MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011080	ACAGA	2	10	116899	116908	60 %	0 %	20 %	20 %	194444922
2502	NC_011080	ATT	2	6	116923	116928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444922
2503	NC_011080	T	7	7	116943	116949	0 %	100 %	0 %	0 %	194444922
2504	NC_011080	A	6	6	116970	116975	100 %	0 %	0 %	0 %	194444922
2505	NC_011080	CCG	2	6	117014	117019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_011080	ATC	2	6	117066	117071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_011080	GCG	2	6	117111	117116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_011080	CGG	2	6	117206	117211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_011080	TGG	2	6	117259	117264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_011080	CTTT	2	8	117305	117312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2511	NC_011080	CTG	2	6	117342	117347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_011080	GCA	2	6	117362	117367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_011080	GGC	2	6	117436	117441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_011080	AC	3	6	117518	117523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_011080	TGA	2	6	117528	117533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_011080	A	7	7	117719	117725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_011080	CAA	2	6	117770	117775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_011080	TGC	2	6	117793	117798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_011080	A	6	6	117853	117858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011080	GCC	2	6	117903	117908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_011080	TGGG	2	8	117943	117950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_011080	TCAG	2	8	118002	118009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2523	NC_011080	GTTGAA	2	12	118040	118051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_011080	CA	3	6	118067	118072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2525	NC_011080	ACGGT	2	10	118128	118137	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2526	NC_011080	ACCA	2	8	118140	118147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_011080	CAG	2	6	118219	118224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_011080	GAT	2	6	118333	118338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011080	CAG	2	6	118389	118394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_011080	GCC	2	6	118470	118475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_011080	TGGCG	2	10	118496	118505	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2532	NC_011080	GAAA	2	8	118570	118577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_011080	TG	3	6	118600	118605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_011080	GCG	2	6	118661	118666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_011080	GCC	2	6	118707	118712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_011080	GTC	2	6	118746	118751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_011080	GGA	2	6	118800	118805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443651
2538	NC_011080	CAA	2	6	118847	118852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443651
2539	NC_011080	TTC	2	6	118867	118872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443651
2540	NC_011080	GGAA	2	8	118881	118888	50 %	0 %	50 %	0 %	194443651
2541	NC_011080	ATT	2	6	118915	118920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443651
2542	NC_011080	AT	3	6	118968	118973	50 %	50 %	0 %	0 %	194443651
2543	NC_011080	TCA	2	6	118986	118991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443651
2544	NC_011080	TGC	2	6	119086	119091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967492
2545	NC_011080	GCG	2	6	119105	119110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967492
2546	NC_011080	GGC	2	6	119117	119122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967492
2547	NC_011080	AGA	2	6	119123	119128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448967492
2548	NC_011080	CTT	2	6	119144	119149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967492
2549	NC_011080	GCG	2	6	119239	119244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967492
2550	NC_011080	CAA	2	6	119270	119275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448967492
2551	NC_011080	GTGG	2	8	119367	119374	0 %	25 %	75 %	0 %	448967492
2552	NC_011080	GT	3	6	119434	119439	0 %	50 %	50 %	0 %	448967492
2553	NC_011080	GCC	2	6	119445	119450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967492
2554	NC_011080	GAC	2	6	119497	119502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967492
2555	NC_011080	ACC	3	9	119545	119553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448967492
2556	NC_011080	CGC	2	6	119609	119614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448967492
2557	NC_011080	TCT	2	6	119710	119715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448967492
2558	NC_011080	CAGCG	2	10	119892	119901	20 %	0 %	40 %	40 %	194446528
2559	NC_011080	ATCA	2	8	119933	119940	50 %	25 %	0 %	25 %	194446528
2560	NC_011080	GC	3	6	120019	120024	0 %	0 %	50 %	50 %	194446528
2561	NC_011080	GCCA	2	8	120026	120033	25 %	0 %	25 %	50 %	194446528
2562	NC_011080	GCG	2	6	120115	120120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446528
2563	NC_011080	CAG	2	6	120146	120151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2564	NC_011080	CGA	2	6	120184	120189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2565	NC_011080	GCCGG	2	10	120192	120201	0 %	0 %	60 %	40 %	194446528
2566	NC_011080	GCC	2	6	120239	120244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446528
