MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_91

Total Repeats: 1829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011081	GCA	2	6	74378	74383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447281
1502	NC_011081	GAA	2	6	74413	74418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447281
1503	NC_011081	TG	3	6	74477	74482	0 %	50 %	50 %	0 %	194447281
1504	NC_011081	CAT	2	6	74551	74556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447281
1505	NC_011081	GAA	2	6	74559	74564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447281
1506	NC_011081	GTGA	2	8	74598	74605	25 %	25 %	50 %	0 %	194447281
1507	NC_011081	ACA	2	6	74724	74729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447281
1508	NC_011081	T	7	7	74735	74741	0 %	100 %	0 %	0 %	194447281
1509	NC_011081	TTC	2	6	74767	74772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447281
1510	NC_011081	GGA	2	6	74800	74805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194447281
1511	NC_011081	AACG	2	8	74958	74965	50 %	0 %	25 %	25 %	194447281
1512	NC_011081	TGTA	2	8	74970	74977	25 %	50 %	25 %	0 %	194447281
1513	NC_011081	GTT	2	6	74990	74995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447281
1514	NC_011081	A	6	6	75169	75174	100 %	0 %	0 %	0 %	194447281
1515	NC_011081	CAA	2	6	75181	75186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447281
1516	NC_011081	ATC	3	9	75223	75231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_011081	AC	3	6	75279	75284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_011081	AC	3	6	75414	75419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_011081	CTTG	2	8	75447	75454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_011081	CGCA	2	8	75515	75522	25 %	0 %	25 %	50 %	194447179
1521	NC_011081	CCG	2	6	75595	75600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447179
1522	NC_011081	TAT	2	6	75743	75748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447179
1523	NC_011081	ATG	2	6	75776	75781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447179
1524	NC_011081	CCG	2	6	75868	75873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447179
1525	NC_011081	TTG	2	6	75886	75891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447179
1526	NC_011081	AGCC	2	8	75952	75959	25 %	0 %	25 %	50 %	194447179
1527	NC_011081	AACC	2	8	75979	75986	50 %	0 %	0 %	50 %	194447179
1528	NC_011081	ATT	2	6	75987	75992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447179
1529	NC_011081	CAC	2	6	76232	76237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447179
1530	NC_011081	AT	3	6	76354	76359	50 %	50 %	0 %	0 %	194447179
1531	NC_011081	CCA	2	6	76360	76365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447179
1532	NC_011081	CCA	2	6	76423	76428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447179
1533	NC_011081	GTA	2	6	76448	76453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447179
1534	NC_011081	GTT	2	6	76579	76584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447179
1535	NC_011081	TAC	2	6	76589	76594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447179
1536	NC_011081	TA	3	6	76623	76628	50 %	50 %	0 %	0 %	194447179
1537	NC_011081	TTTG	2	8	76684	76691	0 %	75 %	25 %	0 %	194447179
1538	NC_011081	T	6	6	76788	76793	0 %	100 %	0 %	0 %	194447179
1539	NC_011081	CAG	2	6	76829	76834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447294
1540	NC_011081	CTT	2	6	76876	76881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447294
1541	NC_011081	TCC	2	6	76922	76927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447294
1542	NC_011081	AC	4	8	76939	76946	50 %	0 %	0 %	50 %	194447294
1543	NC_011081	TA	3	6	76957	76962	50 %	50 %	0 %	0 %	194447294
1544	NC_011081	GCA	2	6	77064	77069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447294
1545	NC_011081	TGT	2	6	77081	77086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447294
1546	NC_011081	ACC	2	6	77092	77097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447294
1547	NC_011081	AT	3	6	77098	77103	50 %	50 %	0 %	0 %	194447294
1548	NC_011081	A	6	6	77136	77141	100 %	0 %	0 %	0 %	194447294
1549	NC_011081	TAA	2	6	77162	77167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447294
1550	NC_011081	GTG	2	6	77242	77247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447294
1551	NC_011081	ATG	2	6	77248	77253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447294
1552	NC_011081	AAT	2	6	77258	77263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447294
1553	NC_011081	CAG	2	6	77305	77310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447294
1554	NC_011081	GT	3	6	77312	77317	0 %	50 %	50 %	0 %	194447294
1555	NC_011081	A	6	6	77346	77351	100 %	0 %	0 %	0 %	194447294
1556	NC_011081	AAT	2	6	77381	77386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447294
1557	NC_011081	TA	3	6	77411	77416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011081	TGCC	2	8	77453	77460	0 %	25 %	25 %	50 %	194447269
1559	NC_011081	CT	3	6	77527	77532	0 %	50 %	0 %	50 %	194447269
1560	NC_011081	TGTC	2	8	77540	77547	0 %	50 %	25 %	25 %	194447269
1561	NC_011081	T	6	6	77675	77680	0 %	100 %	0 %	0 %	194447269
1562	NC_011081	T	7	7	77763	77769	0 %	100 %	0 %	0 %	194447269
1563	NC_011081	TTAT	2	8	77774	77781	25 %	75 %	0 %	0 %	194447269
1564	NC_011081	AAT	3	9	77831	77839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447269
1565	NC_011081	GC	4	8	77854	77861	0 %	0 %	50 %	50 %	194447269
1566	NC_011081	TTG	2	6	77888	77893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447269
