MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011080	GATC	2	8	69349	69356	25 %	25 %	25 %	25 %	194444878
1502	NC_011080	GTC	2	6	69506	69511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444878
1503	NC_011080	GC	3	6	69600	69605	0 %	0 %	50 %	50 %	194444878
1504	NC_011080	CTG	2	6	69612	69617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444878
1505	NC_011080	GCC	2	6	69644	69649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444878
1506	NC_011080	AC	3	6	69652	69657	50 %	0 %	0 %	50 %	194444878
1507	NC_011080	GGCA	2	8	69723	69730	25 %	0 %	50 %	25 %	194446729
1508	NC_011080	TGA	2	6	69749	69754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446729
1509	NC_011080	TCCA	2	8	69765	69772	25 %	25 %	0 %	50 %	194446729
1510	NC_011080	AG	3	6	69798	69803	50 %	0 %	50 %	0 %	194446729
1511	NC_011080	AGC	2	6	69812	69817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446729
1512	NC_011080	GCG	2	6	69826	69831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446729
1513	NC_011080	GGT	2	6	69840	69845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446729
1514	NC_011080	CG	3	6	69877	69882	0 %	0 %	50 %	50 %	194446729
1515	NC_011080	GC	3	6	69905	69910	0 %	0 %	50 %	50 %	194446729
1516	NC_011080	GGC	3	9	69939	69947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446729
1517	NC_011080	TGT	2	6	70009	70014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446194
1518	NC_011080	AGA	2	6	70088	70093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446194
1519	NC_011080	GTG	2	6	70179	70184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446194
1520	NC_011080	CGT	2	6	70232	70237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446194
1521	NC_011080	GTG	2	6	70240	70245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446194
1522	NC_011080	GCTGGA	2	12	70292	70303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446194
1523	NC_011080	GGC	2	6	70364	70369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446194
1524	NC_011080	TGG	2	6	70429	70434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446194
1525	NC_011080	GGC	2	6	70445	70450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446194
1526	NC_011080	TGC	2	6	70522	70527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446194
1527	NC_011080	GCG	2	6	70530	70535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446194
1528	NC_011080	CG	3	6	70534	70539	0 %	0 %	50 %	50 %	194446194
1529	NC_011080	GCC	2	6	70551	70556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446194
1530	NC_011080	ATG	2	6	70558	70563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446194
1531	NC_011080	AAT	2	6	70581	70586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446194
1532	NC_011080	GAA	2	6	70587	70592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446194
1533	NC_011080	GAAG	2	8	70601	70608	50 %	0 %	50 %	0 %	194446194
1534	NC_011080	AAG	2	6	70702	70707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446194
1535	NC_011080	GCC	2	6	70731	70736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446194
1536	NC_011080	CGT	2	6	70766	70771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446194
1537	NC_011080	CG	3	6	70814	70819	0 %	0 %	50 %	50 %	194446194
1538	NC_011080	GTG	2	6	70824	70829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446194
1539	NC_011080	AAGG	2	8	70858	70865	50 %	0 %	50 %	0 %	194446194
1540	NC_011080	CGT	2	6	71020	71025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442210
1541	NC_011080	CCA	2	6	71058	71063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442210
1542	NC_011080	GTG	2	6	71072	71077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442210
1543	NC_011080	GTG	2	6	71200	71205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442210
1544	NC_011080	CGG	2	6	71295	71300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442210
1545	NC_011080	CGTGC	2	10	71355	71364	0 %	20 %	40 %	40 %	194442210
1546	NC_011080	TG	3	6	71455	71460	0 %	50 %	50 %	0 %	194442210
1547	NC_011080	CTGA	2	8	71467	71474	25 %	25 %	25 %	25 %	194442210
1548	NC_011080	TTGAT	2	10	71525	71534	20 %	60 %	20 %	0 %	194442210
1549	NC_011080	GGC	2	6	71628	71633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442210
1550	NC_011080	TGG	2	6	71789	71794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442210
1551	NC_011080	GCT	2	6	71823	71828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442210
1552	NC_011080	CAT	2	6	71881	71886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442210
1553	NC_011080	CAAT	2	8	71901	71908	50 %	25 %	0 %	25 %	194442210
1554	NC_011080	GC	3	6	71966	71971	0 %	0 %	50 %	50 %	194442210
1555	NC_011080	TGA	2	6	72002	72007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442210
1556	NC_011080	GGC	2	6	72040	72045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442210
1557	NC_011080	GCA	2	6	72058	72063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442210
1558	NC_011080	ATT	2	6	72079	72084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442210
1559	NC_011080	ACCGC	2	10	72085	72094	20 %	0 %	20 %	60 %	194442210
1560	NC_011080	TG	3	6	72115	72120	0 %	50 %	50 %	0 %	194442210