2567	NC_011080	GGAC	2	8	120293	120300	25 %	0 %	50 %	25 %	194446528
2568	NC_011080	AC	3	6	120299	120304	50 %	0 %	0 %	50 %	194446528
2569	NC_011080	CGAGC	2	10	120317	120326	20 %	0 %	40 %	40 %	194446528
2570	NC_011080	TCC	2	6	120363	120368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446528
2571	NC_011080	GCC	2	6	120380	120385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446528
2572	NC_011080	GCG	2	6	120426	120431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446528
2573	NC_011080	TGC	2	6	120468	120473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2574	NC_011080	GTA	2	6	120531	120536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446528
2575	NC_011080	GCC	2	6	120551	120556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446528
2576	NC_011080	CGC	2	6	120593	120598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446528
2577	NC_011080	GGCG	2	8	120638	120645	0 %	0 %	75 %	25 %	194446528
2578	NC_011080	GCT	2	6	120656	120661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2579	NC_011080	TCGCCG	2	12	120690	120701	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194446528
2580	NC_011080	CAC	2	6	120710	120715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446528
2581	NC_011080	ATTTG	2	10	120760	120769	20 %	60 %	20 %	0 %	194446528
2582	NC_011080	GTCA	2	8	120788	120795	25 %	25 %	25 %	25 %	194446528
2583	NC_011080	GAC	2	6	120923	120928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2584	NC_011080	TGC	2	6	120933	120938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446528
2585	NC_011080	CG	3	6	120948	120953	0 %	0 %	50 %	50 %	194446528
2586	NC_011080	GCC	2	6	120974	120979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446528
2587	NC_011080	GGTTCA	2	12	120991	121002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194446528
2588	NC_011080	GCG	2	6	121035	121040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446528
2589	NC_011080	AGT	2	6	121062	121067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446528
2590	NC_011080	ACC	2	6	121131	121136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446528
2591	NC_011080	GCTG	2	8	121315	121322	0 %	25 %	50 %	25 %	194446528
2592	NC_011080	TGT	2	6	121438	121443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445733
2593	NC_011080	CTG	2	6	121461	121466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445733
2594	NC_011080	GCG	2	6	121470	121475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
2595	NC_011080	GGC	2	6	121554	121559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
2596	NC_011080	CGG	2	6	121589	121594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
2597	NC_011080	GCG	2	6	121603	121608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
2598	NC_011080	CGA	2	6	121634	121639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445733
2599	NC_011080	GCA	2	6	121665	121670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445733
2600	NC_011080	GCC	2	6	121704	121709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445733
2601	NC_011080	GC	5	10	121765	121774	0 %	0 %	50 %	50 %	194445733
2602	NC_011080	GCG	2	6	121878	121883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
2603	NC_011080	CAC	2	6	121902	121907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445733
2604	NC_011080	GCT	2	6	121964	121969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445733
2605	NC_011080	CTGG	2	8	121971	121978	0 %	25 %	50 %	25 %	194445733
2606	NC_011080	TGC	2	6	122005	122010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445733
2607	NC_011080	GTT	2	6	122018	122023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445733
2608	NC_011080	CAC	2	6	122109	122114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445733
2609	NC_011080	CGC	2	6	122270	122275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445733
2610	NC_011080	CAC	2	6	122283	122288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445733
2611	NC_011080	CGG	2	6	122348	122353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
2612	NC_011080	TCA	2	6	122410	122415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445733
2613	NC_011080	AAG	2	6	122416	122421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445733
2614	NC_011080	GGC	2	6	122428	122433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
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2616	NC_011080	GTG	2	6	122509	122514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445733
2617	NC_011080	AGC	2	6	122521	122526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445733
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2619	NC_011080	CGG	2	6	122561	122566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
2620	NC_011080	GCC	2	6	122637	122642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445733
2621	NC_011080	AGT	2	6	122654	122659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445733
2622	NC_011080	TCG	2	6	122695	122700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445733
2623	NC_011080	GCG	2	6	122860	122865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445733
2624	NC_011080	CG	3	6	122918	122923	0 %	0 %	50 %	50 %	194445733
2625	NC_011080	GAT	2	6	122924	122929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445733
2626	NC_011080	GTT	2	6	122940	122945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445733
2627	NC_011080	CTT	2	6	122966	122971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445733
2628	NC_011080	TGG	2	6	122996	123001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445733
