MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_011080	GTT	2	6	92694	92699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445455
2003	NC_011080	CCG	2	6	92703	92708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445455
2004	NC_011080	CTAT	2	8	92771	92778	25 %	50 %	0 %	25 %	194445455
2005	NC_011080	TCG	2	6	92795	92800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445455
2006	NC_011080	T	6	6	92860	92865	0 %	100 %	0 %	0 %	194445455
2007	NC_011080	ATG	2	6	92941	92946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445455
2008	NC_011080	GCT	2	6	92961	92966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445455
2009	NC_011080	CAT	2	6	92988	92993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445455
2010	NC_011080	GTG	2	6	93001	93006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445455
2011	NC_011080	CTT	2	6	93024	93029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445455
2012	NC_011080	CGG	2	6	93033	93038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445455
2013	NC_011080	TCA	2	6	93110	93115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445455
2014	NC_011080	TAT	2	6	93138	93143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445455
2015	NC_011080	TTA	2	6	93167	93172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445455
2016	NC_011080	TAA	2	6	93186	93191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445455
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2021	NC_011080	GAGC	2	8	93631	93638	25 %	0 %	50 %	25 %	194444528
2022	NC_011080	TAAT	2	8	93643	93650	50 %	50 %	0 %	0 %	194444528
2023	NC_011080	T	6	6	93655	93660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2051	NC_011080	GCC	2	6	95113	95118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2057	NC_011080	TAT	2	6	95293	95298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2063	NC_011080	AT	3	6	95643	95648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2109	NC_011080	ATC	2	6	98203	98208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2130	NC_011080	GC	3	6	98988	98993	0 %	0 %	50 %	50 %	194446332
2131	NC_011080	GGC	3	9	99004	99012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
2132	NC_011080	TGG	2	6	99023	99028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
2133	NC_011080	GCG	2	6	99032	99037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
2134	NC_011080	TCTGT	2	10	99048	99057	0 %	60 %	20 %	20 %	194446332
2135	NC_011080	AATG	2	8	99141	99148	50 %	25 %	25 %	0 %	194446332
2136	NC_011080	TGG	2	6	99227	99232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
2137	NC_011080	GAT	2	6	99234	99239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446332
2138	NC_011080	CTG	2	6	99244	99249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
2139	NC_011080	GCC	2	6	99250	99255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446332
2140	NC_011080	GCG	2	6	99257	99262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
2141	NC_011080	CCA	2	6	99266	99271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446332
2142	NC_011080	TGG	2	6	99323	99328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
2143	NC_011080	TGC	2	6	99329	99334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
2144	NC_011080	GCGCT	2	10	99358	99367	0 %	20 %	40 %	40 %	194446332
2145	NC_011080	CG	3	6	99372	99377	0 %	0 %	50 %	50 %	194446332
2146	NC_011080	GGCG	2	8	99483	99490	0 %	0 %	75 %	25 %	194446332
2147	NC_011080	CTG	2	6	99493	99498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
2148	NC_011080	TGC	2	6	99554	99559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
2149	NC_011080	GATT	2	8	99591	99598	25 %	50 %	25 %	0 %	194446332
2150	NC_011080	TGG	2	6	99608	99613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
2151	NC_011080	CTG	2	6	99631	99636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
2152	NC_011080	TTG	2	6	99637	99642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446332
2153	NC_011080	TTA	2	6	99733	99738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446332
2154	NC_011080	GGCGC	2	10	99772	99781	0 %	0 %	60 %	40 %	194446332
2155	NC_011080	GGC	2	6	99846	99851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
2156	NC_011080	TGC	2	6	99869	99874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446332
2157	NC_011080	GC	3	6	99907	99912	0 %	0 %	50 %	50 %	194446332
2158	NC_011080	CGA	2	6	99927	99932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446332
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2161	NC_011080	T	6	6	100076	100081	0 %	100 %	0 %	0 %	194446332
2162	NC_011080	GCGAC	2	10	100085	100094	20 %	0 %	40 %	40 %	194446332
2163	NC_011080	GCG	2	6	100123	100128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446332
2164	NC_011080	GCCCGT	2	12	100225	100236	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194446332
2165	NC_011080	GC	3	6	100304	100309	0 %	0 %	50 %	50 %	194446332
2166	NC_011080	GAC	2	6	100319	100324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446332
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2168	NC_011080	GC	3	6	100368	100373	0 %	0 %	50 %	50 %	194446332
2169	NC_011080	TGG	2	6	100403	100408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446332
2170	NC_011080	CGC	3	9	100446	100454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446332
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2172	NC_011080	TGA	2	6	100575	100580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446332
2173	NC_011080	A	6	6	100609	100614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2174	NC_011080	ACT	2	6	100657	100662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2178	NC_011080	T	8	8	100779	100786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2179	NC_011080	TAAT	2	8	100798	100805	50 %	50 %	0 %	0 %	194445577
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2189	NC_011080	GGC	2	6	101300	101305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2190	NC_011080	CTTCGC	2	12	101403	101414	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194442603
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2213	NC_011080	TCATGG	2	12	103164	103175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194446536
