MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011080	GTG	2	6	45638	45643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446358
1002	NC_011080	ATGA	2	8	45647	45654	50 %	25 %	25 %	0 %	194446358
1003	NC_011080	GC	3	6	45696	45701	0 %	0 %	50 %	50 %	194446358
1004	NC_011080	CAG	2	6	45737	45742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446358
1005	NC_011080	TGA	2	6	45781	45786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446358
1006	NC_011080	GCT	2	6	45862	45867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446358
1007	NC_011080	TAC	2	6	45932	45937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446358
1008	NC_011080	AACG	2	8	45949	45956	50 %	0 %	25 %	25 %	194446358
1009	NC_011080	ATC	2	6	46025	46030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011080	TGAC	2	8	46033	46040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_011080	A	6	6	46047	46052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011080	A	6	6	46081	46086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011080	TCA	2	6	46095	46100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011080	TA	3	6	46101	46106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011080	TAG	2	6	46141	46146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011080	GAA	2	6	46151	46156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011080	GA	3	6	46168	46173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011080	T	6	6	46199	46204	0 %	100 %	0 %	0 %	194446207
1019	NC_011080	AGC	2	6	46205	46210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446207
1020	NC_011080	CAT	2	6	46225	46230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446207
1021	NC_011080	TCA	2	6	46233	46238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446207
1022	NC_011080	CGC	2	6	46240	46245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446207
1023	NC_011080	CAA	2	6	46345	46350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446207
1024	NC_011080	TGT	2	6	46359	46364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446207
1025	NC_011080	GCC	2	6	46478	46483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446207
1026	NC_011080	CGG	2	6	46486	46491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446207
1027	NC_011080	GAT	2	6	46492	46497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446207
1028	NC_011080	ACT	2	6	46527	46532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446207
1029	NC_011080	GGGCT	2	10	46552	46561	0 %	20 %	60 %	20 %	194446207
1030	NC_011080	ATC	2	6	46661	46666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446207
1031	NC_011080	GAT	2	6	46667	46672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446207
1032	NC_011080	TTA	2	6	46686	46691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446207
1033	NC_011080	GGC	2	6	46738	46743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446207
1034	NC_011080	GCT	2	6	46765	46770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446207
1035	NC_011080	GCG	2	6	46779	46784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446207
1036	NC_011080	TA	3	6	46800	46805	50 %	50 %	0 %	0 %	194446207
1037	NC_011080	CGG	2	6	46830	46835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446207
1038	NC_011080	CTT	2	6	46882	46887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446207
1039	NC_011080	GAAA	2	8	46897	46904	75 %	0 %	25 %	0 %	194446207
1040	NC_011080	TCGC	2	8	46912	46919	0 %	25 %	25 %	50 %	194446207
1041	NC_011080	TGC	2	6	47040	47045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446207
1042	NC_011080	ATT	2	6	47054	47059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446207
1043	NC_011080	CTG	2	6	47066	47071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446207
1044	NC_011080	GCTG	2	8	47103	47110	0 %	25 %	50 %	25 %	194446207
1045	NC_011080	TG	3	6	47181	47186	0 %	50 %	50 %	0 %	194446207
1046	NC_011080	TTA	2	6	47250	47255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446207
1047	NC_011080	GTG	2	6	47300	47305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446207
1048	NC_011080	GC	4	8	47320	47327	0 %	0 %	50 %	50 %	194446207
1049	NC_011080	TTA	2	6	47441	47446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443115
1050	NC_011080	AAG	2	6	47464	47469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443115
1051	NC_011080	CGC	2	6	47506	47511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443115
1052	NC_011080	TGT	2	6	47692	47697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443115
1053	NC_011080	CAG	2	6	47738	47743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443115
1054	NC_011080	GCG	2	6	47754	47759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443115
1055	NC_011080	GTG	2	6	47760	47765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443115
1056	NC_011080	CACG	2	8	47801	47808	25 %	0 %	25 %	50 %	194443115
1057	NC_011080	CAGC	2	8	47828	47835	25 %	0 %	25 %	50 %	194443115
1058	NC_011080	GCA	2	6	47879	47884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443115
1059	NC_011080	CTGC	2	8	47965	47972	0 %	25 %	25 %	50 %	194443115
1060	NC_011080	GTT	2	6	48026	48031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443115
1061	NC_011080	TGA	2	6	48080	48085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443115
1062	NC_011080	GAA	2	6	48210	48215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443115
1063	NC_011080	GA	3	6	48234	48239	50 %	0 %	50 %	0 %	194443115
1064	NC_011080	CGG	2	6	48253	48258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443115
1065	NC_011080	ACT	2	6	48280	48285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443115
