MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011080	AAT	2	6	141195	141200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_011080	ATT	2	6	141205	141210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011080	T	6	6	141233	141238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_011080	CTTT	2	8	141244	141251	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_011080	TTGTT	2	10	141308	141317	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_011080	TCG	2	6	141334	141339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_011080	CGG	2	6	141513	141518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011080	T	7	7	141530	141536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_011080	T	6	6	141618	141623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011080	CTTG	2	8	141643	141650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_011080	TCC	2	6	141660	141665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_011080	AAG	2	6	141710	141715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011080	G	6	6	141736	141741	0 %	0 %	100 %	0 %	194442600
3014	NC_011080	CATC	2	8	141845	141852	25 %	25 %	0 %	50 %	194442600
3015	NC_011080	CTG	2	6	141861	141866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442600
3016	NC_011080	CCTG	2	8	141875	141882	0 %	25 %	25 %	50 %	194442600
3017	NC_011080	ATT	2	6	141891	141896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442600
3018	NC_011080	GATG	2	8	141983	141990	25 %	25 %	50 %	0 %	194442600
3019	NC_011080	AAG	2	6	142045	142050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442600
3020	NC_011080	CAA	2	6	142070	142075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442600
3021	NC_011080	GAT	2	6	142188	142193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443193
3022	NC_011080	AC	3	6	142206	142211	50 %	0 %	0 %	50 %	194443193
3023	NC_011080	CGG	2	6	142290	142295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443193
3024	NC_011080	CGAT	2	8	142346	142353	25 %	25 %	25 %	25 %	194443193
3025	NC_011080	CAT	2	6	142407	142412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443193
3026	NC_011080	TCT	2	6	142501	142506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443193
3027	NC_011080	GCC	2	6	142594	142599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443193
3028	NC_011080	CGG	2	6	142613	142618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443193
3029	NC_011080	AGG	2	6	142619	142624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443193
3030	NC_011080	GAG	2	6	142657	142662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443193
3031	NC_011080	TTG	2	6	142691	142696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443193
3032	NC_011080	GCTG	2	8	142734	142741	0 %	25 %	50 %	25 %	194443193
3033	NC_011080	GCG	3	9	142750	142758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443193
3034	NC_011080	GGA	2	6	142836	142841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443193
3035	NC_011080	GCTC	2	8	142862	142869	0 %	25 %	25 %	50 %	194443193
3036	NC_011080	GGCG	2	8	142885	142892	0 %	0 %	75 %	25 %	194443193
3037	NC_011080	ATC	2	6	142900	142905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443193
3038	NC_011080	CGG	2	6	142976	142981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443193
3039	NC_011080	A	6	6	143008	143013	100 %	0 %	0 %	0 %	194443193
3040	NC_011080	AGTTC	2	10	143092	143101	20 %	40 %	20 %	20 %	194443193
3041	NC_011080	AG	3	6	143112	143117	50 %	0 %	50 %	0 %	194443193
3042	NC_011080	CAG	2	6	143132	143137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446206
3043	NC_011080	TGCCT	2	10	143192	143201	0 %	40 %	20 %	40 %	194446206
3044	NC_011080	CAT	2	6	143261	143266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446206
3045	NC_011080	CGG	2	6	143272	143277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446206
3046	NC_011080	GGT	2	6	143282	143287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446206
3047	NC_011080	ACG	2	6	143289	143294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446206
3048	NC_011080	AAC	2	6	143329	143334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446206
3049	NC_011080	GAA	2	6	143385	143390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446206
3050	NC_011080	GCA	2	6	143447	143452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446206
3051	NC_011080	AGC	2	6	143513	143518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446375
3052	NC_011080	GAA	2	6	143547	143552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446375
3053	NC_011080	TCA	2	6	143563	143568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446375
3054	NC_011080	T	7	7	143614	143620	0 %	100 %	0 %	0 %	194446375
3055	NC_011080	CG	3	6	143628	143633	0 %	0 %	50 %	50 %	194446375
3056	NC_011080	ACCG	2	8	143730	143737	25 %	0 %	25 %	50 %	194446375
3057	NC_011080	AAG	2	6	143794	143799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446375
3058	NC_011080	CGG	2	6	143810	143815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446375
3059	NC_011080	TTTA	2	8	143913	143920	25 %	75 %	0 %	0 %	194446375
3060	NC_011080	GC	3	6	143925	143930	0 %	0 %	50 %	50 %	194446375
3061	NC_011080	A	6	6	143961	143966	100 %	0 %	0 %	0 %	194446375
