MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011080	C	6	6	164178	164183	0 %	0 %	0 %	100 %	194444422
3502	NC_011080	GAC	2	6	164185	164190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444422
3503	NC_011080	ACG	2	6	164216	164221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444422
3504	NC_011080	GCA	2	6	164385	164390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3505	NC_011080	CGT	2	6	164397	164402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3506	NC_011080	GATCA	2	10	164464	164473	40 %	20 %	20 %	20 %	194443863
3507	NC_011080	TGT	2	6	164549	164554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443863
3508	NC_011080	GCC	2	6	164599	164604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443863
3509	NC_011080	GCT	2	6	164655	164660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3510	NC_011080	CCG	2	6	164694	164699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443863
3511	NC_011080	CTG	2	6	164707	164712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3512	NC_011080	GCT	2	6	164775	164780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3513	NC_011080	CAG	2	6	164797	164802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443863
3514	NC_011080	A	6	6	164858	164863	100 %	0 %	0 %	0 %	194443863
3515	NC_011080	TCT	2	6	164946	164951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443863
3516	NC_011080	TTA	2	6	165082	165087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443064
3517	NC_011080	GC	3	6	165114	165119	0 %	0 %	50 %	50 %	194443064
3518	NC_011080	CG	3	6	165161	165166	0 %	0 %	50 %	50 %	194443064
3519	NC_011080	CAT	2	6	165170	165175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443064
3520	NC_011080	CGTCA	2	10	165210	165219	20 %	20 %	20 %	40 %	194443064
3521	NC_011080	ACC	2	6	165220	165225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443064
3522	NC_011080	CAG	2	6	165264	165269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443064
3523	NC_011080	CTG	2	6	165327	165332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443064
3524	NC_011080	TTC	2	6	165369	165374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443064
3525	NC_011080	A	6	6	165383	165388	100 %	0 %	0 %	0 %	194443064
3526	NC_011080	CGG	2	6	165425	165430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443064
3527	NC_011080	GGGC	2	8	165470	165477	0 %	0 %	75 %	25 %	194443064
3528	NC_011080	GC	3	6	165498	165503	0 %	0 %	50 %	50 %	194443064
3529	NC_011080	ATA	2	6	165505	165510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443064
3530	NC_011080	CCG	2	6	165580	165585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443064
3531	NC_011080	CTA	2	6	165691	165696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_011080	A	7	7	165728	165734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_011080	GAA	2	6	165843	165848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443094
3534	NC_011080	CTG	2	6	166051	166056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443094
3535	NC_011080	A	6	6	166165	166170	100 %	0 %	0 %	0 %	194443094
3536	NC_011080	TCG	2	6	166255	166260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443094
3537	NC_011080	ACG	2	6	166392	166397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443094
3538	NC_011080	CGG	2	6	166432	166437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
3539	NC_011080	GGC	2	6	166470	166475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
3540	NC_011080	GGC	2	6	166491	166496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
3541	NC_011080	CGG	3	9	166529	166537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
3542	NC_011080	AG	3	6	166580	166585	50 %	0 %	50 %	0 %	194443094
3543	NC_011080	CGG	2	6	166586	166591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
3544	NC_011080	AGA	2	6	166601	166606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443094
3545	NC_011080	CGG	2	6	166670	166675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
3546	NC_011080	CG	3	6	166689	166694	0 %	0 %	50 %	50 %	194443094
3547	NC_011080	CCGC	2	8	166744	166751	0 %	0 %	25 %	75 %	194443094
3548	NC_011080	GGC	2	6	166761	166766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443094
3549	NC_011080	CAC	2	6	166823	166828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443094
3550	NC_011080	CTGG	2	8	166882	166889	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_011080	ATCCC	2	10	166910	166919	20 %	20 %	0 %	60 %	194444325
3552	NC_011080	CCA	3	9	166961	166969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444325
3553	NC_011080	TGA	2	6	166991	166996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444325
3554	NC_011080	GCCAGC	2	12	167035	167046	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194444325
3555	NC_011080	GCA	2	6	167078	167083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444325
3556	NC_011080	T	6	6	167155	167160	0 %	100 %	0 %	0 %	194444325
3557	NC_011080	GAA	2	6	167267	167272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444325
3558	NC_011080	AGA	2	6	167368	167373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444325
3559	NC_011080	CGCTGC	2	12	167374	167385	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194444325
3560	NC_011080	GCC	2	6	167467	167472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444325
3561	NC_011080	C	6	6	167471	167476	0 %	0 %	0 %	100 %	194444325
3562	NC_011080	ATA	2	6	167491	167496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444325
3563	NC_011080	CG	3	6	167498	167503	0 %	0 %	50 %	50 %	194444325
3564	NC_011080	AGA	2	6	167506	167511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444325
3565	NC_011080	GGC	2	6	167541	167546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444325
3566	NC_011080	GCA	2	6	167567	167572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444325
3567	NC_011080	GGC	2	6	167589	167594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444325
3568	NC_011080	AAT	2	6	167604	167609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444325