2214	NC_011080	CTG	2	6	103180	103185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446536
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2242	NC_011080	CCCAA	2	10	104692	104701	40 %	0 %	0 %	60 %	194444526
2243	NC_011080	CGC	2	6	104747	104752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444526
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2246	NC_011080	GC	3	6	104810	104815	0 %	0 %	50 %	50 %	194444526
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2251	NC_011080	CAA	2	6	105112	105117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444526
2252	NC_011080	CGT	2	6	105139	105144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2253	NC_011080	CTT	2	6	105253	105258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444526
2254	NC_011080	CGA	2	6	105279	105284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2255	NC_011080	TTG	2	6	105291	105296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444526
2256	NC_011080	ATC	2	6	105312	105317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444526
2257	NC_011080	TTGTT	2	10	105399	105408	0 %	80 %	20 %	0 %	194444526
2258	NC_011080	TCT	2	6	105463	105468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444526
2259	NC_011080	CGT	2	6	105532	105537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2260	NC_011080	GCT	2	6	105544	105549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2261	NC_011080	CCTG	2	8	105552	105559	0 %	25 %	25 %	50 %	194444526
2262	NC_011080	ACG	2	6	105612	105617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444526
2263	NC_011080	ATT	2	6	105620	105625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444526
2264	NC_011080	GAC	2	6	105626	105631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444526
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2268	NC_011080	ATCA	2	8	105765	105772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2269	NC_011080	GTT	2	6	105897	105902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445274
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2273	NC_011080	AT	3	6	106139	106144	50 %	50 %	0 %	0 %	194445274
2274	NC_011080	GCT	4	12	106207	106218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
2275	NC_011080	GTC	2	6	106327	106332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
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2277	NC_011080	TAG	2	6	106379	106384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445274
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2282	NC_011080	GCTTC	2	10	106779	106788	0 %	40 %	20 %	40 %	194445274
2283	NC_011080	GTA	2	6	106939	106944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445274
2284	NC_011080	GCT	2	6	106975	106980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
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2286	NC_011080	TACT	2	8	107096	107103	25 %	50 %	0 %	25 %	194445274
2287	NC_011080	TGC	2	6	107186	107191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445274
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2290	NC_011080	ATA	2	6	107324	107329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445274
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2292	NC_011080	TGG	2	6	107361	107366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445274
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2328	NC_011080	AATG	2	8	109244	109251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2351	NC_011080	ATCA	2	8	110163	110170	50 %	25 %	0 %	25 %	194446131
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2368	NC_011080	T	6	6	111029	111034	0 %	100 %	0 %	0 %	194446131
2369	NC_011080	GAC	2	6	111086	111091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2370	NC_011080	CAG	2	6	111105	111110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2371	NC_011080	GC	3	6	111203	111208	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2372	NC_011080	TCT	2	6	111214	111219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446131
2373	NC_011080	GGC	3	9	111231	111239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446131
2374	NC_011080	CGG	2	6	111278	111283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446131
2375	NC_011080	TTCGCG	2	12	111294	111305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2376	NC_011080	GGT	2	6	111330	111335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446131
2377	NC_011080	CCA	2	6	111420	111425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446131
2378	NC_011080	CG	3	6	111505	111510	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2379	NC_011080	CGGCAG	2	12	111552	111563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194446131
2380	NC_011080	TCA	2	6	111670	111675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446131
2381	NC_011080	GGC	2	6	111678	111683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446131
2382	NC_011080	TCG	2	6	111691	111696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2383	NC_011080	TCG	2	6	111769	111774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2384	NC_011080	CAG	2	6	111795	111800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2385	NC_011080	TTC	2	6	111840	111845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446131
2386	NC_011080	TGGCG	2	10	111927	111936	0 %	20 %	60 %	20 %	194446131
2387	NC_011080	CAG	3	9	111939	111947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2388	NC_011080	AT	3	6	111985	111990	50 %	50 %	0 %	0 %	194446131
2389	NC_011080	GAT	2	6	112022	112027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446131
2390	NC_011080	TCG	2	6	112033	112038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2391	NC_011080	ACC	2	6	112039	112044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446131
2392	NC_011080	GCT	2	6	112082	112087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2393	NC_011080	CGG	2	6	112093	112098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446131
2394	NC_011080	GTT	2	6	112124	112129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446131