1066	NC_011080	TACC	2	8	48312	48319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_011080	CAG	2	6	48372	48377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443677
1068	NC_011080	GCGTA	2	10	48428	48437	20 %	20 %	40 %	20 %	194443677
1069	NC_011080	CCT	2	6	48451	48456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443677
1070	NC_011080	CATG	2	8	48533	48540	25 %	25 %	25 %	25 %	194443677
1071	NC_011080	CAG	2	6	48552	48557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443677
1072	NC_011080	TCC	2	6	48661	48666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443677
1073	NC_011080	CCG	2	6	48931	48936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443677
1074	NC_011080	CGT	2	6	48942	48947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443677
1075	NC_011080	CCA	2	6	48948	48953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443677
1076	NC_011080	CGG	2	6	48983	48988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443677
1077	NC_011080	GAG	2	6	49015	49020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443677
1078	NC_011080	GACCA	2	10	49033	49042	40 %	0 %	20 %	40 %	194443677
1079	NC_011080	A	6	6	49125	49130	100 %	0 %	0 %	0 %	194443677
1080	NC_011080	CCGGC	2	10	49175	49184	0 %	0 %	40 %	60 %	194443677
1081	NC_011080	GTCGTA	2	12	49200	49211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194443677
1082	NC_011080	CG	4	8	49301	49308	0 %	0 %	50 %	50 %	194443677
1083	NC_011080	AAGT	2	8	49327	49334	50 %	25 %	25 %	0 %	194443677
1084	NC_011080	CCAG	2	8	49385	49392	25 %	0 %	25 %	50 %	194443677
1085	NC_011080	CG	3	6	49514	49519	0 %	0 %	50 %	50 %	194443677
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1088	NC_011080	CAG	2	6	49617	49622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443677
1089	NC_011080	CAT	2	6	49680	49685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443677
1090	NC_011080	CGG	2	6	49686	49691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443677
1091	NC_011080	AGT	2	6	49754	49759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443677
1092	NC_011080	GTT	2	6	49830	49835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443677
1093	NC_011080	T	6	6	49964	49969	0 %	100 %	0 %	0 %	194443677
1094	NC_011080	GAT	2	6	50074	50079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443677
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1096	NC_011080	TTGA	2	8	50166	50173	25 %	50 %	25 %	0 %	194443677
1097	NC_011080	TGG	2	6	50209	50214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443677
1098	NC_011080	TGC	2	6	50359	50364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443677
1099	NC_011080	CAGAC	2	10	50365	50374	40 %	0 %	20 %	40 %	194443677
1100	NC_011080	TTG	2	6	50385	50390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443677
1101	NC_011080	TGG	2	6	50402	50407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443677
1102	NC_011080	TCT	2	6	50474	50479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445592
1103	NC_011080	GAAA	2	8	50501	50508	75 %	0 %	25 %	0 %	194445592
1104	NC_011080	AGT	2	6	50509	50514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445592
1105	NC_011080	GCA	2	6	50584	50589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445592
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1107	NC_011080	GGC	2	6	50811	50816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445592
1108	NC_011080	TGT	2	6	50831	50836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445592
1109	NC_011080	GCCA	2	8	50842	50849	25 %	0 %	25 %	50 %	194445592
1110	NC_011080	CAT	2	6	50850	50855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445592
1111	NC_011080	CGC	2	6	50858	50863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445592
1112	NC_011080	CAG	2	6	50877	50882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445592
1113	NC_011080	AAG	2	6	50923	50928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445592
1114	NC_011080	GAT	2	6	50937	50942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445592
1115	NC_011080	TCG	2	6	50957	50962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445592
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1121	NC_011080	TAAA	2	8	51235	51242	75 %	25 %	0 %	0 %	194445592
1122	NC_011080	ATC	2	6	51252	51257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445592
1123	NC_011080	A	6	6	51268	51273	100 %	0 %	0 %	0 %	194445592
1124	NC_011080	TAA	2	6	51303	51308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445592
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1126	NC_011080	GTG	2	6	51398	51403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445592
1127	NC_011080	TGC	2	6	51447	51452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445592
1128	NC_011080	GC	3	6	51500	51505	0 %	0 %	50 %	50 %	194445592
1129	NC_011080	GAC	2	6	51545	51550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445592
1130	NC_011080	GAT	3	9	51579	51587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445592
1131	NC_011080	ATA	2	6	51616	51621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445592
1132	NC_011080	CAG	3	9	51627	51635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445592
1133	NC_011080	CAG	2	6	51714	51719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445592
1134	NC_011080	GTA	2	6	51758	51763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445592
1135	NC_011080	ATG	2	6	51770	51775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445592
