4580	NC_011083	ATA	2	6	211178	211183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194451211
4581	NC_011083	CA	3	6	211218	211223	50 %	0 %	0 %	50 %	194451211
4582	NC_011083	TCTT	2	8	211245	211252	0 %	75 %	0 %	25 %	194451211
4583	NC_011083	GGC	2	6	211261	211266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194451211
4584	NC_011083	AGC	2	6	211287	211292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194451211
4585	NC_011083	CAC	2	6	211320	211325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194451211
4586	NC_011083	TGC	2	6	211361	211366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194451211
4587	NC_011083	GCTTT	2	10	211522	211531	0 %	60 %	20 %	20 %	194447392
4588	NC_011083	ACGCCG	2	12	211641	211652	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194447392
4589	NC_011083	ACGA	2	8	211734	211741	50 %	0 %	25 %	25 %	194447392
4590	NC_011083	GGT	2	6	211790	211795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447392
4591	NC_011083	GGT	2	6	211841	211846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447392
4592	NC_011083	GAATG	2	10	211877	211886	40 %	20 %	40 %	0 %	194447392
4593	NC_011083	CAT	2	6	211892	211897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447392
4594	NC_011083	GCC	2	6	211976	211981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447392
4595	NC_011083	TAA	2	6	211990	211995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447392
4596	NC_011083	T	8	8	212060	212067	0 %	100 %	0 %	0 %	194447392
4597	NC_011083	GTC	2	6	212090	212095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447392
4598	NC_011083	ATA	2	6	212111	212116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447392
4599	NC_011083	AAC	2	6	212208	212213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447392
4600	NC_011083	TC	3	6	212269	212274	0 %	50 %	0 %	50 %	194447392
4601	NC_011083	CAT	2	6	212275	212280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447392
4602	NC_011083	CAG	2	6	212339	212344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447392
4603	NC_011083	CAA	2	6	212468	212473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447392
4604	NC_011083	TCA	2	6	212503	212508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447392
4605	NC_011083	CAAC	2	8	212535	212542	50 %	0 %	0 %	50 %	194447892
4606	NC_011083	CGC	2	6	212559	212564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447892
4607	NC_011083	GC	3	6	212590	212595	0 %	0 %	50 %	50 %	194447892
4608	NC_011083	CGT	2	6	212643	212648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447892
4609	NC_011083	GCGCC	2	10	212727	212736	0 %	0 %	40 %	60 %	194447892
4610	NC_011083	TGT	2	6	212737	212742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447892
4611	NC_011083	CAT	2	6	212745	212750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447892
4612	NC_011083	GCG	2	6	212790	212795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447892
4613	NC_011083	GCC	2	6	212866	212871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447892
4614	NC_011083	TCG	2	6	212876	212881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447892
4615	NC_011083	CTG	2	6	212897	212902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447892
4616	NC_011083	CGT	2	6	212904	212909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447892
4617	NC_011083	C	7	7	212952	212958	0 %	0 %	0 %	100 %	194447892
4618	NC_011083	CCCG	2	8	213052	213059	0 %	0 %	25 %	75 %	194447892
4619	NC_011083	CAA	2	6	213150	213155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194449800
4620	NC_011083	CGG	2	6	213180	213185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449800
4621	NC_011083	CCA	2	6	213213	213218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449800
4622	NC_011083	GGTA	2	8	213237	213244	25 %	25 %	50 %	0 %	194449800
4623	NC_011083	CCT	2	6	213267	213272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194449800
4624	NC_011083	TGG	2	6	213280	213285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449800
4625	NC_011083	CGC	2	6	213321	213326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449800
4626	NC_011083	GCC	2	6	213397	213402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449800
4627	NC_011083	T	6	6	213530	213535	0 %	100 %	0 %	0 %	194449800
4628	NC_011083	ACG	2	6	213548	213553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449800
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4630	NC_011083	ATG	2	6	213796	213801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194448245
4631	NC_011083	CCAGA	2	10	213843	213852	40 %	0 %	20 %	40 %	194448245
4632	NC_011083	CGG	2	6	213863	213868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194448245
4633	NC_011083	TAA	2	6	213875	213880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194448245
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4635	NC_011083	TA	3	6	213924	213929	50 %	50 %	0 %	0 %	194448245
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4644	NC_011083	CAC	2	6	214435	214440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449944
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4654	NC_011083	GTC	2	6	214918	214923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449944
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4656	NC_011083	GCT	2	6	215011	215016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449944
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4666	NC_011083	GTT	2	6	215758	215763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194449944
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4670	NC_011083	TGC	2	6	215910	215915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449944
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4678	NC_011083	TCATA	2	10	216381	216390	40 %	40 %	0 %	20 %	194449944
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4687	NC_011083	GCT	2	6	216778	216783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449944
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4690	NC_011083	CTG	3	9	216843	216851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194449944
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4719	NC_011083	AG	3	6	218527	218532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4720	NC_011083	T	7	7	218577	218583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4721	NC_011083	TAT	2	6	218601	218606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4722	NC_011083	ATAA	2	8	218619	218626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4723	NC_011083	ATA	2	6	218630	218635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4724	NC_011083	TTAT	2	8	218636	218643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4725	NC_011083	A	8	8	218653	218660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4726	NC_011083	TAT	2	6	218702	218707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4731	NC_011083	CTT	2	6	219097	219102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4732	NC_011083	GGC	3	9	219243	219251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194449309
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4735	NC_011083	GGCAAT	2	12	219357	219368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194449309
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4739	NC_011083	AAT	2	6	219510	219515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194449309
4740	NC_011083	CGA	2	6	219524	219529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194449309
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4742	NC_011083	CGC	2	6	219656	219661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194449309
4743	NC_011083	AG	3	6	219699	219704	50 %	0 %	50 %	0 %	194449309
4744	NC_011083	ACGT	2	8	219718	219725	25 %	25 %	25 %	25 %	194449309
4745	NC_011083	CAC	2	6	219891	219896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194449309
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4747	NC_011083	TGG	2	6	219956	219961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194449309
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4867	NC_011083	GC	4	8	225640	225647	0 %	0 %	50 %	50 %	194451129
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4991	NC_011083	GTC	2	6	230620	230625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194450105
4992	NC_011083	GAC	2	6	230691	230696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450105
4993	NC_011083	ACA	2	6	230699	230704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450105
4994	NC_011083	AAC	2	6	230770	230775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194450105
4995	NC_011083	CGA	2	6	230780	230785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450105
4996	NC_011083	GCG	2	6	230801	230806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194450105
4997	NC_011083	GACGCC	2	12	230841	230852	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194450105
4998	NC_011083	CGC	2	6	230864	230869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194450105
4999	NC_011083	TGG	2	6	230879	230884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194450105
5000	NC_011083	ACG	2	6	230900	230905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194450105

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