3062	NC_011080	GAA	2	6	143994	143999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446375
3063	NC_011080	CGC	2	6	144003	144008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446375
3064	NC_011080	TAC	2	6	144009	144014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446375
3065	NC_011080	GCGA	2	8	144121	144128	25 %	0 %	50 %	25 %	194446375
3066	NC_011080	TCC	2	6	144171	144176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446375
3067	NC_011080	TGA	2	6	144215	144220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446375
3068	NC_011080	AAC	2	6	144252	144257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446375
3069	NC_011080	TGGCGA	2	12	144325	144336	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446375
3070	NC_011080	CAA	2	6	144356	144361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446375
3071	NC_011080	TGG	2	6	144442	144447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446375
3072	NC_011080	TGA	2	6	144448	144453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446375
3073	NC_011080	GC	3	6	144540	144545	0 %	0 %	50 %	50 %	194446375
3074	NC_011080	TAG	2	6	144634	144639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446375
3075	NC_011080	TACT	2	8	144641	144648	25 %	50 %	0 %	25 %	194446375
3076	NC_011080	GGT	2	6	144724	144729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446375
3077	NC_011080	AG	3	6	144737	144742	50 %	0 %	50 %	0 %	194446375
3078	NC_011080	GTG	2	6	144906	144911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446375
3079	NC_011080	ATG	2	6	144915	144920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446375
3080	NC_011080	GCG	4	12	144940	144951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446375
3081	NC_011080	GGC	2	6	144956	144961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446375
3082	NC_011080	TATCG	2	10	144972	144981	20 %	40 %	20 %	20 %	194446375
3083	NC_011080	A	6	6	145002	145007	100 %	0 %	0 %	0 %	194446375
3084	NC_011080	CAA	2	6	145031	145036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446375
3085	NC_011080	TGG	2	6	145090	145095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446375
3086	NC_011080	TCA	2	6	145099	145104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446375
3087	NC_011080	TAC	2	6	145125	145130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446375
3088	NC_011080	GGC	2	6	145131	145136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446375
3089	NC_011080	CAT	2	6	145163	145168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446375
3090	NC_011080	GCG	2	6	145171	145176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446375
3091	NC_011080	A	7	7	145222	145228	100 %	0 %	0 %	0 %	194446375
3092	NC_011080	TAAT	2	8	145237	145244	50 %	50 %	0 %	0 %	194446375
3093	NC_011080	CTT	2	6	145285	145290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443335
3094	NC_011080	GTGG	2	8	145296	145303	0 %	25 %	75 %	0 %	194443335
3095	NC_011080	CG	3	6	145314	145319	0 %	0 %	50 %	50 %	194443335
3096	NC_011080	GA	3	6	145328	145333	50 %	0 %	50 %	0 %	194443335
3097	NC_011080	GCG	2	6	145357	145362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443335
3098	NC_011080	AGT	2	6	145380	145385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443335
3099	NC_011080	TCA	2	6	145389	145394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443335
3100	NC_011080	AT	3	6	145410	145415	50 %	50 %	0 %	0 %	194443335
3101	NC_011080	ATT	2	6	145447	145452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443335
3102	NC_011080	GCGA	2	8	145471	145478	25 %	0 %	50 %	25 %	194443335
3103	NC_011080	CAGC	2	8	145521	145528	25 %	0 %	25 %	50 %	194443335
3104	NC_011080	TGG	2	6	145592	145597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443335
3105	NC_011080	ACC	3	9	145624	145632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443335
3106	NC_011080	ACT	2	6	145635	145640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443335
3107	NC_011080	TCT	2	6	145813	145818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443335
3108	NC_011080	GCA	2	6	145830	145835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443335
3109	NC_011080	GGC	2	6	145842	145847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443335
3110	NC_011080	GCC	2	6	145858	145863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443335
3111	NC_011080	GGC	2	6	145926	145931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443335
3112	NC_011080	CCAC	2	8	145949	145956	25 %	0 %	0 %	75 %	194443335
3113	NC_011080	GAT	2	6	145984	145989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443335
3114	NC_011080	CGC	2	6	145999	146004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443335
3115	NC_011080	TGGC	2	8	146005	146012	0 %	25 %	50 %	25 %	194443335
3116	NC_011080	CGA	2	6	146117	146122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443335
3117	NC_011080	GCC	2	6	146162	146167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443335
3118	NC_011080	CTG	2	6	146197	146202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443335
3119	NC_011080	GCT	2	6	146214	146219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443335
3120	NC_011080	CCG	2	6	146255	146260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443335