3569	NC_011080	AGCGC	2	10	167618	167627	20 %	0 %	40 %	40 %	194444325
3570	NC_011080	AGC	2	6	167684	167689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444325
3571	NC_011080	ATC	2	6	167725	167730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444325
3572	NC_011080	GCG	2	6	167741	167746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444325
3573	NC_011080	ATGA	2	8	167895	167902	50 %	25 %	25 %	0 %	194444325
3574	NC_011080	TGA	2	6	167914	167919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444325
3575	NC_011080	CTT	2	6	167939	167944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444325
3576	NC_011080	GCG	2	6	167953	167958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444325
3577	NC_011080	TGA	2	6	168011	168016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444325
3578	NC_011080	TGCC	2	8	168340	168347	0 %	25 %	25 %	50 %	194443188
3579	NC_011080	GC	3	6	168357	168362	0 %	0 %	50 %	50 %	194443188
3580	NC_011080	CAC	2	6	168385	168390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443188
3581	NC_011080	ACC	2	6	168449	168454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443188
3582	NC_011080	ATC	2	6	168473	168478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443188
3583	NC_011080	TGC	2	6	168497	168502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443188
3584	NC_011080	TGG	2	6	168522	168527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443188
3585	NC_011080	GCC	2	6	168569	168574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443188
3586	NC_011080	ATG	3	9	168620	168628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443188
3587	NC_011080	GC	4	8	168648	168655	0 %	0 %	50 %	50 %	194443188
3588	NC_011080	GGAT	2	8	168686	168693	25 %	25 %	50 %	0 %	194443188
3589	NC_011080	GC	3	6	168780	168785	0 %	0 %	50 %	50 %	194443188
3590	NC_011080	CAA	2	6	168931	168936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443188
3591	NC_011080	GAC	2	6	168943	168948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443188
3592	NC_011080	CTT	2	6	168957	168962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443188
3593	NC_011080	GAA	2	6	169128	169133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443188
3594	NC_011080	GAT	2	6	169299	169304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443188
3595	NC_011080	CA	3	6	169328	169333	50 %	0 %	0 %	50 %	194443188
3596	NC_011080	ACC	2	6	169397	169402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443188
3597	NC_011080	TGA	2	6	169445	169450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443188
3598	NC_011080	TGAGC	2	10	169467	169476	20 %	20 %	40 %	20 %	194443188
3599	NC_011080	TGT	2	6	169532	169537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442571
3600	NC_011080	CCAG	2	8	169573	169580	25 %	0 %	25 %	50 %	194442571
3601	NC_011080	GGCG	2	8	169603	169610	0 %	0 %	75 %	25 %	194442571
3602	NC_011080	ATG	2	6	169613	169618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442571
3603	NC_011080	TGA	2	6	169656	169661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442571
3604	NC_011080	TGA	2	6	169698	169703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442571
3605	NC_011080	CGCAT	2	10	169729	169738	20 %	20 %	20 %	40 %	194442571
3606	NC_011080	CCA	2	6	169748	169753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442571
3607	NC_011080	CGG	2	6	169776	169781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442571
3608	NC_011080	GAT	2	6	169876	169881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442571
3609	NC_011080	GTT	2	6	169920	169925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442571
3610	NC_011080	TGC	2	6	170030	170035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_011080	ACG	2	6	170089	170094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_011080	GA	3	6	170170	170175	50 %	0 %	50 %	0 %	194444228
3613	NC_011080	GC	4	8	170180	170187	0 %	0 %	50 %	50 %	194444228
3614	NC_011080	GC	3	6	170201	170206	0 %	0 %	50 %	50 %	194444228
3615	NC_011080	ATA	2	6	170350	170355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444228
3616	NC_011080	CGAAC	2	10	170458	170467	40 %	0 %	20 %	40 %	194444228
3617	NC_011080	GAT	2	6	170475	170480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444228
3618	NC_011080	GAT	2	6	170522	170527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444228
3619	NC_011080	GCC	3	9	170532	170540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444228
3620	NC_011080	GCCA	2	8	170616	170623	25 %	0 %	25 %	50 %	194444228
3621	NC_011080	GCG	2	6	170637	170642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444228
3622	NC_011080	GTTCA	2	10	170724	170733	20 %	40 %	20 %	20 %	194444228
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3871	NC_011080	GGT	2	6	182328	182333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444897
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3989	NC_011080	ACC	2	6	186587	186592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445597
3990	NC_011080	TGA	2	6	186615	186620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445597
3991	NC_011080	TGG	3	9	186654	186662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445597
3992	NC_011080	TTG	2	6	186663	186668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445597
3993	NC_011080	CGG	2	6	186675	186680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445597
3994	NC_011080	TGC	2	6	186716	186721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445597
3995	NC_011080	GAGC	2	8	186750	186757	25 %	0 %	50 %	25 %	194445597
3996	NC_011080	CATC	2	8	186777	186784	25 %	25 %	0 %	50 %	194445597
3997	NC_011080	TGGC	2	8	186905	186912	0 %	25 %	50 %	25 %	194445597
3998	NC_011080	CGC	2	6	187138	187143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445597
3999	NC_011080	CA	3	6	187214	187219	50 %	0 %	0 %	50 %	194445597
4000	NC_011080	TC	3	6	187259	187264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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