1561	NC_011080	TGC	2	6	72231	72236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442210
1562	NC_011080	TGA	2	6	72248	72253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442210
1563	NC_011080	AAC	2	6	72260	72265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442210
1564	NC_011080	GC	3	6	72273	72278	0 %	0 %	50 %	50 %	194442210
1565	NC_011080	GTG	2	6	72325	72330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442210
1566	NC_011080	TGA	2	6	72388	72393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442210
1567	NC_011080	CTG	2	6	72405	72410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444126
1568	NC_011080	GGA	2	6	72434	72439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444126
1569	NC_011080	GC	3	6	72450	72455	0 %	0 %	50 %	50 %	194444126
1570	NC_011080	GCC	2	6	72465	72470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444126
1571	NC_011080	GGC	2	6	72559	72564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444126
1572	NC_011080	ATGG	2	8	72665	72672	25 %	25 %	50 %	0 %	194444126
1573	NC_011080	GGC	2	6	72742	72747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444126
1574	NC_011080	ATT	2	6	72762	72767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444126
1575	NC_011080	CAG	2	6	72834	72839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444126
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1578	NC_011080	GTTG	2	8	72990	72997	0 %	50 %	50 %	0 %	194443498
1579	NC_011080	GCT	2	6	73005	73010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443498
1580	NC_011080	GGC	2	6	73086	73091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443498
1581	NC_011080	TGGA	2	8	73123	73130	25 %	25 %	50 %	0 %	194443498
1582	NC_011080	T	6	6	73135	73140	0 %	100 %	0 %	0 %	194443498
1583	NC_011080	CAA	2	6	73149	73154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443498
1584	NC_011080	CGG	2	6	73157	73162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443498
1585	NC_011080	GGC	2	6	73167	73172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443498
1586	NC_011080	TGC	2	6	73190	73195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443498
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1588	NC_011080	CG	3	6	73311	73316	0 %	0 %	50 %	50 %	194443498
1589	NC_011080	TTG	2	6	73376	73381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443498
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1591	NC_011080	GC	3	6	73457	73462	0 %	0 %	50 %	50 %	194443498
1592	NC_011080	TTG	2	6	73570	73575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443498
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1596	NC_011080	TTG	2	6	73663	73668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443498
1597	NC_011080	G	6	6	73692	73697	0 %	0 %	100 %	0 %	194443498
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1600	NC_011080	TC	3	6	73844	73849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_011080	GGC	2	6	73941	73946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_011080	GC	3	6	73953	73958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_011080	GCC	2	6	74076	74081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445308
1604	NC_011080	AGC	2	6	74196	74201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445308
1605	NC_011080	GAT	2	6	74217	74222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445308
1606	NC_011080	GCC	2	6	74281	74286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445308
1607	NC_011080	TAC	2	6	74312	74317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445308
1608	NC_011080	GAC	2	6	74325	74330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445308
1609	NC_011080	CGC	2	6	74381	74386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445308
1610	NC_011080	GCT	2	6	74420	74425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445308
1611	NC_011080	ATT	2	6	74469	74474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445308
1612	NC_011080	CAC	2	6	74481	74486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445308
1613	NC_011080	CG	3	6	74640	74645	0 %	0 %	50 %	50 %	194445308
1614	NC_011080	TCG	2	6	74653	74658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445308
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1616	NC_011080	TAT	2	6	74821	74826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445308
1617	NC_011080	TGTGGT	2	12	74848	74859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011080	AT	3	6	74888	74893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011080	T	7	7	74907	74913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011080	C	6	6	74915	74920	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1621	NC_011080	TTC	2	6	74971	74976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_011080	T	6	6	75110	75115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011080	AAAGAA	2	12	75162	75173	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_011080	TTA	2	6	75203	75208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_011080	T	6	6	75227	75232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011080	ATG	2	6	75242	75247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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