2395	NC_011080	CGT	2	6	112151	112156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2396	NC_011080	GCA	2	6	112214	112219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2397	NC_011080	GAT	2	6	112257	112262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446131
2398	NC_011080	CCG	2	6	112274	112279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446131
2399	NC_011080	ATA	2	6	112286	112291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446131
2400	NC_011080	ATC	2	6	112306	112311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446131
2401	NC_011080	CAG	2	6	112350	112355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2402	NC_011080	CG	3	6	112358	112363	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2403	NC_011080	CGA	2	6	112372	112377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446131
2404	NC_011080	CAT	2	6	112382	112387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446131
2405	NC_011080	GCTC	2	8	112460	112467	0 %	25 %	25 %	50 %	194446131
2406	NC_011080	AGCGC	2	10	112487	112496	20 %	0 %	40 %	40 %	194446131
2407	NC_011080	TCGA	2	8	112509	112516	25 %	25 %	25 %	25 %	194446131
2408	NC_011080	TCT	2	6	112645	112650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446131
2409	NC_011080	GC	3	6	112740	112745	0 %	0 %	50 %	50 %	194446131
2410	NC_011080	CATC	2	8	112796	112803	25 %	25 %	0 %	50 %	194446131
2411	NC_011080	CAA	2	6	112805	112810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446131
2412	NC_011080	GGC	2	6	113028	113033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2413	NC_011080	AGT	2	6	113073	113078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446652
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2420	NC_011080	GCG	2	6	113296	113301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
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2422	NC_011080	CGCC	2	8	113371	113378	0 %	0 %	25 %	75 %	194446652
2423	NC_011080	GCG	2	6	113470	113475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
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2426	NC_011080	CCGCG	2	10	113572	113581	0 %	0 %	40 %	60 %	194446652
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2435	NC_011080	ATCA	2	8	114098	114105	50 %	25 %	0 %	25 %	194446652
2436	NC_011080	GCC	2	6	114194	114199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446652
2437	NC_011080	GCG	2	6	114211	114216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
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2440	NC_011080	TCG	2	6	114328	114333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446652
2441	NC_011080	CG	3	6	114332	114337	0 %	0 %	50 %	50 %	194446652
2442	NC_011080	GCG	2	6	114440	114445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
2443	NC_011080	A	7	7	114603	114609	100 %	0 %	0 %	0 %	194446652
2444	NC_011080	GCA	2	6	114700	114705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446652
2445	NC_011080	CAC	2	6	114722	114727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446652
2446	NC_011080	GAT	2	6	114737	114742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446652
2447	NC_011080	GCGG	2	8	114793	114800	0 %	0 %	75 %	25 %	194446652
2448	NC_011080	GCG	2	6	114952	114957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
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2454	NC_011080	GCG	2	6	115198	115203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
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2456	NC_011080	CTGG	2	8	115253	115260	0 %	25 %	50 %	25 %	194446652
2457	NC_011080	GCG	2	6	115285	115290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
2458	NC_011080	TGTC	2	8	115315	115322	0 %	50 %	25 %	25 %	194446652
2459	NC_011080	GCCA	2	8	115323	115330	25 %	0 %	25 %	50 %	194446652
2460	NC_011080	GCG	2	6	115351	115356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446652
2461	NC_011080	CCTG	2	8	115386	115393	0 %	25 %	25 %	50 %	194446652
2462	NC_011080	GAT	2	6	115400	115405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2464	NC_011080	TAA	2	6	115501	115506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446096
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2476	NC_011080	CTGA	2	8	115965	115972	25 %	25 %	25 %	25 %	194446096
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2479	NC_011080	TGCC	2	8	116027	116034	0 %	25 %	25 %	50 %	194446096
2480	NC_011080	ATGA	2	8	116062	116069	50 %	25 %	25 %	0 %	194446096
2481	NC_011080	GTTC	2	8	116070	116077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2482	NC_011080	AT	3	6	116156	116161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2483	NC_011080	AAT	2	6	116168	116173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_011080	GGC	2	6	116188	116193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2485	NC_011080	GAGT	2	8	116198	116205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2486	NC_011080	ATGG	2	8	116303	116310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2487	NC_011080	ATG	2	6	116362	116367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2488	NC_011080	CAG	2	6	116378	116383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2489	NC_011080	TTTA	2	8	116420	116427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2490	NC_011080	A	6	6	116535	116540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_011080	T	6	6	116547	116552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2492	NC_011080	GTTT	2	8	116553	116560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2493	NC_011080	ATA	2	6	116618	116623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_011080	TAAA	2	8	116644	116651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_011080	TCG	2	6	116671	116676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2496	NC_011080	CT	3	6	116681	116686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2497	NC_011080	TAATT	2	10	116690	116699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_011080	ATTTT	2	10	116716	116725	20 %	80 %	0 %	0 %	194444922
2499	NC_011080	CGGGTG	2	12	116732	116743	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194444922
2500	NC_011080	T	6	6	116878	116883	0 %	100 %	0 %	0 %	194444922

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