3121	NC_011080	CG	3	6	146259	146264	0 %	0 %	50 %	50 %	194443335
3122	NC_011080	GTG	2	6	146323	146328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443335
3123	NC_011080	GGC	2	6	146370	146375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443335
3124	NC_011080	GC	3	6	146374	146379	0 %	0 %	50 %	50 %	194443335
3125	NC_011080	GAA	2	6	146467	146472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443335
3126	NC_011080	TCG	2	6	146483	146488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443335
3127	NC_011080	TGAC	2	8	146492	146499	25 %	25 %	25 %	25 %	194443335
3128	NC_011080	GAG	2	6	146515	146520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443335
3129	NC_011080	CG	3	6	146522	146527	0 %	0 %	50 %	50 %	194443335
3130	NC_011080	CTGG	2	8	146545	146552	0 %	25 %	50 %	25 %	194443335
3131	NC_011080	CGT	2	6	146637	146642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443335
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3134	NC_011080	CTG	2	6	146937	146942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444164
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3152	NC_011080	GGC	2	6	147665	147670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444164
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3232	NC_011080	CGC	2	6	151230	151235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446027
3233	NC_011080	ATT	2	6	151401	151406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446027
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3236	NC_011080	CG	3	6	151470	151475	0 %	0 %	50 %	50 %	194446027
3237	NC_011080	ACC	2	6	151507	151512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446027
3238	NC_011080	TGC	2	6	151594	151599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446027
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3240	NC_011080	GGCG	2	8	151771	151778	0 %	0 %	75 %	25 %	194443313
3241	NC_011080	CGG	2	6	151783	151788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443313
3242	NC_011080	CAT	2	6	151817	151822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443313
3243	NC_011080	GCTG	2	8	151848	151855	0 %	25 %	50 %	25 %	194443313
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3245	NC_011080	GGC	2	6	151960	151965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443313
3246	NC_011080	GGC	2	6	151989	151994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443313
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3353	NC_011080	CGG	2	6	157274	157279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443610
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3355	NC_011080	GCC	2	6	157415	157420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3356	NC_011080	GA	4	8	157455	157462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3357	NC_011080	ACG	2	6	157490	157495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444484
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3362	NC_011080	GTCG	2	8	157690	157697	0 %	25 %	50 %	25 %	194444484
3363	NC_011080	CGG	2	6	157703	157708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444484
3364	NC_011080	TGCG	2	8	157727	157734	0 %	25 %	50 %	25 %	194444484
3365	NC_011080	GGCA	2	8	157767	157774	25 %	0 %	50 %	25 %	194444484
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3367	NC_011080	CGGCG	2	10	157794	157803	0 %	0 %	60 %	40 %	194444484
3368	NC_011080	GTG	2	6	157852	157857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444484
3369	NC_011080	GCT	2	6	157965	157970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444484
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3372	NC_011080	TGA	2	6	158078	158083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444484
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3380	NC_011080	ACG	2	6	158372	158377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444484
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3388	NC_011080	GAT	2	6	158716	158721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442525
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3489	NC_011080	TTA	2	6	163753	163758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444623
3490	NC_011080	GCCG	2	8	163798	163805	0 %	0 %	50 %	50 %	194444623
3491	NC_011080	CGT	2	6	163809	163814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444623
3492	NC_011080	GCC	2	6	163835	163840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444623
3493	NC_011080	GGC	2	6	163902	163907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3494	NC_011080	TAT	2	6	163946	163951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_011080	CG	3	6	163958	163963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3496	NC_011080	TATT	2	8	163986	163993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_011080	ATT	2	6	163995	164000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_011080	GTC	2	6	164062	164067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444422
3499	NC_011080	CGC	2	6	164082	164087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444422
3500	NC_011080	CGG	2	6	164109	164114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444422

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