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1137	NC_011080	ATT	2	6	51885	51890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_011080	AGTA	2	8	51928	51935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_011080	AGT	2	6	51950	51955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_011080	ATCA	2	8	51968	51975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1141	NC_011080	ATT	2	6	51976	51981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_011080	TTA	2	6	52004	52009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_011080	GGT	2	6	52042	52047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_011080	T	6	6	52053	52058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_011080	GAAA	2	8	52088	52095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_011080	AGGG	2	8	52121	52128	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_011080	A	6	6	52136	52141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_011080	A	7	7	52218	52224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_011080	TTG	2	6	52281	52286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444108
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1155	NC_011080	CTT	2	6	52598	52603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1156	NC_011080	GCA	2	6	52642	52647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1159	NC_011080	TCA	2	6	52786	52791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444305
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1162	NC_011080	TCAG	2	8	52891	52898	25 %	25 %	25 %	25 %	194442807
1163	NC_011080	GT	3	6	52910	52915	0 %	50 %	50 %	0 %	194442807
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1166	NC_011080	GCG	2	6	53113	53118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442807
1167	NC_011080	TGTGC	2	10	53126	53135	0 %	40 %	40 %	20 %	194442807
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1183	NC_011080	TGA	2	6	53844	53849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
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1194	NC_011080	CTG	2	6	54752	54757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
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1210	NC_011080	TCG	2	6	55807	55812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1211	NC_011080	CG	3	6	55825	55830	0 %	0 %	50 %	50 %	194442276
1212	NC_011080	CTG	2	6	55835	55840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442276
1213	NC_011080	TGG	2	6	55893	55898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442276
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1217	NC_011080	TGA	2	6	56164	56169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
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1228	NC_011080	TGA	2	6	56678	56683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442276
1229	NC_011080	GTA	2	6	56725	56730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446803
1230	NC_011080	GCA	2	6	56753	56758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446803
1231	NC_011080	TCC	2	6	56768	56773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446803
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1233	NC_011080	TGA	2	6	56933	56938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446803
1234	NC_011080	ATC	2	6	56989	56994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446803
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1236	NC_011080	GC	3	6	56999	57004	0 %	0 %	50 %	50 %	194446803
1237	NC_011080	TGT	2	6	57039	57044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446803
1238	NC_011080	CGGCG	2	10	57117	57126	0 %	0 %	60 %	40 %	194446803
1239	NC_011080	AGCGC	2	10	57225	57234	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1240	NC_011080	GTG	2	6	57247	57252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_011080	TTCAC	2	10	57372	57381	20 %	40 %	0 %	40 %	194446160
1242	NC_011080	GAT	2	6	57392	57397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446160
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1244	NC_011080	AGCC	2	8	57432	57439	25 %	0 %	25 %	50 %	194446160
1245	NC_011080	AGC	3	9	57480	57488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446160
1246	NC_011080	AAG	2	6	57501	57506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446160
1247	NC_011080	AAAG	2	8	57511	57518	75 %	0 %	25 %	0 %	194446160
1248	NC_011080	CGC	2	6	57538	57543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446160
1249	NC_011080	GGC	2	6	57598	57603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446160
1250	NC_011080	ATGG	2	8	57644	57651	25 %	25 %	50 %	0 %	194446160
1251	NC_011080	TTG	2	6	57848	57853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443769
1252	NC_011080	GC	3	6	57875	57880	0 %	0 %	50 %	50 %	194443769
1253	NC_011080	TCT	2	6	57995	58000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443769
1254	NC_011080	GC	4	8	58105	58112	0 %	0 %	50 %	50 %	194443769
1255	NC_011080	GAA	2	6	58126	58131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443769
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1257	NC_011080	TGG	2	6	58214	58219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443769
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1259	NC_011080	TCG	2	6	58349	58354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443769
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1262	NC_011080	TGG	2	6	58439	58444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443769
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1265	NC_011080	CGA	2	6	58521	58526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443769
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1285	NC_011080	G	6	6	59499	59504	0 %	0 %	100 %	0 %	194445334
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1356	NC_011080	TTTC	2	8	63481	63488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1357	NC_011080	A	6	6	63491	63496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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