2629	NC_011080	TCG	2	6	123007	123012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445733
2630	NC_011080	GC	3	6	123037	123042	0 %	0 %	50 %	50 %	194445733
2631	NC_011080	CAATTG	2	12	123068	123079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194445733
2632	NC_011080	TCCA	2	8	123092	123099	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2633	NC_011080	AG	3	6	123124	123129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_011080	CAGG	2	8	123146	123153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2635	NC_011080	AATGCT	2	12	123176	123187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2636	NC_011080	TCA	2	6	123328	123333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2637	NC_011080	GTC	2	6	123364	123369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2638	NC_011080	TCT	2	6	123393	123398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2639	NC_011080	G	6	6	123408	123413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_011080	T	7	7	123522	123528	0 %	100 %	0 %	0 %	194445205
2641	NC_011080	ATCG	2	8	123529	123536	25 %	25 %	25 %	25 %	194445205
2642	NC_011080	AT	3	6	123555	123560	50 %	50 %	0 %	0 %	194445205
2643	NC_011080	TAA	3	9	123594	123602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445205
2644	NC_011080	TGTC	2	8	123615	123622	0 %	50 %	25 %	25 %	194445205
2645	NC_011080	AT	3	6	123632	123637	50 %	50 %	0 %	0 %	194445205
2646	NC_011080	CCG	2	6	123646	123651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445205
2647	NC_011080	TCA	2	6	123660	123665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445205
2648	NC_011080	GC	3	6	123796	123801	0 %	0 %	50 %	50 %	194445205
2649	NC_011080	ATC	2	6	123832	123837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445205
2650	NC_011080	CTG	2	6	123886	123891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445205
2651	NC_011080	AGC	2	6	123893	123898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445205
2652	NC_011080	TAAT	2	8	123920	123927	50 %	50 %	0 %	0 %	194445205
2653	NC_011080	CCG	2	6	123940	123945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445205
2654	NC_011080	TGCC	2	8	123966	123973	0 %	25 %	25 %	50 %	194445205
2655	NC_011080	CAG	2	6	124072	124077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445205
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2658	NC_011080	ATG	2	6	124277	124282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2659	NC_011080	TCA	2	6	124366	124371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2660	NC_011080	AC	3	6	124381	124386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2661	NC_011080	CTG	2	6	124397	124402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444593
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2664	NC_011080	GCG	2	6	124539	124544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444593
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2667	NC_011080	CTGG	2	8	124612	124619	0 %	25 %	50 %	25 %	194444593
2668	NC_011080	GCT	2	6	124675	124680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444593
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2717	NC_011080	GTG	2	6	126822	126827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442730
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2725	NC_011080	GCCA	2	8	127131	127138	25 %	0 %	25 %	50 %	194442730
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2739	NC_011080	CGG	2	6	127755	127760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444243
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2742	NC_011080	GGT	2	6	127804	127809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444243
2743	NC_011080	CGTCAC	2	12	127873	127884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	194444243
2744	NC_011080	GCC	2	6	127892	127897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444243
2745	NC_011080	GCG	2	6	127914	127919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444243
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2747	NC_011080	CGG	2	6	128041	128046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444243
2748	NC_011080	GCTT	2	8	128055	128062	0 %	50 %	25 %	25 %	194444243
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2761	NC_011080	GC	4	8	128551	128558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2762	NC_011080	TAGTG	2	10	128589	128598	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2871	NC_011080	CGA	2	6	134066	134071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444052
2872	NC_011080	GCG	2	6	134100	134105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444052
2873	NC_011080	ATG	2	6	134109	134114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444052
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2990	NC_011080	CCGCA	2	10	140722	140731	20 %	0 %	20 %	60 %	194444269
2991	NC_011080	GCC	2	6	140789	140794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444269
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2994	NC_011080	GCT	2	6	140950	140955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444269
2995	NC_011080	TGA	2	6	141043	141048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444269
2996	NC_011080	TCG	2	6	141097	141102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444269
2997	NC_011080	CGG	2	6	141130	141135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2998	NC_011080	CT	4	8	141143	141150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2999	NC_011080	GCC	2	6	141154	141159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3000	NC_011080	CAAA	2	8	141162	141169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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