1567	NC_011081	CGGG	2	8	77927	77934	0 %	0 %	75 %	25 %	194447269
1568	NC_011081	A	6	6	77946	77951	100 %	0 %	0 %	0 %	194447269
1569	NC_011081	GTTT	2	8	78030	78037	0 %	75 %	25 %	0 %	194447198
1570	NC_011081	TGC	2	6	78045	78050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447198
1571	NC_011081	CTT	2	6	78078	78083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447198
1572	NC_011081	AGT	2	6	78085	78090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447198
1573	NC_011081	GTTA	2	8	78133	78140	25 %	50 %	25 %	0 %	194447198
1574	NC_011081	GTT	2	6	78217	78222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447198
1575	NC_011081	CTG	2	6	78368	78373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447198
1576	NC_011081	TTGT	2	8	78426	78433	0 %	75 %	25 %	0 %	194447198
1577	NC_011081	ACGCA	2	10	78469	78478	40 %	0 %	20 %	40 %	194447198
1578	NC_011081	AAC	2	6	78493	78498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447198
1579	NC_011081	AAC	2	6	78514	78519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447198
1580	NC_011081	TTC	2	6	78572	78577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447198
1581	NC_011081	TTA	2	6	78578	78583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194447198
1582	NC_011081	CTA	2	6	78612	78617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447198
1583	NC_011081	TGT	2	6	78656	78661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447184
1584	NC_011081	GA	3	6	78705	78710	50 %	0 %	50 %	0 %	194447184
1585	NC_011081	TAA	2	6	78834	78839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447184
1586	NC_011081	GCT	2	6	78853	78858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447184
1587	NC_011081	GAT	2	6	78905	78910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447184
1588	NC_011081	AAT	2	6	78930	78935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447184
1589	NC_011081	GAA	2	6	78977	78982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447184
1590	NC_011081	CGT	2	6	78999	79004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447184
1591	NC_011081	CAC	2	6	79232	79237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447184
1592	NC_011081	TCA	2	6	79310	79315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447184
1593	NC_011081	GTG	2	6	79390	79395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447184
1594	NC_011081	CTT	2	6	79426	79431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447184
1595	NC_011081	AG	3	6	79492	79497	50 %	0 %	50 %	0 %	194447184
1596	NC_011081	CAG	2	6	79632	79637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447184
1597	NC_011081	TGT	2	6	79736	79741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447184
1598	NC_011081	CAT	2	6	79754	79759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447225
1599	NC_011081	GAT	2	6	79791	79796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447225
1600	NC_011081	GAA	2	6	79841	79846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447225
1601	NC_011081	CCAG	2	8	79880	79887	25 %	0 %	25 %	50 %	194447225
1602	NC_011081	TGC	2	6	79896	79901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447225
1603	NC_011081	CGT	2	6	80024	80029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447225
1604	NC_011081	TGA	2	6	80050	80055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447225
1605	NC_011081	TCG	3	9	80125	80133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447225
1606	NC_011081	AGG	2	6	80171	80176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194447225
1607	NC_011081	GCTG	2	8	80198	80205	0 %	25 %	50 %	25 %	194447225
1608	NC_011081	ATC	2	6	80206	80211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447225
1609	NC_011081	TGTA	2	8	80295	80302	25 %	50 %	25 %	0 %	194447225
1610	NC_011081	GTC	2	6	80305	80310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447225
1611	NC_011081	GGT	2	6	80340	80345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447225
1612	NC_011081	CAT	2	6	80349	80354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447225
1613	NC_011081	ATG	2	6	80383	80388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447225
1614	NC_011081	TCG	2	6	80452	80457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447225
1615	NC_011081	GCG	2	6	80634	80639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447225
1616	NC_011081	GTT	2	6	80684	80689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194447225
1617	NC_011081	GC	3	6	80817	80822	0 %	0 %	50 %	50 %	194447225
1618	NC_011081	GAA	2	6	80841	80846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447225
1619	NC_011081	TCT	2	6	81041	81046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447225
1620	NC_011081	AAT	2	6	81081	81086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447225
1621	NC_011081	CCT	2	6	81125	81130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447225
1622	NC_011081	ACT	2	6	81148	81153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447225
1623	NC_011081	AGC	2	6	81181	81186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447225
1624	NC_011081	GTTT	2	8	81225	81232	0 %	75 %	25 %	0 %	194447225
1625	NC_011081	GTG	2	6	81326	81331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447193
1626	NC_011081	GCTG	2	8	81393	81400	0 %	25 %	50 %	25 %	194447193
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1628	NC_011081	GAA	2	6	81438	81443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447193
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.